单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 38102 篇文献，本页显示第 8801 - 8820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8801 | 2025-10-05 |
Single-cell-scale spatial transcriptome of the developing and adult mouse ovary
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.16.676655
PMID:41000831
|
研究论文 | 本研究使用空间转录组技术构建了小鼠卵巢发育和成年期的单细胞尺度空间转录组图谱 | 首次在保持卵巢原生细胞结构的前提下，通过10X Genomics Visium HD空间转录组技术实现了近单细胞分辨率的空间基因表达分析 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及其他物种验证 | 探究卵巢发育过程中的空间模式调控机制 | 发育中和成年小鼠卵巢 | 空间转录组学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 8个关键胎儿期和出生后时间点的小鼠卵巢样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | 10X Genomics Visium HD空间转录组学平台 |
| 8802 | 2025-10-05 |
Downregulation of heat shock protein 90 alpha family class A member 1 inhibits necroptosis in cardiac microvascular endothelial cells and alleviates sepsis-induced cardiomyopathy
2025-Sep-16, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2025.114757
PMID:40967330
|
研究论文 | 本研究探讨HSP90AA1下调通过抑制心脏微血管内皮细胞坏死性凋亡缓解脓毒症诱导心肌病的机制 | 首次在单细胞水平揭示HSP90aa1+毛细血管内皮细胞在脓毒症心肌病中的异质性，并阐明HSP90AA1通过NF-κB信号通路调控坏死性凋亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；未探讨其他潜在信号通路的参与 | 探究Hsp90AA1对小鼠心脏微血管内皮细胞功能和坏死性凋亡的影响及其在脓毒症诱导心肌病中的作用机制 | 小鼠心脏微血管内皮细胞和脓毒症诱导心肌病小鼠模型 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, Western blot, 免疫荧光, ELISA, 经胸超声心动图 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 影像数据 | 未明确样本数量的小鼠模型和细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8803 | 2025-10-05 |
Global Pangenome Analysis Highlights the Critical Role of Structural Variants in Cattle Improvement and Identifies a Unique Event as a Novel Enhancer in IGFBP7+ Cells
2025-Sep-01, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaf205
PMID:40828965
|
研究论文 | 本研究通过泛基因组图谱平台分析全球2409头牛的SNP和SV变异，揭示结构变异在牛群改良和适应性进化中的关键作用 | 首次在牛基因组中发现约40.14%的结构变异未被邻近SNP标记，并鉴定出一个作为IGFBP7基因增强子的独特结构变异 | 研究主要基于82个品种的2409个个体，可能未覆盖所有牛种遗传多样性 | 探究结构变异在全球牛群种群结构和表型形成中的作用 | 来自82个品种的2409头全球牛个体 | 基因组学 | NA | 泛基因组分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，单细胞转录组数据 | 2409个个体，82个品种 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8804 | 2025-10-05 |
Mouse-Specific Single cell cytokine activity prediction and Estimation (MouSSE)
2025-Sep, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013475
PMID:40971965
|
研究论文 | 提出了一种名为MouSSE的新方法，用于在小鼠单细胞RNA测序和空间转录组数据中预测和估计细胞因子活性 | 开发了专门针对小鼠数据的细胞因子活性估计方法，使用经过修改的方差调整马氏距离技术，支持正负基因权重 | 方法主要针对小鼠数据，在人类数据中的适用性可能需要进一步验证 | 开发准确的小鼠单细胞水平细胞因子活性估计方法 | 小鼠单细胞RNA测序和空间转录组数据 | 生物信息学 | 自身免疫疾病、癌症、感染反应 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、基因集评分方法 | VAM（方差调整马氏距离）技术 | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 8805 | 2025-10-05 |
Safety and Anti-Inflammatory Effects of Engineered Extracellular Vesicles (ILB-202) for NF-κB Inhibition: A Double-Blind, Randomized, Placebo-Controlled Phase 1 Trial
2025-Sep, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70141
PMID:41002119
|
研究论文 | 评估工程化细胞外囊泡ILB-202在健康志愿者中的安全性、耐受性和初步药效学效应的I期临床试验 | 首次使用装载超抑制因子IκBα的工程化细胞外囊泡进行NF-κB靶向治疗的人体临床试验 | 单中心研究、样本量较小(18名志愿者)、仅评估短期效果 | 评估ILB-202在人体中的安全性和抗炎作用 | 18名健康志愿者 | NA | 炎症性疾病、自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、实验室参数、单细胞RNA测序数据 | 18名健康志愿者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8806 | 2025-10-05 |
Tensor-cell2cell v2 unravels coordinated dynamics of protein- and metabolite-mediated cell-cell communication
2025-Sep-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.11.02.514917
PMID:40950142
|
研究论文 | 介绍Tensor-cell2cell v2计算工具，用于联合分析蛋白质和代谢物介导的细胞间通讯动态变化 | 首次通过耦合张量分量分析同时分析蛋白质和代谢物介导的细胞通讯，保留各模态通讯评分的独立性和数据结构 | NA | 开发能够解析多种配体类型协调动态的细胞通讯分析工具 | 脑类器官发育过程中的细胞通讯 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学，耦合张量分量分析 | 张量分解模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8807 | 2025-10-05 |
An Intrinsic-hoc Framework for Heterogeneous Cellular Senescence Elucidation Using Deep Graph Representation Learning and Experimental Validation
2025-Jul-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.01.662364
PMID:40631080
|
研究论文 | 提出一种基于深度图表示学习的框架DeepSAS，用于从单细胞RNA-seq数据中解析衰老细胞的异质性 | 开发了首个结合深度图表示学习和实验验证的本征框架，能够稳健地识别衰老细胞类型及其相关基因 | NA | 解析衰老细胞的异质性及其相关基因，增进对衰老和年龄相关疾病的理解 | 健康眼部细胞图谱和特发性肺纤维化数据集中的衰老细胞 | 机器学习 | 年龄相关疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 深度图表示学习 | 单细胞RNA-seq数据，空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组学验证平台 |
| 8808 | 2025-10-05 |
cp_measure: API-first feature extraction for image-based profiling workflows
2025-Jul-01, ArXiv
PMID:41019218
|
研究论文 | 开发了一个名为cp_measure的Python库，用于从生物图像中提取特征以支持基于图像的细胞分析工作流 | 将CellProfiler的核心测量功能提取为模块化、API优先的工具，实现程序化特征提取 | NA | 开发适用于机器学习工作流的自动化、可重复图像分析工具 | 生物图像中的细胞和其他实体 | 计算机视觉 | NA | 图像分析，特征提取 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学，3D成像 | NA | NA |
| 8809 | 2025-10-05 |
Spatiotemporal profiling reveals the impact of caloric restriction on mammalian brain aging
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.04.652093
PMID:40654944
|
研究论文 | 通过时空分析揭示热量限制对哺乳动物大脑衰老的影响机制 | 首次整合单细胞核基因组学与空间转录组学技术，在区域特异性和细胞类型特异性分辨率下系统解析热量限制的抗衰老机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中验证；样本量相对有限（36个大脑） | 阐明热量限制对大脑衰老的分子和细胞作用机制 | 小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞核基因组学, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 空间转录组数据 | 36个小鼠大脑（超过500,000个细胞），12个脑切片 | NA | 单细胞核基因组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8810 | 2025-10-05 |
p63 co-opts the skin Krt8-to-Krt5 transition for enamel organ development
2025-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.11.637463
PMID:39990386
