单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8861 - 8880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8861 | 2025-10-07 |
Spatially Resolved Tumor Ecosystems and Cell States in Gastric Adenocarcinoma Progression and Evolution
2025-Apr-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-0605
PMID:39774838
|
研究论文 | 通过整合胃癌的空间转录组和单细胞RNA测序数据，揭示肿瘤内空间异质性与不同免疫微环境的关联 | 发现两种独立的进化轨迹，并识别肿瘤-基质界面作为独特的肿瘤生态状态 | NA | 研究胃腺癌进展和演化中的空间分辨肿瘤生态系统和细胞状态 | 多个胃癌样本 | 空间转录组学 | 胃癌 | 空间转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | GeoMx Digital Spatial Profiler | NA |
| 8862 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies endothelial-derived HBEGF as promoting pancreatic beta cell proliferation in mice via the EGFR-Kmt5a-H4K20me pathway
2025-Apr, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06341-y
PMID:39694915
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现内皮细胞来源的HBEGF通过EGFR-Kmt5a-H4K20me通路促进小鼠胰腺β细胞增殖 | 首次揭示内皮细胞来源的HBEGF通过Kmt5a-H4K20me信号通路调控β细胞增殖的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探索调控生理性β细胞增殖的细胞内和细胞外信号通路 | 小鼠胰腺β细胞、内皮细胞、小鼠和大鼠β细胞系、原代小鼠胰岛 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 体外功能验证 | CellChat | 单细胞转录组数据 | 43,724个胰岛内分泌和非内分泌细胞，其中15,569个β细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8863 | 2025-10-07 |
Restorative Effects of Short-Chain Fatty Acids on Corneal Homeostasis Disrupted by Antibiotic-Induced Gut Dysbiosis
2025-Apr, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.010
PMID:39732390
|
研究论文 | 本研究探讨肠道微生物群对角膜稳态的影响及短链脂肪酸的修复作用 | 首次揭示抗生素诱导的肠道菌群失调会破坏角膜昼夜节律基因表达和屏障功能，并证明短链脂肪酸具有修复作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 研究肠道微生物群对角膜稳态的调控机制 | 小鼠角膜组织 | 微生物组学 | 角膜功能障碍 | RNA测序,单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠角膜组织样本 | NA | RNA-seq,单细胞测序 | NA | NA |
| 8864 | 2025-10-07 |
Effect of tumor microenvironment in pancreatic cancer on the loss of β-cell mass: implications for type 3c diabetes
2025-Apr, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-024-02204-w
PMID:39760782
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胰腺导管腺癌肿瘤微环境对β细胞质量损失的影响，揭示3c型糖尿病的发病机制 | 首次在单细胞水平系统分析PDAC肿瘤微环境中不同细胞类型与内分泌细胞的相互作用，并比较近端和远端肿瘤旁区域胰岛特征的差异 | 样本量相对有限，主要关注胰腺导管腺癌，未涵盖其他胰腺肿瘤类型 | 探索胰腺癌肿瘤微环境与β细胞质量损失之间的复杂相互作用，阐明3c型糖尿病发病机制 | 胰腺导管腺癌患者肿瘤组织、正常胰腺供体组织、INS-1E细胞系、PANC-1细胞系 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, TUNEL染色, RT-qPCR, CCK8检测 | NA | 单细胞转录组数据, 组织病理学数据, 细胞实验数据 | 正常胰腺供体、非糖尿病患者和3c型糖尿病患者的肿瘤旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8865 | 2025-10-07 |
MicroRNA-mediated Ets1 repression in retinal endothelial cells: A novel anti-angiogenic mechanism in nonproliferative diabetic retinopathy
2025-Apr, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.16182
PMID:39777974
|
研究论文 | 本研究通过microRNA测序和单细胞测序分析，揭示了非增殖性糖尿病视网膜病变中一种新型microRNA通过抑制Ets1介导的抗血管生成机制 | 发现了一种靶向Ets1的新型microRNA在NPDR患者血浆中上调，并揭示了其在视网膜内皮细胞中的抗血管生成作用机制 | 研究样本量有限，主要基于病例对照设计，需要更大规模研究验证 | 探索非增殖性糖尿病视网膜病变中血管生成的调控机制 | 2型糖尿病患者（伴有和不伴有NPDR）的血浆和视网膜样本，以及小鼠和大鼠模型的视网膜细胞 | 分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | microRNA测序, 单细胞测序 | NA | 测序数据 | 2型糖尿病患者病例对照样本 | NA | 单细胞测序, microRNA测序 | NA | NA |
| 8866 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq reveals that granulosa cells are a target of phthalate toxicity in the ovary
2025-Apr-01, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfaf001
PMID:39752319
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究邻苯二甲酸盐对卵巢颗粒细胞的毒性作用 | 首次在单细胞水平揭示邻苯二甲酸盐对卵巢颗粒细胞的特异性毒性作用，发现其对不同细胞亚型的影响差异 | 研究仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证；仅测试单一浓度（10µg/ml）的邻苯二甲酸盐代谢物混合物 | 探究邻苯二甲酸盐在卵巢中的分子毒性机制 | 小鼠窦卵泡中的颗粒细胞、卵泡膜细胞和基质细胞 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠窦卵泡（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8867 | 2025-10-07 |
Machine learning analysis of FOSL2 and RHoBTB1 as central immunological regulators in knee osteoarthritis synovium
2025-Apr, The Journal of international medical research
IF:1.4Q4
DOI:10.1177/03000605251333646
PMID:40287984
|
研究论文 | 通过机器学习分析膝骨关节炎滑膜中的关键免疫调节基因FOSL2和RHoBTB1 | 首次结合多种机器学习算法和单细胞RNA测序技术系统鉴定膝骨关节炎滑膜中的核心免疫调节基因 | 需要进一步的研究验证这些基因在膝骨关节炎中的确切作用和治疗潜力 | 探索膝骨关节炎滑膜的分子机制和免疫调节机制 | 膝骨关节炎滑膜组织、小鼠模型 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、机器学习算法、基因组关联分析 | LASSO、支持向量机 | 基因表达数据 | GSE55235和GSE51588数据集，膝骨关节炎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8868 | 2025-10-07 |
scPEDSSC: proximity enhanced deep sparse subspace clustering method for scRNA-seq data
2025-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012924
PMID:40294099
|
研究论文 | 提出一种基于邻近性增强的深度稀疏子空间聚类方法scPEDSSC，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型识别 | 采用基于两部分广义伽马分布的深度自编码器学习自表达矩阵，并结合其二阶幂生成相似度矩阵 | NA | 解决单细胞RNA测序数据聚类分析中的高维度、噪声和稀疏性挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度自编码器, 稀疏子空间聚类 | 基因表达数据 | 12个真实生物数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8869 | 2025-10-07 |
The Application of scRNA-Seq in Heart Development and Regeneration
2025-Apr, Genesis (New York, N.Y. : 2000)
DOI:10.1002/dvg.70013
PMID:40300044
|
综述 | 本文总结了单细胞RNA测序技术在心脏发育与再生研究中的应用 | 系统梳理了scRNA-seq技术在揭示心脏损伤修复分子机制方面的最新进展 | NA | 探索单细胞RNA测序在心脏发育和再生研究中的应用价值 | 哺乳动物心脏、斑马鱼心脏、心肌细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 8870 | 2025-10-07 |
Benchmarking algorithms for spatially variable gene identification in spatial transcriptomics
2025-Mar-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf131
PMID:40139667
|
研究论文 | 提出一个用于评估空间转录组学中空间可变基因识别算法的基准框架 | 首次构建了包含30个合成数据集和74个真实数据集的综合基准框架，用于系统评估空间可变基因识别算法 | NA | 评估空间可变基因识别算法的性能并确定最佳算法及其适用场景 | 空间转录组学数据分析算法 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据分析 | NA | 空间转录组数据 | 30个合成数据集和74个真实数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8871 | 2025-10-07 |
adverSCarial: assessing the vulnerability of single-cell RNA-sequencing classifiers to adversarial attacks
2025-Mar-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf168
PMID:40234247
|
研究论文 | 开发了一个名为adverSCarial的R软件包，用于评估单细胞RNA测序分类器对对抗性攻击的脆弱性 | 首次提供了专门针对单细胞转录组数据的对抗性攻击模拟工具，支持从轻微到激进的不同攻击模式 | 仅评估了五种机器学习分类器，在四个数据集上进行测试，样本范围有限 | 评估单细胞RNA测序分类器对对抗性攻击的脆弱性，提高模型可靠性 | 单细胞RNA测序分类器和对抗性攻击方法 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 多种机器学习分类器 | 基因表达数据 | 四个不同数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8872 | 2025-10-07 |
Protocol for investigating intracellular microbial diversity using single-cell RNA-seq in immune cells of SARS-CoV-2-positive and recovered patients
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103546
PMID:39786999
|
研究方案 | 本文提出了一种利用单细胞RNA测序检测SARS-CoV-2阳性及康复患者免疫细胞中胞内微生物多样性的实验方案 | 开发了针对非可培养状态胞内微生物的单细胞RNA测序检测流程，专门应用于新冠病毒感染研究 | NA | 建立检测免疫细胞中胞内微生物多样性的标准化实验流程 | SARS-CoV-2阳性患者和康复患者的免疫细胞 | 单细胞测序 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8873 | 2025-10-07 |
Single-cell atlas of the pregnant equine endometrium before and after implantation†
2025-Mar-16, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf004
PMID:39756438
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建妊娠母马子宫内膜在胚胎植入前后的细胞图谱 | 首次在母马中发现常驻先天淋巴细胞和黏膜相关恒定T细胞等新型免疫细胞亚群，并揭示子宫内膜自然杀伤细胞是植入期间最丰富的白细胞群体 | 仅分析了两个时间点（妊娠第33天和第42天）的样本，样本时间点有限 | 确定和比较马胚胎植入前后子宫内膜细胞的转录组和细胞亚群 | 母马子宫内膜细胞 | 单细胞组学 | 生殖生物学 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约97,000个子宫内膜细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8874 | 2025-10-07 |
Spatial Organization of Macrophages in CTL-Rich Hepatocellular Carcinoma Influences CTL Antitumor Activity
2025-Mar-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0589
PMID:39745778
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间分析揭示了巨噬细胞空间聚集在CTL富集型肝细胞癌中的免疫抑制作用和预后价值 | 首次发现巨噬细胞空间聚集是CTL富集型肝癌的独特空间模式，揭示了空间分布对巨噬细胞重编程和CTL耗竭的影响 | 样本量相对有限，需要更大规模验证 | 探究CTL富集型肝细胞癌中空间免疫变异对临床结局的影响机制 | 肝细胞癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 多重原位染色，单细胞转录组测序，空间转录组测序 | 随机森林，Cox回归 | 图像，转录组数据 | 20例CTL富集型HCC用于深度分析，386例患者队列用于验证 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 8875 | 2025-10-07 |
A3AR antagonism mitigates metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease by exploiting monocyte-derived Kupffer cell necroptosis and inflammation resolution
2025-Mar, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2024.156114
PMID:39732364
|
研究论文 | 本研究探讨了选择性A3AR拮抗剂通过诱导单核细胞来源库普弗细胞坏死性凋亡来改善代谢功能障碍相关脂肪肝病的作用机制 | 首次揭示A3AR拮抗通过β-arrestin2介导的受体降解导致线粒体功能障碍，进而诱导促炎性MoKCs坏死性凋亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 研究A3AR拮抗对代谢功能障碍相关脂肪肝病的治疗作用及机制 | MASLD患者和快餐饮食喂养的小鼠 | 肝脏疾病研究 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 空间转录组学，基因敲除，体内药物治疗 | A3AR基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，组织病理学数据 | MASLD患者和FFD喂养的小鼠样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8876 | 2025-10-07 |
Integrative approaches to m6A and m5C RNA modifications in autism spectrum disorder revealing potential causal variants
2025-Mar, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-024-10095-8
PMID:39738578
|
研究论文 | 通过整合m6A和m5C RNA修饰分析识别自闭症谱系障碍的潜在因果变异 | 首次整合m6A和m5C RNA修饰变异进行自闭症基因组分析，结合cis-eQTL和基因差异表达分析 | 需要实验验证和单细胞RNA-seq数据进一步确认因果关系 | 识别自闭症谱系障碍的潜在因果变异和调控机制 | 自闭症谱系障碍相关基因和RNA修饰变异 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍 | 整合基因组分析、cis-eQTL分析、基因差异表达分析、基因富集分析 | NA | 基因组数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、微阵列基因表达分析 | NA | NA |
| 8877 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq offer new insights into the cell fate decision of the primordial germ cells
2025-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.139136
PMID:39740725
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示原始生殖细胞命运决定的新机制 | 首次通过单细胞RNA测序发现细胞周期驱动细胞异质性，识别了参与PGC自我更新的活跃群体和衰老细胞命运特征 | 未明确说明样本来源物种和具体实验室间重复性问题的量化数据 | 研究培养原始生殖细胞系网络建立的分子动力学机制 | 原始生殖细胞(PGCs) | 单细胞生物学 | 生殖生物学 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8878 | 2025-10-07 |
Immune Cell Biology in Peripheral Nervous System Injury
2025-Mar, Neurorehabilitation and neural repair
IF:3.7Q1
DOI:10.1177/15459683241304325
PMID:39744962
|
综述 | 总结免疫细胞在周围神经系统损伤与修复过程中的关键作用 | 通过单细胞测序分析为巨噬细胞表型争议提供新见解，系统阐述各类免疫细胞在神经损伤中的动态变化 | 主要基于现有文献总结，缺乏原始实验数据验证 | 阐明免疫细胞在周围神经系统损伤修复中的机制 | 周围神经系统损伤后的免疫细胞（巨噬细胞、中性粒细胞、淋巴细胞等） | 神经科学 | 周围神经损伤 | 单细胞测序 | NA | 文本综述 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8879 | 2025-10-07 |
The relationship between a high-fat diet, gut microbiome, and systemic chronic inflammation: insights from integrated multiomics analysis
2025-Mar, The American journal of clinical nutrition
DOI:10.1016/j.ajcnut.2024.12.026
PMID:39746397
|
研究论文 | 通过整合多组学分析探讨高脂饮食、肠道微生物组与系统性慢性炎症之间的因果关系 | 首次采用孟德尔随机化方法结合单细胞测序和转录组学分析，揭示特定肠道菌群在高脂饮食诱导炎症中的介导作用 | 研究数据主要来源于欧洲人群，可能限制结果在其他人群的普适性 | 探究高脂饮食通过肠道微生物组影响系统性慢性炎症的机制 | 人类遗传数据、肠道微生物组、炎症细胞因子、免疫细胞特征、血清代谢物和小鼠结肠组织 | 多组学整合分析 | 代谢性疾病 | 孟德尔随机化, 全基因组关联分析, 转录组测序, 单细胞测序, 代谢组学 | 孟德尔随机化模型, 中介分析 | 遗传数据, 微生物组数据, 转录组数据, 单细胞数据, 代谢组数据 | 欧洲人群GWAS数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 8880 | 2025-10-07 |
Lymphocytes-Associated Extracellular Vesicles Activate Natural Killer Cells in HNSCC
2025-Mar, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16440
PMID:39749376
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析头颈鳞状细胞癌中小细胞外囊泡的异质性及其对自然杀伤细胞的激活作用 | 首次在液滴水平分析HNSCC中sEVs的异质性，发现T细胞是sEVs主要分泌源，并揭示其通过sEVs间接激活NK细胞的抗肿瘤机制 | 研究主要基于计算算法SEVtras的分析结果，需要进一步实验验证 | 探究头颈鳞状细胞癌中小细胞外囊泡的异质性及其在肿瘤免疫中的作用机制 | 头颈鳞状细胞癌患者样本中的小细胞外囊泡、T细胞和自然杀伤细胞 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | SEVtras算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |