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当前共找到 37491 篇文献,本页显示第 861 - 880 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
861 2026-03-09
A spatiotemporal atlas of cerebrovascular development in zebrafish
2026-Jan-31, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究结合原位测序、单细胞转录组学和3D血管重建技术,构建了斑马鱼大脑内皮发育的时空图谱 首次将原位测序、单细胞转录组学和3D血管重建技术整合,实现了分子、细胞和结构尺度的多维度映射,并发现了三个未表征的CapEC富集基因对血管模式和血脑屏障完整性的调控作用 研究仅聚焦于斑马鱼3-11天发育阶段,未覆盖全生命周期;功能验证仅限于三个基因,可能存在其他重要调控因子未被发现 解析脊椎动物脑血管发育的分子和细胞动力学机制 斑马鱼大脑内皮细胞 空间转录组学 NA 原位测序, 单细胞转录组学, 3D血管重建 NA 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 3D成像数据 斑马鱼3-11天发育阶段样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
862 2026-03-09
Neoadjuvant modified FOLFIRINOX plus nivolumab in borderline-resectable pancreatic ductal adenocarcinoma: a pilot phase 1 trial
2026-Jan-31, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究是一项单臂、前瞻性Ib/II期临床试验,评估了改良FOLFIRINOX联合纳武利尤单抗作为新辅助治疗方案在交界性可切除胰腺导管腺癌患者中的安全性和病理学反应率 首次在交界性可切除胰腺导管腺癌患者中探索改良FOLFIRINOX联合免疫检查点抑制剂(纳武利尤单抗)的新辅助治疗方案,并通过空间转录组学等分析揭示了治疗后肿瘤微环境中浆细胞和CD8 T细胞的增加及免疫细胞组成的特定变化 这是一项单臂、非随机、样本量较小的试点研究,缺乏对照组直接比较,且为研究者发起的研究,可能限制结果的普适性 评估改良FOLFIRINOX联合纳武利尤单抗新辅助治疗在交界性可切除胰腺导管腺癌中的安全性、病理学反应率及临床疗效 交界性可切除胰腺导管腺癌患者 数字病理学 胰腺癌 基因表达分析、免疫组织化学、空间转录组学 NA 临床数据、基因表达数据、空间转录组数据、病理图像 28名患者 NA 空间转录组学 NA NA
863 2026-03-09
Molecular signatures of resilience to Alzheimer's disease in neocortical layer 4 neurons
2026-Jan-31, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过单细胞核和空间转录组学技术,识别了阿尔茨海默病中具有韧性的神经元群体,并揭示了KCNIP4作为关键韧性因子在早期病理阶段的作用机制 首次在阿尔茨海默病中,结合单细胞核与空间转录组学,系统性地识别了大脑皮层第四层神经元中的韧性分子特征,并发现KCNIP4作为新的关键韧性因子,通过调控神经元过度兴奋性发挥保护作用 研究主要基于男性App小鼠模型进行验证,未在女性模型或更广泛的人群中验证,且机制研究局限于KCNIP4的过表达效应,其他韧性基因的功能尚未深入探索 探究阿尔茨海默病中神经元韧性的分子基础,识别关键韧性因子及其保护机制 阿尔茨海默病患者大脑皮层神经元,特别是早期受影响(前额叶皮层、楔前叶)和晚期受影响(初级视觉皮层)的区域 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞核转录组学, 空间转录组学 NA 转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及阿尔茨海默病患者大脑皮层多个区域 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
864 2026-03-09
ACACA modulates R-loop homeostasis to enhance lipid metabolism and microenvironmental interactions in ccRCC
2026-Jan-31, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过整合转录组和临床数据,发现ACACA通过调节R-loop稳态来增强脂质代谢和微环境相互作用,从而驱动透明细胞肾细胞癌的进展 首次揭示ACACA作为R-loop相关代谢驱动因子,连接基因组应激与脂质重编程及肿瘤微环境重塑在ccRCC中的作用机制 研究主要基于公共数据集和体外实验,缺乏大规模临床样本验证和更深入的机制探索 探究R-loop在透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中的作用及其与代谢重编程的关联 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的肿瘤微环境、R-loop结构和ACACA基因 生物信息学与计算生物学 肾细胞癌 转录组测序、单细胞转录组学、空间转录组学、ssGSEA分析 线性机器学习算法 转录组数据、临床数据、单细胞数据、空间转录组数据 公共ccRCC转录组和临床数据集(未明确具体样本数) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
865 2026-03-09
Kynurenine mediates the chemotherapy-induced intestinal toxicity through modulation of gut microbiota
2026-Jan-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文揭示了化疗诱导的肠道毒性中,血清L-犬尿氨酸通过调节肠道菌群加剧损伤的机制 首次发现L-犬尿氨酸通过驱动肠道菌群失调(特别是乳杆菌的减少)并激活TNFα/JNK通路,介导化疗诱导的肠道毒性 研究主要基于小鼠模型和患者血清样本,临床转化和具体干预策略的有效性需进一步验证 探究化疗诱导肠道毒性的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 化疗患者血清样本、小鼠模型、骨髓细胞 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因敲除模型 NA 基因表达数据、血清代谢物数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
866 2026-03-09
Deficiency of SMARCB1 drives an immunosuppressive microenvironment in meningioma
2026-Jan-24, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本研究揭示了SMARCB1缺陷通过调控IL-17/CSF1轴驱动脑膜瘤免疫抑制微环境中CD163+巨噬细胞浸润的机制 首次将SMARCB1突变与脑膜瘤免疫抑制微环境联系起来,并发现IL-17/CSF1轴是介导CD163+巨噬细胞浸润的关键通路 样本量相对有限(共148例患者),机制研究主要基于公共数据库分析和体外实验验证,缺乏体内功能验证 探究脑膜瘤免疫抑制微环境的形成机制及其与SMARCB1突变的关系 脑膜瘤患者(包括不同WHO分级和疾病状态)的肿瘤组织和血清样本 肿瘤免疫学 脑膜瘤 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、全外显子测序、免疫组化染色、多重免疫荧光染色 NA 基因组数据、转录组数据、蛋白质表达数据、空间分布数据 148例脑膜瘤患者(113例预后队列,35例验证队列) NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, whole exon sequencing NA NA
867 2026-03-09
Single-nucleus multiple-organ chromatin accessibility landscape in the adult rat
2026-Jan-21, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 本研究通过单核ATAC测序技术构建了成年大鼠多器官染色质可及性图谱,识别了77种细胞类型,并分析了细胞类型和器官特异性转录因子、内皮与基质细胞的共享与特异性特征、跨器官巨噬细胞调控状态以及跨物种基因调控程序的保守性与特异性 首次系统性地生成了大鼠多器官单核染色质可及性图谱,填补了该重要生物医学模型生物在此领域的空白,并进行了跨器官和跨物种的细胞类型注释与功能推断 NA 构建大鼠多器官染色质可及性图谱,以解析组织特异性调控机制并支持大鼠模型在系统生物学和生物医学研究中的更广泛应用 成年大鼠(Rattus norvegicus)的9个器官 基因组学 NA 单核ATAC测序(snATAC-seq) NA 染色质可及性数据 超过110,000个细胞,来自9个器官的25个文库 NA 单核ATAC-seq NA NA
868 2026-03-09
Single-cell profiling of peripheral and local immune compartments reveal unique genotype-independent prognostic immune signatures across isocitrate dehydrogenase-stratified glioma
2026-Jan-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析IDH突变型和野生型胶质瘤的局部与外周免疫环境,揭示了独特的基因型无关预后免疫特征 首次在IDH分层胶质瘤中系统比较局部与外周免疫细胞图谱,并鉴定出GZMH+ CD8+ T细胞等新型免疫细胞亚群及基因型无关的预后标志 样本量较小(仅18例),且未验证免疫特征在独立队列中的预后价值 揭示胶质瘤中局部与外周免疫环境的差异及其与IDH基因型的关联 IDH突变型和野生型胶质瘤患者的肿瘤组织与外周血单个核细胞 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 18例胶质瘤患者(6例IDH突变型,12例IDH野生型) NA 单细胞RNA-seq NA NA
869 2026-03-09
YBX1&YBX3 as novel targets to potentiate immune checkpoint blockade response in gliomas
2026-Jan-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究揭示了CHK2-YBX1&YBX3调控枢纽在胶质母细胞瘤免疫逃逸中的作用,并证明靶向该枢纽可增强免疫检查点阻断疗法的疗效 首次将CHK2、YBX1和YBX3定义为胶质瘤内在免疫抑制程序的核心调控枢纽,并提出通过靶向该枢纽来增强免疫检查点阻断疗法反应的新策略 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证;机制研究虽深入,但具体下游信号通路细节仍需进一步阐明 探究胶质母细胞瘤抵抗CD8⁺ T细胞杀伤的肿瘤内在机制,并寻找增强免疫检查点阻断疗法疗效的新靶点 人源和小鼠胶质瘤细胞系、临床前胶质瘤模型、人类胶质母细胞瘤肿瘤样本 肿瘤免疫学、分子生物学 胶质母细胞瘤 免疫沉淀-质谱联用、磷酸化蛋白质组学、批量RNA测序、染色质免疫沉淀测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 蛋白质相互作用数据、转录组数据、表观遗传数据、单细胞基因表达数据、空间基因表达数据 未明确说明具体样本数量,但涉及人类和小鼠胶质瘤细胞以及人类GBM肿瘤样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 NA NA
870 2026-03-09
Identification of cancer-associated fibroblasts and analysis of the association of origin with endothelial-to-mesenchymal transition in hepatocellular carcinoma
2026-01, Scandinavian journal of gastroenterology IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过免疫组化、免疫荧光和空间转录组学技术,探讨了肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞的起源及其与内皮-间质转化的关联 首次结合Visium和Visium HD空间转录组学技术,揭示了内皮细胞通过EndoMT转化为CAFs的潜在机制,并识别了CTGF作为关键分子决定因素 样本量较小(仅57例HCC组织),且研究主要基于间接组织分布观察和相关性分析,缺乏直接的体内功能验证 探究肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞的细胞起源及其分子决定因素,以期为HCC的分子靶向治疗提供依据 肝细胞癌组织样本及其中的癌症相关成纤维细胞和内皮细胞 数字病理学 肝细胞癌 免疫组织化学染色、免疫荧光双染色、空间转录组学 NA 组织图像、空间转录组数据 57例肝细胞癌组织 10x Genomics 空间转录组学 Visium, Visium HD Visium和Visium HD空间转录组学平台
871 2026-03-09
Workshop Introduction: Advances of AI Methods in Single Cell Spatial Omics
2026, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
workshop introduction 本次研讨会聚焦于人工智能方法在单细胞空间组学中的最新进展与应用 强调AI和机器学习在空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学中的前沿应用,包括数据整合、细胞间相互作用建模等 NA 促进AI方法在单细胞空间组学领域的发展与应用,推动疾病研究和精准医学 空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据 machine learning NA NA NA 空间组学数据 NA NA 单细胞空间组学 NA NA
872 2026-03-09
Unveiling the Role of SLC6A17 in Lung Adenocarcinoma: Prognosis, Pathways, and Therapeutic Implications
2026, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了SLC6A17基因在肺腺癌中的异常表达、预后价值、相关通路及治疗意义 首次系统性地研究了SLC6A17在肺腺癌中的表达模式、预后关联、免疫浸润相关性及药物反应,并利用单细胞测序数据进行了深入分析 研究主要基于公共数据库和细胞系数据,缺乏大规模临床样本的直接验证,且机制研究有待进一步深入 阐明SLC6A17在肺腺癌中的作用,评估其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 肺腺癌患者数据、细胞系 生物信息学 肺癌 生物信息学分析、qRTPCR、单细胞测序数据分析 NA 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 TCGA数据库中的肺腺癌患者数据、GSE87340数据集、多种细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
873 2026-03-09
Single-cell sequencing reveals reversible glial remodeling in the visual cortex during visual deprivation and recovery
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了视觉剥夺和恢复期间视觉皮层中非神经元细胞(如小胶质细胞和少突胶质细胞)的可逆性重塑过程 首次在豚鼠模型中利用单细胞测序全面描绘了视觉皮层在视觉剥夺和恢复过程中的动态转录组变化,并揭示了小胶质细胞-少突胶质细胞轴在皮质可塑性中的关键作用 研究仅基于豚鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证;样本量相对较小,可能影响统计效力 全面表征视觉剥夺和恢复过程中视觉皮层非神经元细胞的动态变化 豚鼠的初级视觉皮层(V1) 数字病理学 近视 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫荧光,定量PCR,Western blotting,透射电子显微镜 轨迹推断,细胞间通讯映射 转录组数据,图像数据 三组豚鼠:正常对照组(NC)、形觉剥夺组(FDM;5周单眼剥夺)、恢复组(REC;4周剥夺后1周恢复视觉) NA 单细胞RNA-seq NA NA
874 2026-03-09
Integrating multi-omics and machine learning to unravel mechanisms of lymph node metastasis in papillary carcinoma with and without thyroiditis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,揭示了伴有和不伴有甲状腺炎的甲状腺乳头状癌淋巴结转移的机制差异 首次在单细胞分辨率下比较了PTC-blank和PTC-thyroiditis的分子和细胞异质性,识别了与淋巴结转移相关的关键驱动因素,并开发了一个17基因预测模型 研究依赖于公共数据库数据,可能受到样本选择和批次效应的影响,且预测模型需要在前瞻性临床队列中进一步验证 比较PTC-blank和PTC-thyroiditis的分子和细胞异质性,识别淋巴结转移的关键驱动因素,并开发临床预测模型 甲状腺乳头状癌患者,根据是否伴有甲状腺炎分为PTC-blank和PTC-thyroiditis两组 机器学习和计算生物学 甲状腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 孟德尔随机化, 分子对接 LASSO, 随机森林, KNN 基因表达数据, 单细胞转录组数据 TCGA数据库的批量RNA-seq数据和GSE184362的单细胞RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
875 2026-03-09
Identification of FTO as a key m6A demethylase linking immune dysregulation to sepsis pathogenesis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过生物信息学和实验分析,识别出FTO作为脓毒症的关键m6A去甲基化酶,并揭示了其在免疫失调和脓毒症发病机制中的作用 首次通过多机器学习算法共识特征选择,将FTO确定为脓毒症的潜在诊断生物标志物和m6A甲基化调节因子,并利用单细胞RNA测序数据阐明其在免疫细胞亚群中的分布和功能 研究主要基于公开转录组数据集和体外模型,缺乏大规模临床队列验证和体内实验证据 识别脓毒症的潜在诊断生物标志物并阐明其分子机制 脓毒症患者和健康对照的转录组数据,以及体外巨噬细胞和中性粒细胞模型 生物信息学 脓毒症 转录组测序,单细胞RNA测序(scRNA-seq) LASSO,机器学习算法 基因表达数据 五个公开转录组数据集(GSE13904,GSE26440,GSE28750,GSE95233,GSE57065)中的脓毒症和健康对照样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
876 2026-03-09
A multi-dimensional omics framework identifies GPR35 as a driver of M2 macrophage activation and poor prognosis in colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多队列单细胞RNA测序数据,构建了结直肠癌肿瘤微环境的综合图谱,识别出GPR35作为M2巨噬细胞激活的关键驱动因子,并与不良预后及免疫治疗抵抗相关 首次通过单细胞多组学框架将GPR35鉴定为结直肠癌中M2巨噬细胞激活和免疫逃避的细胞内在驱动因子,并验证其作为免疫治疗抵抗的生物标志物 研究主要基于生物信息学分析,体内功能验证和临床转化应用仍需进一步实验 探究结直肠癌肿瘤微环境中驱动免疫逃避的机制,并识别新的治疗靶点 结直肠癌患者肿瘤样本中的单细胞转录组数据 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 非负矩阵分解, WGCNA 单细胞转录组数据 多队列结直肠癌患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
877 2026-03-09
Identification of public neoantigens with broad HLA class I coverage as candidates for off-the-shelf cancer vaccine development in colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合TCGA突变数据和HLA I类结合预测,开发了一个结直肠癌特异性、即用型新抗原面板,并在越南患者队列中进行了功能验证 开发了一个针对亚洲和高加索人群、具有广泛HLA I类覆盖的结直肠癌即用型新抗原面板,并首次在越南患者队列中对TP53_R273H新抗原进行了功能免疫原性验证 研究队列规模有限(n=67),功能验证仅在7名患者中进行,需要更大规模、多人群的临床研究来确认面板的普适性和疗效 开发一种具有广泛人群覆盖和功能验证的即用型癌症疫苗新抗原面板,用于结直肠癌免疫治疗 结直肠癌患者,特别是亚洲和高加索人群,以及患者来源的CD8⁺ T细胞 癌症免疫学 结直肠癌 TCGA突变数据分析,HLA I类结合预测,IFN-γ ELISpot检测,单细胞RNA测序 NA 基因组突变数据,HLA分型数据,免疫反应功能数据,单细胞转录组数据 TCGA数据库的结直肠癌突变数据,越南结直肠癌患者队列(n=67),其中7名患者进行了功能验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
878 2026-03-09
PAH-former: Transfer learning for efficient discovery of pulmonary arterial hypertension-associated genes
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究开发了一个名为PAH-former的迁移学习平台,用于从有限的公开单细胞RNA测序数据中高效发现与肺动脉高压相关的基因 通过微调Geneformer深度学习模型,创建了专门针对肺动脉高压的PAH-former模型,并利用其进行计算机模拟扰动分析来识别新的疾病相关基因 研究依赖于公开可用的有限患者样本数据,且体外验证仅在人类肺动脉内皮细胞中进行 高效识别肺动脉高压的新型功能相关疾病基因 肺动脉高压相关的基因 机器学习 肺动脉高压 单细胞RNA测序 深度学习模型(基于Geneformer) 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
879 2026-03-09
<em>IGHG1, HLA-DOB, </em>and <em>GABBR1</em>: Genetic Insights into Rheumatoid Arthritis Using Mendelian Randomisation and Single-Cell RNA Sequencing
2026-Jan, Journal of the College of Physicians and Surgeons--Pakistan : JCPSP
研究论文 本研究通过整合差异基因表达分析、孟德尔随机化和单细胞RNA测序,识别了与类风湿关节炎相关的关键基因,并探索了其在疾病发病机制中的作用 首次将孟德尔随机化与单细胞RNA测序结合,识别出GABBR1这一G蛋白偶联受体与类风湿关节炎的新关联,揭示了其在免疫调节和炎症中的复杂作用 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量可能有限,影响结果的普适性 识别类风湿关节炎的关键基因并探索其在疾病发病机制中的作用,以提出新的治疗靶点 类风湿关节炎患者与健康对照的基因表达数据,特别是滑膜组织的单细胞转录组数据 生物信息学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 差异基因表达分析 线性模型(limma包) 基因表达谱, 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,数据来源于公共数据库(GEO、GWAS Catalogue、NIH ImmPort) NA 单细胞RNA测序 NA NA
880 2026-03-09
Novel Acinar Metaplastic States Uncovered in Exocrine Pancreas Disease
2025-Dec-25, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组和空间转录组技术,全面定义了外分泌胰腺疾病中腺泡细胞的化生反应,揭示了新的化生状态及其与胰腺癌前病变的关联 发现了跨疾病背景的保守腺泡反应程序,识别了先前未知的“门户”ADM群体和早期PanIN病变中的癌症亚型特征,并建立了未解决的ADM与免疫重塑之间的联系 研究主要基于小鼠模型,人类组织验证样本有限;空间转录组技术(CosMx)可能受分辨率限制 全面定义临床相关外分泌胰腺疾病(增加癌症风险)中的化生反应 小鼠胰腺疾病模型(急性、复发性、慢性胰腺炎及致癌Kras模型)和人类胰腺组织 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 超过300,000个单细胞 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA 使用了FixNCut方法以在酶丰富的组织中保持RNA完整性,并采用CosMx进行人类组织的空间转录组验证
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