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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8741 | 2025-10-07 |
Protocol for the isolation of silk glands from silkworms for snRNA-seq and spatial transcriptomics
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103581
PMID:39804771
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研究论文 | 本文提供了一个从蚕中分离丝腺并进行单核RNA测序和空间转录组学分析的实验方案 | 开发了专门针对蚕丝腺的核分离和高质量组织切片制备方法,首次实现了丝腺细胞在单细胞分辨率下的空间分布研究 | 该方案主要针对蚕丝腺组织,可能不适用于其他昆虫组织,且需要专门的实验设备和技术 | 建立蚕丝腺单核RNA测序和空间转录组学分析的标准实验流程 | 蚕的丝腺组织 | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 冷冻切片, RNA捕获测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
8742 | 2025-10-07 |
Developing and experimental validating a T cell senescence-related gene signature to predict prognosis and immunotherapeutic sensitivity in non-small cell lung cancer
2025-Mar-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149233
PMID:39800199
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研究论文 | 开发并实验验证了一个T细胞衰老相关基因特征,用于预测非小细胞肺癌的预后和免疫治疗敏感性 | 首次构建了基于T细胞衰老相关基因的风险模型,并通过多组学数据和实验验证其在NSCLC预后和免疫治疗预测中的价值 | 研究样本量相对有限,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 预测非小细胞肺癌患者的预后和免疫治疗敏感性 | 非小细胞肺癌患者组织和T细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 多变量Cox回归, 细胞共培养实验 | 多变量Cox回归模型, 机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-NSCLC数据集训练,8个GEO独立队列验证,10对癌旁和癌组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
8743 | 2025-10-07 |
Comparative Single-Cell Transcriptomics of Human Neuroblastoma and Preclinical Models Reveals Conservation of an Adrenergic Cell State
2025-Mar-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1507
PMID:39808065
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研究论文 | 通过单细胞转录组学比较人类神经母细胞瘤与临床前模型的细胞状态保守性 | 首次通过单细胞RNA测序系统比较TH-MYCN转基因小鼠模型、体外肿瘤球与人类神经母细胞瘤的转录景观,发现肾上腺素能细胞状态的保守性 | 研究主要基于TH-MYCN转基因小鼠模型,其他神经母细胞瘤模型的适用性仍需验证 | 验证临床前模型对人类神经母细胞瘤细胞身份的再现程度 | 人类神经母细胞瘤患者样本、TH-MYCN转基因小鼠肿瘤、体外肿瘤球培养物 | 单细胞转录组学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类神经母细胞瘤患者样本、TH-MYCN小鼠肿瘤样本、体外肿瘤球培养物 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8744 | 2025-10-07 |
An augmented GSNMF model for complete deconvolution of bulk RNA-seq data
2025-Mar-14, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2025036
PMID:40296800
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研究论文 | 提出一种增强的GSNMF模型用于批量RNA-seq数据的完全解卷积分析 | 开发了伪批量组织数据增强的几何结构引导NMF模型(GSNMF+),通过统计分布模拟伪细胞组成和单细胞RNA-seq数据生成伪批量组织数据,并利用估计的重缩放矩阵调整NMF最小值 | 在奇异细胞组成场景中表现较好,但未明确说明在其他复杂场景中的适用性限制 | 解决批量RNA-seq数据完全解卷积分析的数学不适定问题,提高细胞类型特异性基因表达谱和相对细胞丰度估计的准确性 | 批量RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NMF, GSNMF | 基因表达数据 | 多个真实批量组织数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
8745 | 2025-10-07 |
Identification of Pathogenic PD-1+CD8+ T Cells for Effective Chimeric Antigen Receptor Therapy in a Murine Model of Sjögren Disease
2025-Mar-03, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43144
PMID:40026078
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研究论文 | 本研究通过识别干燥综合征中的致病性PD-1+CD8+ T细胞,开发了PD-1靶向CAR-T细胞疗法并在小鼠模型中验证其疗效 | 首次将PD-1鉴定为致病性CD8+ T细胞的标志物,并开发了针对该细胞亚群的CAR-T细胞疗法 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 开发针对干燥综合征致病性T细胞的靶向治疗策略 | 干燥综合征患者样本和Il12b-/-Il2ra-/-小鼠模型 | 免疫治疗 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,T细胞受体分析 | CAR-T细胞疗法 | 基因表达数据,流式细胞数据,组织病理数据 | 干燥综合征患者和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8746 | 2025-10-07 |
Novel biallelic MCMDC2 variants were associated with meiotic arrest and nonobstructive azoospermia
2025-Mar-01, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202495
PMID:39789727
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研究论文 | 本研究通过全外显子组测序在768名非梗阻性无精子症患者中发现MCMDC2基因的双等位基因有害变异与生精停滞相关 | 首次发现MCMDC2基因双等位基因变异与非梗阻性无精子症的关联,揭示了该基因在人类精子发生中的新功能 | 样本量有限(768名患者),仅发现4个变异(0.5%),需要更大规模研究验证 | 探索非梗阻性无精子症的遗传病因,特别是MCMDC2基因的作用机制 | 768名非梗阻性无精子症患者 | 生殖医学遗传学 | 男性不育症 | 全外显子组测序, 苏木精-伊红染色, 免疫荧光染色, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组测序数据, 组织染色图像, 单细胞转录组数据 | 768名NOA患者 | NA | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8747 | 2025-10-07 |
A creatine efflux transporter in oligodendrocytes
2025-Mar, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.17382
PMID:39792585
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研究论文 | 本研究揭示了转运蛋白SLC22A15在少突胶质细胞中作为关键肌酸外排转运蛋白的功能机制 | 首次发现SLC22A15是少突胶质细胞中受控肌酸释放的关键转运蛋白,填补了脑内肌酸代谢机制的关键空白 | 研究主要基于293细胞的异源表达实验,需要进一步在原生少突胶质细胞中验证功能 | 探究脑内肌酸从产生细胞释放的分子机制 | 转运蛋白SLC22A15在少突胶质细胞中的功能 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 质谱分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,代谢物检测数据 | 人类和大鼠的细胞系及组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8748 | 2025-10-07 |
Exosome-Mediated Lectin Pathway and Resistin-MIF-AA Metabolism Axis Drive Immune Dysfunction in Immune Thrombocytopenia
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412378
PMID:39792656
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了外泌体介导的凝集素补体途径和抵抗素-MIF-AA代谢轴在免疫性血小板减少症发病机制中的作用 | 首次发现外泌体介导的凝集素补体途径参与ITP发病,并阐明抵抗素和MIF通过促炎信号通路导致免疫细胞过度活化和AA代谢紊乱 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 探索免疫性血小板减少症的发病机制和潜在治疗靶点 | 免疫性血小板减少症患者样本 | 免疫学 | 免疫性血小板减少症 | 流式细胞术,蛋白质组学,单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | ITP患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
8749 | 2025-10-07 |
Cell-Type Specific miRNA Regulatory Network Responses to ABA Stress Revealed by Time Series Transcriptional Atlases in Arabidopsis
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415083
PMID:39792694
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研究论文 | 本研究通过拟南芥ABA胁迫下的单细胞转录组时序图谱,揭示了细胞类型特异的miRNA调控网络响应机制 | 首次在单细胞水平构建ABA胁迫下的时序转录图谱,发现miRNA在调控网络中的枢纽作用及细胞类型特异性响应模式 | 研究仅针对拟南芥ABA胁迫响应,未验证其他植物或胁迫条件 | 揭示植物在ABA胁迫下细胞类型特异的miRNA调控网络动态响应机制 | 拟南芥在不同ABA处理时间点的单细胞转录组 | 单细胞转录组学 | 植物胁迫响应 | 单细胞RNA测序 | 调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 拟南芥不同时间点(早期、中期、晚期)ABA处理的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8750 | 2025-10-07 |
The molecular structure of SHISA5 protein and its novel role in primary biliary cholangitis: From single-cell RNA sequencing to biomarkers
2025-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.139775
PMID:39800023
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示SHISA5蛋白在原发性胆汁性胆管炎中的表达特征及其分子结构 | 首次发现SHISA5蛋白在PBC患者肝组织中高表达,并揭示其可能通过调控胆管细胞分化参与疾病进程 | 样本量有限,功能机制尚未通过实验验证 | 探究SHISA5蛋白在原发性胆汁性胆管炎中的表达特征和生物学功能 | PBC患者和健康对照者的肝组织样本 | 数字病理学 | 原发性胆汁性胆管炎 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | PBC患者和健康对照者的肝组织样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8751 | 2025-10-07 |
Dectin-2 depletion alleviates osteoclast-induced bone loss in periodontitis via Syk/NOX2/ROS signaling
2025-Mar-01, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究揭示了Dectin-2通过Syk/NOX2/ROS信号轴促进破骨细胞分化和牙周炎骨吸收的新机制 | 首次发现Dectin-2在破骨细胞分化中的关键作用及其通过Syk/NOX2/ROS/MAPK信号轴的调控机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究Dectin-2在破骨细胞分化和牙周炎骨吸收中的作用机制 | RAW264.7细胞、骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)、Dectin-2基因敲除小鼠 | 分子生物学 | 牙周炎 | 单细胞测序、转录组分析、基因敲除、基因过表达 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据、动物模型数据 | 细胞系和小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、转录组测序 | NA | NA |
8752 | 2025-10-07 |
Scale-Up of Human Amniotic Epithelial Cells Through Regulation of Epithelial-Mesenchymal Plasticity Under Defined Conditions
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408581
PMID:39804851
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研究论文 | 通过调控上皮-间质可塑性在限定条件下实现人羊膜上皮细胞的规模化扩增 | 首次通过单细胞RNA测序揭示hAECs增殖与上皮-间质可塑性的关联,并开发出使细胞扩增50倍同时保持增殖能力的培养方法 | 未明确说明研究涉及的样本数量及具体疾病治疗应用场景 | 阐明人羊膜上皮细胞的增殖机制并优化其体外培养体系 | 不同孕周和传代次数的人羊膜上皮细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8753 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals intratumor heterogeneity and the potential roles of cancer stem cells and myCAFs in colorectal cancer liver metastasis and recurrence
2025-Mar-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217452
PMID:39805388
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示结直肠癌肝转移和复发中的肿瘤内异质性,以及癌症干细胞和myCAFs的潜在作用 | 在单细胞分辨率下发现癌症干细胞样细胞亚群与myCAFs之间的新型细胞通讯机制,并构建了可用于评估复发风险的基因特征 | NA | 研究结直肠癌肝转移和复发的分子机制 | 结直肠癌原发灶和肝转移灶 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8754 | 2025-10-07 |
Mannose Promotes β-Amyloid Pathology by Regulating BACE1 Glycosylation in Alzheimer's Disease
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409105
PMID:39807036
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研究论文 | 本研究揭示了甘露糖通过调节BACE1糖基化促进阿尔茨海默病β-淀粉样蛋白病理的机制 | 首次发现甘露糖通过调节BACE1和Nicastrin的N-糖基化增强其蛋白稳定性,从而促进Aβ产生 | 研究主要基于AD小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究甘露糖在阿尔茨海默病病理进展中的作用机制 | AD小鼠模型和AD患者血清样本 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,代谢组学 | NA | 基因表达数据,代谢物数据 | AD小鼠和AD患者血清样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8755 | 2025-10-07 |
Anxiety-like behavior and altered hippocampal activity in a transgenic mouse model of Fabry disease
2025-Feb, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.106797
PMID:39788162
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研究论文 | 本研究通过转基因法布里病小鼠模型探索焦虑样行为与海马体功能改变之间的关联 | 首次在法布里病模型中结合行为学、转录组学、功能和形态学评估,揭示海马体细胞群中Gb3沉积与基因表达异常的关系 | 研究仅使用雄性小鼠模型,未涵盖性别差异;结果主要基于动物模型,人类直接适用性需进一步验证 | 探究法布里病神经精神症状的病理机制,特别是焦虑行为与海马体功能异常的关系 | 转基因法布里病小鼠模型 | 神经科学 | 法布里病 | 单细胞测序, 行为学测试, 电生理记录 | 转基因小鼠模型 | 行为数据, 转录组数据, 电生理数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8756 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of the spleen reveals differences in Salmonella typhimurium infection mechanisms between different chicken breeds
2025-Feb, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2024.104669
PMID:39793244
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较不同鸡品种脾脏对鼠伤寒沙门氏菌感染的免疫应答差异 | 首次对鸡脾脏进行单细胞转录组分析,揭示不同品种鸡在细菌感染中的免疫调节机制差异 | 研究仅关注脾脏免疫细胞,未涉及其他免疫器官;样本量相对有限 | 探究不同鸡品种对鼠伤寒沙门氏菌感染的免疫应答机制差异 | 北京油鸡和科宝肉鸡的脾脏CD45+免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 54,487个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8757 | 2025-10-07 |
Mechanisms and strategies of immunosenescence effects on non-small cell lung cancer (NSCLC) treatment: A comprehensive analysis and future directions
2025-Feb, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2025.01.001
PMID:39793777
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综述 | 本文全面分析了免疫衰老对非小细胞肺癌治疗的影响机制及应对策略 | 系统阐述了免疫衰老在NSCLC进展中的作用机制,并探讨了单细胞测序和CRISPR-Cas9等新兴技术在研究免疫衰老中的应用前景 | NA | 探讨免疫衰老对非小细胞肺癌治疗的影响及未来研究方向 | 老年非小细胞肺癌患者的免疫系统 | NA | 肺癌 | 单细胞测序, CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8758 | 2025-10-07 |
Combined analysis of bulk, single-cell RNA sequencing, and spatial transcriptomics reveals the expression patterns of lipid metabolism and ferroptosis in the immune microenvironment of metabolic-associated fatty liver disease
2025-Feb-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123377
PMID:39793853
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研究论文 | 通过整合分析bulk RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示脂质代谢和铁死亡在代谢相关脂肪肝病免疫微环境中的表达模式 | 首次将单细胞RNA测序、bulk RNA测序和空间转录组学数据整合分析,构建了MAFLD风险评估系统和预测模型,并发现11个与铁死亡和脂质代谢相关的关键基因 | NA | 识别与铁死亡和脂质代谢相关的关键生物标志物,研究它们在MAFLD进展中的作用及其与免疫浸润环境的相互作用 | 代谢相关脂肪肝病(MAFLD)患者的肝脏样本 | 生物信息学 | 代谢相关脂肪肝病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,空间转录组学,WGCNA | 风险评估系统,预测模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
8759 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomic characterization of a Carnegie stage 7 human embryo
2025-Feb, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01597-3
PMID:39794460
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术对卡内基第7期人类胚胎进行单细胞分辨率分析 | 首次使用空间转录组学技术分析完整人类原肠胚,揭示了中胚层亚型早期特化和原始生殖细胞位置等新发现 | 人类早期胚胎组织获取困难,仅分析了两个胚胎样本 | 研究人类原肠胚发育过程中的细胞谱系多样化和形态发生运动 | 卡内基第7期人类胚胎 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,免疫荧光验证 | NA | 空间转录组数据,三维模型数据 | 2个人类胚胎(1个用于主要分析,1个用于验证) | NA | 空间转录组学,Stereo-seq | NA | 82个连续冷冻切片,Stereo-seq技术 |
8760 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals intrahepatic signature related to pathobiology of duck hepatitis A virus type 3 (DHAV-3) infection
2025-Feb, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.104798
PMID:39799860
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了鸭甲型肝炎病毒3型感染过程中易感与抗性鸭子的肝内分子特征差异 | 首次在鸭病毒性肝炎研究中应用单细胞RNA测序技术,识别了PLAC8作为促进DHAV-3感染的宿主因子,并发现了补体凝血级联和ANGPTL4在易感鸭子中的特异性失调 | 样本量相对有限(14只感染鸭+4只健康对照),研究聚焦于肝脏组织可能忽略其他器官的病理变化 | 解析DHAV-3感染过程中鸭子肝脏的分子病理特征和免疫反应机制 | DHAV-3易感鸭、抗性鸭和健康对照鸭的肝脏细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14只感染鸭(包含易感和抗性个体)和4只健康对照鸭,共140万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |