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当前共找到 39398 篇文献，本页显示第 861 - 880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2026-05-05 |
Developmental neurotoxicity of thyroid hormone system-disrupting chemicals: a systems-level exploration using multi-omics approach
2026-05, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-026-04303-4
PMID:41654649
|
研究论文 | 本研究利用多组学方法系统探索甲状腺激素系统干扰化学物质对发育神经毒性的影响 | 创新性地将蛋白质组学、代谢组学和空间转录组学结合，从系统层面揭示两种不同作用机制的THSDCs（PTU和PCN）对孕鼠及后代大脑发育的分子扰动，并发现尽管作用模式不同，但在脑内能量代谢和细胞骨架组织方面存在汇聚性扰动 | 主要针对单一物种（大鼠）和两种THSDCs，可能无法完全代表人类和更广泛化学物质的暴露情况，且PCN暴露未观察到明显不良毒理学效应，难以直接外推其神经发育风险 | 探究甲状腺激素系统干扰化学物质如何通过破坏特定分子靶点影响母体甲状腺激素稳态和后代大脑发育 | 孕鼠及其后代，包括甲状腺、肝脏和大脑等靶器官 | 数字病理学 | 神经发育疾病 | 蛋白质组学、代谢组学、空间转录组学 | NA | 蛋白质组、代谢组、空间转录组数据 | 孕鼠接受PTU（2.4 mg/kg/天）或PCN（300 mg/kg/天）处理，涉及母鼠和后代多个时间点样本，具体数量未明确 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 862 | 2026-05-05 |
Evidence of off-target probe binding affecting 10x Genomics Xenium gene panels compromise accuracy of spatial transcriptomic profiling
2026-May-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.107070
PMID:42065925
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研究论文 | 通过开发离线探针追踪工具（OPT），验证10x Genomics Xenium平台存在脱靶结合，并评估其对空间转录组分析准确性的影响 | 首次系统评估Xenium探针的脱靶结合现象，开发OPT工具通过多参考基因组比对预测脱靶位点，并结合正交实验验证其生物学效应 | 仅使用乳腺癌数据集验证，未涵盖其他组织类型；脱靶预测依赖参考基因组的完整性和注释质量 | 评估探针型空间转录组技术中脱靶结合对基因表达谱准确性的影响 | 10x Genomics Xenium技术的探针结合特异性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 序列比对算法 | 基因表达数据 | 1个乳腺癌肿瘤块样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium, Visium CytAssist, 3'单细胞RNA-seq | Xenium人类乳腺基因面板、Visium CytAssist空间转录组、3'单细胞RNA-seq |
| 863 | 2026-05-05 |
Niacin promotes motor function recovery after spinal cord injury via Hcar2-dependent microglia immunometabolic regulation
2026-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70683
PMID:42068080
|
研究论文 | 探讨烟酸通过Hcar2依赖的小胶质细胞免疫代谢调控促进脊髓损伤后运动功能恢复的作用 | 首次发现Hcar2作为脊髓损伤后小胶质细胞中保守的代谢检查点，通过免疫代谢重编程将促炎表型转化为抗炎表型，并用烟酸激活Hcar2来改善运动功能恢复 | 未明确说明主要局限性，但依赖小鼠和猕猴模型，体外实验使用BV2细胞系，可能不完全反映人类病理过程 | 研究Hcar2在脊髓损伤中的作用及其通过烟酸激活对运动功能恢复的影响 | 小鼠和恒河猴的脊髓损伤模型，以及LPS诱导的BV2小胶质细胞模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，免疫荧光染色，Western印迹，实时聚合酶链反应 | NA | 基因表达数据，图像数据 | 公开的小鼠和恒河猴单细胞RNA测序数据集，小鼠体内模型和BV2细胞体外模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 864 | 2026-05-05 |
Excitatory neurons and astrocytes-specific dysregulation and aberrant interactions are vulnerable to FCDI as suggested by single-cell spatial transcriptomics
2026-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70673
PMID:42068085
|
研究论文 | 通过单细胞空间转录组学分析，揭示FCDI中兴奋性神经元和星形胶质细胞的特异性失调及异常相互作用 | 构建了FCDI患者致癫痫皮层的单细胞空间转录组图谱，首次识别CBLN2highEx-1亚群在神经元过度兴奋和皮层发育中的潜在作用，并发现了兴奋性神经元与星形胶质细胞间的异常信号通路和空间共定位模式 | 样本量较小（仅3例FCDI患者和3例对照），且未提及验证队列或功能实验的直接因果证据 | 探索FCDI的分子机制，特别是兴奋性神经元和星形胶质细胞的失调及其细胞间通讯异常 | FCDI患者的致癫痫皮层组织和相对正常的皮层对照组织 | 数字病理学 | 局灶性皮质发育不良I型（癫痫相关神经发育障碍） | 单核RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质印迹, 免疫荧光分析 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 3例FCDI患者和3例对照的皮层组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 865 | 2026-05-05 |
Integrated Single-Cell Whole-Genome Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal Intratumoral Heterogeneity in Ovarian Cancer
2026-May-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0795
PMID:42007974
|
研究论文 | 本研究通过单细胞全基因组测序和空间转录组学分析揭示了卵巢癌的瘤内异质性 | 首次整合单细胞全基因组测序与空间转录组学，从基因组和转录组两个层面解析卵巢癌瘤内异质性，并发现基因组不稳定性驱动的克隆异质性与可塑性 | 仅纳入五例晚期初治原发性上皮性卵巢癌样本，样本量较小；研究未涉及肿瘤微环境对异质性的影响 | 探究卵巢癌中由基因组不稳定性驱动的瘤内异质性及其对疾病复发和治疗失败的影响 | 五例晚期初治原发性上皮性卵巢癌（包括高级别浆液型和透明细胞型）样本 | 基因组学, 空间转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞全基因组测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞DNA测序数据, 空间转录组数据 | 5例卵巢癌组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 866 | 2026-05-05 |
Normalization choice drives biological interpretation in single-cell RNA-seq cancer studies: A systematic benchmarking of 465 computational pipelines
2026-May-01, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 系统比较单细胞RNA-seq数据分析中不同计算流程对生物学解释的影响 | 引入生物不一致性评分（BDS）来量化标记基因解释在不同分析流程中的变化，发现归一化方法选择对生物学解释的影响大于聚类算法选择，且高聚类一致性的流程可能识别出高达86%不同的标记基因 | 未提及具体局限性 | 评估单细胞RNA-seq数据分析中计算流程选择对肿瘤研究生物学结论的影响 | 3个癌症数据集，涵盖超过43.4万个细胞 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过43.4万个细胞（来自3个癌症数据集） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 867 | 2026-05-05 |
Blockade of Tumor TAK1 Induces DNA Damage and Immunogenic cGAS-STING Pathway Activation in Pancreatic Cancer
2026-May-01, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2026.04.017
PMID:42070691
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤TAK1在胰腺癌中维持基因组完整性的关键作用，阻断TAK1可诱导DNA损伤和cGAS-STING通路激活，从而增强免疫检查点阻断疗效 | 首次发现TAK1通过磷酸化EphA2和RAD51维持DNA损伤修复，阻断TAK1能将免疫‘冷’肿瘤微环境转变为‘热’肿瘤微环境 | NA | 探索胰腺导管腺癌中TAK1作为治疗靶点以逆转免疫抑制性肿瘤微环境 | 人类胰腺癌样本、基因工程小鼠模型、肿瘤与T细胞共培养体系 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫组化、流式细胞术、蛋白质组学 | NA | 图像、文本 | 人类胰腺癌样本（未提供具体数量）及基因工程小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |
| 868 | 2026-05-05 |
Unraveling the role of non-coding RNAs in Parkinson's disease: Molecular mechanisms and therapeutic insights
2026-Apr-30, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2026.106963
PMID:42067182
|
综述 | 本文系统总结了非编码RNA（miRNA、lncRNA和circRNA）在帕金森病发病机制中的分子调控作用，并探讨其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 整合了从单细胞测序和多组学数据中发现的非编码RNA细胞特异性失调模式，并提出了基于ncRNA的分子分层和靶向治疗策略 | 未涉及非编码RNA在帕金森病中直接用于临床治疗的验证数据，也缺乏跨病理阶段的纵向研究支持 | 阐明非编码RNA在帕金森病中的分子机制及其作为早期诊断和治疗靶点的潜力 | 帕金森病患者脑组织中的非编码RNA（miRNA、lncRNA和circRNA）及其调控网络 | 机器学习 | 帕金森病 | 单细胞测序、多组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学 | NA | NA |
| 869 | 2026-05-05 |
Integrated single-cell transcriptomics and in vivo investigation reveal the role of ANXA1 in intestinal barrier dysfunction during heat stroke by mediating neutrophil-monocyte interaction and regulating the TLR4/ERK/NF-κB pathway
2026-Apr-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153873
PMID:42070539
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和体内实验，揭示了ANXA1在中暑引起的肠道屏障功能障碍中通过调节中性粒细胞-单核细胞相互作用和TLR4/ERK/NF-κB通路的作用 | 首次整合单细胞RNA测序和体内实验，阐明了ANXA1通过中性粒细胞-单核细胞相互作用和TLR4/ERK/NF-κB通路保护肠道屏障的机制，并确定了ANXA1-FPR2为关键轴 | 未提供显著局限性 | 研究ANXA1在中暑引起的肠道屏障功能障碍中的作用机制 | 中暑患者和健康对照者的单细胞转录组数据，以及小鼠中暑模型中的结肠组织 | 数字病理学 | 中暑 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 中暑患者和健康对照组，以及小鼠中暑模型（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 870 | 2026-05-05 |
Kidney Hematopoietic Stem and Progenitor Cells Contribute to Myeloid Development and Pathology in Lupus Nephritis
2026-Apr-28, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70201
PMID:42047318
|
研究论文 | 探讨肾脏驻留造血干细胞和祖细胞在狼疮性肾炎中对髓系发育和病理的贡献 | 首次证明肾脏中的造血干细胞和祖细胞参与髓外造血，并通过局部髓系细胞扩增促进狼疮性肾炎进展 | 主要基于小鼠模型，人源样本分析有限，可能需要进一步验证临床相关性 | 研究髓外造血和肾脏驻留造血干细胞和祖细胞在狼疮性肾炎发病机制中的作用 | 狼疮性肾炎小鼠模型（MRL/lpr和TLR7激动剂诱导）及患者尿液样本 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序、免疫染色、过继转移实验 | NA | 序列数据、图像数据 | 两种小鼠模型及狼疮性肾炎患者尿液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于肾脏和骨髓祖细胞分析 |
| 871 | 2026-05-05 |
Myeloid Cell States in Influenza-Associated Pulmonary Aspergillosis Are Shaped by Iron Overload and Metabolic Reprogramming
2026-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.22.720189
PMID:42079193
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研究论文 | 结合小鼠模型和单细胞RNA测序探究流感相关肺曲霉病中髓系细胞功能紊乱及铁超载和代谢重编程的作用 | 首次通过单细胞转录组学揭示铁超载驱动的免疫代谢重编程在流感诱导的肺曲霉病中导致髓系细胞抗真菌功能受损 | 仅基于小鼠模型和单细胞RNA测序数据，可能不完全反映人类复杂的免疫反应 | 揭示流感病毒预感染如何通过铁代谢和代谢重编程破坏髓系细胞抗真菌功能，增加继发性曲霉病易感性 | 小鼠模型中的肺单核细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺部感染 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（未提供具体数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 872 | 2026-05-05 |
SIV infection disrupts the spatial cellular and communication networks of pulmonary granulomas during SIV/Mtb co-infection
2026-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.24.720743
PMID:42079194
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研究论文 | 利用空间转录组学比较SIV/Mtb共感染猕猴肺部肉芽肿的细胞和通讯网络，探究HIV如何破坏肉芽肿的空间免疫功能 | 首次在SIV/Mtb共感染模型中，通过空间转录组学揭示HIV干扰了肺部肉芽肿内部髓系和T细胞区域的空间分化模式，并指出抗逆转录病毒治疗无法完全恢复这些免疫网络 | 未提供具体限制信息 | 研究HIV/Mtb共感染中肺部肉芽肿的免疫相互作用，以及抗逆转录病毒治疗的影响 | SIV/Mtb共感染猕猴的肺部肉芽肿 | 数字病理学 | 肺结核、HIV共感染 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 猕猴样本，具体数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 873 | 2026-05-05 |
Unique nasal cell states induced by common pediatric respiratory viruses
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.20.719671
PMID:42079074
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序绘制了儿童鼻黏膜病毒感染的细胞图谱，揭示了不同呼吸道病毒诱导的独特鼻细胞状态 | 首次在单细胞分辨率下比较SARS-CoV-2、鼻病毒和RSV对儿童鼻黏膜的重塑，发现RSV特有的鳞状样上皮亚群和病毒特异性免疫响应程序 | 限于儿童早期病例，未包含年龄较大儿童或成人，且样本主要来自单一地区 | 阐明常见儿童呼吸道病毒如何以细胞分辨率重塑鼻黏膜及其与疾病严重程度和哮喘风险的关联 | 5岁以下儿童鼻黏膜中的335174个鼻腔上皮和免疫细胞 | 单细胞基因组学 | 呼吸道病毒感染，儿童哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 132名儿童，包含SARS-CoV-2、鼻病毒或RSV感染者和未感染对照，共335174个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 874 | 2026-05-05 |
Synovial transcriptional clusters link cartilage degeneration to cell-type-specific gene expression in knee osteoarthritis
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.21.719697
PMID:42079156
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研究论文 | 通过转录组聚类分析揭示膝关节骨关节炎滑膜转录簇与软骨退变及细胞类型特异性基因表达的关系 | 首次将人类膝关节骨关节炎滑膜组织分为四个转录簇，并明确它们与软骨退变严重程度的关联 | 样本量有限，未涉及纵向随访数据验证，需要进一步验证这些转录簇在其他人群中的可重复性 | 识别膝关节骨关节炎中滑膜的转录簇，并阐明其与滑膜组织学特征、细胞类型特异性基因表达和软骨退变严重程度的关系 | 膝关节骨关节炎患者的滑膜组织 | 机器学习 | 骨关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 共识聚类 | 基因表达数据, 组织学图像 | n=135（批量RNA-seq），n=18（单细胞RNA-seq） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 875 | 2026-05-05 |
Turep: Detecting cross-cancer tumor-reactive T cells in single-cell and spatial transcriptomics data
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.21.719961
PMID:42079298
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研究论文 | 提出Turep深度学习方法，利用单细胞和空间转录组数据稳健预测跨癌种肿瘤反应性T细胞 | 整合七种人类恶性肿瘤的配对单细胞RNA和T细胞受体测序数据，识别泛癌肿瘤反应性基因特征，并采用生成式数据增强解决数据不平衡问题 | NA | 开发一种通用性强的方法，用于跨癌种预测肿瘤反应性T细胞 | 肿瘤浸润淋巴细胞中的肿瘤反应性T细胞与非反应性旁观者细胞 | 机器学习 | 多种癌症（泛癌） | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 空间转录组学 | 深度学习模型（Turep） | 基因表达数据（单细胞和空间转录组） | 七种人类恶性肿瘤的患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 876 | 2026-05-05 |
scSketch: Interactive Sketch-based Trajectory Exploration and Pathway-Aware Analysis of Single-Cell Data
2026-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.16.718997
PMID:42079097
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研究论文 | scSketch是一个交互式工具，允许用户通过草图轨迹探索单细胞数据中的基因表达梯度并进行通路感知分析 | 首次允许用户通过绘制轨迹交互式探索单细胞数据，并在迭代探索中保持统计有效性和生物学可解释性，同时自动计算基因-轨迹相关性并应用在线错误发现率控制 | NA | 开发一个能够交互式探索单细胞数据中轨迹假设并保持统计有效性和生物学可解释性的工具 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达梯度及细胞状态转变过程 | 机器学习 | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 877 | 2026-05-05 |
Interpreting and Validating a Deep Learning Model Predictive of Spatial Morphologic-Molecular Patterns in Lung Adenocarcinoma, Using Ground Truth Immunohistochemistry Images
2026-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.20.719723
PMID:42079136
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研究论文 | 开发并验证了深度学习模型XpressO-Lung，该模型利用常规H&E染色的全切片图像预测肺腺癌中空间形态-分子模式，并通过免疫组化在外部临床样本中验证 | 首次实现通过常规病理切片预测肿瘤及其微环境的基因表达空间异质性，无需空间转录组学技术，且模型具有可解释性 | 训练样本仅来自TCGA的200例肺腺癌病例，可能存在选择偏倚；预测基因数量有限；AUC范围0.64-0.92，部分基因预测性能中等 | 开发可解释的深度学习模型，通过学习组织形态与批量转录组数据的关联，在常规病理切片上预测肿瘤及其微环境的基因表达空间异质性 | 肺腺癌肿瘤组织及其微环境中的空间基因表达模式 | 数字病理学 | 肺癌 | 深度学习 | 可解释深度学习模型 | 图像 | 200例TCGA肺腺癌病例用于训练，外部验证集来自Dartmouth Health的临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 878 | 2026-05-05 |
Atypical memory B cell clonal expansion and inflammatory programs associate with platelet-activating antibody development in COVID-19
2026-Apr-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.201033
PMID:41746733
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序、单B细胞V(D)J测序及血浆细胞因子分析，揭示了COVID-19患者中血小板激活抗体发展与免疫特征的关系 | 首次通过单细胞多组学方法系统描绘了与血小板激活抗体产生相关的非典型记忆B细胞克隆扩增和炎症程序 | NA | 阐明COVID-19患者血小板激活抗体发展的免疫特征 | COVID-19患者的B细胞、T细胞及血浆 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、单细胞V(D)J测序、血浆细胞因子分析 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞B细胞V(D)J-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 879 | 2026-05-05 |
TNF-α blockade mitigates immune checkpoint-related nephritis in a humanized mouse model
2026-Apr-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199694
PMID:41785046
|
研究论文 | 使用人源化小鼠模型研究TNF-α阻断对免疫检查点抑制剂相关肾炎的缓解作用 | 首次在人源化嵌合PD-1/PD-L1小鼠模型中评估TNF-α阻断对免疫检查点抑制剂所致急性间质性肾炎的预防效果，并利用单细胞RNA-seq揭示免疫细胞群和关键基因变化 | 未提及具体局限性 | 探讨TNF-α阻断能否预防免疫检查点抑制剂相关急性间质性肾炎 | 人源化PD-1/PD-L1嵌合小鼠 | 机器学习和数字病理学 | 肾炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量，但分为4组：对照组、ICI-only组、ICI-细胞因子组、ICI-阻断组 | 未指定 | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 880 | 2026-05-05 |
Single-cell profiling reveals epithelial and immune responses in BK polyomavirus-infected human kidney biopsies
2026-Apr-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198227
PMID:41818285
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析BK多瘤病毒感染人肾活检组织中的上皮和免疫反应 | 首次在单细胞分辨率下揭示BK病毒感染不同阶段（病毒滴度上升期和消退期）中肾小管上皮细胞和免疫细胞的动态分子变化 | 横断面研究设计无法观察纵向动态变化，且体外细胞培养模型未能完全模拟体内代谢适应和免疫反应 | 阐明BK多瘤病毒感染导致肾损伤的分子机制，为临床管理提供新见解 | 肾移植活检组织中的上皮细胞和免疫细胞 | 机器学, 数字病理学 | BK病毒性肾病，肾移植并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未感染者对照和BK病毒感染两个阶段（病毒滴度上升期和消退期）的肾移植活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |