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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8721 | 2025-10-07 |
Characterization of NK Cells Using Single-Cell RNA Sequencing in Patients With Acute-On-Chronic Liver Failure
2025-Apr, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.16870
PMID:39800654
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析慢加急性肝衰竭患者外周血中NK细胞亚群的特征及其在疾病进展中的作用 | 首次在ACLF患者中通过单细胞RNA测序系统鉴定NK细胞亚群,并发现炎症性NK细胞与疾病进展的相关性 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证结果 | 探究慢加急性肝衰竭患者外周血中NK细胞亚群的特征及其在炎症反应中的作用 | 慢加急性肝衰竭患者和健康对照者的外周血NK细胞 | 单细胞组学 | 肝衰竭 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 14,751个NK细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8722 | 2025-10-07 |
ODSEI Chip: An Open 3D Microfluidic Platform for Studying Tumor Spheroid-Endothelial Interactions
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410659
PMID:39805002
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研究论文 | 介绍一种新型开放式3D微流控平台ODSEI芯片,用于研究肿瘤球体与内皮细胞的相互作用 | 开发了能够阵列1000多个肿瘤球体的开放式3D微阵列平台,实现单球体水平的药物耐药性分析 | NA | 研究肿瘤球体与内皮细胞相互作用及其在药物耐药性中的作用 | 乳腺癌肿瘤球体和血管内皮细胞 | 生物医学工程 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,蛋白质阵列 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | 超过1000个肿瘤球体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 开放式3D微流控平台ODSEI芯片 |
8723 | 2025-10-07 |
Unleashing the Power of Multiomics: Unraveling the Molecular Landscape of Peripheral Neuropathy
2025-Apr, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70019
PMID:40126913
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综述 | 本文回顾了基因组技术在周围神经病变研究中的演变,重点分析了多组学技术在揭示疾病分子机制方面的潜力 | 系统整合了传统基因组技术与新兴多组学技术(包括RNA测序和蛋白质组学),为周围神经病变提供全面病理生理学见解 | 标准化这些技术用于临床仍面临挑战,需要建立更完善的指导方针 | 探索周围神经病变的分子机制,提升诊断准确性和治疗策略 | 周围神经病变患者及其分子特征 | 基因组学与多组学分析 | 周围神经病变 | NGS, 长读长测序, 单细胞测序, RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 全基因组关联研究, 靶向基因panel测序, 全外显子/基因组测序, 单细胞测序 | NA | NA |
8724 | 2025-10-07 |
Flow-Cytometric Quantification of Urine Kidney Epithelial Cells Specifically Reflects Tubular Damage in Acute Kidney Diseases
2025-Apr, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2025.01.037
PMID:40303202
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研究论文 | 本研究开发了一种通过流式细胞术定量尿液中肾上皮细胞的方法,用于特异性反映急性肾疾病中的肾小管损伤 | 通过CITE-Seq技术将尿液单细胞转录组与TEC表面蛋白对齐,首次建立了流式细胞术定量尿液中近端和远端肾小管上皮细胞的标准化方案 | 样本量相对有限,需要在更广泛的患者群体中进一步验证 | 建立肾小管上皮细胞作为肾小管损伤的临床标志物 | 急性肾损伤患者、COVID-19感染者、ANCA相关性血管炎患者和健康对照者 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞测序, CITE-Seq, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 表面蛋白表达数据 | 243名患者(包括8个AKI和肾小球疾病患者的测序样本,以及4个队列共235名验证患者) | NA | 单细胞RNA-seq, 表位测序 | NA | NA |
8725 | 2025-10-07 |
Investigating the Prognostic Role of Telomerase-Related Cellular Senescence Gene Signatures in Breast Cancer Using Machine Learning
2025-Mar-30, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13040826
PMID:40299459
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,建立了与端粒维持和细胞衰老相关的基因特征,用于乳腺癌预后预测 | 开发了包含19个关键端粒和衰老相关基因的新型预后特征,并采用包含101种算法组合的机器学习框架进行模型构建 | NA | 研究端粒酶相关细胞衰老基因特征在乳腺癌中的预后作用 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | 随机生存森林, 岭回归 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
8726 | 2025-10-07 |
A multi-view graph convolutional network framework based on adaptive adjacency matrix and multi-strategy fusion mechanism for identifying spatial domains
2025-Mar-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf172
PMID:40233119
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研究论文 | 提出了一种基于自适应邻接矩阵和多策略融合机制的多视图图卷积网络框架STMGAMF,用于识别空间转录组数据中的空间域 | 采用自适应邻接矩阵动态调整边权重以捕捉复杂空间结构,并通过多策略融合机制优化嵌入特征 | NA | 解决空间转录组数据中空间域识别的挑战 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 多视图图卷积网络 | 基因表达数据和空间位置信息 | 多个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
8727 | 2025-10-07 |
Migrasome-Related Genes as Potential Prognosis and Immunotherapy Response Predictors for Colorectal Cancer
2025-Mar-26, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13040799
PMID:40299331
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研究论文 | 通过生物信息学分析迁移体相关基因在结直肠癌预后和免疫治疗反应中的潜在作用 | 首次系统研究迁移体相关基因在结直肠癌预后和免疫治疗反应中的预测价值 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探索迁移体相关基因作为结直肠癌预后和免疫治疗反应预测标志物的潜力 | 结直肠癌患者和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,差异表达基因分析 | 风险预测模型 | 基因表达数据 | TCGA-CRC数据集和GSE231559单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8728 | 2025-10-07 |
Migrasome Marker Epidermal Growth Factor Domain-Specific O-GlcNAc Transferase: Pan-Cancer Angiogenesis Biomarker and the Potential Role of circ_0058189/miR-130a-3p/EOGT Axis in Hepatocellular Carcinoma Progression and Sorafenib Resistance
2025-Mar-22, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13040773
PMID:40299340
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研究论文 | 本研究系统分析了迁移体标志物EOGT在泛癌中的致癌机制,特别聚焦于其在肝细胞癌进展和索拉非尼耐药中的作用 | 首次确立EOGT作为泛癌血管生成生物标志物,并发现外泌体circ_0058189/miR-130a-3p/EOGT轴在肝细胞癌治疗耐药中的调控机制 | EOGT在泛癌中的功能和治疗意义仍需进一步探索 | 系统表征EOGT在恶性肿瘤中的致癌机制,特别关注肝细胞癌进展和索拉非尼耐药 | 33种癌症类型的TCGA/GTEx数据、10个肝细胞癌队列、Huh7细胞模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 多组学分析、空间/单细胞转录组学、RNA测序、ceRNA网络构建 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 33种癌症类型的TCGA/GTEx数据、10个肝细胞癌队列 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
8729 | 2025-10-07 |
Protocol for transcriptomic and epigenomic analyses of tip-like endothelial cells using scRNA-seq and ChIP-seq
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103326
PMID:39799578
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研究论文 | 本文提出了一种用于分析尖端样内皮细胞转录组和表观基因组的实验方案 | 开发了结合单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀测序的综合分析方案,适用于多种组学研究 | NA | 建立尖端样内皮细胞的转录组和表观基因组分析流程 | 人脐静脉内皮细胞(HUVECs) | 表观基因组学 | NA | scRNA-seq, ChIP-seq | NA | 转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
8730 | 2025-10-07 |
Protocol for the isolation of silk glands from silkworms for snRNA-seq and spatial transcriptomics
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103581
PMID:39804771
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研究论文 | 本文提供了一个从蚕中分离丝腺并进行单核RNA测序和空间转录组学分析的实验方案 | 开发了专门针对蚕丝腺的核分离和高质量组织切片制备方法,首次实现了丝腺细胞在单细胞分辨率下的空间分布研究 | 该方案主要针对蚕丝腺组织,可能不适用于其他昆虫组织,且需要专门的实验设备和技术 | 建立蚕丝腺单核RNA测序和空间转录组学分析的标准实验流程 | 蚕的丝腺组织 | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 冷冻切片, RNA捕获测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
8731 | 2025-10-07 |
Developing and experimental validating a T cell senescence-related gene signature to predict prognosis and immunotherapeutic sensitivity in non-small cell lung cancer
2025-Mar-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149233
PMID:39800199
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研究论文 | 开发并实验验证了一个T细胞衰老相关基因特征,用于预测非小细胞肺癌的预后和免疫治疗敏感性 | 首次构建了基于T细胞衰老相关基因的风险模型,并通过多组学数据和实验验证其在NSCLC预后和免疫治疗预测中的价值 | 研究样本量相对有限,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 预测非小细胞肺癌患者的预后和免疫治疗敏感性 | 非小细胞肺癌患者组织和T细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 多变量Cox回归, 细胞共培养实验 | 多变量Cox回归模型, 机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-NSCLC数据集训练,8个GEO独立队列验证,10对癌旁和癌组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
8732 | 2025-10-07 |
Comparative Single-Cell Transcriptomics of Human Neuroblastoma and Preclinical Models Reveals Conservation of an Adrenergic Cell State
2025-Mar-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1507
PMID:39808065
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研究论文 | 通过单细胞转录组学比较人类神经母细胞瘤与临床前模型的细胞状态保守性 | 首次通过单细胞RNA测序系统比较TH-MYCN转基因小鼠模型、体外肿瘤球与人类神经母细胞瘤的转录景观,发现肾上腺素能细胞状态的保守性 | 研究主要基于TH-MYCN转基因小鼠模型,其他神经母细胞瘤模型的适用性仍需验证 | 验证临床前模型对人类神经母细胞瘤细胞身份的再现程度 | 人类神经母细胞瘤患者样本、TH-MYCN转基因小鼠肿瘤、体外肿瘤球培养物 | 单细胞转录组学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类神经母细胞瘤患者样本、TH-MYCN小鼠肿瘤样本、体外肿瘤球培养物 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8733 | 2025-10-07 |
An augmented GSNMF model for complete deconvolution of bulk RNA-seq data
2025-Mar-14, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2025036
PMID:40296800
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研究论文 | 提出一种增强的GSNMF模型用于批量RNA-seq数据的完全解卷积分析 | 开发了伪批量组织数据增强的几何结构引导NMF模型(GSNMF+),通过统计分布模拟伪细胞组成和单细胞RNA-seq数据生成伪批量组织数据,并利用估计的重缩放矩阵调整NMF最小值 | 在奇异细胞组成场景中表现较好,但未明确说明在其他复杂场景中的适用性限制 | 解决批量RNA-seq数据完全解卷积分析的数学不适定问题,提高细胞类型特异性基因表达谱和相对细胞丰度估计的准确性 | 批量RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NMF, GSNMF | 基因表达数据 | 多个真实批量组织数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
8734 | 2025-10-07 |
Identification of Pathogenic PD-1+CD8+ T Cells for Effective Chimeric Antigen Receptor Therapy in a Murine Model of Sjögren Disease
2025-Mar-03, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43144
PMID:40026078
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研究论文 | 本研究通过识别干燥综合征中的致病性PD-1+CD8+ T细胞,开发了PD-1靶向CAR-T细胞疗法并在小鼠模型中验证其疗效 | 首次将PD-1鉴定为致病性CD8+ T细胞的标志物,并开发了针对该细胞亚群的CAR-T细胞疗法 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 开发针对干燥综合征致病性T细胞的靶向治疗策略 | 干燥综合征患者样本和Il12b-/-Il2ra-/-小鼠模型 | 免疫治疗 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,T细胞受体分析 | CAR-T细胞疗法 | 基因表达数据,流式细胞数据,组织病理数据 | 干燥综合征患者和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8735 | 2025-10-07 |
Novel biallelic MCMDC2 variants were associated with meiotic arrest and nonobstructive azoospermia
2025-Mar-01, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202495
PMID:39789727
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研究论文 | 本研究通过全外显子组测序在768名非梗阻性无精子症患者中发现MCMDC2基因的双等位基因有害变异与生精停滞相关 | 首次发现MCMDC2基因双等位基因变异与非梗阻性无精子症的关联,揭示了该基因在人类精子发生中的新功能 | 样本量有限(768名患者),仅发现4个变异(0.5%),需要更大规模研究验证 | 探索非梗阻性无精子症的遗传病因,特别是MCMDC2基因的作用机制 | 768名非梗阻性无精子症患者 | 生殖医学遗传学 | 男性不育症 | 全外显子组测序, 苏木精-伊红染色, 免疫荧光染色, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组测序数据, 组织染色图像, 单细胞转录组数据 | 768名NOA患者 | NA | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8736 | 2025-10-07 |
A creatine efflux transporter in oligodendrocytes
2025-Mar, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.17382
PMID:39792585
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研究论文 | 本研究揭示了转运蛋白SLC22A15在少突胶质细胞中作为关键肌酸外排转运蛋白的功能机制 | 首次发现SLC22A15是少突胶质细胞中受控肌酸释放的关键转运蛋白,填补了脑内肌酸代谢机制的关键空白 | 研究主要基于293细胞的异源表达实验,需要进一步在原生少突胶质细胞中验证功能 | 探究脑内肌酸从产生细胞释放的分子机制 | 转运蛋白SLC22A15在少突胶质细胞中的功能 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 质谱分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,代谢物检测数据 | 人类和大鼠的细胞系及组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8737 | 2025-10-07 |
Exosome-Mediated Lectin Pathway and Resistin-MIF-AA Metabolism Axis Drive Immune Dysfunction in Immune Thrombocytopenia
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412378
PMID:39792656
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了外泌体介导的凝集素补体途径和抵抗素-MIF-AA代谢轴在免疫性血小板减少症发病机制中的作用 | 首次发现外泌体介导的凝集素补体途径参与ITP发病,并阐明抵抗素和MIF通过促炎信号通路导致免疫细胞过度活化和AA代谢紊乱 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 探索免疫性血小板减少症的发病机制和潜在治疗靶点 | 免疫性血小板减少症患者样本 | 免疫学 | 免疫性血小板减少症 | 流式细胞术,蛋白质组学,单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | ITP患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
8738 | 2025-10-07 |
Cell-Type Specific miRNA Regulatory Network Responses to ABA Stress Revealed by Time Series Transcriptional Atlases in Arabidopsis
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415083
PMID:39792694
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研究论文 | 本研究通过拟南芥ABA胁迫下的单细胞转录组时序图谱,揭示了细胞类型特异的miRNA调控网络响应机制 | 首次在单细胞水平构建ABA胁迫下的时序转录图谱,发现miRNA在调控网络中的枢纽作用及细胞类型特异性响应模式 | 研究仅针对拟南芥ABA胁迫响应,未验证其他植物或胁迫条件 | 揭示植物在ABA胁迫下细胞类型特异的miRNA调控网络动态响应机制 | 拟南芥在不同ABA处理时间点的单细胞转录组 | 单细胞转录组学 | 植物胁迫响应 | 单细胞RNA测序 | 调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 拟南芥不同时间点(早期、中期、晚期)ABA处理的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8739 | 2025-10-07 |
The molecular structure of SHISA5 protein and its novel role in primary biliary cholangitis: From single-cell RNA sequencing to biomarkers
2025-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.139775
PMID:39800023
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示SHISA5蛋白在原发性胆汁性胆管炎中的表达特征及其分子结构 | 首次发现SHISA5蛋白在PBC患者肝组织中高表达,并揭示其可能通过调控胆管细胞分化参与疾病进程 | 样本量有限,功能机制尚未通过实验验证 | 探究SHISA5蛋白在原发性胆汁性胆管炎中的表达特征和生物学功能 | PBC患者和健康对照者的肝组织样本 | 数字病理学 | 原发性胆汁性胆管炎 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | PBC患者和健康对照者的肝组织样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8740 | 2025-10-07 |
Dectin-2 depletion alleviates osteoclast-induced bone loss in periodontitis via Syk/NOX2/ROS signaling
2025-Mar-01, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究揭示了Dectin-2通过Syk/NOX2/ROS信号轴促进破骨细胞分化和牙周炎骨吸收的新机制 | 首次发现Dectin-2在破骨细胞分化中的关键作用及其通过Syk/NOX2/ROS/MAPK信号轴的调控机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究Dectin-2在破骨细胞分化和牙周炎骨吸收中的作用机制 | RAW264.7细胞、骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)、Dectin-2基因敲除小鼠 | 分子生物学 | 牙周炎 | 单细胞测序、转录组分析、基因敲除、基因过表达 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据、动物模型数据 | 细胞系和小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、转录组测序 | NA | NA |