单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27901 篇文献，本页显示第 8881 - 8900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8881 | 2024-09-20 |
Multimodal single cell analysis infers widespread enhancer co-activity in a lymphoblastoid cell line
2023-05-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04954-4
PMID:37237005
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研究论文 | 本文利用单细胞技术分析了淋巴母细胞系中增强子的共活性 | 首次在单细胞水平上研究了增强子对同一基因的共活性，并预测了增强子之间的关联 | 研究仅基于单一细胞系，预测的增强子关联需要进一步的功能验证 | 探究增强子在基因表达调控中的共活性模式 | 人类淋巴母细胞系中的增强子和基因表达 | 基因组学 | NA | 单细胞ATAC-seq和单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据和染色质状态数据 | 24,844个单细胞 |
| 8882 | 2024-09-20 |
Subcellular spatially resolved gene neighborhood networks in single cells
2023-05-22, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100476
PMID:37323566
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研究论文 | 本文介绍了一种用于分析亚细胞基因邻近关系的空间解析基因邻域网络（spaGNN）管道 | 提出了一种新的空间解析基因邻域网络（spaGNN）方法，用于分析亚细胞空间转录组数据中的基因邻近关系 | NA | 开发一种新的方法来分析亚细胞空间转录组数据中的基因邻近关系，并展示其在细胞类型分类任务中的应用 | 亚细胞空间转录组数据中的基因邻近关系 | 数字病理学 | NA | 荧光原位杂交（FISH） | 机器学习 | 图像 | 使用了成纤维细胞、U2-OS细胞和间充质干细胞（MSCs）的FISH数据 |
| 8883 | 2024-09-20 |
Deciphering tumor ecosystems at super resolution from spatial transcriptomics with TESLA
2023-05-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.03.008
PMID:37164011
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TESLA的机器学习框架，用于在空间转录组学中以像素级分辨率进行组织注释 | TESLA整合了组织学信息和基因表达，直接在组织学图像上注释异质性免疫和肿瘤细胞，并检测独特的肿瘤微环境特征，如三级淋巴结构 | 本文主要展示了TESLA在癌症中的应用，未详细探讨其在其他疾病中的应用 | 开发一种能够以高分辨率解析肿瘤微环境的空间转录组学方法 | 肿瘤微环境中的细胞群体及其丰度、组成和空间位置 | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学 | 机器学习框架 | 图像 | NA |
| 8884 | 2024-09-20 |
Applying causal discovery to single-cell analyses using CausalCell
2023-05-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81464
PMID:37129360
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研究论文 | 本文介绍了CausalCell工作流程和平台，用于在单细胞分析中应用因果发现 | 开发了CausalCell平台，通过基准测试四种因果发现方法，并分析多个单细胞RNA测序数据集，提出在大多数情况下基于约束的PC算法与基于核的条件独立性测试效果最佳 | 评估和选择因果发现方法以及开发和执行适当的工作流程仍然存在挑战 | 将因果发现应用于单细胞分析，以解决科学问题中的因果关系 | 单细胞RNA测序数据中的因果交互 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PC算法 | 单细胞RNA测序数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 8885 | 2024-09-20 |
Single-cell characteristics and malignancy regulation of alpha-fetoprotein-producing gastric cancer
2023-05, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.5883
PMID:37017469
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研究论文 | 研究了甲胎蛋白产生型胃癌的单细胞特征及其恶性调控因子 | 首次在单细胞水平上描述了甲胎蛋白产生型胃癌的特征，并发现DKK1与AFP表达和恶性表型相关 | NA | 在单细胞水平上描述甲胎蛋白产生型胃癌的特征，并识别调控AFP表达和恶性的因子 | 甲胎蛋白产生型胃癌的单细胞特征及其恶性调控因子 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个甲胎蛋白产生型胃癌患者的肿瘤样本 |
| 8886 | 2024-09-20 |
Uncovering the spatial landscape of molecular interactions within the tumor microenvironment through latent spaces
2023-04-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.03.004
PMID:37080163
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaceMarkers的生物信息学算法，用于通过空间转录组数据的潜在空间分析推断细胞间相互作用引起的分子变化 | SpaceMarkers算法通过空间转录组数据推断肿瘤微环境中细胞间相互作用引起的分子变化，并结合单细胞RNA测序数据进行迁移学习，进一步量化特定细胞类型中的分子变化 | NA | 研究肿瘤微环境中细胞间相互作用引起的分子变化 | 肿瘤微环境中的细胞间相互作用 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 潜在空间分析 | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA |
| 8887 | 2024-09-20 |
Single-cell transcriptomes in the heart: when every epigenome counts
2023-03-17, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac040
PMID:35325060
