单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8761 - 8780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8761 | 2025-10-07 |
Integrin α8 is a useful cell surface marker of alveolar lipofibroblasts
2025-Jan-13, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03103-1
PMID:39806390
|
研究论文 | 本研究鉴定整合素α8作为肺泡脂成纤维细胞的有效表面标志物 | 首次发现整合素α8可作为野生型小鼠肺中肺泡脂成纤维细胞的表面标志物，无需基因特异性报告小鼠系 | 肺成纤维细胞亚群之间的功能区分仍需进一步研究 | 鉴定肺脂成纤维细胞的合适表面标志物并研究其特性 | 小鼠肺成纤维细胞亚群 | 细胞生物学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序, LipidTOX染色, Oil Red O染色 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 新生、成年和老年小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8762 | 2025-10-07 |
Amantadine modulates novel macrophage phenotypes to enhance neural repair following spinal cord injury
2025-Jan-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05916-y
PMID:39806436
|
研究论文 | 本研究探讨金刚烷胺通过调节巨噬细胞表型促进脊髓损伤后神经修复的作用机制 | 首次发现金刚烷胺可调节巨噬细胞从炎症表型向修复表型分化，并通过HIF-1α和NF-κB通路促进神经再生 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探索金刚烷胺在脊髓损伤后调节巨噬细胞表型促进神经修复的分子机制 | 小鼠脊髓损伤模型和巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 脊髓损伤 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,高维基因共表达网络分析,轨迹分析,免疫荧光染色,流式细胞术,蛋白质印迹,分子对接 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据,蛋白质数据 | 小鼠脊髓损伤模型（3天和7天时间点） | NA | 单细胞RNA测序,微阵列分析 | NA | NA |
| 8763 | 2025-10-07 |
The microenvironment cell index is a novel indicator for the prognosis and therapeutic regimen selection of cancers
2025-Jan-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05950-w
PMID:39806464
|
研究论文 | 本研究构建了基于微环境细胞浸润的预后预测模型MCI，并验证其在三阴性乳腺癌预后和治疗方案选择中的价值 | 首次提出微环境细胞指数(MCI)概念，结合六种微环境细胞构建预后模型，并通过单细胞测序、空间转录组学和多色免疫荧光验证 | 研究主要基于三阴性乳腺癌，在其他癌症类型中的适用性需要进一步验证 | 建立基于微环境细胞浸润的预后预测模型并探索新的治疗策略 | 三阴性乳腺癌患者和荷瘤小鼠 | 数字病理学 | 乳腺癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, 多色免疫荧光染色 | LASSO-Cox回归分析 | RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 8764 | 2025-10-07 |
Lipid nanoparticles deliver DNA-encoded biologics and induce potent protective immunity
2025-Jan-13, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02211-8
PMID:39806486
|
研究论文 | 本研究评估了脂质纳米颗粒递送DNA编码生物制剂的效能及其诱导的保护性免疫反应 | 发现Moderna Spikevax mRNA疫苗中使用的LNP-M配方在DNA递送中表现出稳定的纳米结构、高表达效率和低毒性，并能诱导更强的免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果仍需验证 | 评估不同LNP配方递送DNA编码生物制剂的效能和免疫保护效果 | DNA编码的疫苗和癌症免疫治疗制剂 | 生物医学工程 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠模型 | Moderna | 脂质纳米颗粒递送技术 | LNP-M | Moderna Spikevax mRNA疫苗中使用的脂质纳米颗粒配方 |
| 8765 | 2025-10-07 |
TRIAGE: an R package for regulatory gene analysis
2025-Jan-12, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf004
PMID:39800877
|
研究论文 | 开发了一个专门用于分析调控基因的R软件包TRIAGE | 利用联盟级别的H3K27me3数据富集细胞类型特异性调控区域，专门设计用于批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据的调控元件分析 | NA | 解决标准RNA-seq分析工作流程在揭示细胞身份和功能调控基础方面的局限性 | 调控基因和调控元件 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 三个独立的转录组数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 8766 | 2025-10-07 |
inDrops-2: a flexible, versatile and cost-efficient droplet microfluidic approach for high-throughput scRNA-seq of fresh and preserved clinical samples
2025-Jan-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1312
PMID:39797728
|
研究论文 | 本文介绍了inDrops-2这一开源、灵活且经济高效的高通量单细胞RNA测序技术 | 开发了成本降低6倍但灵敏度与先进商业系统相当的开源scRNA-seq技术，支持两种扩增方案并适用于新鲜和保存的临床样本 | NA | 开发成本效益更高的高通量单细胞RNA测序技术 | 人类肺癌样本中的细胞 | 单细胞测序 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 开源平台 | 单细胞RNA测序, 液滴微流体 | inDrops-2 | 支持指数和线性扩增的液滴微流体scRNA-seq平台 |
| 8767 | 2025-10-07 |
Unraveling the potential mechanism and prognostic value of pentose phosphate pathway in hepatocellular carcinoma: a comprehensive analysis integrating bulk transcriptomics and single-cell sequencing data
2025-Jan-11, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01521-w
PMID:39798003
|
研究论文 | 本研究通过整合批量转录组学和单细胞测序数据，开发了基于磷酸戊糖途径相关基因的肝细胞癌预后预测模型 | 首次将磷酸戊糖途径相关基因与单细胞测序数据结合构建肝细胞癌预后模型，并验证关键基因ATAD2和SPP1的生物学功能 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要更多前瞻性研究验证模型的临床应用价值 | 构建肝细胞癌预后预测模型并指导个体化治疗策略 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA测序 | LASSO惩罚Cox回归模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA、GEO和ICGC数据库的多个队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8768 | 2025-10-07 |
Deterministic patterns in single-cell transcriptomic data
2025-Jan-11, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00490-5
PMID:39799124
|
研究论文 | 本研究报道了单细胞转录组数据统计图中存在的确定性模式，并建立了理论解释这些模式产生的原因 | 首次发现单细胞转录组数据中的确定性模式，并证明这些模式既非测量伪影也非生物学机制导致，而是有限样本量效应的自然产物 | NA | 探究单细胞转录组数据中确定性模式的起源和性质 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序，多重误差稳健荧光原位杂交 | 理论模型 | 基因表达数据 | NA | 多种平台公司 | 单细胞RNA测序 | 五种不同类型的单细胞测序平台 | 包括多重误差稳健荧光原位杂交和五种不同单细胞测序平台的数据 |
| 8769 | 2025-10-07 |
Integrated RNA sequencing analysis and machine learning identifies a metabolism-related prognostic signature in clear cell renal cell carcinoma
2025-Jan-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85618-7
PMID:39799252
|
研究论文 | 本研究通过整合RNA测序分析和机器学习方法，在透明细胞肾细胞癌中识别了一个与代谢相关的预后特征 | 首次结合单细胞RNA测序解卷积和机器学习构建代谢相关预后特征，并在51个已发表特征和常规临床特征中显示出更高准确性 | 需要进一步验证MRPS在更广泛临床场景中的应用价值 | 探索代谢重编程如何影响透明细胞肾细胞癌的患者异质性和预后 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者样本 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 机器学习, 体外实验 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8770 | 2025-10-07 |
The role of mitophagy-related genes in prognosis and immunotherapy of cutaneous melanoma: a comprehensive analysis based on single-cell RNA sequencing and machine learning
2025-Jan-11, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-025-09593-x
PMID:39799269
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法，系统分析了线粒体自噬相关基因在皮肤黑色素瘤预后和免疫治疗中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法构建皮肤黑色素瘤预后模型，识别了7个关键基因并验证其临床价值 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证和前瞻性临床研究确认模型的普适性 | 阐明线粒体自噬相关基因在皮肤黑色素瘤中的作用并开发预后预测模型 | 皮肤黑色素瘤患者样本和细胞系 | 机器学习 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 实时定量PCR, 单样本基因集富集分析, 加权基因共表达网络分析 | 十种不同机器学习算法的集成框架 | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据, 临床数据 | 来自公共数据库的皮肤黑色素瘤样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8771 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis pinpoints CCNA2 as a prognostic and immunological biomarker in non-small cell lung cancer
2025-Jan-11, BMC pulmonary medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1186/s12890-025-03490-7
PMID:39799294
|
研究论文 | 本研究通过综合分析确定CCNA2作为非小细胞肺癌的预后和免疫生物标志物 | 首次系统阐明CCNA2在非小细胞肺癌中的表达特征及其与免疫细胞浸润的关联 | 研究主要基于公共数据库分析，实验验证样本量有限 | 探索CCNA2在非小细胞肺癌中的生物学功能和临床意义 | 非小细胞肺癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | 微阵列分析, qRT-PCR, 免疫组织化学, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 三个GEO数据集(GSE18842, GSE101929, GSE116959) + 实验验证样本 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 8772 | 2025-10-07 |
Ferroptosis-related genes participate in the microglia-induced neuroinflammation of spinal cord injury via NF-κB signaling: evidence from integrated single-cell and spatial transcriptomic analysis
2025-Jan-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06095-0
PMID:39799354
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组分析，揭示铁死亡相关基因通过NF-κB信号通路参与小胶质细胞诱导的脊髓损伤神经炎症 | 首次发现具有M1极化和铁死亡表型的小胶质细胞新亚群在脊髓损伤中的作用机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探究铁死亡相关基因在脊髓损伤神经炎症中的作用机制 | 脊髓损伤小鼠模型和小胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | 加权基因共表达网络分析, 差异表达分析, 蛋白质相互作用网络 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集（GSE45006, GSE69334, GSE151371, GSE214349, GSE184369, GSE162610, GSE226286） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8773 | 2025-10-07 |
FAP-targeted radioligand therapy with 68Ga/177Lu-DOTA-2P(FAPI)2 enhance immunogenicity and synergize with PD-L1 inhibitors for improved antitumor efficacy
2025-Jan-11, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010212
PMID:39800373
|
研究论文 | 本研究探讨FAP靶向放射性配体疗法联合PD-L1抑制剂通过重塑肿瘤微环境增强抗肿瘤免疫反应的机制与疗效 | 首次报道二聚体FAP靶向放射性药物68Ga/177Lu-DOTA-2P(FAPI)2可诱导DNA双链断裂并上调PD-L1表达，且与PD-L1抑制剂联合可实现100%肿瘤清除并建立免疫记忆 | 研究仅使用CT26-FAP肿瘤细胞系和小鼠模型，尚未在更广泛的肿瘤类型或临床环境中验证 | 探索FAP靶向放射性配体疗法联合PD-1/PD-L1免疫疗法的抗肿瘤疗效及作用机制 | CT26-FAP肿瘤细胞系和荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫治疗 | FAP阳性肿瘤 | 放射性配体疗法，免疫组织化学染色，单细胞RNA测序 | NA | 分子影像数据，基因表达数据，组织病理学数据 | 小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8774 | 2025-10-07 |
Loss of FTH1 Induces Ferritinophagy-Mediated Ferroptosis in Anaemia of Myelodysplastic Syndromes
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70350
PMID:39804099
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现骨髓增生异常综合征患者FTH1表达降低，并证实FTH1缺失通过铁蛋白自噬途径诱导铁死亡导致贫血 | 首次揭示FTH1通过铁蛋白自噬调控铁死亡在MDS贫血发生中的关键作用 | 研究主要基于细胞系模型，临床样本验证仍需扩展 | 探究FTH1在骨髓增生异常综合征贫血发生机制中的作用 | MDS患者的Lin-细胞、GlycoA有核红细胞及K562、SKM1细胞系 | 单细胞测序 | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞测序，shRNA基因敲低 | NA | 单细胞测序数据，基因表达数据 | MDS患者和对照组的Lin-细胞及有核红细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8775 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-sequencing and spatial transcriptomic analysis reveal a distinct population of APOE- cells yielding pathological lymph node metastasis in papillary thyroid cancer
2025-Jan, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70172
PMID:39810624
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，发现甲状腺乳头状癌中APOE-细胞亚群与淋巴结转移相关 | 首次在甲状腺乳头状癌中鉴定出APOE-细胞亚群，并揭示其通过ABCA1-LXR轴和CD99信号通路促进肿瘤转移的机制 | 研究样本量有限，机制研究仍需进一步验证 | 探究甲状腺乳头状癌淋巴结转移的分子机制 | 甲状腺癌组织样本 | 单细胞组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 假时序分析, 细胞通讯分析 | 机器学习模型 | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8776 | 2025-10-07 |
Integrated bulk RNA and single-cell analysis with experimental validation reveal oxidative stress-related diagnostic biomarkers for osteoporosis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0322326
PMID:40299834
|
研究论文 | 通过整合bulk RNA和单细胞分析结合实验验证，揭示了氧化应激相关诊断标志物CHRM2在骨质疏松症中的作用 | 首次整合bulk RNA和单细胞分析识别CHRM2作为骨质疏松症的氧化应激相关诊断标志物，并通过实验验证其功能机制 | NA | 探索CHRM2在成骨分化中的作用并评估其作为骨质疏松症生物标志物的潜力 | 骨质疏松症患者和健康对照的细胞样本 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 体外实验 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8777 | 2025-10-07 |
Construction of a Prognostic Model for Cervical Cancer Related to lncRNA Based on Differential Co-expression Network and Functional Study of Key Gene EGFR-AS1
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.108429
PMID:40302795
|
研究论文 | 基于差异共表达网络构建宫颈癌相关lncRNA预后模型并研究关键基因EGFR-AS1的功能 | 首次结合多组学数据和单细胞测序数据，通过随机森林算法构建33-lncRNA宫颈癌预后模型，并发现EGFR-AS1与FAM83B通过EGFR通路相互作用调控宫颈癌发展 | NA | 建立有效的宫颈癌预后预测模型并探索关键基因的分子机制 | 宫颈癌患者数据及宫颈癌细胞 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞测序, 多组学分析, 随机森林算法, 共表达网络分析 | 随机森林, 共表达网络 | 基因组数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 8778 | 2025-10-07 |
Integration of multi-omics and single-cell transcriptome reveals mitochondrial outer membrane protein-2 (MTX-2) as a prognostic biomarker and characterizes ubiquinone metabolism in lung adenocarcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.106902
PMID:40302794
|
研究论文 | 本研究通过多组学和单细胞转录组分析，揭示线粒体外膜蛋白-2(MTX-2)作为肺腺癌预后生物标志物的作用及其在泛醌代谢中的功能 | 首次系统评估MTX-2在肺腺癌中的表达、预后价值及其在肿瘤代谢和免疫浸润中的作用机制 | NA | 探索MTX-2在肺腺癌进展和预后中的作用及其潜在治疗价值 | 肺腺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,分子生物学功能实验 | NA | 转录组数据,临床数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8779 | 2025-10-07 |
Identification of the role of MED6 in the development and prognosis of lung adenocarcinoma based on multi-omics profiling
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.110981
PMID:40302793
|
研究论文 | 基于多组学分析揭示MED6在肺腺癌发展和预后中的作用 | 首次发现MED6通过影响肿瘤细胞生长和肿瘤微环境相互作用促进肺腺癌进展，并基于MED6表达鉴定潜在治疗药物 | MED6在肺腺癌中的具体分子机制仍需进一步验证 | 探究Mediator复合物亚基在肺腺癌中的作用及其临床意义 | 肺腺癌细胞系和患者样本 | 多组学分析 | 肺腺癌 | CRISPR-Cas9功能缺失筛选,RNA-seq,单细胞测序,药物敏感性分析 | NA | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8780 | 2025-10-07 |
Identification and Validation of Prognostic Genes Related to Histone Lactylation Modification in Glioblastoma: An Integrated Analysis of Transcriptome and Single-cell RNA Sequencing
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.110646
PMID:40302809
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序分析，识别并验证了与胶质母细胞瘤中组蛋白乳酸化修饰相关的预后基因 | 首次系统分析组蛋白乳酸化修饰在胶质母细胞瘤中的预后价值，并构建了基于HLMRGs的风险预测模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 识别GBM中HLM相关预后基因并探索其作用机制 | 胶质母细胞瘤临床组织样本和公共数据库中的GBM测序数据 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 免疫组织化学染色, Western blotting, 转录组测序, 单细胞RNA测序, WGCNA, LASSO回归 | 风险预测模型, Cox回归模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床数据 | 从TCGA-GBM数据集获得3343个差异表达基因和948个关键模块基因 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |