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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8701 | 2025-10-07 |
Single-nucleus RNA sequencing reveals a preclinical model for the most common subtype of glioblastoma
2025-Apr-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08092-x
PMID:40295632
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研究论文 | 通过单核RNA测序揭示最常见胶质母细胞瘤亚型的临床前模型特征 | 首次在免疫活性小鼠模型中利用单核RNA测序系统表征胶质母细胞瘤及其肿瘤微环境在不同阶段和治疗下的变化 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步验证在人类患者中的适用性 | 建立和验证胶质母细胞瘤临床前模型,为开发新疗法提供基础 | 胶质母细胞瘤干细胞颅内植入的免疫活性小鼠模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单核RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 单核RNA测序用于细胞表征,Visium空间转录组学用于确认细胞定位 |
8702 | 2025-10-07 |
Integrated spatial and single cell transcriptomics identifies PRKDC as a dual prognostic biomarker and therapeutic target in hepatocellular carcinoma
2025-Apr-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-98866-4
PMID:40295654
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学、单细胞转录组学和批量RNA测序技术,首次发现PRKDC是肝细胞癌的可靠预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次整合空间转录组学和单细胞转录组学技术研究PRKDC在肝细胞癌中的作用,揭示了其在肿瘤免疫微环境中的新功能 | NA | 探索PRKDC在肝细胞癌预后评估中的生物标志物价值及其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌组织样本和细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 拷贝数变异分析 | NA | 转录组数据, 基因组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
8703 | 2025-10-07 |
Unveiling the heterogeneity and immunotherapy potency of tumor-associated neutrophils in the tumor microenvironment of gastric cancer
2025-Apr-28, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-025-03920-0
PMID:40295944
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了胃癌肿瘤微环境中肿瘤相关中性粒细胞的异质性及其与恶性上皮细胞的相互作用 | 首次系统描绘了胃癌中肿瘤相关中性粒细胞的五个亚群及其与上皮细胞的相互作用网络,并发现RGS2在MMP9高表达的N4亚群中特异性高表达 | 样本量相对有限(12个样本),需要更大规模的研究验证发现 | 探究胃癌肿瘤微环境中中性粒细胞的分化特征及其在免疫治疗中的潜力 | 胃癌患者组织样本中的上皮细胞和肿瘤相关中性粒细胞 | 单细胞转录组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,bulk转录组数据 | 12个样本(包括胃癌原发肿瘤、非肿瘤组织和转移性肿瘤) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8704 | 2025-10-07 |
Characterization of T cells in the progression of dry eye disease using single-cell RNA sequencing in mice
2025-Apr-28, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-02607-2
PMID:40296131
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了小鼠干眼病进展过程中T细胞的动态变化和异质性功能状态 | 首次在干眼病模型中结合飞行时间质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术,系统描绘了T细胞在疾病进展中的动态变化轨迹和细胞间通讯网络 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 阐明T细胞在干眼病进展中的调控作用 | 小鼠干眼病模型中的T细胞 | 单细胞组学 | 干眼病 | 单细胞RNA测序, 飞行时间质谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠干眼病模型在不同时间点(第3天和第7天)的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8705 | 2025-10-07 |
Cardiac endothelial cells and cardiomyocytes alter their communication properties in diabetic mice
2025-Apr-28, Biological research
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40659-025-00602-9
PMID:40296165
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析糖尿病小鼠心脏中内皮细胞和心肌细胞的异质性及通讯特性变化 | 首次在糖尿病模型中系统揭示心脏内皮细胞和心肌细胞的亚群异质性及其通讯网络改变,发现ANGPTL和SEMA4信号通路在糖尿病心脏中的关键作用 | 研究基于公开数据集,缺乏实验验证;样本量有限;仅使用链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠模型 | 探索糖尿病条件下心脏细胞异质性及细胞间通讯特性 | 糖尿病小鼠心脏组织中的内皮细胞和心肌细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 细胞聚类分析、轨迹分析、细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | GSE213337数据集中的对照和糖尿病小鼠心脏样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
8706 | 2025-10-07 |
Deciphering immune cell heterogeneity in vascular diseases: Insights from single-cell sequencing
2025-Apr-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114719
PMID:40306113
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综述 | 系统总结单细胞测序技术在血管疾病中揭示免疫细胞异质性的最新应用 | 扩展了先前研究,系统总结了单细胞测序在血管疾病中的最新应用,重点关注新发现的免疫细胞亚群及其功能可塑性 | 作为综述文章,不包含原始实验数据,主要基于现有文献分析 | 阐明免疫细胞在血管疾病中的异质性及其病理机制 | 血管疾病中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8707 | 2025-10-07 |
Novel biomarkers related to mitochondrial permeability transition driven-necrosis in hypertrophic cardiomyopathy
2025-Apr-28, Journal of cardiology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.jjcc.2025.04.008
PMID:40306461
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研究论文 | 本研究通过转录组学和孟德尔随机化分析,探索线粒体通透性转换驱动的坏死相关基因在肥厚型心肌病中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序、转录组测序和孟德尔随机化分析识别与肥厚型心肌病中线粒体通透性转换驱动坏死相关的新基因 | 研究基于公共数据库的基因表达数据,需要进一步实验验证 | 探索线粒体通透性转换驱动坏死相关基因与肥厚型心肌病的关联 | 肥厚型心肌病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 肥厚型心肌病 | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 孟德尔随机化分析, 基因集富集分析 | NA | 基因表达数据 | 三个GEO数据集:GSE36961(训练集)、GSE141910(验证集)、GSE174691(单细胞数据集) | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
8708 | 2025-10-07 |
Ferroptosis and low-grade Glioma: The breakthrough potential of NUAK2
2025-Apr-24, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析发现NUAK2基因是低级别胶质瘤中铁死亡相关基因的关键调控因子,并验证其作为潜在治疗靶点的价值 | 首次系统鉴定低级别胶质瘤中铁死亡相关基因的预后价值,并通过单细胞RNA测序和实验验证揭示NUAK2在肿瘤进展和免疫抑制中的关键作用 | 研究队列规模有限,需要更大样本验证NUAK2的临床应用价值 | 探索铁死亡相关基因在低级别胶质瘤预后和肿瘤微环境调控中的作用 | 低级别胶质瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 低级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序,多组学数据分析,假时序轨迹分析,体外和体内实验验证 | NA | 基因组数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA、CGGA和GEO数据库的多组学数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8709 | 2025-10-07 |
Vitamin A treatment restores vision failures arising from Leber's hereditary optic neuropathy-linked mtDNA mutation
2025-Apr-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.188962
PMID:40036074
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研究论文 | 本研究通过维生素A治疗成功恢复了由Leber遗传性视神经病变相关mtDNA突变引起的视力缺陷 | 首次揭示LHON相关mtDNA突变导致维生素A代谢异常,并证明维生素A补充能有效改善视网膜功能和线粒体形态 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探究LHON相关mtDNA突变的视网膜细胞特异性机制并开发有效治疗方法 | 携带LHON相关ND6P25L突变的小鼠模型及其视网膜细胞 | 线粒体视网膜病变研究 | Leber遗传性视神经病变 | 单细胞RNA测序,电生理学检测 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据,形态学数据,电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8710 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics delineates potential differences in intestinal phenotypes of cardiac and classical necrotizing enterocolitis
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112166
PMID:40201118
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学比较了心脏性和经典型坏死性小肠结肠炎(NEC)的肠道表型差异 | 首次在空间转录组水平揭示两种NEC亚型在免疫和上皮细胞区段的通路和网络差异 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究心脏性和经典型坏死性小肠结肠炎的分子机制差异 | 坏死性小肠结肠炎患者的回肠组织 | 空间转录组学 | 坏死性小肠结肠炎 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
8711 | 2025-10-07 |
Regulatory T Cell Mimicry by a Subset of Mesenchymal GBM Stem Cells Suppresses CD4 and CD8 Cells
2025-04-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14080592
PMID:40277917
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研究论文 | 本研究通过多组学方法发现胶质母细胞瘤中具有免疫抑制功能的Treg样间充质干细胞亚群及其TGFBR2依赖性机制 | 首次发现间充质胶质瘤干细胞通过模拟调节性T细胞形成免疫抑制状态,并揭示TGFBR2特异性驱动该过程的分子机制 | 研究主要基于患者来源的细胞模型,需要进一步体内验证;TGFBR2靶向治疗的临床转化效果仍需评估 | 阐明胶质母细胞瘤免疫抑制微环境中肿瘤干细胞的分子机制和功能特征 | 胶质母细胞瘤患者来源的胶质瘤干细胞和T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 生物信息学分析、单细胞测序、分子药理学干预、shRNA基因沉默 | NA | 基因组数据、单细胞测序数据、临床样本数据 | 患者来源的胶质母细胞瘤神经球和临床标本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
8712 | 2025-10-07 |
Integration of Transcriptomic and Single-Cell Data to Uncover Senescence- and Ferroptosis-Associated Biomarkers in Sepsis
2025-Apr-11, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13040942
PMID:40299574
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞数据,揭示了脓毒症中铁死亡和细胞衰老相关的生物标志物 | 首次系统整合WGCNA和单细胞RNA测序技术,识别脓毒症中铁死亡和衰老相关的关键基因及其在免疫细胞中的特异性表达 | 需要进一步的临床验证和精准医学应用研究 | 探索脓毒症的发病机制并识别诊断和靶向治疗的生物标志物 | 脓毒症患者和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | WGCNA, 差异表达基因分析, ROC分析, 单细胞RNA测序, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自三个公共数据集(GSE57065, GSE65682, GSE26378)的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组分析 | NA | NA |
8713 | 2025-10-07 |
Comprehensive Integrated Analysis Reveals the Spatiotemporal Microevolution of Cancer Cells in Patients with Bone-Metastatic Prostate Cancer
2025-Apr-09, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13040909
PMID:40299503
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研究论文 | 通过整合分析124个样本的单细胞转录组数据,系统揭示了前列腺癌骨转移中癌细胞的异质性和微环境适应机制 | 发现了具有独特分化模式和空间分布特征的新型上皮亚群NEndoCs,并揭示了癌细胞在转移过程中的关键进化轨迹 | 样本主要来自已形成的骨转移灶,对早期转移过程的研究有限 | 系统表征前列腺癌骨转移的异质性和微环境适应机制 | 前列腺癌患者原发肿瘤、骨转移灶和非恶性组织的细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序 | 无监督聚类 | 单细胞转录组数据 | 124个样本,602,497个高质量单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8714 | 2025-10-07 |
Immune Regulation and Disulfidptosis in Atherosclerosis Influence Disease Progression and Therapy
2025-Apr-09, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13040926
PMID:40299531
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和生物信息学分析揭示了动脉粥样硬化中免疫调节和二硫键死亡的作用机制 | 首次发现平滑肌细胞中二硫键死亡现象,并构建了包含CTSC、TGFBI和GMFG的诊断风险评分模型 | 研究未详细探讨其他细胞类型在二硫键死亡中的作用机制 | 探索动脉粥样硬化的分子机制并开发诊断和治疗策略 | 动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞和平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 伪时间轨迹分析, WGCNA, 机器学习 | 诊断风险评分模型, 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8715 | 2025-10-07 |
Exploring Immune-Related Ferroptosis Genes in Thyroid Cancer: A Comprehensive Analysis
2025-Apr-08, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13040903
PMID:40299520
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,探索甲状腺癌中免疫相关铁死亡基因,并构建预后风险模型 | 首次在甲状腺癌中系统鉴定免疫相关铁死亡基因,并基于这些基因构建了稳健的预后模型 | 研究样本主要来自TCGA数据库,需要进一步实验验证 | 探索甲状腺癌中免疫相关铁死亡基因,发现新的治疗靶点并改善预后评估 | 甲状腺癌患者样本和正常甲状腺组织 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, CIBERSORTx, WGCNA, LASSO Cox回归 | 预后风险评分模型 | 基因表达数据 | TCGA-THCA数据库中的甲状腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
8716 | 2025-10-07 |
Integrative bioinformatics analysis reveals mitochondrial-Immune crosstalk in depression and stroke: a multi-omics mechanistic exploration
2025-Apr-02, Progress in neuro-psychopharmacology & biological psychiatry
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.pnpbp.2025.111308
PMID:40058518
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研究论文 | 通过整合生物信息学方法探索线粒体-免疫相互作用在抑郁症和脑卒中中的分子机制 | 首次系统揭示线粒体相关差异表达基因与免疫微环境的复杂互作网络,并识别出10个关键hub-MitoDEGs和10种潜在靶向药物 | 基于生物信息学分析的预测性结果需要实验验证,样本来源和规模可能存在限制 | 阐明线粒体代谢与免疫微环境在抑郁症和脑卒中发病机制中的相互作用 | 抑郁症和脑卒中患者的基因表达数据及线粒体基因数据 | 生物信息学 | 抑郁症,脑卒中 | 基因表达谱分析,单细胞RNA测序,蛋白质相互作用网络分析 | 生物信息学分析流程 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,多组学分析 | NA | NA |
8717 | 2025-10-07 |
Integrated genetic analysis and single cell-RNA sequencing for brain image-derived phenotypes and Parkinson's disease
2025-Apr-02, Progress in neuro-psychopharmacology & biological psychiatry
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.pnpbp.2025.111317
PMID:40081564
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研究论文 | 通过整合遗传分析和单细胞RNA测序技术,研究脑影像表型与帕金森病之间的遗传关联和生物学机制 | 首次系统性地整合GWAS汇总统计数据和scRNA-seq数据,识别脑影像表型与帕金森病之间的共享遗传结构和细胞类型特异性表达谱 | 基于汇总统计数据而非原始个体数据,无法进行更深入的个体层面分析 | 揭示脑影像表型与帕金森病之间的遗传和生物学联系 | 624个脑影像表型和帕金森病 | 生物信息学 | 帕金森病 | GWAS, scRNA-seq, LDSC, Mendelian randomization, MAGMA, PLACO, FUMA, Metascape | MR, meta-analysis | 遗传汇总统计数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8718 | 2025-10-07 |
Application of bioinformatic tools in cell type classification for single-cell RNA-seq data
2025-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 比较评估支持向量机四种不同核函数在单细胞RNA测序数据细胞类型分类中的性能 | 首次系统比较SVM四种核函数在单细胞RNA-seq数据分类中的表现,发现线性和sigmoid核能达到约99%的准确率 | 仅使用了三个标准数据集,未在更大规模或更复杂的数据集上验证 | 开发更有效的单细胞RNA测序数据细胞类型分类方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | SVM | 基因表达数据 | 三个标准scRNA-seq数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
8719 | 2025-10-07 |
PcoCas12a: A novel CRISPR enzyme from Prevotella copri enhancing TCR-T-cell tumor suppression
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.139740
PMID:39800033
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研究论文 | 本研究鉴定了一种来自Prevotella copri的新型基因编辑酶PcoCas12a,并证明其在TCR-T细胞中通过敲除DGKα基因增强肿瘤抑制能力 | 发现了一种新型CRISPR酶PcoCas12a,具有更广的编辑位点范围和更高的编辑效率,特别是在T细胞编辑中表现优于AsCas12a | NA | 开发用于免疫细胞编辑的高效基因编辑工具 | TCR-T细胞和DGKα基因 | 基因编辑 | 肿瘤 | CRISPR基因编辑,单细胞测序 | NA | 基因编辑效率数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
8720 | 2025-10-07 |
Update on mast cell biology
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1092
PMID:39800266
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综述 | 本文回顾了2022-2024年间关于肥大细胞生物学研究的关键进展 | 整合了单细胞RNA测序等新技术对肥大细胞异质性和功能的新认识 | NA | 更新对肥大细胞生物学的理解 | 小鼠和人类肥大细胞 | NA | 过敏炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |