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当前共找到 40675 篇文献，本页显示第 8701 - 8720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8701 | 2026-01-29 |
COL6A1, LAPTM5, and ZFAND2A as Crucial Biomolecules Driving Immunoregulation in Human Nucleus Pulposus Degeneration
2025-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500320R
PMID:41124083
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、转录组学和孟德尔随机化分析，揭示了椎间盘退变中关键的免疫调控生物分子及其作用机制 | 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析相结合，系统性地识别了与椎间盘退变风险显著相关的关键基因（COL6A1、LAPTM5、ZFAND2A），并阐明了它们在免疫微环境中的调控作用 | 样本量较小（仅4名患者），且研究结果主要在蛋白水平进行了验证，缺乏更深入的体内功能实验验证 | 探究椎间盘退变的免疫调控机制，并识别驱动该过程的关键生物分子 | 人类髓核组织 | 生物信息学 | 椎间盘退行性疾病 | 单细胞RNA测序，转录组学，孟德尔随机化分析，eQTL分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，转录组数据，基因组关联数据 | 4名椎间盘退变患者的髓核样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8702 | 2026-01-29 |
A Lactylation-Based Diagnostic Model Reveals Molecular Subtypes and Therapeutic Targets in Dilated Cardiomyopathy
2025-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502739R
PMID:41137708
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据和乳酸化相关基因，构建了一个基于乳酸化的诊断模型，用于扩张型心肌病的分子分型和治疗靶点识别 | 首次将蛋白质乳酸化与扩张型心肌病诊断模型结合，利用集成机器学习算法识别核心乳酸化相关基因，并揭示了两种分子亚型及免疫代谢重塑机制 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，缺乏大规模前瞻性临床队列验证，且治疗化合物的预测需进一步实验证实 | 开发基于乳酸化相关基因的扩张型心肌病诊断模型，探索分子亚型及潜在治疗靶点 | 扩张型心肌病患者及小鼠心肌组织的转录组和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | 集成机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个外部队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8703 | 2026-01-29 |
β-cell heterogeneity and molecular plasticity in type 2 diabetes: multi-omics perspectives and the role of gut microbiota
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1698296
PMID:41584842
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综述 | 本文综述了利用多组学技术揭示2型糖尿病中β细胞的异质性与分子可塑性，并探讨了肠道微生物群在其中的作用及潜在治疗策略 | 整合单细胞转录组学、表观基因组学、空间转录组学等多组学视角与肠道微生物组研究，提出了理解β细胞功能失调与微生物群介导代谢调控的综合框架 | 作为一篇综述文章，主要整合现有证据而非提出新的原始数据，且微生物群与β细胞功能间的因果机制仍需更多实验验证 | 阐明2型糖尿病中β细胞的异质性、分子可塑性及其与肠道微生物群的相互作用，以寻找潜在治疗靶点 | 胰腺β细胞、胰岛其他内分泌细胞、免疫细胞、基质细胞、胰腺外分泌部分以及肠道微生物群 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞转录组学、表观基因组学、空间转录组学、多组学整合分析 | NA | 转录组数据、表观基因组数据、空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8704 | 2026-01-29 |
Single-cell analysis of microglial activation after traumatic brain injury reveals immune signaling pathways linked to mitochondrial dysfunction and brain aging
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1657523
PMID:41583003
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学绘制了创伤性脑损伤后小胶质细胞动态响应的图谱，并验证了与线粒体功能障碍和脑衰老相关的关键免疫信号通路 | 首次整合多个组织和时间点，提供了创伤性脑损伤后小胶质细胞-髓系细胞相互作用的单细胞转录组图谱，并将小胶质细胞信号与线粒体功能障碍和神经炎症联系起来 | 研究主要基于公开数据集和体外模型验证，缺乏体内功能验证，且样本量有限 | 绘制创伤性脑损伤后小胶质细胞的动态响应图谱，并验证关键信号通路 | 小鼠的皮质、海马体和血液样本中的髓系细胞（包括单核细胞、巨噬细胞和小胶质细胞） | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞转录组学，qPCR | NA | 转录组数据 | 35只小鼠（11个血液样本，12个皮质样本，12个海马体样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8705 | 2026-01-29 |
A novel prognostic model based on epithelial cell progression genes identifies OAS1 as a suppressor of bladder cancer aggressiveness
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1716130
PMID:41584451
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研究论文 | 本研究基于上皮细胞肿瘤进展相关基因构建了一个新的膀胱癌预后模型，并发现OAS1是抑制膀胱癌侵袭性的关键基因 | 利用单细胞RNA测序数据识别上皮细胞亚群及其恶性进展轨迹，并基于此构建了一个四基因特征的预后模型，同时通过体外实验验证了关键基因OAS1的功能 | 模型验证依赖于公共数据库的回顾性数据，需要在前瞻性临床队列中进一步验证；体外实验未能完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 识别驱动膀胱癌进展的关键上皮细胞来源特征基因，构建可靠的预后模型，并探索关键基因OAS1的生物学功能 | 膀胱癌患者（来自TCGA和GEO数据库）及膀胱癌细胞系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，LASSO Cox回归，CCK-8，Transwell，伤口愈合实验 | LASSO Cox回归模型 | 单细胞RNA-seq数据，批量RNA-seq数据，临床数据 | TCGA膀胱癌队列及独立GEO验证队列（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8706 | 2026-01-29 |
A robust ammonia metabolism gene signature identified by machine learning predicts prognosis and immunotherapy response in clear cell renal cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1709096
PMID:41584585
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法，识别了一个与氨代谢相关的基因特征，用于预测透明细胞肾细胞癌的预后和免疫治疗反应 | 首次利用机器学习整合多组学数据，构建了氨代谢风险评分模型，并验证了其在预测预后和免疫治疗反应中的有效性，同时通过体外实验验证了关键基因CSAD的功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步的前瞻性临床研究验证模型的普适性 | 开发一个能够预测透明细胞肾细胞癌患者预后和免疫治疗反应的生物标志物 | 透明细胞肾细胞癌患者 | 机器学习 | 肾细胞癌 | RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA, TMB分析 | 随机森林, LASSO, 多元Cox回归 | RNA-seq数据, 多组学数据 | TCGA数据库中的患者数据，以及外部验证队列和免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8707 | 2026-01-29 |
Berberine suppresses hepatocellular carcinoma progression by blocking IL-4-JAK1-STAT6-mediated M2 polarization of macrophage
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1734201
PMID:41585886
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研究论文 | 本研究揭示了小檗碱通过阻断IL-4-JAK1-STAT6信号轴抑制巨噬细胞M2极化，从而抑制肝细胞癌进展的机制 | 首次阐明小檗碱通过直接结合JAK1蛋白的FERM结构域并稳定该蛋白，进而抑制IL-4诱导的巨噬细胞M2极化，并与抗PD-L1抗体联合治疗显示出协同抗肿瘤效应 | 研究主要基于H22荷瘤小鼠模型和体外实验，缺乏临床患者样本验证；联合治疗策略的长期安全性和疗效需进一步评估 | 探究小檗碱是否通过调节肿瘤炎症微环境抑制肝细胞癌进展 | 肝细胞癌（HCC）、肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）、H22肿瘤细胞系、荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、分子对接、蛋白质稳定性测定、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据、细胞表型数据 | H22荷瘤小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8708 | 2026-01-29 |
Integrative transcriptomic analysis reveals microglial metabolic-inflammatory crosstalk of HK2-HSPA5-TNF axis after intracerebral hemorrhage
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1740715
PMID:41601478
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学数据，揭示了脑出血后小胶质细胞中HK2-HSPA5-TNF轴介导的代谢-炎症相互作用 | 首次通过整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学数据，系统揭示了脑出血后小胶质细胞中葡萄糖代谢与炎症反应之间的时空动态调控网络 | 研究主要基于转录组学数据，缺乏蛋白质水平的功能验证；动物模型与人类组织的直接可比性有待进一步确认 | 探究脑出血后葡萄糖代谢失调如何促进神经炎症的发病机制 | 脑出血后的小胶质细胞代谢-炎症调控网络 | 生物信息学 | 脑血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 加权基因共表达网络分析, 伪时间轨迹重建, 细胞间通讯推断 | 转录组数据 | 人类血肿周围组织和小鼠脑出血模型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8709 | 2026-01-29 |
SpaLLM: a general framework for spatial domain identification with large language models
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1713975
PMID:41601479
|
研究论文 | 提出SpaLLM框架，通过整合大语言模型生成的基因描述嵌入与空间转录组学数据，改进空间域识别 | 首次将大语言模型生成的基因功能描述嵌入整合到空间转录组学分析中，利用预计算的GenePT嵌入创建生物学信息丰富的基因表示，从而增强空间域识别的准确性 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 改进空间转录组学中的空间域识别方法 | 空间转录组学数据，包括基因表达矩阵和空间坐标 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 大语言模型 | 基因表达矩阵、空间坐标、基因功能描述文本 | 12个基于测序的Visium切片和一个独立的基于成像的osmFISH数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 基于测序的Visium切片 |
| 8710 | 2026-01-29 |
High-dimensional co-expression network analysis reveals persistent TRH gene expression throughout axolotl telencephalon regeneration
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1697212
PMID:41601481
|
研究论文 | 本研究通过高维加权基因共表达网络分析，结合空间转录组学，揭示了蝾螈端脑再生过程中基因共表达的动态图谱，并识别了包括TRH在内的关键枢纽基因 | 整合hdWGCNA、空间转录组学和蛋白质-蛋白质相互作用网络，首次在蝾螈端脑再生中系统识别了枢纽基因，并发现了TRH基因在多个阶段的持续表达模式 | 研究主要为描述性分析，未进行实验验证枢纽基因的功能机制 | 识别蝾螈端脑再生过程中的枢纽基因并定位其细胞位置，以阐明脑再生的分子基础 | 蝾螈（Ambystoma mexicanum）的端脑再生过程 | 生物信息学 | NA | 高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、空间转录组学、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | NA | 时空转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8711 | 2026-01-29 |
Integrated multi-omics and single-cell analysis identify SERPINE1 as a key mediator of the inflammatory tumor microenvironment in PDAC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1716878
PMID:41601623
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学与单细胞分析，揭示了SERPINE1是胰腺导管腺癌（PDAC）炎症性肿瘤微环境的关键调控因子 | 首次通过整合多组学与单细胞分析，系统性地将SERPINE1确立为PDAC炎症驱动基质重塑和免疫逃逸的核心协调者，并发现其作为药物靶点的新潜力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，体内功能验证和临床转化研究有待进一步开展 | 阐明PDAC炎症性肿瘤微环境中的关键调控因子及其在免疫抑制和肿瘤进展中的作用 | 胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中的细胞与分子 | 生物信息学，单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，多组学分析，分子对接，CRISPR基因敲除 | NA | 基因组，转录组，单细胞转录组数据 | 来自TCGA、GEO、ArrayExpress数据库的多队列数据集，以及IMvigor210队列 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8712 | 2026-01-29 |
From multi-omics to functional validation: the PTMRS stratifies TME and positions PDGFRB in CRC biology
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1728291
PMID:41601676
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研究论文 | 本研究构建了一个基于翻译后修饰相关基因的风险特征模型（PTMRS），用于结直肠癌的预后分层，并通过实验验证了PDGFRβ在肿瘤微环境中的关键作用 | 首次整合多种翻译后修饰信号构建结直肠癌风险模型，并通过单细胞RNA测序和细胞通讯分析揭示了PTMRS与肿瘤微环境的关联，实验验证了PDGFRβ在成纤维细胞中的促癌功能 | 需要在体内模型和前瞻性临床队列中进一步验证 | 开发结直肠癌的精准预后分层工具并探索其生物学机制 | 结直肠癌患者样本、人类结肠成纤维细胞和结直肠癌细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞通讯分析（CellChat）、体外功能实验 | Cox偏最小二乘框架 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和GTEx数据集中的结直肠癌样本，多个独立队列和免疫治疗数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8713 | 2026-01-29 |
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis reveals shared pathogenesis and prognostic biomarkers in breast and thyroid cancers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1710915
PMID:41601694
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析，揭示了乳腺癌和甲状腺癌的共享发病机制及预后生物标志物 | 首次结合单细胞和批量转录组数据，系统探索乳腺癌与甲状腺癌的共病分子机制，并利用机器学习构建预后模型，验证了SMR3B作为共享预后基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分有限，且样本来源和数量可能影响结果的普适性 | 阐明乳腺癌和甲状腺癌的共享发病机制，并识别共同的预后生物标志物和治疗靶点 | 乳腺癌和甲状腺癌的转录组数据，包括单细胞和批量RNA测序数据 | 生物信息学 | 乳腺癌, 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 差异表达基因分析, 功能富集分析, 拷贝数变异分析, 非负矩阵分解, 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法 | 非负矩阵分解, 加权基因共表达网络分析, 机器学习模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8714 | 2026-01-29 |
P2RY13+ dendritic cells correlate with enhanced antigen presentation and lymphocyte activation in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1708670
PMID:41601785
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，揭示了P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的特异性表达于树突状细胞，并阐明了其通过增强抗原呈递和T细胞激活来促进抗肿瘤免疫的作用机制 | 首次在单细胞分辨率下确定了P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的特异性细胞表达谱（树突状细胞），并系统性地将其表达与免疫浸润、细胞间通讯及预后关联起来 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏实验验证来证实P2RY13在树突状细胞中的功能机制 | 探究P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的细胞特异性表达、功能及其与免疫调节和预后的关系 | 肺腺癌患者肿瘤组织及正常组织的转录组和临床数据 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，生物信息学算法 | Seurat, CIBERSORT, MCP-counter, quanTIseq, TIMER, ESTIMATE, CellChat, AUCell, UCell, AddModuleScore, GSVA, JASMINE, singscore, ssGSEA, viper | 转录组数据，单细胞RNA测序数据，临床数据 | 来自TCGA、GEO（GSE68465和GSE31210）和单细胞数据集（GSE131907）的样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8715 | 2026-01-29 |
Cellular senescence in age-related cardiovascular disease: past and future
2025, Frontiers in aging
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/fragi.2025.1721744
PMID:41602167
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综述 | 本文综述了细胞衰老在年龄相关心血管疾病中的作用，并提出了一个以衰老相关分泌表型为核心、解释少数衰老细胞如何系统性影响心血管微环境的统一框架 | 超越对通路的简单罗列，提出了一个以少数衰老细胞如何重编程心血管微环境为核心、整合关键调控网络的统一框架，并前瞻性地讨论了靶向衰老的治疗策略 | 机制复杂性高，动物模型和体外系统存在局限性 | 阐明细胞衰老在年龄相关心血管疾病发生发展中的作用机制，并探讨靶向衰老作为延缓心血管衰老和治疗相关疾病的新策略 | 衰老细胞及其分泌表型对主要心血管细胞类型（心肌细胞、内皮细胞、成纤维细胞、平滑肌细胞）的影响 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8716 | 2026-01-29 |
JAK-centric explainable few-shot gene-expression diagnosis framework for alopecia via MultiPLIER priors and relation-style set-to-set comparison
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1753206
PMID:41602548
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研究论文 | 本文开发了一个基于JAK-STAT信号通路的可解释少样本基因表达诊断框架，用于区分斑秃和雄激素性脱发 | 提出了一种结合生物学先验知识（MultiPLIER潜在变量）和关系式集合比较的少样本深度学习分类器，增强了小样本条件下的诊断鲁棒性和机制可解释性 | 研究样本量有限，且框架在更广泛疾病类型中的应用仍需验证 | 开发可解释的AI框架，用于小样本转录组诊断，以区分斑秃和雄激素性脱发 | 斑秃和雄激素性脱发患者的头皮样本 | 机器学习 | 脱发疾病 | RNA-seq | 少样本深度学习分类器（Relation-style set-to-set comparator） | 基因表达数据 | 未明确指定具体样本数量，但涉及独立AA/AGA/健康头皮样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 8717 | 2026-01-29 |
Spatiotemporal dynamics of spermatogenesis: insights from high-resolution spatial transcriptomics and pseudotime trajectories in mouse testes
2025, Frontiers in reproductive health
IF:2.3Q3
DOI:10.3389/frph.2025.1747902
PMID:41602862
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研究论文 | 本研究利用高分辨率空间转录组学技术揭示了小鼠睾丸中精子发生的时空动态过程 | 采用Salus-STS高分辨率空间转录组学（约1微米分辨率）结合Salus Cellbins算法，首次在单细胞水平上解析了睾丸的空间转录组特征，克服了传统空间转录组学分辨率不足的问题 | 研究仅基于小鼠模型，未直接验证人类样本；高分辨率技术可能受限于样本处理和成本 | 探究精子发生的分子基础和时空动态，以增进对男性生殖生物学的理解 | 小鼠睾丸组织 | 空间转录组学 | 男性不育 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | Salus-STS | Salus-STS高分辨率空间转录组学（约1微米分辨率） |
| 8718 | 2026-01-29 |
Epigenomic, transcriptomic and proteomic characterizations of reference samples
2024-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.09.612110
PMID:39314461
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研究论文 | 本研究通过ATAC-seq、Methyl-seq、RNA-seq和蛋白质组学分析，全面表征了乳腺癌细胞系和配对B细胞系的表观基因组、转录组和蛋白质组景观，提供了多组学参考材料 | 首次为两种细胞系提供了包括表观基因组和蛋白质组在内的全面多组学参考数据，填补了现有参考材料在表观组学和蛋白质组学方面的空白 | 研究仅基于两种细胞系，可能无法完全代表更广泛的生物样本多样性 | 开发和验证用于下一代测序技术和临床应用的参考标准材料 | 乳腺癌细胞系和配对的B细胞系 | 多组学分析 | 乳腺癌 | ATAC-seq, Methyl-seq, RNA-seq, 蛋白质组学分析, 全基因组测序, HiC, scRNA-seq | NA | 基因组、表观基因组、转录组、单细胞RNA-seq和蛋白质组数据 | 两种细胞系（乳腺癌细胞系和配对B细胞系） | Illumina, PacBio, Nanopore | 全基因组测序, HiC, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 甲基化测序, RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 8719 | 2026-01-29 |
Single-cell RNA sequencing data locate ALDH1A2-mediated retinoic acid synthetic pathway to glomerular parietal epithelial cells
2024, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.3389/ebm.2024.10167
PMID:39360029
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综述 | 本文通过挖掘小鼠和人类肾脏的单细胞及单核RNA测序数据库，发现肾小球壁层上皮细胞（PECs）表达全谱的视黄酸合成相关基因，并定位了ALDH1A2介导的视黄酸合成通路，探讨了其在肾脏生理和病理中的潜在作用 | 首次利用单细胞及单核RNA测序数据，系统性地将ALDH1A2介导的视黄酸合成通路定位到肾小球壁层上皮细胞，并揭示了该通路在多种肾脏疾病模型及患者中的表达变化 | 本文主要基于数据挖掘和生物信息学分析，提出的假说（即PECs中ALDH1A2介导的视黄酸合成在肾脏中发挥未定义的作用且其失调介导损伤）仍需通过条件性基因敲除、RNA沉默及转基因小鼠模型等实验进行验证 | 阐明ALDH1A2介导的视黄酸合成通路在肾脏（特别是肾小球壁层上皮细胞）中的定位、表达调控及其在肾脏生理和病理（如肾小球肾炎、急性肾损伤、慢性肾病等）中的潜在作用 | 小鼠和人类肾脏组织，特别是肾小球壁层上皮细胞（PECs） | 数字病理学 | 肾脏疾病（包括肾小球肾炎、急性肾损伤、慢性肾病、糖尿病肾病、局灶节段性肾小球硬化、多囊肾病等） | 单细胞RNA测序，单核RNA测序，Spearman秩相关系数分析，基因本体通路分析 | NA | RNA测序数据（单细胞及单核水平） | NA（涉及多个公开数据库中的小鼠模型及人类患者数据） | NA | 单细胞RNA-seq，单核RNA-seq | NA | NA |
| 8720 | 2026-01-29 |
ExAD-GNN: Explainable Graph Neural Network for Alzheimer's Disease State Prediction from Single-cell Data
2023-Dec-06, APSIPA Transactions on Signal and Information Processing
DOI:10.1561/116.00000239
PMID:41584071
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研究论文 | 本文提出了一种名为ExAD-GNN的可解释图神经网络，用于从单细胞测序数据预测阿尔茨海默病状态 | 通过结合KNN图结构分析单细胞表达谱，ExAD-GNN不仅能预测AD病理状态，还能识别细胞类型特异性标记基因，提供分子层面的疾病机制洞察 | 方法依赖于单细胞测序数据的质量和可用性，可能未完全解决大脑复杂异质性的所有方面 | 开发一种可解释的机器学习方法，以从单细胞数据中准确预测阿尔茨海默病状态并识别相关风险基因 | 阿尔茨海默病患者和对照组的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 单细胞表达谱数据 | 大规模单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |