本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']
”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!
除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
8781 | 2025-10-07 |
Construction of a Prognostic Model for Cervical Cancer Related to lncRNA Based on Differential Co-expression Network and Functional Study of Key Gene EGFR-AS1
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.108429
PMID:40302795
|
研究论文 | 基于差异共表达网络构建宫颈癌相关lncRNA预后模型并研究关键基因EGFR-AS1的功能 | 首次结合多组学数据和单细胞测序数据,通过随机森林算法构建33-lncRNA宫颈癌预后模型,并发现EGFR-AS1与FAM83B通过EGFR通路相互作用调控宫颈癌发展 | NA | 建立有效的宫颈癌预后预测模型并探索关键基因的分子机制 | 宫颈癌患者数据及宫颈癌细胞 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞测序, 多组学分析, 随机森林算法, 共表达网络分析 | 随机森林, 共表达网络 | 基因组数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
8782 | 2025-10-07 |
Integration of multi-omics and single-cell transcriptome reveals mitochondrial outer membrane protein-2 (MTX-2) as a prognostic biomarker and characterizes ubiquinone metabolism in lung adenocarcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.106902
PMID:40302794
|
研究论文 | 本研究通过多组学和单细胞转录组分析,揭示线粒体外膜蛋白-2(MTX-2)作为肺腺癌预后生物标志物的作用及其在泛醌代谢中的功能 | 首次系统评估MTX-2在肺腺癌中的表达、预后价值及其在肿瘤代谢和免疫浸润中的作用机制 | NA | 探索MTX-2在肺腺癌进展和预后中的作用及其潜在治疗价值 | 肺腺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,分子生物学功能实验 | NA | 转录组数据,临床数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8783 | 2025-10-07 |
Identification of the role of MED6 in the development and prognosis of lung adenocarcinoma based on multi-omics profiling
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.110981
PMID:40302793
|
研究论文 | 基于多组学分析揭示MED6在肺腺癌发展和预后中的作用 | 首次发现MED6通过影响肿瘤细胞生长和肿瘤微环境相互作用促进肺腺癌进展,并基于MED6表达鉴定潜在治疗药物 | MED6在肺腺癌中的具体分子机制仍需进一步验证 | 探究Mediator复合物亚基在肺腺癌中的作用及其临床意义 | 肺腺癌细胞系和患者样本 | 多组学分析 | 肺腺癌 | CRISPR-Cas9功能缺失筛选,RNA-seq,单细胞测序,药物敏感性分析 | NA | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8784 | 2025-10-07 |
Identification and Validation of Prognostic Genes Related to Histone Lactylation Modification in Glioblastoma: An Integrated Analysis of Transcriptome and Single-cell RNA Sequencing
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.110646
PMID:40302809
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序分析,识别并验证了与胶质母细胞瘤中组蛋白乳酸化修饰相关的预后基因 | 首次系统分析组蛋白乳酸化修饰在胶质母细胞瘤中的预后价值,并构建了基于HLMRGs的风险预测模型 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 识别GBM中HLM相关预后基因并探索其作用机制 | 胶质母细胞瘤临床组织样本和公共数据库中的GBM测序数据 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 免疫组织化学染色, Western blotting, 转录组测序, 单细胞RNA测序, WGCNA, LASSO回归 | 风险预测模型, Cox回归模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床数据 | 从TCGA-GBM数据集获得3343个差异表达基因和948个关键模块基因 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
8785 | 2025-10-07 |
Bridging the gap: how patient-derived lung cancer organoids are transforming personalized medicine
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1554268
PMID:40302940
|
综述 | 总结患者来源肺癌类器官的培养验证流程及其在个性化医疗中的临床应用与跨学科整合 | 系统整合PDLCOs与肿瘤组装体、人工智能、器官芯片等前沿技术的交叉应用 | 类器官模型在可重复性和标准化方面仍存在标本来源、培养条件等技术挑战 | 探讨肺癌类器官技术在精准医疗中的应用前景与挑战 | 患者来源肺癌类器官(PDLCOs) | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、基因编辑、3D生物打印 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8786 | 2025-10-07 |
