单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 38991 篇文献，本页显示第 861 - 880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2026-04-24 |
Re-analysis of single-cell transcriptomics reveals a critical role of TNS1 gene in driving contractile VSMC transdifferentiation into macrophage-like SMC and atherosclerotic plaque instability
2026-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70664
PMID:42007508
|
研究论文 | 通过重新分析单细胞转录组数据，发现TNS1基因在驱动收缩型血管平滑肌细胞转分化为巨噬细胞样平滑肌细胞及动脉粥样硬化斑块不稳定中起关键作用 | 首次揭示TNS1基因在血管平滑肌细胞表型转换中的调控作用，并验证其通过促进巨噬细胞样平滑肌细胞转分化加剧斑块不稳定的机制 | 未提及具体局限性 | 探究血管平滑肌细胞转分化亚型对动脉粥样硬化进展和斑块不稳定的影响 | 动脉粥样硬化斑块中的血管平滑肌细胞 | 单细胞转录组学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | GSE155513和GSE253903数据集以及三个不稳定斑块转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 862 | 2026-04-24 |
The landscape of responses to neoadjuvant immunotherapy in resectable Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog-mutant lung adenocarcinoma: Clinical heterogeneity and correlative immunologic analysis
2026-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70670
PMID:42011021
|
研究论文 | 通过整合临床结果与单细胞RNA测序，分析KRAS突变肺腺癌对新辅助免疫治疗反应的异质性和免疫特征 | 首次在KRAS突变肺腺癌中结合临床预后与单细胞转录组，发现免疫抑制性CD4T_Treg_TNFRSF4亚群和新型耗竭样B细胞（Bex）与Th1细胞的协同网络，并阐明Treg与Th1/Bex平衡决定治疗疗效 | 单细胞RNA测序样本量较小（13例KRAS突变），且未进行功能验证实验 | 阐明KRAS突变肺腺癌对新辅助免疫治疗反应差异的免疫决定因素 | 可切除肺腺癌患者（143例临床队列，48例单细胞测序样本） | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 143例患者（106例KRAS野生型，37例KRAS突变型）；单细胞测序48例（13例KRAS突变，35例野生型） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 863 | 2026-04-24 |
Single-cell RNA sequencing and high-dimensional flow cytometry reveal distinct peripheral immune landscapes of type 1 autoimmune pancreatitis and pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70680
PMID:42011980
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和高维流式细胞术揭示1型自身免疫性胰腺炎与胰腺导管腺癌的外周免疫景观差异 | 首次利用单细胞RNA/BCR测序结合流式细胞术，鉴定了AIP患者PBMC中三种新型免疫细胞亚群（IgG4高表达转换记忆B细胞、Tfh细胞、TREM2上调中间单核细胞），并建立了基于这些亚群的诊断列线图 | 未明确说明，但可能涉及样本量较小（10例AIP患者）及外部验证队列的局限性 | 阐明AIP的外周免疫特征，区分其与PDAC的免疫差异，并寻找新的生物标志物用于疾病鉴别诊断 | 1型AIP患者、PDAC患者和健康志愿者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA/BCR测序（scRNA/BCR-seq），高维流式细胞术 | Boruta算法 | 基因表达数据 | 10例AIP患者（scRNA/BCR-seq）、13例PDAC患者和11例健康志愿者（公共数据） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 864 | 2026-04-24 |
Acupuncture inhibits astrocytic hyperactivationthe p38 mitogen-activated protein kinase/mitogen- and stress-activated protein kinase 1 signaling pathway in cerebral ischemia-reperfusion injury
2026-Apr, Journal of traditional Chinese medicine = Chung i tsa chih ying wen pan
DOI:10.19852/j.cnki.jtcm.2026.02.005
PMID:42015770
|
研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞测序分析，探究针刺通过p38 MAPK/MSK1信号通路抑制脑缺血再灌注损伤后星形胶质细胞过度活化的机制 | 首次揭示针刺通过调控p38 MAPK/MSK1通路促进星形胶质细胞从促炎A1型向修复A2型转化的新机制 | 研究仅在大鼠模型中进行，未涉及人体临床试验验证 | 阐明针刺治疗脑缺血再灌注损伤的分子机制 | 大脑中动脉闭塞诱导的脑缺血大鼠模型 | 数字病理学 | 脑缺血再灌注损伤 | 转录组测序、单细胞测序、免疫印迹、免疫组化 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 大鼠模型，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 865 | 2026-04-24 |
Zishen Huoxue Decoction alleviates myocardial ischemia-reperfusion injury through dysregulation of endoplasmic reticulum-mitochondria homeostasis mediated by DUSP1-NDUFS4
2026-Apr, Chinese journal of natural medicines
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/S1875-5364(26)61171-5
PMID:42019993
|
研究论文 | 研究滋肾活血方通过DUSP1-NDUFS4通路调控内质网-线粒体稳态缓解心肌缺血再灌注损伤的机制 | 首次揭示滋肾活血方通过DUSP1-NDUFS4轴调控内质网-线粒体稳态缓解心肌缺血再灌注损伤的新机制，并鉴定了其主要活性成分山奈酚的保护作用 | 未明确说明研究的局限性 | 探索滋肾活血方调控缺血再灌注心肌线粒体蛋白稳态及代谢活动的新分子靶点 | 心肌缺血再灌注损伤的动物模型和细胞模型 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞测序，代谢组学，网络药理学 | NA | 单细胞转录组数据，代谢组数据 | 涉及动物和细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 866 | 2026-04-24 |
[Advances in tumor-associated macrophage research driven by single-cell sequencing and spatial omics technologies]
2026-Apr, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:42020332
|
综述 | 本文综述了单细胞测序和空间组学技术在肿瘤相关巨噬细胞研究中的进展 | 利用单细胞RNA测序和空间组学技术识别多种转录上不同、功能特化的TAM亚群，超越了传统的M1/M2极化框架 | NA | 探讨单细胞和空间组学技术如何推动肿瘤相关巨噬细胞研究及精准免疫治疗策略开发 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAM）在各种实体肿瘤（包括胶质瘤、肝癌和乳腺癌）中的亚群 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 空间组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间组学 | NA | NA |
| 867 | 2026-04-24 |
Quercetin improves retinal glycolysis to slow myopia progression through orchestrating the AKT/FOXO/HK2 axis
2026-Mar-31, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104139
PMID:41980459
|
研究论文 | 本文研究了槲皮素通过调控AKT/FOXO/HK2轴改善视网膜糖酵解以延缓近视进展的机制 | 首次通过多组学分析（单细胞RNA测序、蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学）揭示AKT/FOXO/HK2通路在近视进展中抑制糖酵解，并发现槲皮素可通过调控该通路恢复糖酵解、减轻氧化应激和神经元损伤 | 研究主要基于豚鼠模型，结论是否适用于人类近视尚需进一步验证 | 探讨视网膜糖酵解变化引起的氧化损伤如何促进近视，并评估槲皮素缓解该过程的效果 | 豚鼠视网膜组织及细胞 | 数字病理学 | 近视 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、免疫共沉淀、双荧光素酶实验、代谢组学 | NA | 测序数据、蛋白质数据、代谢组数据 | 近视豚鼠视网膜样本（具体数量未说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 868 | 2026-04-24 |
TAZ alleviates ischemic stroke injury by activating Foxo1: Usp1-mediated deubiquitination is the pivotal mechanism
2026-Mar-30, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本文揭示了转录共激活因子TAZ通过Usp1介导的去泛素化稳定自身并激活Foxo1，从而减轻缺血性脑卒中氧化损伤和神经元凋亡的机制 | 首次发现Usp1-TAZ-Foxo1轴是缺血性脑卒中抗氧化防御和神经元存活的關鍵调控通路，并阐明了TAZ通过去泛素化稳定的分子机制 | 仅使用了小鼠模型和体外神经元损伤模型，研究结果尚需在临床样本中验证；机制细节如Usp1对TAZ的特异性调控仍需进一步探索 | 阐明转录共激活因子TAZ在缺血性脑卒中中调控氧化损伤的作用及其分子机制 | 缺血性脑卒中小鼠模型及氧糖剥夺/复氧神经元损伤模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠脑组织样本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 869 | 2026-04-24 |
Integrated single-cell and spatial mapping coupled with machine learning unveils core stemness landscapes and regulatory drivers in triple-negative breast cancer
2026-Mar-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04824-5
PMID:41870799
|
研究论文 | 整合单细胞和空间转录组数据，结合机器学习构建三阴性乳腺癌干细胞性景观及调控驱动因子模型 | 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习技术相结合，构建基于五个核心干性相关基因（CALD1, ANP32B, FIS1, CD82, APLP2）的预测模型，并揭示了高干性评分与不良预后及免疫逃逸的关联 | 研究主要基于公开数据集，缺乏独立的临床队列验证；虚拟敲除实验尚未在体内或体外模型中进行功能验证 | 解析三阴性乳腺癌中癌症干细胞相关干性特征的分子调控机制，并构建预测模型以指导个性化治疗 | 三阴性乳腺癌患者的单细胞、空间转录组和批量转录组数据 | 机器学习, 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组学 | XGBoost, 机器学习 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 870 | 2026-04-24 |
Maternal opioid use and hepatitis C infection disrupt the placental immune landscape and structure
2026-Mar-17, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199606
PMID:41842943
|
研究论文 | 利用流式细胞术、组织学、空间和单细胞转录组学揭示母体阿片类药物使用障碍对胎盘免疫景观和结构的破坏性影响 | 首次综合运用空间和单细胞转录组学技术，系统揭示阿片类药物使用障碍对胎盘血管发育、免疫细胞通讯和稳态维持的干扰，并进一步按丙型肝炎感染状态分层分析 | 未提及样本量、因果关系验证及临床转化潜力 | 探究母体阿片类药物使用障碍对胎盘结构和功能的影响 | 胎盘组织，包含伴有或不伴有丙型肝炎共感染的母体样本 | 数字病理学 | 阿片类药物使用障碍 | 流式细胞术、组织学、空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | 组织图像、基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium 空间转录组学, 10x Chromium 单细胞转录组学 |
| 871 | 2026-03-19 |
Dissecting the immunosuppressive microenvironment of LAMA3 + malignant cells and SPP1 + macrophages in esophageal squamous cell carcinoma using single-cell and spatial transcriptomics
2026-Mar-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08004-5
PMID:41845425
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 872 | 2026-03-18 |
Integrative bibliometrics and spatial transcriptomics identify CAF-associated genes and immune niches in hepatocellular carcinoma
2026-Mar-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04694-x
PMID:41838222
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 873 | 2026-04-24 |
SPP1high fibrogenic macrophages mediate protective fibrotic remodeling and promote vascular stability in hypertension-associated aortic dissection
2026-Mar-16, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04798-9
PMID:41840626
|
研究论文 | 本研究鉴定出SPP1高表达的促纤维化巨噬细胞在高血压相关主动脉夹层中促进保护性纤维化重塑和血管稳定性 | 首次发现TGF-β1-SPP1轴驱动SPP1高表达促纤维化巨噬细胞的出现，该细胞群通过促进胶原组织化和降低炎症因子表达来稳定剥离的主动脉壁 | 样本量较小（每组3例进行单细胞测序），且主要基于小鼠模型验证，临床转化需进一步研究 | 揭示高血压相关主动脉夹层中促进血管壁稳定的巨噬细胞状态及其治疗潜力 | 高血压相关主动脉夹层患者、马凡综合征相关主动脉夹层患者及健康捐献者的胸主动脉和外周血样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 单细胞测序每组3例（共9例），临床样本每组30例（共90例），手术中采集样本10例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 874 | 2026-04-24 |
IDH2 Clonal Hematopoiesis and IKAROS Loss Cooperate in a B-ALL Subtype after Lenalidomide Therapy for Multiple Myeloma
2026-03-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025031047
PMID:41824395
|
研究论文 | 该研究对57例来那度胺相关B细胞急性淋巴细胞白血病（LenB-ALL）进行了全面的分子特征分析，揭示了三种突变亚群，并发现IDH2 R140Q突变在LenB-ALL中高度富集 | 首次将来那度胺相关B-ALL定义为IDH2突变克隆造血与IKAROS缺失协同作用的分子亚型，并阐明了来那度胺通过促进IDH2突变克隆扩增及IKAROS下调导致B前体细胞成熟阻滞的致癌机制 | 研究样本量有限且为回顾性分析，未探索IDH2突变在不同种族人群中的差异，未明确继发白血病中其他遗传或表观遗传改变的具体类型 | 阐明来那度胺相关B-ALL的分子特征及致病机制 | 57例来那度胺治疗多发性骨髓瘤后继发B-ALL的患者标本 | 数字病理学 | B细胞急性淋巴细胞白血病, 多发性骨髓瘤 | NGS, RNA-seq, 甲基化测序, 单细胞RNA测序 | NA | DNA序列, RNA序列, 甲基化数据, 单细胞转录组数据 | 57例来那度胺相关B-ALL患者标本及对照样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 875 | 2026-04-24 |
Insights from pooled CRISPRi single-cell screens in K562 cells reveal gene functions, regulatory networks, and highlight opportunities and limitations
2026-Mar-13, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12667-1
PMID:41826830
|
研究论文 | 本研究利用改良的CRISPRi单细胞筛选技术在K562细胞中敲低六个转录因子，重建基因调控网络并评估技术潜力与局限性 | 优化CROP-seq方案实现sgRNA高效捕获，无需单独富集步骤，并揭示如LMO2-GATA2等新调控相互作用 | 仅约40-50%靶基因实现有效敲低，扰动效率存在实验间差异，需进一步优化标准化 | 评估联合CRISPRi和单细胞RNA测序的筛选技术在基因功能解析和调控网络重建中的潜力与局限性 | K562细胞系中的六个转录因子（LMO2、TCF3、LDB1、MYB、GATA2、RUNX1） | 功能性基因组学 | NA | CRISPRi、单细胞RNA测序、CROP-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | K562细胞系，具体样本数未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | CROP-seq | 改良CRISPR droplet sequencing (CROP-seq) 方案，从cDNA文库直接捕获sgRNA |
| 876 | 2026-04-24 |
The MDM2-p53 Axis in Osteosarcoma: Current Understanding of Regulatory Mechanisms and Targeted Therapeutic Strategies
2026-Mar-13, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph19030476
PMID:41901322
|
综述 | 系统阐述骨肉瘤中MDM2-p53通路的分子机制及靶向治疗策略 | 综述了新兴MDM2抑制剂（如APG-115）进入II期临床试验的突破进展，并引入单细胞测序和AI辅助药物设计加速开发 | 多数药物尚未在骨肉瘤专用队列中验证，早期抑制剂存在疗效有限与剂量限制性毒性 | 阐明MDM2-p53通路调控机制并总结靶向治疗策略 | 骨肉瘤患者及MDM2-p53通路相关分子机制 | 机器学习 | 骨肉瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 877 | 2026-04-24 |
Transcriptome combined with single-cell data to construct a prognostic model for glycosylation-related genes in osteosarcoma
2026-Mar-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04761-3
PMID:41820703
|
研究论文 | 结合转录组和单细胞数据构建骨肉瘤糖基化相关基因的预后模型 | 首次系统性地将单细胞RNA测序数据与转录组数据结合，鉴定骨肉瘤中糖基化相关基因的预后价值，并构建了基于LASSO回归的预后模型 | 未明确指出具体局限，但可能包括数据集样本量有限和模型验证不足 | 鉴定骨肉瘤中糖基化相关预后基因并构建预后模型，探索其分子机制 | 骨肉瘤患者样本（来自GSE36001、TARGET-OS、GSE21257和GSE152048数据集） | 机器学习 | 骨肉瘤 | 转录组测序、单细胞RNA测序 | LASSO回归、Cox比例风险模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量，但涉及多个公开数据集（GSE36001、TARGET-OS、GSE21257和GSE152048） | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 878 | 2026-04-24 |
Pericytes and mesenchymal stromal cells converge toward pro-tumor phenotypes in the tumor microenvironment
2026-Mar-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04790-y
PMID:41811593
|
综述 | 综述间充质基质细胞和周细胞在肿瘤微环境中向促肿瘤表型的趋同现象 | 提出了MSC-周细胞状态分类框架，强调了空间分辨多标志物分析的重要性 | 该领域仍需更多实验验证机制，且目前对表型趋同的理解还比较有限 | 探讨MSCs和周细胞在肿瘤微环境中功能趋同的角色及其对治疗的影响 | 肿瘤微环境中的间充质基质细胞和周细胞 | 分子生物学 | 结直肠癌, 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 879 | 2026-04-24 |
Comprehensive In Silico Investigation of L-Glutamine Transporters and Metabolism in Glioblastoma
2026-Mar-11, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph19030455
PMID:41901300
|
研究论文 | 通过计算生物学方法系统研究了胶质母细胞瘤中L-谷氨酰胺转运蛋白和代谢的调控机制 | 首次系统整合多组学数据（转录组、表观遗传、单细胞RNA测序等）鉴定了三个与谷氨酰胺代谢相关且具有预后意义的基因（CP、SLC25A13、SLC38A2），并揭示其通过不同机制驱动GBM恶性进展 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，缺乏独立实验验证，药物基因组学分析和分子对接仅作为辅助验证层 | 系统鉴定胶质母细胞瘤中与谷氨酰胺代谢相关且具有预后意义和生物学合理性的调控因子 | 胶质母细胞瘤（GBM）中谷氨酰胺代谢相关基因 | 机器学习 | 脑肿瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序、分子对接 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据、表观遗传数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和GTEx数据库的转录组数据，CGGA数据库的生存验证数据 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 880 | 2026-04-24 |
HIF3A-mediated aberrant activation of TXNIP promotes Alzheimer's disease progression
2026-Mar-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43404-z
PMID:41807716
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示HIF3A通过转录上调TXNIP介导阿尔茨海默病中星形胶质细胞的异常氧化应激反应 | 首次在单细胞水平上鉴定了星形胶质细胞中HIF3A作为关键氧化应激相关基因，并阐明其通过直接结合TXNIP启动子促进阿尔茨海默病进展的分子机制 | NA | 探究阿尔茨海默病中细胞类型特异性的氧化应激机制 | 星形胶质细胞中HIF3A和TXNIP的调控关系 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |