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当前共找到 39535 篇文献，本页显示第 861 - 880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2026-05-09 |
Innate immune responses against mRNA vaccine promote cellular immunity through IFN-β at the injection site
2024-08-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51411-9
PMID:39191748
|
研究论文 | 通过生成综合的单细胞转录组图谱，研究mRNA疫苗在小鼠注射部位引发的先天免疫反应，特别是IFN-β信号在促进细胞免疫中的作用 | 首次揭示注射部位成纤维细胞在mRNA疫苗免疫反应中的关键作用，发现成纤维细胞特异性对mRNA组分响应产生IFN-β，并证明IFN-β信号对增强抗原特异性细胞免疫至关重要 | 研究仅基于雌性BALB/c小鼠模型，未在人类或其他动物模型中验证；未深入探讨IFN-β信号的持续时间及长期免疫效果 | 阐明mRNA疫苗注射部位早期免疫反应的分子机制，特别是先天免疫与适应性免疫的衔接过程 | 雌性BALB/c小鼠注射部位组织及引流淋巴结 | 数字病理学 | 新型冠状病毒肺炎（COVID-19） | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 雌性BALB/c小鼠注射部位及引流淋巴结样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3‘测序平台 |
| 862 | 2026-05-09 |
Plasma proteomics of acute tubular injury
2024-08-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51304-x
PMID:39191768
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研究论文 | 利用SomaScan蛋白质组学平台鉴定急性肾小管损伤的血浆生物标志物，并结合多组学分析验证 | 首次在经活检确诊的肾病患者中系统鉴定与急性肾小管损伤严重程度相关的156种血浆蛋白，并阐明骨桥蛋白等关键标志物的生物学通路 | 可能缺乏外部验证队列中差异人群的普适性分析，且单细胞测序与血浆蛋白的相关性需进一步功能验证 | 发现与急性肾小管损伤相关的非侵入性血浆生物标志物 | 急性肾小管损伤患者及对照人群的血浆样本 | 蛋白质组学 | 肾脏疾病 | SomaScan蛋白质组学、区域转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据、转录组数据、临床队列数据 | 434例活检确诊肾病患者（发现队列）、44例（KPMP验证）、4610例（ARIC验证）、268例（CHROME验证） | SomaLogic | 蛋白质组学 | SomaScan | SomaScan蛋白质组学平台用于血浆蛋白定量分析 |
| 863 | 2026-05-09 |
Single-cell transcriptomics reveal transcriptional programs underlying male and female cell fate during Plasmodium falciparum gametocytogenesis
2024-08-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51201-3
PMID:39187486
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示恶性疟原虫配子体形成过程中雄性和雌性细胞命运的转录程序 | 首次利用单细胞RNA-seq解析恶性疟原虫在缺乏性染色体情况下的雄性和雌性配子体分化机制，预测了候选驱动基因，并发现AP2-G5转录因子特异性调控雄性发育 | 未明确提及实验重复次数及统计方法，且结果依赖于报告基因系，可能无法完全反映自然感染条件下的细胞状态 | 阐明恶性疟原虫雄性和雌性配子体分化的转录程序及调控机制 | 恶性疟原虫配子体报告基因系细胞 | 单细胞转录组学 | 疟疾（恶性疟原虫感染） | 单细胞RNA-seq | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 基于FACS富集的恶性疟原虫配子体细胞（具体细胞数量未在摘要中说明） | 未明确提及 | 单细胞RNA-seq | 未明确提及 | 基于FACS的细胞富集后进行单细胞RNA-seq |
| 864 | 2026-05-09 |
TooManyCellsInteractive: A visualization tool for dynamic exploration of single-cell data
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae056
PMID:39172544
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研究论文 | 介绍TooManyCellsInteractive (TMCI)，一种基于浏览器的JavaScript应用，用于交互式探索单细胞数据中的细胞群体 | 提供直观界面可视化径向树表示的分层细胞亚群，支持多分辨率覆盖、过滤和比较生物学特征 | NA | 开发一种用户友好的可视化工具，促进大规模单细胞测序数据的探索 | 药物耐受持久性细胞中的泛癌分析数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 865 | 2026-05-09 |
StereoSiTE: a framework to spatially and quantitatively profile the cellular neighborhood organized iTME
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae078
PMID:39452614
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研究论文 | 提出StereoSiTE框架，结合开源生物信息学工具和自定义算法，从空间转录组数据中推断免疫肿瘤微环境（iTME）中细胞邻域（CN）的功能性空间细胞相互作用强度（SCII） | 首次提供综合性分析框架，充分利用空间信息来精确推断细胞邻域内的空间细胞相互作用强度，并成功识别出由中性粒细胞主导的细胞邻域及其在治疗后的免疫肿瘤微环境重塑作用 | 仅应用于异种移植模型，可能需要在临床样本中进一步验证；框架的通用性和可扩展性尚未在多种数据类型和条件下全面测试 | 开发一种能够全面利用空间转录组数据、精确分析免疫肿瘤微环境中细胞邻域和空间细胞相互作用的分析框架 | 异种移植模型中的空间转录组数据集 | 计算生物学, 生物信息学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 多个样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 866 | 2026-05-09 |
demuxSNP: supervised demultiplexing single-cell RNA sequencing using cell hashing and SNPs
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae090
PMID:39607981
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研究论文 | 提出一种名为demuxSNP的监督算法，结合细胞哈希和单核苷酸多态性进行单细胞RNA测序的多重样本拆分 | 首次使用监督学习方法，同时利用细胞哈希和SNP两种数据模态进行样本拆分，提高了低质量哈希数据的分类准确性并克服了类别不平衡问题 | 要求生物学样本具有遗传差异，且依赖高质量哈希数据初步推断基因型 | 改进单细胞RNA测序多重样本拆分的准确性和稳健性 | 模拟数据和肾细胞癌真实数据 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 细胞哈希, SNP分析 | 最近邻算法 | 单细胞基因表达数据, 基因型数据 | 模拟数据（含5-50%双细胞率）及真实肾细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 867 | 2026-05-09 |
GPU-accelerated Kendall distance computation for large or sparse data
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae088
PMID:39658191
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研究论文 | 本文介绍了GADES，一个GPU加速的Kendall距离计算软件包，适用于大型或稀疏数据 | 提出利用GPU进行大规模并行Kendall-τ距离矩阵计算，通过特定内存管理突破GPU容量限制，并针对稀疏数据设计了额外加速算法 | 未提及具体局限性，可能依赖GPU硬件资源 | 开发高性能Kendall距离矩阵计算方法，实现大数据的高效处理 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 数值数据 | 模拟数据集和真实单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 868 | 2026-05-09 |
Identification and experimental validation of cuproptosis regulatory program in a sepsis immune microenvironment through a combination of single-cell and bulk RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1336839
PMID:38947313
|
研究论文 | 结合单细胞和批量RNA测序技术，识别并实验验证脓毒症免疫微环境中的铜死亡调控程序 | 首次在脓毒症中构建基于铜死亡的风险模型，并利用单细胞测序揭示铜死亡活性评分与单核细胞的关联及免疫微环境特征 | 未提及具体局限性，但可能包括模型验证样本量有限或体外实验的临床相关性需进一步验证 | 建立基于铜死亡的风险模型以诊断和预测脓毒症风险，并鉴定用于靶向治疗的铜死亡相关基因 | 脓毒症患者的免疫微环境及铜死亡相关基因 | 机器学习和数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、LASSO回归、Cox回归、流式细胞术、蛋白质印迹法、ELISA | LASSO回归模型、Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据 | 三个外部队列用于模型验证，具体样本量未在摘要中提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |
| 869 | 2026-05-09 |
Interstitial macrophage phenotypes in Schistosoma-induced pulmonary hypertension
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372957
PMID:38779688
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术，鉴定了血吸虫诱导肺动脉高压中三种间质巨噬细胞亚群，并揭示了其功能串扰机制 | 首次阐明了血吸虫诱导肺动脉高压中常驻FOLR2+间质巨噬细胞分泌单核细胞招募配体，而招募的CCR2+间质巨噬细胞表达血小板反应蛋白-1（TSP-1）驱动肺动脉高压病理的细胞间对话机制 | 未在人体样本中验证，且仅关注小鼠模型中的间质巨噬细胞亚群，未涉及其他免疫细胞类型 | 探究血吸虫诱导肺动脉高压中间质巨噬细胞亚群的功能分化及其在病理中的作用 | 血吸虫暴露后的小鼠肺间质巨噬细胞亚群 | 机器学习和数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未暴露组及血吸虫暴露后第1、3、7天的小鼠肺间质巨噬细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 870 | 2026-05-09 |
Activation of TLR9 signaling suppresses the immunomodulating functions of CD55lo fibroblastic reticular cells during bacterial peritonitis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1337384
PMID:38827745
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研究论文 | 本文研究了TLR9信号激活对细菌性腹膜炎期间CD55低表达成纤维网状细胞免疫调节功能的抑制作用 | 首次通过单细胞RNA测序发现肠系膜脂肪相关淋巴簇中两种成纤维网状细胞亚型（CD55高表达和CD55低表达），并揭示TLR9信号特异性抑制CD55低表达亚型的增殖、细胞因子产生和类维生素A代谢 | 仅在小鼠模型和人类脂肪组织来源的成纤维网状细胞中验证，未在临床患者中直接验证治疗效果 | 探索TLR9信号在不同成纤维网状细胞亚型中的调控作用及其对腹膜炎免疫应答的影响 | 小鼠肠系膜脂肪相关淋巴簇的成纤维网状细胞亚型及人类脂肪组织来源的成纤维网状细胞 | 免疫学 | 细菌性腹膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及人类脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 871 | 2026-05-09 |
Elucidating the causal associations and mechanisms between circulating immune cells and idiopathic pulmonary fibrosis: new insights from Mendelian randomization and transcriptomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1437984
PMID:39896814
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和转录组学分析阐明循环免疫细胞与特发性肺纤维化之间的因果关系及机制 | 首次结合双向孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序验证，识别出CTSB、IL10和AGER作为特发性肺纤维化的潜在生物标志物 | 孟德尔随机化分析依赖公开数据库，可能受人群分层影响；单细胞分析样本量有限，需要进一步实验验证 | 阐明循环免疫细胞与特发性肺纤维化之间的因果关联并探索潜在生物标志物 | 循环免疫细胞表型和特发性肺纤维化 | 自然语言处理 | 特发性肺纤维化 | 孟德尔随机化分析、转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 公开数据库来源，未明确样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 872 | 2026-05-09 |
Novel pyroptosis-immune-related lncRNA signature exhibits a distinct immune cell infiltration landscape in breast cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522327
PMID:39906743
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研究论文 | 构建了一种新型细胞焦亡-免疫相关长链非编码RNA特征，揭示乳腺癌中不同的免疫细胞浸润景观 | 首次整合细胞焦亡与免疫相关lncRNA构建六lncRNA预后特征，并在单细胞水平验证免疫细胞浸润差异 | NA | 探索细胞焦亡和免疫相关lncRNA作为乳腺癌治疗靶点的潜力，构建预后及免疫治疗反应预测特征 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞测序 | Cox回归, LASSO | 转录组数据, 单细胞测序数据 | TCGA数据集（训练集和测试集），单细胞数据集GSE176078 | NA | NA | NA | NA |
| 873 | 2026-05-09 |
A randomized, placebo-controlled trial of the BTK inhibitor zanubrutinib in hospitalized patients with COVID-19 respiratory distress: immune biomarker and clinical findings
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1369619
PMID:39906744
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研究论文 | 一项随机、安慰剂对照试验评估BTK抑制剂zanubrutinib对COVID-19呼吸窘迫住院患者的免疫生物标志物和临床效果 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了zanubrutinib在COVID-19患者中减少炎症信号并保留SARS-CoV-2血清学反应的作用，同时发现其对γ-δ T细胞的激活作用 | 样本量较小（队列1共63例，队列2仅4例），多数患者同时使用类固醇和抗病毒治疗可能干扰结果，且未在临床恢复方面显示优于安慰剂 | 评估下一代BTK抑制剂zanubrutinib在SARS-CoV-2感染伴呼吸窘迫住院患者中的疗效和免疫学影响 | COVID-19呼吸窘迫住院患者（无需机械通气和需机械通气≤24小时） | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 队列1共63例（zanubrutinib组30例，安慰剂组33例），队列2共4例 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于单细胞转录组分析 |
| 874 | 2026-05-09 |
Immune regulatory genes impact the hot/cold tumor microenvironment, affecting cancer treatment and patient outcomes
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382842
PMID:39911580
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研究论文 | 本研究通过分析33种癌症的免疫组成，区分热/冷肿瘤微环境，识别调控的免疫基因和潜在药物靶点 | 提出基于CD8+ T细胞、激活NK细胞和M2型巨噬细胞等免疫特征区分热/冷肿瘤的框架，并发现NT5E等核心基因及达沙替尼等药物可转化冷肿瘤为热肿瘤 | 未明确提及局限性，但可能包括数据来源单一（仅TCGA）、临床验证仅在胰腺癌中进行、药物转化效果需进一步验证 | 建立跨癌种的临床相关热/冷肿瘤免疫亚型分类框架，并鉴定调控肿瘤微环境的免疫基因及潜在治疗药物 | 33种癌症类型的肿瘤组织样本及临床数据 | 机器学习 | 泛癌种（包括膀胱尿路上皮癌、胰腺腺癌、宫颈鳞状细胞癌等） | NA | CIBERSORT算法 | 基因表达数据、临床生存数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA数据库中的33种癌症类型的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 875 | 2026-05-09 |
Convergent alterations in the tumor microenvironment of MYC-driven human and murine prostate cancer
2023-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.07.553268
PMID:37905029
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研究论文 | 通过对人类和基因工程小鼠模型的前列腺癌进行单细胞RNA测序和分子病理学分析，揭示了MYC驱动的肿瘤微环境趋同变化 | 首次系统阐明了MYC信号激活作为人类前列腺癌肿瘤微环境重塑的共同驱动因素，并通过跨物种比较研究验证了该发现 | 文中未明确说明，但可能涉及小鼠模型与人类疾病的差异以及样本量有限 | 探究MYC驱动的前列腺癌细胞如何调控肿瘤微环境改变 | 人类前列腺癌组织及基因工程小鼠模型的前列腺组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 人类组织样本和小鼠模型样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 876 | 2026-05-09 |
Spatial transcriptomics reveals the heterogeneity and FGG+CRP+ inflammatory cancer-associated fibroblasts replace islets in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1112576
PMID:37124494
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示胰腺导管腺癌中肿瘤微环境的异质性及FGG+CRP+炎性癌相关成纤维细胞替代胰岛的现象 | 首次通过空间转录组学技术系统描绘胰腺癌组织中包括正常组织、癌组织、邻近肿瘤组织和肿瘤间质在内的空间基因表达特征，并发现FGG+CRP+炎性癌相关成纤维细胞替代胰岛这一新现象 | 样本量较小，仅涉及一份正常胰腺组织样本，且空间转录组学的分辨率可能限制对单细胞层面的深入分析 | 揭示胰腺导管腺癌肿瘤微环境的空间异质性，并阐明胰腺结构和功能损伤的动态变化 | 正常胰腺组织、胰腺癌组织、邻近肿瘤组织和肿瘤间质中的空间基因表达特征 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 一份正常胰腺组织以及胰腺癌组织的多个位点（共18,075个空间点） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 877 | 2026-05-09 |
Single-cell RNA-seq of primary bone marrow neutrophils from female and male adult mice
2022-07-23, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-022-01544-7
PMID:35871169
|
研究论文 | 使用单细胞RNA-seq技术对成年雌性和雄性小鼠骨髓中的原发性中性粒细胞进行转录组分析 | 首次对雌性和雄性小鼠骨髓中性粒细胞进行单细胞分辨率转录组分析，克服了中性粒细胞RNA含量低的技术挑战 | 仅分析了小鼠模型，尚未涉及人类样本或更复杂的生理病理条件 | 研究哺乳动物免疫系统的性别二态性，特别是中性粒细胞在单细胞水平的转录组差异 | 成年雌性和雄性小鼠骨髓中的原发性中性粒细胞 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 约2500个雌性和雄性小鼠骨髓中性粒细胞（具体数量需参考原文） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 878 | 2026-05-08 |
Macrophage polarization as a therapeutic target in lung diseases: From pathogenesis to precision intervention
2026-Jul-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116660
PMID:41999690
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综述 | 系统阐述了巨噬细胞极化在多种肺部疾病发病机制中的核心作用，并探讨了从传统非特异调控向精准重编程转变的治疗策略，提出整合单细胞多组学、空间转录组学和人工智能的免疫稳态重建新框架 | 提出从非特异广谱调控向靶向精准重编程的范式转变，创新性地提出整合人工智能驱动预测模型和巨噬细胞外泌体生物标志物发现以实现实时无创监测极化动态与自适应治疗决策，以及从对抗性干预转向免疫稳态重建的策略框架 | 未提及具体局限性 | 综述巨噬细胞极化在肺部疾病中的作用机制及精准干预的治疗策略演进 | 肺巨噬细胞（包括组织驻留肺泡巨噬细胞和单核细胞来源的募集巨噬细胞） | 机器学习 | 肺部疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞多组学， 空间转录组学 | NA | NA |
| 879 | 2026-05-08 |
Cholangiocyte biology in primary sclerosing cholangitis and other cholangiopathies: pathogenesis, clinical insights, and experimental tools
2026-Jul-01, Physiological reviews
IF:29.9Q1
DOI:10.1152/physrev.00022.2025
PMID:41973609
|
综述 | 本文综述了胆管细胞生物学，特别是在原发性硬化性胆管炎（PSC）及其他胆管病变中的发病机制、临床见解和实验工具 | 整合了胆管细胞异质性、可塑性及新型技术（如类器官培养、单细胞转录组学、表观基因组学和空间组学）对胆道病理生理学理解的变革性影响 | PSC 治疗仍未解决，需要持续的多学科努力来开发靶向干预措施 | 探讨胆管细胞生物学及其在胆管病变（特别是PSC）发病机制中的作用，并提供现有研究工具和模型的概述 | 胆管细胞 | 数字病理学 | 胆管疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞转录组学，单细胞表观基因组学，空间组学 | NA | NA |
| 880 | 2026-05-08 |
Alveolar macrophage subtypes express cholesterol and inflammation genes in cystic fibrosis
2026-Jul, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503482
PMID:42061984
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析囊性纤维化患者肺泡巨噬细胞亚型，发现表达胆固醇和炎症相关基因的巨噬细胞亚型 | 首次在囊性纤维化患者中鉴定出12种肺泡巨噬细胞亚型，并发现CDKN1A和LDLR表达上调与胆固醇代谢和炎症相关 | 样本量较小，仅涉及囊性纤维化患者和健康对照者，可能无法完全代表人群多样性 | 研究囊性纤维化患者肺泡巨噬细胞的细胞组成及其在肺部炎症中的作用 | 囊性纤维化患者和健康对照者的肺泡巨噬细胞和单核细胞 | 单细胞测序 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 囊性纤维化患者和健康对照者，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 支气管肺泡灌洗液样本进行单细胞RNA测序 |