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综述 | 本文综述了心脏中单细胞转录组学的研究进展，探讨了细胞异质性的生物学意义及其在心脏功能和疾病中的作用 | 本文通过全面分析心脏中的单细胞转录组学数据，提出了新的心脏功能模型和假设，并讨论了新兴的表观基因组学方法与单细胞RNA测序的结合 | NA | 探讨心脏中单细胞转录组学的生物学意义及其在心脏功能和疾病中的作用 | 心脏中的单细胞转录组学数据和新兴的表观基因组学方法 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 8888 | 2024-09-20 |
Fibrotic immune microenvironment remodeling mediates superior anti-tumor efficacy of a nano-PD-L1 trap in hepatocellular carcinoma
2023-01-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2022.09.012
PMID:36146933
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研究论文 | 研究报道了一种纳米PD-L1陷阱基因在治疗肝纤维化相关肝细胞癌中的优越疗效 | 首次报道了纳米PD-L1陷阱基因在肝纤维化相关肝细胞癌治疗中的应用，相比传统单克隆抗体，其诱导的肿瘤消退更大且无毒性 | 研究主要基于动物模型，尚未在临床试验中验证其疗效 | 探讨纳米PD-L1陷阱基因在肝纤维化相关肝细胞癌治疗中的疗效及机制 | 肝纤维化相关肝细胞癌及其微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个临床队列的单细胞RNA测序数据 |
| 8889 | 2024-09-20 |
Single-cell transcriptome reveals insights into the development and function of the zebrafish ovary
2022-05-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76014
PMID:35588359
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组测序技术研究了斑马鱼卵巢的发育和功能 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼卵巢中不同细胞亚群的转录组特征，并发现了新的细胞亚群 | 基因敲除实验仅限于少数基因，未来需要进一步扩展以全面理解卵巢发育和功能的调控机制 | 揭示斑马鱼卵巢发育和功能的分子机制 | 斑马鱼卵巢中的生殖细胞和体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10,658个生殖细胞和14,431个体细胞 |
| 8890 | 2024-09-20 |
Noninvasive Low-Frequency Pulsed Focused Ultrasound Therapy for Rheumatoid Arthritis in Mice
2022, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0013
PMID:39290964
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研究论文 | 研究低频脉冲聚焦超声（LFPFU）对小鼠类风湿性关节炎的治疗效果及其对免疫细胞的影响 | 首次揭示了低频脉冲聚焦超声对类风湿性关节炎小鼠模型的治疗效果，并详细分析了其对免疫细胞亚群的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨低频脉冲聚焦超声治疗类风湿性关节炎的机制及其对免疫细胞的影响 | 类风湿性关节炎小鼠模型及其免疫细胞 | NA | 类风湿性关节炎 | 低频脉冲聚焦超声 | NA | 细胞 | DBA/1J小鼠模型中的类风湿性关节炎小鼠及其免疫细胞 |
| 8891 | 2024-09-19 |
Shexiang Tongxin dropping pill ameliorates microvascular obstruction via downregulating ALOX12 after myocardial ischemia-reperfusion
2024-Dec-01, International journal of cardiology
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.ijcard.2024.132481
PMID:39179033
|
研究论文 | 研究了麝香通心滴丸通过下调ALOX12改善心肌缺血-再灌注后的微血管阻塞 | 首次揭示了麝香通心滴丸通过下调ALOX12改善心肌缺血-再灌注后的微血管阻塞的具体作用和机制 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在临床患者中验证 | 阐明麝香通心滴丸在心肌缺血-再灌注诱导的微血管功能障碍中的作用及其潜在机制 | 小鼠心脏功能和微血管阻塞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 蛋白质组学和单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质和RNA | 小鼠心脏和心脏微血管内皮细胞 |
| 8892 | 2024-09-19 |
Single-cell RNA sequencing reveals a distinct profile of bone immune microenvironment and decreased osteoclast differentiation in type 2 diabetic mice
2024-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.101145
PMID:39281831
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研究论文 | 研究揭示了2型糖尿病小鼠骨髓细胞的单细胞转录组特征，并发现其骨免疫微环境的变化和破骨细胞分化的减少 | 首次详细描绘了2型糖尿病小鼠骨髓细胞的全局转录组图谱，揭示了骨免疫微环境在基因水平上的独特变化 | NA | 探讨2型糖尿病对骨组织的影响及其细胞和分子机制 | 2型糖尿病小鼠的骨髓细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和2型糖尿病小鼠的骨髓细胞 |
| 8893 | 2024-09-19 |
A novel study on CXXC5: unraveling its regulatory mechanisms in hematopoietic stem cell biology through proteomics and gene editing
2024-Oct, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-024-01540-8
PMID:39150611
|
研究论文 | 本研究探讨了CXXC5在造血干细胞自我更新和分化中的调控机制 | 通过单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因编辑和蛋白质组学分析，揭示了CXXC5在造血干细胞生物学中的重要作用 | NA | 研究CXXC5在造血干细胞自我更新和分化中的调控机制 | 造血干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9、蛋白质组学分析 | NA | RNA、蛋白质 | 从骨髓样本中分离的造血干细胞 |
| 8894 | 2024-09-19 |
The interaction of innate immune and adaptive immune system
2024-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.714
PMID:39286776
|
综述 | 本文详细剖析了先天免疫系统和适应性免疫系统的组成和功能，强调了它们在生理和病理环境中的协同作用 | 揭示了先天免疫和适应性免疫之间更复杂的相互作用，并提供了新的见解 | NA | 增强对先天免疫和适应性免疫复杂相互作用的理解，并提供新的视角 | 先天免疫系统和适应性免疫系统的相互作用 | 免疫学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 8895 | 2024-09-19 |
3D spheroid culture synchronizes heterogeneous MSCs into an immunomodulatory phenotype with enhanced anti-inflammatory effects
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110811
PMID:39286508
|
研究论文 | 研究通过3D球状培养将异质性间充质干细胞（MSCs）同步化为具有增强抗炎作用的免疫调节表型 | 首次发现3D球状培养可以将异质性MSCs同步化为统一的免疫抑制表型，并显著增强其抗炎效果 | NA | 探索3D球状培养对MSCs表型和功能的影响 | 间充质干细胞（MSCs）及其在3D球状培养下的表型和功能变化 | NA | 银屑病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 异质性MSCs在2D和3D培养条件下的细胞样本 |
| 8896 | 2024-09-19 |
Type I interferon signaling regulates myeloid and T cell crosstalk in the glioblastoma tumor microenvironment
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110810
PMID:39286510
|
研究论文 | 研究探讨了I型干扰素信号在胶质母细胞瘤肿瘤微环境中对髓系细胞和T细胞相互作用的影响 | 利用单细胞RNA测序分析肿瘤浸润淋巴细胞，揭示了I型干扰素信号在髓系细胞中对T细胞功能的调节作用 | 研究基于Gl261小鼠胶质母细胞瘤模型，结果的临床转化性有待进一步验证 | 探讨I型干扰素信号在胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 | 胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的髓系细胞和T细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用Gl261小鼠胶质母细胞瘤模型进行研究 |
| 8897 | 2024-09-19 |
Positional information modulates transient regeneration-activated cell states during vertebrate appendage regeneration
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110737
PMID:39286507
|
研究论文 | 研究了非洲齿鲤尾部再生过程中的组织动态变化，发现位置特异性的空间分布调节、持久性和增殖幅度 | 揭示了基底表皮中一种瞬时再生激活细胞状态（TRACS），并通过重塑细胞外基质（ECM）传递位置信息 | NA | 探讨脊椎动物附肢再生过程中位置信息传递的机制 | 非洲齿鲤的尾部再生组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8898 | 2024-09-19 |
Single-cell RNA-seq reveals a resolving immune phenotype in the oral mucosa
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110735
PMID:39280609
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了口腔黏膜在不同牙周健康状态下的免疫反应 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了口腔黏膜在牙周疾病和恢复过程中的免疫表型变化 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨口腔黏膜在不同牙周状态下的免疫反应机制 | 口腔黏膜中的巨噬细胞和中性粒细胞在牙周健康、疾病和恢复过程中的基因表达变化 | 数字病理学 | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠口腔黏膜样本，涵盖牙周健康、疾病和恢复三种状态 |
| 8899 | 2024-09-19 |
Foam Cells: The Origin of Formation and Target for Plant-derived Bioactive Compounds
2024-Sep-16, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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综述 | 本文综述了泡沫细胞的形成来源及其作为植物来源生物活性化合物靶点的研究进展 | 本文探讨了植物来源的生物活性成分对泡沫细胞形成的抑制作用，并提出了基于细胞靶点的治疗策略 | NA | 探讨泡沫细胞的形成机制及其作为治疗动脉粥样硬化的潜在靶点 | 泡沫细胞及其在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 8900 | 2024-09-19 |
Multiomics integrated analysis and experimental validation identify TLR4 and ALOX5 as oxidative stress-related biomarkers in intracranial aneurysms
2024-Sep-15, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03226-0
PMID:39278904
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研究论文 | 通过多组学分析和实验验证，识别与氧化应激相关的颅内动脉瘤诊断标志物TLR4和ALOX5 | 首次通过多组学分析和实验验证，识别出与氧化应激相关的颅内动脉瘤诊断标志物TLR4和ALOX5，并探讨了其潜在的治疗药物 | NA | 识别与氧化应激相关的颅内动脉瘤诊断标志物，并探讨其潜在的治疗药物 | 颅内动脉瘤及其相关基因TLR4和ALOX5 | 生物信息学 | 脑血管疾病 | 多组学分析、单细胞测序、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | 23,342个细胞来自2个颅内动脉瘤和3个浅表颞动脉样本 |