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了p63在釉质器官发育中调控Krt8向Krt5过渡的机制 | 首次发现p63在釉质器官发育中借用皮肤发育的Krt8-to-Krt5过渡机制 | 研究仅基于小鼠切牙模型，早期p63敲除小鼠的发育停滞限制了更全面功能研究 | 探究p63在釉质器官细胞分化中的具体作用机制 | 小鼠切牙釉质器官上皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 轨迹重建, 比较转录组分析, 染色质可及性分析 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 小鼠切牙样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8811 | 2025-10-05 |
3D spatial transcriptomics reveals the molecular structure of input and output pathways in the mouse olfactory bulb
2025-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639192
PMID:40060607
|
研究论文 | 利用3D空间转录组学技术重建小鼠嗅球的解剖和分子组织，揭示嗅觉通路的分子结构 | 首次使用3D空间转录组学技术绘制了嗅球的全面分子图谱，揭示了嗅球对称性组织的新原理 | 研究仅限于小鼠模型，未在其他物种中验证 | 研究脊椎动物大脑对称性组织的分子基础 | 小鼠嗅球组织 | 空间转录组学 | NA | 3D空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 近一千个分子特征不同的肾小球 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8812 | 2025-10-05 |
Multi-omics analysis of parthanatos related molecular subgroup and prognostic model development in stomach adenocarcinoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0332988
PMID:41004487
|
研究论文 | 通过多组学分析研究胃腺癌中parthanatos相关分子亚型并开发预后模型 | 首次系统研究parthanatos相关基因在胃腺癌中的作用，建立了基于PRG的新型预后特征，并通过单细胞RNA测序和体外实验验证关键基因COL8A1的功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索parthanatos相关基因在胃腺癌中的分子特征和预后价值 | 胃腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胃腺癌 | 多组学分析，转录组学，基因组学，单细胞RNA测序，western blot，集落形成，CCK-8，Transwell实验 | 机器学习算法，无监督聚类 | 转录组数据，基因组数据，临床数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，多组学分析 | NA | NA |
| 8813 | 2025-10-05 |
Integration of Single-Cell RNA and Bulk RNA Sequencing Reveals Cellular Heterogeneity and Identifies Survival-Associated Regulatory Networks in Glioblastoma
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70025
PMID:40804738
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序揭示胶质母细胞瘤细胞异质性并识别与生存相关的调控网络 | 首次结合单细胞和bulk转录组数据识别生存相关细胞状态，发现超级增强子调控网络在胶质母细胞瘤中的关键作用 | NA | 识别胶质母细胞瘤预后生物标志物和治疗靶点 | 胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的细胞异质性 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | Scissor算法,WGCNA分析,CellChat分析 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8814 | 2025-10-05 |
Insights gained from single-cell analysis of chimeric antigen receptor T-cell immunotherapy in cancer
2023-11-08, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-023-00486-4
PMID:37941075
|
综述 | 探讨单细胞分析在嵌合抗原受体T细胞免疫疗法中的应用与进展 | 系统总结单细胞测序技术如何优化CAR-T细胞疗法的受体设计、基因修饰和制造条件 | NA | 分析CAR-T免疫疗法在临床实践中失败的原因及单细胞测序技术带来的突破 | 嵌合抗原受体T细胞免疫疗法 | 单细胞分析 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8815 | 2025-10-05 |
Netrin-1 blockade inhibits tumour growth and EMT features in endometrial cancer
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06367-z
PMID:37532934
|
研究论文 | 本研究评估了netrin-1阻断剂NP137在子宫内膜癌中的抗肿瘤效果及其对上皮间质转化的抑制作用 | 首次报道netrin-1阻断在子宫内膜癌中的临床应用，并发现其能同时诱导肿瘤消退和抑制EMT | I期临床试验样本量较小（14例患者），需要更大规模研究验证 | 评估netrin-1阻断作为子宫内膜癌治疗策略的有效性和作用机制 | 子宫内膜癌小鼠模型和14例晚期子宫内膜癌患者 | 癌症研究 | 子宫内膜癌 | RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据, 转录组数据 | 14例患者（临床试验）加上小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8816 | 2025-10-05 |
Cryopreservation and post-thaw characterization of dissociated human islet cells
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0263005
PMID:35081145
|
研究论文 | 本研究优化了分散人胰岛细胞的冷冻保存方法，并验证了冻存后细胞的功能特性 | 开发了迭代分级冷冻方法，首次系统评估了冻存后胰岛细胞的分子和功能表型完整性 | 研究仅针对分散的胰岛细胞，未评估完整胰岛组织的冷冻保存效果 | 优化胰岛细胞冷冻保存技术，为糖尿病研究和治疗提供细胞来源 | 分散的人胰岛细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序，膜片钳电生理学 | NA | 基因表达数据，电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8817 | 2025-10-05 |
Daytime SHP2 inhibitor dosing, when immune cell numbers are elevated, shrinks neurofibromas
2025-Dec, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503359
PMID:40992926
|
研究论文 | 本研究探讨SHP2抑制剂在特定给药时间下对神经纤维瘤体积及免疫微环境的影响 | 发现SHP2抑制剂仅在白昼给药时（髓系细胞浸润较少时段）能有效缩小肿瘤，并揭示其疗效依赖于靶向单核细胞来源的巨噬细胞 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未验证人体适用性 | 探究SHP2抑制剂对神经纤维瘤体积和免疫微环境的调控机制 | 神经纤维瘤小鼠模型及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 神经纤维瘤 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8818 | 2025-10-05 |
Lichenoid graft-versus-host disease shows a high interferon score, with IFNAR1 inhibition preventing skin inflammation
2025-Oct, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.20760
PMID:40439472
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了苔藓样移植物抗宿主病的干扰素特征，并证明IFNAR1抗体可预防皮肤炎症 | 首次通过单细胞分辨率揭示lGVHD的干扰素特征，并验证IFNAR1阻断的治疗潜力 | 人类样本量较小（n=3），小鼠模型需进一步验证 | 解析苔藓样GVHD的免疫机制并评估I型干扰素通路阻断的治疗效果 | 人类lGVHD皮肤样本和小鼠ccGVHD模型 | 单细胞基因组学 | 移植物抗宿主病 | scRNA-Seq, bulk RNA-Seq, qPCR, 微阵列 | 小鼠GVHD模型 | 基因表达数据 | 人类样本：3例lGVHD+4例对照（scRNA-Seq），13例lGVHD+10例对照（qPCR）；小鼠公开数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8819 | 2025-10-05 |
The bone marrow immune ecosystem shapes daratumumab acquired resistance in plasma cell myeloma
2025-Oct, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02712-5
PMID:40750676
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和数字空间分析仪探索多发性骨髓瘤患者对达雷妥尤单抗获得性耐药的骨髓免疫生态系统机制 | 首次揭示骨髓免疫生态系统通过IFN-γ激活MYC通路导致达雷妥尤单抗获得性耐药的新机制 | 样本量有限，主要基于配对样本分析，需要更大规模验证 | 探究多发性骨髓瘤对达雷妥尤单抗获得性耐药的免疫机制 | 多发性骨髓瘤患者治疗前后配对样本 | 单细胞测序分析 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 数字空间分析 | 单细胞调控网络推断 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 配对样本分析，4个外部队列验证(GSE24080, GSE136337, GSE57317, coMMpass) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 数字空间分析仪 | NA |
| 8820 | 2025-10-05 |
SPP1 exacerbates ischemic stroke by promoting ferroptosis induced brain injury
2025-Oct-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152627
PMID:40957318
|
研究论文 | 本研究揭示SPP1通过PI3K/AKT信号通路加剧铁死亡诱导的脑损伤，从而恶化缺血性卒中 | 首次发现SPP1通过调控PI3K/AKT信号通路促进铁死亡在缺血性卒中中的作用机制 | 研究主要基于细胞和动物模型，尚未在临床患者中验证 | 探究SPP1在缺血性卒中中铁死亡机制中的作用及潜在治疗靶点 | HT22细胞系和小鼠MCAO/R模型 | 神经科学 | 缺血性卒中 | 单细胞测序, Western blot, 蛋白组学分析, 免疫荧光, 电子显微镜 | NA | 蛋白质表达数据, 细胞成像, 分子信号通路数据 | 细胞系和小鼠模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |