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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2026-03-28 |
Isolation of human cutaneous immune cells for single-cell RNA sequencing
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102239
PMID:37120815
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研究论文 | 本文介绍了一种从人类皮肤中分离高活性免疫细胞用于单细胞RNA测序的协议 | 提出了一种针对人类皮肤屏障特性的高活性免疫细胞分离方法,适用于单细胞RNA测序 | 协议依赖于酶解和流式细胞术,可能对细胞活性有特定要求,且未详细讨论所有潜在技术挑战 | 开发一种从人类皮肤中分离免疫细胞的方法,以支持单细胞RNA测序在炎症性疾病研究中的应用 | 人类皮肤活检样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 862 | 2026-03-28 |
Protocol for analyzing γδ T cells from the vagina of diet-induced obese mice using single-cell RNA sequencing and flow cytometry
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102278
PMID:37289592
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研究论文 | 本文介绍了一种在高脂饮食诱导的肥胖小鼠中,通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析阴道γδ T细胞的实验方案 | 开发了针对肥胖小鼠阴道γδ T细胞分析的综合实验方案,结合单细胞RNA测序和流式细胞术,以研究肥胖对生殖器疱疹易感性的影响 | NA | 研究肥胖如何影响生殖器疱疹(由HSV-2引起)的易感性,并分析阴道γδ T细胞在其中的作用 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠的阴道γδ T细胞 | 数字病理学 | 生殖器疱疹 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 863 | 2026-03-28 |
Protocol for tumor dissociation and fluorescence-activated cell sorting of human head and neck cancers
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102294
PMID:37149858
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protocol | 本文描述了一种用于新鲜人类头颈部肿瘤标本解离及荧光激活细胞分选获取活性单细胞的逐步操作方案 | 提供了一种标准化的头颈部肿瘤组织解离与单细胞分选流程,支持下游单细胞RNA测序和三维患者来源类器官生成等应用 | NA | 建立头颈部肿瘤单细胞研究的前处理实验方案 | 人类头颈部肿瘤组织 | digital pathology | head and neck cancer | fluorescence-activated cell sorting (FACS), single-cell RNA sequencing, organoid culture | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 864 | 2026-03-28 |
Isolating peripheral blood mononuclear cells from HIV-infected patients for single-cell RNA sequencing and integration analysis
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102222
PMID:37060557
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研究论文 | 本文介绍了一种从HIV感染患者中分离外周血单个核细胞并进行单细胞RNA测序及整合分析的实验方案 | 结合10x Genomics单细胞测序技术和Illumina NovaSeq平台,对HIV感染患者的PBMCs进行单细胞转录组分析,并整合B细胞亚群功能和BCR受体库轨迹分析 | 未提及样本量大小或具体患者特征,可能限制结果的普适性 | 研究HIV感染对免疫细胞转录组的影响 | HIV感染患者的外周血单个核细胞 | 单细胞测序 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics protocol, Illumina NovaSeq 6000 | 10x Genomics单细胞测序方案结合Illumina NovaSeq 6000测序平台 |
| 865 | 2026-03-27 |
Small and Large Extracellular Vesicles in Circulation of Diffuse Large B-Cell Lymphoma Patients Originate From Different Cell Types of the Tumor Microenvironment
2026-Apr, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70259
PMID:41885389
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研究论文 | 本研究探讨了弥漫性大B细胞淋巴瘤患者循环中小型与大型细胞外囊泡的来源及其在肿瘤微环境中的细胞特异性分泌差异 | 首次通过单细胞测序数据反卷积分析揭示循环中小型与大型细胞外囊泡分别源自肿瘤微环境中的恶性细胞与非恶性免疫细胞 | 研究样本量有限,且主要基于体外细胞培养和血浆分析,未直接验证体内分泌动态 | 解析弥漫性大B细胞淋巴瘤患者循环细胞外囊泡的细胞来源及其作为液体活检标志物的潜力 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的血浆样本及体外培养的DLBCL细胞 | 肿瘤生物学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 密度梯度分离、可调电阻脉冲传感分析、小RNA测序、信使RNA测序、单细胞测序 | Statescope算法 | 测序数据、传感数据 | 17例DLBCL肿瘤组织的单细胞测序数据及患者血浆样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 866 | 2026-03-27 |
LLOT: application of Laplacian Linear Optimal Transport in spatial transcriptome reconstruction
2026-Jan-06, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujag046
PMID:41885893
|
研究论文 | 本文提出了一种名为LLOT的可解释方法,用于整合单细胞和空间转录组学数据,以在全基因组和单细胞分辨率下重建缺失的空间信息 | LLOT通过迭代校正平台效应并利用拉普拉斯最优传输,将空间转录组学数据中的每个点分解为空间平滑的单细胞概率混合,提供了一种可解释且通用的框架 | NA | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,以重建组织中的空间基因表达和推断细胞位置 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据(如原位杂交、Slide-seq、10x Visium和Visium HD) | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学技术(如原位杂交、Slide-seq、10x Visium、Visium HD) | 拉普拉斯线性最优传输(LLOT) | 基因表达数据(包括单细胞和空间数据) | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, Visium HD | 10x Visium和Visium HD用于空间转录组学测量 |
| 867 | 2026-03-27 |
ANGPTL3 in Podocytes Contributes to the Pathogenesis of Lupus Nephritis by Activating MSR1 in Macrophages
2026 Jan-Dec, Kidney diseases (Basel, Switzerland)
DOI:10.1159/000550803
PMID:41883862
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研究论文 | 本研究揭示了ANGPTL3在足细胞中通过激活巨噬细胞上的MSR1,促进狼疮性肾炎中干扰素偏向性炎症的关键机制 | 首次发现ANGPTL3作为MSR1的配体,并证实其在狼疮性肾炎中连接足细胞损伤与巨噬细胞驱动炎症的新轴心 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限,且未深入探讨其他潜在受体或信号通路 | 探究ANGPTL3在足细胞中是否通过激活巨噬细胞的MSR1驱动狼疮性肾炎的干扰素偏向性炎症 | 狼疮性肾炎的足细胞与巨噬细胞相互作用 | NA | 狼疮性肾炎 | 分泌组蛋白-蛋白相互作用筛选、免疫共沉淀、RNA测序、siRNA沉默、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、组织标本数据 | 小鼠模型、人类肾活检标本、Nephroseq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 868 | 2026-03-27 |
Identification and Validation of a Novel Theranostic Target in Triple Negative Breast Cancer with Transcriptomics and Protein Analyses
2026, Breast cancer (Dove Medical Press)
DOI:10.2147/BCTT.S568001
PMID:41884418
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,在三阴性乳腺癌中鉴定并验证了LY6E作为一个新的治疗诊断靶点 | 首次通过单细胞RNA测序结合批量RNA-seq数据,系统性地在三阴性乳腺癌中鉴定出LY6E等9个差异表达的膜蛋白,并确认LY6E作为高潜力的选择性成像和治疗靶点 | 研究样本量相对有限(8例TNBC患者),且体内验证仅使用了异种移植模型,缺乏临床样本的直接验证 | 识别三阴性乳腺癌的潜在治疗诊断靶点,以解决其因缺乏常规靶点(如雌激素、孕激素和HER2受体)而面临的成像和治疗挑战 | 三阴性乳腺癌细胞、正常乳腺细胞、TNBC患者组织样本、正常乳腺组织样本、人TNBC细胞系及免疫缺陷小鼠的异种移植肿瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,Western blot | NA | 转录组数据,蛋白质表达数据 | 8例TNBC患者和11例正常患者的scRNA-seq数据;TCGA队列中162例TNBC和113例正常乳腺组织的批量RNA-seq数据;代表性TNBC细胞系及小鼠异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 869 | 2026-03-27 |
Screening and molecular functional analysis of telomere-related genes in abdominal aortic aneurysms based on bioinformatics
2026, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2026.1716161
PMID:41884632
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法筛选并分析了腹主动脉瘤中端粒相关基因的分子特征,以识别潜在的治疗靶点 | 结合WGCNA、LASSO、SVM算法及单细胞RNA-seq数据,系统鉴定出KLF15和ZBTB16作为腹主动脉瘤的关键生物标志物,并验证了其在免疫炎症调控中的作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,实验验证仅限于体外细胞模型,缺乏体内动物模型或临床样本的进一步验证 | 探究腹主动脉瘤中端粒相关分子的特征,为开发治疗药物提供潜在靶点 | 腹主动脉瘤患者与正常对照的RNA表达数据及单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, Western blot, ELISA, 流式细胞术, Trans-well实验 | WGCNA, LASSO, SVM | 基因表达数据, 单细胞数据 | 基于公共数据集GSE57691和GSE237230,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 870 | 2026-03-27 |
Cochlear macrophage CD74 enhances the apoptosis of senescent cochlear hair cells by down-regulating MIF
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1751126
PMID:41884819
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研究论文 | 本研究通过分析小鼠耳蜗单细胞测序数据,揭示了巨噬细胞CD74通过下调MIF促进衰老耳蜗毛细胞凋亡的新机制 | 首次发现衰老耳蜗中巨噬细胞CD74表达上调,并通过与MIF相互作用降低局部MIF水平,从而削弱MIF对衰老听觉细胞的保护作用,促进其凋亡 | 研究主要基于HEI-OC1细胞模型和小鼠数据,尚未在人体组织中得到验证,且具体信号通路机制有待进一步阐明 | 探究年龄相关性听力损失的细胞分子机制,特别是巨噬细胞在耳蜗衰老过程中的作用 | C57BL/6J小鼠的耳蜗组织、HEI-OC1听觉细胞系、BV2小胶质细胞系 | 单细胞生物学 | 年龄相关性听力损失 | 单细胞RNA测序 | 细胞共培养模型 | 单细胞转录组数据、细胞实验数据 | 不同年龄段的C57BL/6J小鼠耳蜗组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 871 | 2026-03-25 |
Transient ER stress cell-autonomously promotes beta cell cycling in mice
2026-May, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06649-3
PMID:41537777
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研究论文 | 本研究通过转基因小鼠模型发现,短暂的内质网应激可自主促进小鼠β细胞增殖 | 揭示了转基因过表达、内质网应激、葡萄糖与β细胞周期激活之间的新联系 | 研究主要基于小鼠模型,人体β细胞的响应可能不同 | 探究内分泌胰腺实验性低血管化恢复是否能触发小鼠β细胞增殖 | 转基因小鼠的胰腺β细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 定量RT-PCR, 免疫染色 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 图像数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 872 | 2026-03-25 |
FOXE1 promotes the progression of pulp inflammation by activating PANoptosis in dental pulp cells
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115204
PMID:41869565
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研究论文 | 本研究揭示了FOXE1通过激活牙髓细胞中的PANoptosis来促进牙髓炎症进展的机制 | 首次在牙髓炎症中鉴定出PANoptotic牙髓细胞簇,并发现FOXE1是调控该过程的关键转录因子 | 未明确FOXE1调控PANoptosis的具体下游信号通路 | 探究PANoptosis在牙髓炎中的作用及调控机制 | 牙髓细胞、临床牙髓炎样本、小鼠实验性牙髓炎模型 | 单细胞组学 | 牙髓炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类临床牙髓炎样本、原代培养牙髓细胞、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 873 | 2026-03-25 |
Single-cell resolution spatial transcriptomic signature of the retrosplenial cortex during memory consolidation
2026-Apr, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03331-3
PMID:41188622
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学揭示了学习后压后皮层在空间记忆巩固过程中的分子特征和细胞类型特异性变化 | 首次在单细胞分辨率下解析了空间记忆巩固过程中压后皮层的转录组特征,并揭示了在阿尔茨海默病小鼠模型中学习诱导的神经元激活减少 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类转化的普适性有待验证;化学遗传学干预的时间窗口和特异性可能存在局限 | 探究压后皮层在空间记忆巩固过程中的转录组学变化及其在阿尔茨海默病中的异常 | 小鼠压后皮层神经元,特别是兴奋性神经元亚型 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病及相关痴呆 | 空间转录组学,化学遗传学,深度学习计算工具 | 深度学习模型 | 空间转录组数据,基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及正常成年小鼠和ADRD模型小鼠 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组学平台,用于解析细胞类型和兴奋性神经元层特异性的基因表达变化 |
| 874 | 2026-03-25 |
Genetic and chemical correction of cystic fibrosis reduces airway susceptibility to SARS-CoV-2
2026-Apr-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00223.2025
PMID:41556834
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研究论文 | 本研究利用iPSC衍生的囊性纤维化气道模型,探究CFTR调节剂ETI如何降低CF和非CF气道对SARS-CoV-2感染的易感性 | 首次在iPSC衍生的CF气道模型中揭示CFTR调节剂ETI通过增强I型干扰素信号和抗病毒基因表达,降低SARS-CoV-2感染和炎症反应 | 研究主要基于体外iPSC模型,需进一步在体内或临床环境中验证ETI的保护作用 | 探究CFTR调节剂ETI如何降低CF和非CF气道对SARS-CoV-2感染的易感性 | 囊性纤维化患者及iPSC衍生的CF和非CF气道上皮细胞 | 细胞生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | iPSC衍生的气道上皮模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 875 | 2026-03-25 |
Integration of TWAS with single-cell and spatial transcriptomics identifies TLR1 as a susceptibility gene and therapeutic target in the breast cancer tumor microenvironment
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150951
PMID:41713536
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研究论文 | 本研究通过整合TWAS、单细胞RNA测序和空间转录组学,识别了乳腺癌的易感基因并探讨了其在肿瘤微环境中的作用及作为治疗靶点的潜力 | 首次将TWAS与单细胞和空间转录组学技术结合,系统性地识别了乳腺癌易感基因,并深入分析了这些基因在肿瘤微环境中的细胞类型特异性表达及相互作用机制 | 研究主要基于公开数据库的汇总数据,缺乏实验验证;样本来源和种族背景可能有限,影响结果的普适性 | 识别乳腺癌的遗传易感基因,并探索其在肿瘤微环境中的功能机制及作为治疗靶点的可能性 | 乳腺癌患者组织样本及公开数据库中的eQTL和GWAS数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 转录组范围关联研究(TWAS)、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、GWAS汇总数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 876 | 2026-03-25 |
Postnatal upregulation of cyclooxygenase-2 (COX-2) drives anatomical closure of the ductus arteriosus
2026-Apr-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00647.2025
PMID:41730286
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析,揭示了环氧化酶-2(COX-2)在出生后动脉导管解剖闭合中的关键驱动作用 | 首次在单细胞水平上识别出出生后动脉导管平滑肌细胞的转录变化,并明确COX-2作为氧化应激和血栓素A诱导的关键分子,促进平滑肌细胞增殖和导管闭合 | 研究主要基于小鼠模型,人体相关性需进一步验证;COX-2抑制实验仅涉及早期出生后阶段,长期效应未评估 | 阐明出生后动脉导管解剖闭合的分子机制,特别是平滑肌细胞的作用 | 小鼠动脉导管平滑肌细胞(DASMCs)及出生后动脉导管组织 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),转录组分析,慢病毒过表达 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 小鼠动脉导管组织及平滑肌细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 877 | 2026-03-25 |
Exosomal miR-26a-5p From Urine-Derived Stem Cells Mitigates Renal Fibrosis via Targeting NRAS
2026-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202504385RR
PMID:41874363
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研究论文 | 本研究揭示了尿液来源干细胞外泌体中的miR-26a-5p通过靶向NRAS基因,抑制MAPK信号通路和机械微环境激活,从而缓解肾纤维化的分子机制 | 首次发现尿液来源干细胞外泌体中的miR-26a-5p通过靶向NRAS并抑制下游MAPK信号通路及机械信号分子(如PTK2、SRC等),从而减轻肾纤维化 | NA | 探究尿液来源干细胞外泌体中的miRNA是否能抑制肾纤维化及其分子机制 | 肾纤维化过程、尿液来源干细胞、外泌体、miR-26a-5p、NRAS基因 | 分子生物学 | 慢性肾病 | miRNA高通量测序、整合转录组分析、单细胞测序分析、双荧光素酶报告基因检测 | NA | 测序数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 878 | 2026-03-25 |
CCR8 Expression on Regulatory T Cells Reveals Trajectories of Tissue Adaptation and Protects Against Myocardial Infarction-Induced Tissue Damage
2026-Mar-24, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了心肌梗死后心脏内调节性T细胞的组织适应轨迹,并发现CCL1-CCR8轴对于Treg的募集和功能至关重要,从而保护心肌免受损伤 | 首次描绘了Treg从纵隔淋巴结到心脏的分化轨迹,并确立了CCL1-CCR8轴作为Treg募集和发挥心脏保护功能的关键通路 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证仍需进一步扩大样本量以确认临床普适性 | 探究心肌梗死后心脏特异性调节性T细胞的发育轨迹、募集机制及其在心脏修复中的作用 | 小鼠心肌梗死模型、调节性T细胞、CCR8和CCL1基因修饰小鼠、以及心肌梗死患者的血液和心脏组织 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及多种基因修饰小鼠模型及人类心肌梗死患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 879 | 2026-03-25 |
In Situ Needle-Free Injection of Multiretention Micelles for Melanoma Therapy with Multiomics Insights into Tumor Targeting and Immune Modulation
2026-Mar-24, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01481
PMID:41808385
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研究论文 | 本文报道了一种用于黑色素瘤治疗的无针原位注射多滞留纳米胶束平台,并通过多组学分析揭示了其靶向肿瘤和调节免疫的双重作用机制 | 开发了一种结合热触发局部沉积、pH响应释放和叶酸受体靶向的多滞留纳米胶束,并首次采用无针注射方式递送,同时利用单细胞测序、空间转录组学和蛋白质组学等多组学技术深入解析了其直接抑制肿瘤和重塑免疫微环境的双重作用机制 | NA | 开发一种新型的黑色素瘤治疗策略,旨在提高紫杉醇的局部暴露、减少全身毒性并增强抗肿瘤效果 | 黑色素瘤 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 880 | 2026-03-25 |
AutoGERN: Single-Cell RNA-Seq Gene Regulatory Network Inference via Explicit Link Modeling and Adaptive Architectures
2026-Mar-24, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag143
PMID:41871930
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研究论文 | 本文提出了AutoGERN,一种基于图神经网络(GNN)的框架,专门用于从单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据中推断基因调控网络(GRN) | AutoGERN通过显式建模调控信息、学习表达性链接嵌入,并采用双消息传递空间和自适应架构搜索,提高了GRN推断的性能和鲁棒性 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种能够从scRNA-seq数据中准确推断基因调控网络的方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 图神经网络(GNN),多层感知机(MLP) | 基因表达数据 | 多个真实scRNA-seq数据集(未指定具体数量) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |