单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 8801 - 8820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8801 | 2024-09-13 |
Multi-omics and Single Cell Sequencing Analyses Reveal Associations of Mitophagy-Related Genes Predicting Clinical Prognosis and Immune Infiltration Characteristics in Osteosarcoma
2024-Sep-12, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01280-w
PMID:39264525
|
研究论文 | 研究通过多组学和单细胞测序分析，揭示了线粒体自噬相关基因在骨肉瘤中的临床预后和免疫浸润特征的关联 | 首次报道了线粒体自噬在骨肉瘤中的作用，并开发了一种新的评分系统MPRG评分，用于预测骨肉瘤的预后 | 研究样本量较小，且未在其他癌症类型中验证MPRG评分的有效性 | 探讨线粒体自噬相关基因在骨肉瘤中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 骨肉瘤患者的线粒体自噬相关基因及其与临床预后和免疫浸润的关系 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序 | LASSO-多变量Cox回归算法 | 基因数据 | 58个线粒体自噬相关基因 |
| 8802 | 2024-09-13 |
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneity in plant responses to the environment: a focus on biotic and abiotic interactions
2024-Sep-11, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erae107
PMID:38466621
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在植物对生物和非生物环境因素响应中的应用 | 单细胞转录组学提供了前所未有的细胞响应环境变化的视角 | 单细胞研究在植物-环境相互作用中面临技术挑战 | 探讨单细胞转录组学在理解植物对生物和非生物环境因素响应中的贡献 | 植物细胞对生物和非生物环境因素的响应 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 8803 | 2024-09-13 |
Unveiling impaired vascular function and cellular heterogeneity in diabetic donor-derived vascular organoids
2024-Sep-10, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae043
PMID:39049437
|
研究论文 | 研究揭示了从糖尿病供体诱导的多能干细胞衍生的血管类器官中受损的血管功能和细胞异质性 | 首次展示了糖尿病供体衍生的血管类器官与非糖尿病类器官在血管功能和细胞组成上的差异，并揭示了糖尿病相关血管类器官中特定细胞亚群的异常血管生成特征 | 研究主要集中在糖尿病供体衍生的血管类器官，未涉及其他疾病模型或更广泛的细胞类型 | 探讨糖尿病供体衍生的血管类器官在血管功能和细胞异质性方面的表现 | 糖尿病供体衍生的血管类器官与非糖尿病类器官 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 糖尿病和非糖尿病供体衍生的血管类器官 |
| 8804 | 2024-09-13 |
Endothelial-adipocyte Cx43 Mediated Gap Junctions Can Regulate Adiposity
2024-Sep-10, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqae029
PMID:38984993
|
研究论文 | 研究探讨了内皮细胞与脂肪细胞通过Cx43介导的缝隙连接在肥胖中的调节作用 | 首次揭示了Cx43在调节脂肪组织功能中的作用，并提出了Cx43介导的异细胞通讯可能是调节脂肪组织功能的一种机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨内皮细胞与脂肪细胞相互作用及其对代谢功能的影响 | 内皮细胞与脂肪细胞的相互作用及其在肥胖中的调节机制 | 心血管疾病 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) 和透射电子显微镜 (TEM) | NA | RNA | 高脂饮食 (HFD) 小鼠和Cx43S368A小鼠 |
| 8805 | 2024-09-13 |
Dual-specificity phosphatases 13 and 27 as key switches in muscle stem cell transition from proliferation to differentiation
2024-Sep-10, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae045
PMID:38975693
|
研究论文 | 研究揭示了双特异性磷酸酶13和27在肌肉干细胞从增殖到分化转变中的关键作用 | 首次揭示了MyoD直接靶向双特异性磷酸酶13和27，并阐明了它们在肌肉干细胞命运转变中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨MyoD在肌肉干细胞命运转变中的直接靶点及其作用机制 | 肌肉干细胞及其在肌肉再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | MyoD敲入小鼠和Dusp13:Dusp27双敲除小鼠 |
| 8806 | 2024-09-13 |
Increased autoreactivity and maturity of EBI2+ antibody-secreting cells from nasal polyps
2024-Sep-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177729
PMID:39253973
|
研究论文 | 研究了鼻息肉中表达EBI2的B细胞是否具有更高的自身抗体产生倾向，并评估了鼻息肉中抗体分泌细胞的分子特征 | 首次揭示了鼻息肉中EBI2+抗体分泌细胞具有更高的自身抗体产生倾向，并展示了其分子特征 | 研究仅限于鼻息肉和扁桃体组织，未涉及其他组织或疾病状态 | 探讨鼻息肉中EBI2+ B细胞的自身抗体产生倾向及其分子特征 | 鼻息肉和扁桃体组织中的EBI2+抗体分泌细胞 | 免疫学 | 鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 鼻息肉和扁桃体组织的样本 |
| 8807 | 2024-09-13 |
A pheromone receptor in cichlid fish mediates attraction to females but inhibits male parental care
2024-Sep-09, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2024.07.029
PMID:39094572
|
研究论文 | 研究揭示了慈鲷鱼中一种信息素受体Or113a在吸引雌性和抑制雄性亲代抚育行为中的作用 | 发现了一种信息素受体Or113a在慈鲷鱼中的新功能，即促进雄性吸引和交配行为，同时抑制雄性的亲代抚育行为 | 研究主要集中在慈鲷鱼模型中，结果的普适性需要进一步验证 | 探讨不同物种间交配和亲代抚育行为的控制机制 | 慈鲷鱼中的信息素受体Or113a及其在生殖行为中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学和CRISPR基因编辑 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8808 | 2024-09-13 |
Spatiotemporal transcriptomic landscape of rice embryonic cells during seed germination
2024-Sep-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.05.016
PMID:38848718
|
研究论文 | 研究通过空间增强分辨率组学测序和单细胞RNA测序，揭示了水稻胚胎细胞在种子萌发过程中的时空转录组图谱 | 首次报道了两种未知的盾片细胞类型，并开发了一种基于深度学习的自动细胞分割模型 | NA | 研究水稻胚胎细胞在种子萌发过程中的复杂生物功能 | 水稻胚胎细胞在种子萌发过程中的时空转录组 | 基因组学 | NA | 空间增强分辨率组学测序（Stereo-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度学习 | 转录组 | 6, 24, 36, 和 48小时后的水稻胚胎细胞 |
| 8809 | 2024-09-13 |
Single-cell RNA sequencing reveals the change in cytotoxic NK/T cells, epithelial cells and myeloid cells of the tumor microenvironment of high-grade serous ovarian carcinoma
2024-Sep-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01290-9
PMID:39249551
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了高级别浆液性卵巢癌肿瘤微环境中NK/T细胞、上皮细胞和髓系细胞的变化 | 揭示了高级别浆液性卵巢癌从早期到晚期阶段上皮细胞的异质性和富集通路的变化，以及细胞间通讯的增强 | NA | 研究高级别浆液性卵巢癌肿瘤微环境的变化 | NK/T细胞、上皮细胞和髓系细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 45,448个单细胞 |
| 8810 | 2024-09-13 |
MerlinS13 phosphorylation regulates meningioma Wnt signaling and magnetic resonance imaging features
2024-Sep-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52284-8
PMID:39251601
|
研究论文 | 研究了MerlinS13磷酸化对脑膜瘤Wnt信号传导和磁共振成像特征的调控作用 | 首次揭示了MerlinS13去磷酸化通过减弱与β-catenin的抑制性相互作用并激活Wnt通路来驱动脑膜瘤的生长 | 研究主要基于异种移植模型和患者样本，可能存在样本量和模型适用性的限制 | 探讨Merlin-intact脑膜瘤生长的生化机制，并寻找可用于指导治疗降级或影像监测的非侵入性生物标志物 | 脑膜瘤及其相关信号通路和磁共振成像特征 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序、邻近标记蛋白质组质谱分析、磁共振成像 | NA | 图像 | 涉及脑膜瘤异种移植模型和患者样本 |
| 8811 | 2024-09-13 |
From bioinformatics to clinical applications: a novel prognostic model of cuproptosis-related genes based on single-cell RNA sequencing data in hepatocellular carcinoma
2024-Sep-09, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00649-5
PMID:39251909
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据构建了一个基于铜死亡相关基因的肝细胞癌预后模型 | 开发了一种新的预后模型，利用六个生存相关基因来评估和管理肝细胞癌 | NA | 确定铜死亡相关基因与肝细胞癌预后之间的关系 | 肝细胞癌患者和正常对照组的铜死亡相关基因 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO | RNA测序数据 | NA |
| 8812 | 2024-09-13 |
Revealing the crosstalk between LOX+ fibroblast and M2 macrophage in gastric cancer by single-cell sequencing
2024-Sep-09, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12861-y
PMID:39251966
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了胃癌中LOX+成纤维细胞与M2巨噬细胞之间的相互作用 | 首次构建了胃癌患者的单细胞转录组图谱，并揭示了LOX+成纤维细胞与M2巨噬细胞在肿瘤微环境中的紧密定位和相互作用 | 研究仅限于胃癌样本，未来需在更多癌症类型中验证这些发现 | 揭示胃癌肿瘤微环境中成纤维细胞与巨噬细胞之间的相互作用，寻找潜在的治疗靶点 | 胃癌患者的肿瘤微环境中的LOX+成纤维细胞和M2巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 150,913个细胞 |
| 8813 | 2024-09-13 |
Dimension reduction, cell clustering, and cell-cell communication inference for single-cell transcriptomics with DcjComm
2024-Sep-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03385-6
PMID:39252099
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研究论文 | 提出了一种名为DcjComm的方法，用于单细胞转录组学的综合分析，包括降维、细胞聚类和细胞间通信推断 | DcjComm通过非负矩阵分解联合学习模型进行降维和聚类，并整合配体-受体对、转录因子和靶基因来推断细胞间通信，性能优于现有方法 | NA | 改进单细胞转录组学分析中的降维、细胞聚类和细胞间通信推断方法 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解 | 联合学习模型 | 转录组数据 | NA |
| 8814 | 2024-09-13 |
Cancer cell states: Lessons from ten years of single-cell RNA-sequencing of human tumors
2024-Sep-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.005
PMID:39214095
|
研究论文 | 本文回顾了过去十年单细胞RNA测序（scRNA-seq）在人类肿瘤研究中的应用，并强调了从这些研究中获得的一些重要见解 | 本文总结了scRNA-seq在定义癌症细胞状态和肿瘤内异质性方面的创新方法和发现 | 本文讨论了在定义和命名肿瘤内异质性程序时存在的模糊性 | 回顾和总结scRNA-seq在人类肿瘤研究中的应用，并展望未来在临床中的应用 | 人类肿瘤中的癌症细胞状态和肿瘤内异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8815 | 2024-09-13 |
SpatialOne: end-to-end analysis of visium data at scale
2024-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae509
PMID:39152991
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为SpatialOne的端到端分析管道，用于简化10x Visium数据的分析 | SpatialOne整合了多种先进的计算方法，简化了空间转录组数据的分析流程 | NA | 简化空间转录组数据的分析 | 10x Visium数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 8816 | 2024-09-13 |
Identifying cancer cells from calling single-nucleotide variants in scRNA-seq data
2024-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae512
PMID:39163479
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研究论文 | 开发了一种名为CCLONE的工具，用于从scRNA-seq数据中识别癌症细胞并匹配其表达谱 | 提出了CCLONE工具，能够处理scRNA-seq数据中SNV的不确定性和稀疏性，并联合识别癌症克隆群体及其相关变异 | 仅在急性髓系白血病和肺腺癌数据集上进行了验证，尚未在其他癌症类型中测试 | 解决从scRNA-seq数据中识别癌症细胞的挑战 | scRNA-seq数据中的单核苷酸变异（SNV） | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及两个急性髓系白血病数据集和一个肺腺癌数据集 |
| 8817 | 2024-09-13 |
scDiffusion: conditional generation of high-quality single-cell data using diffusion model
2024-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae518
PMID:39171840
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scDiffusion的生成模型，结合扩散模型和基础模型，用于生成高质量的单细胞RNA测序数据，并能在控制条件下生成数据 | scDiffusion通过设计多个分类器同时指导扩散过程，并提出了一种新的控制策略——梯度插值，使得模型能够生成连续的细胞发育轨迹 | NA | 开发一种能够生成高质量单细胞RNA测序数据的生成模型，并能在控制条件下生成数据 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 扩散模型 | 生成模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 8818 | 2024-09-13 |
Targeting transposable elements in cancer: developments and opportunities
2024-Sep, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2024.189143
PMID:38936517
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综述 | 本文综述了转座子在癌症中的作用及其在癌症治疗中的潜在应用 | 本文探讨了转座子在癌症中的多方面作用，并提出了基于转座子的诊断和治疗新方法 | NA | 探讨转座子在癌症中的作用及其在癌症治疗中的潜在应用 | 转座子及其在癌症中的作用 | NA | 癌症 | 长读长测序、计算分析、单细胞测序、蛋白质组学、CRISPR-Cas9技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 8819 | 2024-09-13 |
Cathepsin D is essential for the degradomic shift of macrophages required to resolve liver fibrosis
2024-Sep, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101989
PMID:39019115
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研究论文 | 研究探讨了溶酶体蛋白酶Cathepsin D在巨噬细胞介导的肝纤维化逆转中的关键作用 | 首次描述了Cathepsin D驱动的溶酶体活性在纤维化逆转过程中巨噬细胞修复功能中的核心作用 | NA | 探讨Cathepsin D在肝纤维化逆转中的作用机制 | 巨噬细胞和肝细胞中的Cathepsin D表达及其在肝纤维化中的功能 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类肝硬化样本和myeloid-CtsD及hepatocyte-CtsD敲除小鼠 |
| 8820 | 2024-09-13 |
An Efficient Fluorescence-Activated Protoplast Sorting (FAPS) and Regeneration Protocol for Canola (Brassica napus)
2024-Sep, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70008
PMID:39264225
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研究论文 | 本文介绍了一种高效的荧光激活原生质体分选（FAPS）和再生协议，用于油菜（Brassica napus）的研究 | 本文首次报道了将FAPS方法应用于油菜原生质体的分选和再生，为功能基因组学和基因编辑应用提供了新的工具 | NA | 开发一种高效的原生质体分选和再生协议，以支持植物科学中的基础和应用研究 | 油菜（Brassica napus）的原生质体 | 植物科学 | NA | 荧光激活原生质体分选（FAPS） | NA | NA | NA |