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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
8781 2025-10-05
Leveraging single-cell transcriptomic data to uncover immune suppressive cancer cell subsets in triple-negative canine breast cancers
2024, Frontiers in veterinary science IF:2.6Q1
研究论文 利用单细胞转录组数据识别三阴性犬乳腺癌中的免疫抑制癌细胞亚群 首次通过整合分析已发表单细胞测序数据揭示犬三阴性乳腺癌的免疫抑制亚群及其作用机制 基于已发表数据集进行二次分析,缺乏原始实验验证 鉴定和表征犬三阴性乳腺癌中的免疫抑制癌细胞亚群 犬三阴性乳腺癌细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 30只狗分为6组 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8782 2025-10-05
Rapid and signal crowdedness-robust in situ sequencing through hybrid block coding
2023-11-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 介绍一种名为SPRINTseq的新型原位测序方法,通过混合块编码和分子稀释策略实现快速、高分辨率的空间转录组分析 结合混合块编码和分子稀释策略,解决了现有方法在分辨率、灵敏度或速度方面的限制 NA 开发改进的空间转录组技术以探索复杂生物过程和疾病机制 小鼠大脑冠状切片中的453,843个细胞 空间转录组学 阿尔茨海默病 原位测序 NA 空间转录组数据 4个小鼠大脑冠状切片中的453,843个细胞,恢复超过1.42亿个转录本 NA 空间转录组学,原位测序 SPRINTseq 使用108个基因panel的混合块编码和分子稀释策略
8783 2025-10-05
NMDAR antagonists suppress tumor progression by regulating tumor-associated macrophages
2023-11-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究揭示了NMDAR在肿瘤相关巨噬细胞中的免疫抑制作用及其拮抗剂的抗肿瘤潜力 首次发现NMDAR激活通过钙内流和活性氧生成驱动肿瘤相关巨噬细胞的免疫抑制功能,并证明NMDAR拮抗剂可逆转此过程 研究主要聚焦于肝细胞肉瘤和纤维肉瘤模型,尚未验证其他肿瘤类型 探究NMDAR在肿瘤微环境中对巨噬细胞的调控机制及治疗潜力 肿瘤相关巨噬细胞、T细胞、NK细胞 肿瘤免疫学 肝细胞肉瘤、纤维肉瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
8784 2025-10-05
Controlling donor and newborn neuron migration and maturation in the eye through microenvironment engineering
2023-11-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 通过微环境工程控制供体和新生神经元在眼中的迁移与成熟 建立了'计算模拟-体外实验-体内验证'框架,首次利用单细胞转录组数据筛选出SDF1作为引导分子,在视网膜中构建人工梯度显著促进神经元迁移 研究仅聚焦于视网膜神经节细胞,未验证该方法在其他神经元类型或脑区的普适性 开发控制移植后供体细胞行为的精准方法,促进神经元整合 视网膜神经节细胞(RGCs) 神经科学 青光眼 单细胞转录组测序,计算机模拟分析,体外功能实验 NA 基因表达数据,细胞迁移数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
8785 2025-10-05
A cellular and molecular spatial atlas of dystrophic muscle
2023-07-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,构建了营养不良肌肉的高分辨率细胞和分子空间图谱 首次将空间转录组学与单细胞RNA测序相结合,揭示了DMD肌肉中细胞群体的非均匀分布和异步再生特征 研究基于D2-mdx小鼠模型,结果向人类DMD的转化需要进一步验证 研究杜氏肌营养不良症中异步肌肉再生对疾病进展的生物学机制 严重营养不良的D2-mdx小鼠模型的肌肉组织 空间生物学 杜氏肌营养不良症 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA 空间基因表达数据, 单细胞基因表达数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
8786 2025-10-05
Integrative in situ mapping of single-cell transcriptional states and tissue histopathology in a mouse model of Alzheimer's disease
2023-03, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 开发STARmap PLUS方法,结合空间转录组学和蛋白质检测,绘制阿尔茨海默病小鼠模型的单细胞转录状态与组织病理学图谱 首次实现高分辨率空间转录组学与蛋白质检测在同一组织切片中的整合,揭示淀粉样斑块周围的核心-壳结构细胞分布 仅在阿尔茨海默病小鼠模型中验证,样本量有限 研究阿尔茨海默病发病机制中的时空细胞和分子变化 阿尔茨海默病小鼠模型的脑组织 空间转录组学 阿尔茨海默病 空间转录组学,蛋白质检测 NA 空间转录组数据,蛋白质表达数据,组织图像 8月龄和13月龄阿尔茨海默病小鼠脑组织 NA 空间转录组学 STARmap PLUS 高分辨率空间转录组学与蛋白质检测整合方法
8787 2025-10-05
Decoding molecular and cellular heterogeneity of mouse nucleus accumbens
2021-12, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和多重错误鲁棒荧光原位杂交技术,构建了小鼠伏隔核的细胞图谱,揭示了其细胞异质性 首次结合单细胞转录组和空间信息构建小鼠伏隔核的细胞分类系统,揭示了神经元亚型的转录和空间多样性 研究仅限于小鼠模型,未在人类或其他物种中验证 解析小鼠伏隔核的分子、细胞和解剖异质性 小鼠伏隔核脑区 神经科学 NA 单细胞RNA测序, 多重错误鲁棒荧光原位杂交 NA 基因表达数据, 空间定位数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
8788 2025-09-30
Single-cell transcriptomics unveils iron dysregulation in macrophages: Implicated genes in periodontitis pathogenesis identified via Mendelian randomization
2026-Jan, Genes & diseases IF:6.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
8789 2025-09-30
Uncovering stromal cell fate genes and a novel risk stratification in UCEC by integrating single-cell RNA sequencing and multi-omics analysis
2026-Jan, Genes & diseases IF:6.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
8790 2025-10-05
Taurine improves bovine oocyte maturation through recovering mitochondrial dysfunction and oxidative stress-induced apoptosis after microplastics exposure
2025-Oct, Journal of dairy science IF:3.7Q2
研究论文 本研究探讨微塑料暴露对牛卵母细胞成熟的影响及牛磺酸的修复作用 首次揭示微塑料通过线粒体功能障碍导致牛卵母细胞成熟失败,并发现牛磺酸具有修复作用 研究仅针对牛卵母细胞,对人类生殖系统的直接适用性需要进一步验证 探究微塑料对雌性生殖系统的毒性作用及牛磺酸的保护机制 牛卵母细胞 生殖生物学 生殖系统疾病 免疫荧光染色,单细胞转录组测序 NA 图像数据,基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
8791 2025-10-05
Intervention of Rutin and Ochnaflavone in the Attenuation of Neuroinflammation and Neuronal Apoptosis in Spinal Cord Injury
2025-Sep-26, Global spine journal IF:2.6Q1
研究论文 本研究探讨芦丁和奥那黄酮通过调节PI3K/AKT和NF-κB信号通路减轻脊髓损伤后神经炎症和神经元凋亡的机制 首次揭示芦丁和奥那黄酮协同作用通过调控小胶质细胞活化和PI3K/AKT/NF-κB信号通路发挥神经保护作用的分子机制 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;机制研究尚未完全阐明所有下游效应分子 阐明芦丁和奥那黄酮在脊髓损伤中的神经保护机制 脊髓损伤小鼠模型、BV2小胶质细胞系、小胶质细胞-神经元共培养系统 神经科学 脊髓损伤 单细胞RNA测序, 网络药理学, 蛋白质印迹, 免疫荧光, ELISA NA 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 细胞培养数据 小鼠脊髓损伤模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8792 2025-10-05
Integrated multi-omics analysis reveals PTM networks as key regulators of colorectal cancer progression and immune evasion
2025-Sep-26, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过整合多组学分析揭示翻译后修饰网络作为结直肠癌进展和免疫逃逸的关键调控因子 首次全面揭示PTM网络在结直肠癌中的调控作用,发现GALNT6介导的糖基化通过稳定PD-L1和排除CD8+T细胞驱动免疫逃逸 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 探索翻译后修饰在结直肠癌进展和免疫逃逸中的综合作用 结直肠癌患者样本和细胞 生物信息学 结直肠癌 多组学整合分析,孟德尔随机化,空间转录组学 LASSO,SVM,随机森林 转录组数据,单细胞数据 1,783例批量RNA-seq样本,41,143个单细胞 NA 单细胞转录组学,空间转录组学,批量RNA-seq NA NA
8793 2025-10-05
Multi-omics analysis reveals the prognostic value and immunomodulatory role of CTSW in breast cancer
2025-Sep-26, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过多组学分析揭示CTSW在乳腺癌中的预后价值和免疫调节作用 首次采用多组学框架系统研究CTSW在乳腺癌中的预后意义和免疫调节功能,并通过单细胞RNA测序发现CTSW在活化CD8+T细胞中的表达与预后相关 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 探索乳腺癌中新的生物标志物和治疗靶点 乳腺癌患者和肿瘤免疫微环境 生物信息学 乳腺癌 转录组学、甲基化组学、数量性状位点分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序 Cox回归、Kaplan-Meier生存分析、孟德尔随机化 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
8794 2025-10-05
Data-driven inference of Boolean networks from transcriptomes to predict cellular differentiation and reprogramming
2025-Sep-26, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 提出一种从转录组数据自动推断布尔网络的方法,用于预测细胞分化和重编程 开发了整合转录组数据和先验知识自动生成布尔网络集合的通用方法,能够处理模型不确定性并预测稳健的重编程靶点 方法依赖于转录组数据的质量和对基础基因调控网络的先验知识 构建能够再现细胞定性行为的布尔网络模型,用于预测细胞分化和重编程 造血系统细胞分化和骨髓基质细胞向脂肪细胞/成骨细胞分化 计算生物学 NA RNA-seq 布尔网络 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
8795 2025-10-05
Integrative analysis of molecular mechanisms in prostate cancer via single-cell RNA sequencing and weighted gene co-expression network analysis
2025-Sep-26, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析研究前列腺癌的分子机制 首次整合scRNA-seq和bulk RNA-seq与hdWGCNA方法,在更高分辨率下分析前列腺癌肿瘤微环境,识别出6个关键基因 需要进一步的临床验证 探索前列腺癌进展的分子机制,发现潜在治疗靶点 前列腺癌组织样本 生物信息学 前列腺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 加权基因共表达网络分析 Cox回归, LASSO回归, 预后预测模型 基因表达数据, 临床数据 9,809个高质量细胞 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
8796 2025-10-05
Hypersonic levitation and spinning: paving the way for enhanced single-cell analysis via contactless tissue dissociation
2025-Sep-26, Communications engineering
研究论文 本文介绍了一种新型非接触式组织解离技术——高超声悬浮旋转技术,用于改进单细胞分析 开发了基于三声谐振器探针的高超声悬浮旋转技术,实现非接触式组织解离,通过微尺度'液体射流'施加精确流体动力 NA 开发高效、温和的组织解离方法以改进单细胞分析 人类肾癌组织 单细胞分析 肾癌 高超声悬浮旋转技术 NA 流式细胞术、原代细胞培养、免疫荧光、单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
8797 2025-10-05
Comprehensive characterization of lysosome-dependent cell death reveals prognostic significance and immune landscape in colon adenocarcinoma
2025-Sep-26, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究全面表征了溶酶体依赖性细胞死亡在结肠腺癌中的预后意义和免疫景观 首次系统分析LDCD相关基因在结肠腺癌中的表达特征,建立五基因预后标志物,并揭示其与肿瘤免疫微环境的关联 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要更多前瞻性研究验证 探索溶酶体依赖性细胞死亡相关基因在结肠腺癌中的预后价值和免疫学意义 结肠腺癌患者组织和细胞系 生物信息学 结肠癌 转录组测序,单细胞RNA测序,LASSO回归,Cox回归分析 预后预测模型 基因表达数据,临床数据 TCGA和GEO数据库中的结肠腺癌样本 NA 单细胞RNA测序,转录组测序 NA NA
8798 2025-10-05
Integrated Multiomics Analysis Identifies CDO1 as a Novel Therapeutic Target for Osteoarthritis
2025-Sep-25, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
研究论文 通过整合多组学分析识别CDO1作为骨关节炎的新型治疗靶点 首次通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和WGCNA分析识别CDO1作为骨关节炎的因果风险基因,并通过体内实验验证其治疗潜力 研究仅在大鼠模型中进行功能验证,尚未在人类临床试验中得到证实 识别骨关节炎进展中的关键基因和潜在治疗靶点 骨关节炎患者样本和大鼠模型 生物信息学 骨关节炎 单细胞RNA测序,批量RNA测序,WGCNA,孟德尔随机化分析 NA 基因表达数据 7个公共OA数据集和大鼠模型 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
8799 2025-10-05
Spatiotemporal profiling reveals the impact of caloric restriction in the aging mammalian brain
2025-Sep-23, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学和空间转录组学技术,揭示了热量限制对衰老小鼠大脑的细胞和分子影响 首次结合单细胞转录组和空间转录组技术,在时空维度上系统解析热量限制对哺乳动物大脑衰老的影响机制 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 探究热量限制延缓大脑衰老的细胞种群和分子通路机制 小鼠大脑细胞 单细胞生物学 衰老相关疾病 单核转录组测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间定位数据 36只小鼠大脑的超过50万个细胞,12个大脑切片 EasySci, IRISeq 单细胞RNA测序, 空间转录组学 EasySci单核转录组, IRISeq空间转录组 无成像IRISeq空间转录组技术
8800 2025-10-05
gwSPADE: gene frequency-weighted reference-free deconvolution in spatial transcriptomics
2025-Sep-23, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 提出一种名为gwSPADE的基因频率加权无参考空间转录组解卷积方法 开发了无需外部单细胞参考数据的空间转录组解卷积方法,采用基因频率加权方案和主题模型 NA 解决空间转录组数据中细胞类型组成的准确解卷积问题 空间转录组数据 空间转录组学 NA 空间转录组技术 主题模型 基因计数矩阵 NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium NA
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