HDC/histamine Signaling Axis Drives Macrophage Reprogramming to Promote Angiogenesis in Hindlimb-Ischemic Mice
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.105148
PMID:40303294
|
研究论文 | 本研究揭示了HDC/组胺信号轴通过驱动巨噬细胞重编程促进后肢缺血小鼠血管生成的新机制 | 首次发现HDC在Ly6C巨噬细胞中高表达并鉴定出HDC+CXCR2+巨噬细胞亚群,开发了HA-DA@组胺水凝胶治疗缺血损伤 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需验证 | 阐明HDC/组胺信号在血管生成中的作用机制 | 后肢缺血小鼠模型中的巨噬细胞和内皮细胞 | 细胞生物学 | 缺血性疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8787 | 2025-10-07 |
Macrophage KDM2A promotes atherosclerosis via regulating FYN and inducing inflammatory response
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.102675
PMID:40303308
|
研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞中KDM2A通过调控FYN促进炎症反应从而驱动动脉粥样硬化发展的新机制 | 首次发现巨噬细胞特异性转录调节因子KDM2A通过直接调控FYN介导炎症反应在动脉粥样硬化中的关键作用 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究巨噬细胞转录重塑在动脉粥样硬化发展中的作用机制 | 人类动脉斑块样本、小鼠巨噬细胞、ApoE基因敲除小鼠 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 染色质免疫共沉淀测序, qPCR, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞数据, 图像数据 | 人类斑块微阵列数据集、小鼠骨髓来源巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
8788 | 2025-10-07 |
NAMPT Impairs Vascular Permeability in Periodontitis by Influencing FASN-mediated Lipogenesis
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.104485
PMID:40303304
|
研究论文 | 本研究揭示了NAMPT通过调节FASN介导的脂肪生成促进牙周炎中血管通透性增加和骨吸收的机制 | 首次发现NAMPT通过影响FASN介导的脂肪生成途径调控血管通透性,并证实这一机制在牙周炎骨吸收中的作用 | 研究主要基于细胞实验和小鼠模型,在人体中的直接证据仍需进一步验证 | 探讨牙周炎中血管通透性异常的关键调控分子及其在疾病进展中的作用 | 人脐静脉内皮细胞(HUVEC)、牙周炎患者组织、牙周炎小鼠模型 | 细胞生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8789 | 2025-10-07 |
Targeting endothelial MYC using siRNA or miR-218 nanoparticles sensitizes chemo- and immuno-therapies by recapitulating the Notch activation-induced tumor vessel normalization
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.112023
PMID:40303332
|
研究论文 | 本研究通过靶向内皮细胞MYC实现肿瘤血管正常化,增强化疗和免疫疗法疗效 | 发现Notch信号通过MYC调控增殖性肿瘤内皮细胞亚群,并开发了纳米颗粒递送siRNA/miR-218靶向MYC的新策略 | 研究主要基于基因修饰小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索肿瘤血管正常化的分子机制及治疗策略 | 肿瘤内皮细胞和肿瘤微环境 | 癌症生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, western blotting, 免疫荧光, 流式细胞术 | 基因修饰小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8790 | 2025-10-07 |
Spatially segregated APOE+ macrophages restrict immunotherapy efficacy in clear cell renal cell carcinoma
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.109097
PMID:40303328
|
研究论文 | 本研究揭示了APOE+巨噬细胞在透明细胞肾细胞癌中通过空间隔离方式促进免疫抑制和免疫检查点阻断治疗抵抗的机制 | 首次发现APOE+巨噬细胞在ccRCC中的空间分布特征及其通过SPP1-TGF-β轴介导免疫治疗抵抗的新机制 | 样本来源相对有限,机制研究主要在细胞系水平进行,需要更多体内实验验证 | 探索透明细胞肾细胞癌免疫治疗抵抗的机制 | 透明细胞肾细胞癌患者样本、786-O和769-P细胞系、THP-1来源的巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光、Western blot、流式细胞术、共培养实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、免疫荧光图像、蛋白质印迹数据、流式细胞数据 | 超过2000个样本,包括230例接受免疫检查点阻断治疗的晚期ccRCC患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8791 | 2025-10-07 |
Single-nucleus RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal an immunosuppressive tumor microenvironment related to metastatic dissemination during pancreatic cancer liver metastasis
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.108925
PMID:40303346
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学揭示了胰腺癌肝转移过程中与转移扩散相关的免疫抑制肿瘤微环境 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术系统解析PDAC肝转移过程中的免疫微环境特征,发现转移扩散细胞通过SPP1通路促进免疫抑制环境形成,并鉴定CITED4作为关键生物标志物 | 样本数量相对有限,需要更大规模队列验证研究结果 | 探究胰腺导管腺癌肝转移过程中肿瘤微环境的免疫特征和分子机制 | 胰腺导管腺癌原发肿瘤和肝转移组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光染色, 免疫组织化学, transwell实验, 划痕愈合实验 | 预后模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 62,326个细胞 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
8792 | 2025-10-07 |
Modulation of brain immune microenvironment and cellular dynamics in systemic inflammation
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.107061
PMID:40303348
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了系统性炎症中大脑免疫微环境的动态变化及细胞通讯网络 | 开发了DeconvCellLink R软件包研究神经炎症相关细胞互作网络,构建了系统性炎症反应期间大脑细胞网络的时序动态图谱 | 人类与动物模型中的大脑细胞变化存在差异 | 探究脓毒症相关脑病中大脑免疫微环境的细胞动力学和细胞通讯网络 | 人类和小鼠模型中的大脑免疫微环境及胶质细胞 | 生物信息学 | 脓毒症相关脑病 | bulk转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
8793 | 2025-10-07 |
Magnetic sculpture-like tumor cell vaccines enable targeted in situ immune activation and potent antitumor effects
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.107162
PMID:40303352
|
研究论文 | 开发了一种具有磁性和肿瘤靶向能力的创新性全细胞疫苗平台 | 使用高浓度FeCl处理肿瘤细胞实现形态固定和磁性赋予,无需传统化学交联 | 目前仅在黑色素瘤小鼠模型中验证,尚未进行人体试验 | 开发具有免疫原性、结构完整性和肿瘤靶向能力的新型全细胞疫苗平台 | 黑色素瘤细胞和荷瘤小鼠模型 | 免疫治疗 | 黑色素瘤 | 空间转录组分析 | 小鼠肿瘤模型 | 转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
8794 | 2025-10-07 |
PD-1 activation mitigates lupus nephritis by suppressing hyperactive and heterogeneous PD-1+CD8+ T cells
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.107418
PMID:40303350
|
研究论文 | 本研究揭示PD-1+CD8+ T细胞在狼疮性肾炎中的过度活跃特性,并通过PD-L1 Fc融合蛋白治疗验证其治疗潜力 | 首次系统阐明PD-1+CD8+ T细胞在自身免疫疾病中的非耗竭特性,发现其具有克隆扩增和过度活化特征 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化需进一步验证 | 探究PD-1+CD8+ T细胞在狼疮性肾炎中的作用机制及治疗策略 | 狼疮性肾炎患者和NZB/W F1小鼠 | 免疫学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, q-PCR, 流式细胞术, Western blot | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞表型数据 | 狼疮性肾炎患者和NZB/W F1小鼠(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8795 | 2025-10-07 |
Identification of disulfidptosis in esophageal squamous cell carcinoma based on single-cell and bulk RNA-seq data to predict prognosis and treatment response
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1567793
PMID:40303412
|
研究论文 | 基于单细胞和批量RNA-seq数据识别食管鳞状细胞癌中的二硫键死亡特征,构建预后模型并预测治疗反应 | 首次在食管鳞癌中系统识别二硫键死亡相关分子亚型,构建具有独立预后价值的特征模型,并发现潜在靶向药物 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 建立食管鳞癌预后预测模型并探索治疗靶点 | 食管鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 食管癌 | RNA-seq, 单细胞测序 | Cox回归, LASSO-Cox回归 | 基因表达数据 | GSE53625和TCGA-ESCC队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
8796 | 2025-10-07 |
Heterogenous cancer-associated fibroblasts related tumor microenvironment marked by CD10/KLF4/TIAM1 were identified in pancreatic adenocarcinoma by integrated transcriptomics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1557698
PMID:40303408
|
研究论文 | 通过整合转录组学识别胰腺导管腺癌中CD10/KLF4/TIAM1标记的异质性癌症相关成纤维细胞相关肿瘤微环境 | 首次系统识别胰腺癌中三种不同的CAF相关TME亚型,并发现关键CAF亚群与肿瘤细胞和巨噬细胞的相互作用机制 | 研究样本量有限,需要进一步验证CAF亚型在治疗反应中的具体作用机制 | 探索胰腺导管腺癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞亚型的组成、比例及其临床意义 | 胰腺导管腺癌患者肿瘤组织和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 整合转录组学,多重免疫组织化学,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,免疫组织化学图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学,转录组分析 | NA | NA |
8797 | 2025-10-07 |
Decoding immune cell dynamics in ischemic stroke: insights from single-cell RNA sequencing analysis
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1549518
PMID:40303468
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析解码缺血性卒中中的免疫细胞动态 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统分析缺血性卒中中的细胞类型、吞噬作用及相关分子机制 | 样本量相对有限(5,582个单细胞),仅基于生物信息学分析需要实验验证 | 研究缺血性卒中的细胞类型和分子生物学过程 | 健康对照和缺血性卒中患者的单细胞 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序 | UMAP, iTALK | 基因表达数据 | 5,582个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8798 | 2025-10-07 |
Heterogeneity of Renal Endothelial Cells, Interact with Neighboring Cells, and Endothelial Injury in Chronic Kidney Disease: Mechanisms and Therapeutic Implications
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.108299
PMID:40303495
|
综述 | 探讨肾脏内皮细胞异质性及其与邻近细胞相互作用在慢性肾脏病中的机制与治疗意义 | 整合单细胞测序技术揭示肾脏内皮细胞异质性及其微环境影响的最新研究进展 | 作为综述文章,未包含原始实验数据验证 | 阐明慢性肾脏病中内皮细胞异质性及损伤机制,探索治疗策略 | 肾脏内皮细胞及其与邻近细胞的相互作用 | 单细胞生物学 | 慢性肾脏病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8799 | 2025-10-07 |
Comprehensive Characterization of the Oxidative Stress Profiles in Neonatal Necrotizing Enterocolitis
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.109008
PMID:40303487
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk-RNA测序和单细胞RNA测序数据,系统揭示了坏死性小肠结肠炎中氧化应激特征及相关机制 | 首次整合bulk-RNA和单细胞RNA测序数据系统分析NEC中氧化应激特征,识别了关键枢纽基因和四种巨噬细胞亚型 | 枢纽基因列表在摘要中未完整呈现,具体药物名称也未明确列出 | 阐明坏死性小肠结肠炎中氧化应激特征,识别关键基因和相关机制,探索潜在治疗药物 | 坏死性小肠结肠炎组织和细胞,NEC小鼠模型 | 生物信息学 | 坏死性小肠结肠炎 | bulk-RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 免疫荧光染色, 差异分析, 基因集富集分析, 免疫浸润分析 | NEC小鼠模型 | RNA测序数据, 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
8800 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of m6A-SNPs and single-cell RNA sequencing reveals key drivers of endocrine combined with CDK4/6 inhibitor therapy resistance in ER+ breast cancer
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1590363
PMID:40303916
|
研究论文 | 通过整合m6A-SNPs和单细胞RNA测序分析,揭示ER+乳腺癌对内分泌联合CDK4/6抑制剂治疗耐药的关键驱动因素 | 首次结合m6A-SNPs和单细胞RNA测序技术,在单细胞分辨率下解析ER+乳腺癌治疗耐药的分子机制 | 研究样本量有限,需要更大规模验证;机制研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探索m6A修饰在ER+乳腺癌对内分泌联合CDK4/6抑制剂治疗耐药中的作用机制 | ER阳性乳腺癌患者 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析, 伪时间轨迹分析 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据, GWAS数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |