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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8701 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome profiling of the human endometrium of patients with intrauterine adhesions
2025-Apr-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97433-1
PMID:40301474
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序比较宫腔粘连患者与健康对照者的子宫内膜细胞 | 首次在单细胞分辨率下对宫腔粘连患者子宫内膜进行转录组分析,发现成纤维细胞亚群3的特定富集和功能特征 | 样本量较小(仅5例子宫内膜组织),需要更大规模研究验证 | 探究宫腔粘连的病理生理机制和子宫内膜微环境紊乱 | 人类子宫内膜组织 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例子宫内膜组织(包含患者和健康对照),55,308个原代人类子宫内膜细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8702 | 2025-10-07 |
Integration of multi-omics data to unveil the molecular landscape and role of piRNAs in early-onset colorectal cancer
2025-Apr-29, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04074-2
PMID:40301858
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研究论文 | 通过整合多组学数据揭示早发性结直肠癌的分子特征及piRNAs的作用机制 | 首次系统鉴定PIWIL1/piRNA作为EOCRC的标志物,并发现FR019089等piRNAs具有抑制肿瘤转移的功能 | 样本量相对有限(69例EOCRC),功能验证实验需进一步扩展 | 阐明早发性结直肠癌的分子机制及其侵袭性表型的驱动因素 | 515例结直肠癌患者(69例早发性,446例晚发性)的肿瘤样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学分析(基因组、表观基因组、转录组)、RNA-seq、scRNA-seq、功能实验 | NA | 基因组数据、表观遗传数据、转录组数据 | 515例结直肠癌样本(69例早发性,446例晚发性) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
8703 | 2025-10-07 |
Inhibition of adenosine/A2A receptor signaling suppresses dermal fibrosis by enhancing fatty acid oxidation
2025-Apr-29, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02210-2
PMID:40301970
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研究论文 | 本研究揭示了腺苷/A2A受体信号通过抑制脂肪酸氧化促进皮肤纤维化的新机制 | 首次发现腺苷/A2A受体信号轴通过抑制CREB磷酸化下调CPT1A表达,从而抑制脂肪酸氧化促进皮肤纤维化 | 样本量相对有限(35例SSc患者),机制研究主要基于动物模型和体外实验 | 探索腺苷代谢在系统性硬化症相关皮肤纤维化中的作用机制 | 系统性硬化症患者、小鼠皮肤纤维化模型、人真皮成纤维细胞 | 代谢组学 | 系统性硬化症 | 代谢组学分析、单细胞RNA测序、RNA测序、Seahorse能量代谢分析 | 基因敲除小鼠模型 | 代谢组数据、转录组数据、单细胞测序数据 | 35例SSc患者血浆样本,多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序、代谢组学 | NA | NA |
8704 | 2025-10-07 |
Single-cell multi-dimensional data analysis decodes RNF19A-mediated drug resistance in rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes: mechanisms and biological insights
2025-Apr-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05707-8
PMID:40293542
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研究论文 | 本研究通过单细胞多维度数据分析揭示了RNF19A介导类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞药物耐药性的机制 | 首次发现RNF19A在耐药FLS中显著过表达,并阐明其通过泛素化降解MKP-1激活MAPK信号通路,形成正反馈循环的分子机制 | 基于公共数据库分析,需要进一步实验验证;机制研究主要在细胞水平进行 | 探索类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞药物耐药性的分子机制 | 骨关节炎和类风湿关节炎滑膜组织中的成纤维样滑膜细胞(FLS) | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 公共数据库中的骨关节炎和类风湿关节炎滑膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8705 | 2025-10-07 |
FOXM1 could serve as a bridge mediating prognosis and immunity for clear cell renal cell carcinoma via single-cell and bulk RNA-sequencing
2025-Apr-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02438-x
PMID:40293585
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析FOXM1在透明细胞肾细胞癌中的预后价值和免疫调节作用 | 首次通过单细胞和批量RNA测序相结合的方法,系统揭示FOXM1在ccRCC免疫微环境中的关键作用及其与免疫治疗耐药性的关联 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证FOXM1的具体作用机制 | 探讨FOXM1在透明细胞肾细胞癌预后和免疫调节中的作用 | 透明细胞肾细胞癌组织和癌旁组织 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组化, 实时定量PCR | Cox回归分析 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库中的ccRCC样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
8706 | 2025-10-07 |
Mapping immune cell dynamics and macrophage plasticity in breast cancer tumor microenvironment through single-cell analysis
2025-Apr-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02419-0
PMID:40293603
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示乳腺癌肿瘤微环境中免疫细胞动态和巨噬细胞可塑性 | 首次在单细胞水平系统分析乳腺癌中巨噬细胞亚型及其与肿瘤细胞的相互作用机制,发现SPP1-CD44和LGALS9-CD44信号网络的关键作用 | 研究样本量有限,未进行实验验证,分析主要基于计算工具 | 解析乳腺癌肿瘤微环境中免疫细胞动态和细胞间相互作用机制 | 乳腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞亚群和巨噬细胞亚型 | 单细胞分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,计算分析 | Sc-Type,infercnv,CellChat,CytoTRACE,Monocle | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8707 | 2025-10-07 |
Epigenetic silencing of DNA sensing pathway by FOXM1 blocks stress ligand-dependent antitumor immunity and immune memory
2025-Apr-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59186-3
PMID:40295473
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子FOXM1通过表观遗传沉默DNA感应通路抑制应激配体表达,从而塑造肿瘤免疫抑制微环境的机制 | 首次发现FOXM1通过DNMT1-UHRF1复合物表观遗传沉默STING蛋白,抑制ULBP1表达,阻断NKG2D-NKG2DL相互作用 | 未明确说明研究样本的具体数量和类型 | 探究肿瘤细胞内在转录因子如何表观遗传调控肿瘤免疫微环境 | 肿瘤细胞、肿瘤免疫微环境、自然杀伤细胞、T细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8708 | 2025-10-07 |
Strigolactones optimise plant water usage by modulating vessel formation
2025-Apr-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59072-y
PMID:40295470
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了独脚金内酯信号通路通过调节维管形成来优化植物水分利用的机制 | 首次在单细胞水平揭示独脚金内酯信号通路负调控导管分子形成及其对植物水分利用的影响 | 研究仅限于拟南芥模型,尚未在其他植物物种中验证 | 探究维管组织形成调控机制及其在植物水分平衡中的作用 | 拟南芥维管组织、形成层干细胞、导管分子 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8709 | 2025-10-07 |
Unveiling fine-scale spatial structures and amplifying gene expression signals in ultra-large ST slices with HERGAST
2025-Apr-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59139-w
PMID:40295488
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研究论文 | 提出HERGAST系统用于超大规模空间转录组数据的空间结构识别和信号放大 | 设计了专门针对空间转录组数据分析的Divide-Iterate-Conquer框架,并构建异构图网络整合局部和全局空间关系 | NA | 解决超大规模空间转录组数据的分析挑战,提升空间结构识别精度和基因表达信号 | 结直肠肿瘤和乳腺癌组织 | 空间转录组学 | 结直肠癌, 乳腺癌 | 空间转录组学 | 异构图网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
8710 | 2025-10-07 |
Disulfidptosis in tumor progression
2025-Apr-28, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02495-9
PMID:40295497
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综述 | 本文系统阐述二硫死亡在肿瘤代谢重编程中的关键作用及其分子机制 | 整合多组学数据与单细胞转录组学解析二硫死亡相关基因的异质表达模式,揭示其与免疫微环境重塑的动态互作 | NA | 探讨二硫死亡在肿瘤进展中的作用机制及治疗潜力 | 二硫死亡相关基因(DRGs)和长链非编码RNA(DRLs) | 肿瘤生物学 | 肿瘤 | 多组学整合分析, 单细胞转录组学 | NA | 多组学数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8711 | 2025-10-07 |
DNA damage in proximal tubules triggers systemic metabolic dysfunction through epigenetically altered macrophages
2025-Apr-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59297-x
PMID:40295524
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研究论文 | 本研究揭示了肾脏近端小管上皮细胞DNA损伤通过表观遗传改变巨噬细胞引发全身代谢功能障碍的机制 | 首次发现肾脏DNA损伤通过巨噬细胞表观遗传改变引发全身代谢功能障碍,揭示了肾脏-血液-代谢轴的新机制 | 未明确DNA损伤的具体诱因,且表观遗传改变的具体调控机制仍需进一步研究 | 探究肾脏DNA损伤对全身代谢功能的影响及其分子机制 | 肾脏近端小管上皮细胞、巨噬细胞、单核细胞及代谢组织(脂肪组织和肝脏) | 表观遗传学 | 代谢功能障碍 | 单细胞RNA测序、DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8712 | 2025-10-07 |
Single-nucleus RNA sequencing reveals a preclinical model for the most common subtype of glioblastoma
2025-Apr-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08092-x
PMID:40295632
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研究论文 | 通过单核RNA测序揭示最常见胶质母细胞瘤亚型的临床前模型特征 | 首次在免疫活性小鼠模型中利用单核RNA测序系统表征胶质母细胞瘤及其肿瘤微环境在不同阶段和治疗下的变化 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步验证在人类患者中的适用性 | 建立和验证胶质母细胞瘤临床前模型,为开发新疗法提供基础 | 胶质母细胞瘤干细胞颅内植入的免疫活性小鼠模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单核RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 单核RNA测序用于细胞表征,Visium空间转录组学用于确认细胞定位 |
8713 | 2025-10-07 |
Integrated spatial and single cell transcriptomics identifies PRKDC as a dual prognostic biomarker and therapeutic target in hepatocellular carcinoma
2025-Apr-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-98866-4
PMID:40295654
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学、单细胞转录组学和批量RNA测序技术,首次发现PRKDC是肝细胞癌的可靠预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次整合空间转录组学和单细胞转录组学技术研究PRKDC在肝细胞癌中的作用,揭示了其在肿瘤免疫微环境中的新功能 | NA | 探索PRKDC在肝细胞癌预后评估中的生物标志物价值及其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌组织样本和细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 拷贝数变异分析 | NA | 转录组数据, 基因组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
8714 | 2025-10-07 |
Unveiling the heterogeneity and immunotherapy potency of tumor-associated neutrophils in the tumor microenvironment of gastric cancer
2025-Apr-28, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-025-03920-0
PMID:40295944
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了胃癌肿瘤微环境中肿瘤相关中性粒细胞的异质性及其与恶性上皮细胞的相互作用 | 首次系统描绘了胃癌中肿瘤相关中性粒细胞的五个亚群及其与上皮细胞的相互作用网络,并发现RGS2在MMP9高表达的N4亚群中特异性高表达 | 样本量相对有限(12个样本),需要更大规模的研究验证发现 | 探究胃癌肿瘤微环境中中性粒细胞的分化特征及其在免疫治疗中的潜力 | 胃癌患者组织样本中的上皮细胞和肿瘤相关中性粒细胞 | 单细胞转录组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,bulk转录组数据 | 12个样本(包括胃癌原发肿瘤、非肿瘤组织和转移性肿瘤) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8715 | 2025-10-07 |
Characterization of T cells in the progression of dry eye disease using single-cell RNA sequencing in mice
2025-Apr-28, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-02607-2
PMID:40296131
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了小鼠干眼病进展过程中T细胞的动态变化和异质性功能状态 | 首次在干眼病模型中结合飞行时间质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术,系统描绘了T细胞在疾病进展中的动态变化轨迹和细胞间通讯网络 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 阐明T细胞在干眼病进展中的调控作用 | 小鼠干眼病模型中的T细胞 | 单细胞组学 | 干眼病 | 单细胞RNA测序, 飞行时间质谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠干眼病模型在不同时间点(第3天和第7天)的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8716 | 2025-10-07 |
Cardiac endothelial cells and cardiomyocytes alter their communication properties in diabetic mice
2025-Apr-28, Biological research
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40659-025-00602-9
PMID:40296165
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析糖尿病小鼠心脏中内皮细胞和心肌细胞的异质性及通讯特性变化 | 首次在糖尿病模型中系统揭示心脏内皮细胞和心肌细胞的亚群异质性及其通讯网络改变,发现ANGPTL和SEMA4信号通路在糖尿病心脏中的关键作用 | 研究基于公开数据集,缺乏实验验证;样本量有限;仅使用链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠模型 | 探索糖尿病条件下心脏细胞异质性及细胞间通讯特性 | 糖尿病小鼠心脏组织中的内皮细胞和心肌细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 细胞聚类分析、轨迹分析、细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | GSE213337数据集中的对照和糖尿病小鼠心脏样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
8717 | 2025-10-07 |
Deciphering immune cell heterogeneity in vascular diseases: Insights from single-cell sequencing
2025-Apr-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114719
PMID:40306113
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综述 | 系统总结单细胞测序技术在血管疾病中揭示免疫细胞异质性的最新应用 | 扩展了先前研究,系统总结了单细胞测序在血管疾病中的最新应用,重点关注新发现的免疫细胞亚群及其功能可塑性 | 作为综述文章,不包含原始实验数据,主要基于现有文献分析 | 阐明免疫细胞在血管疾病中的异质性及其病理机制 | 血管疾病中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8718 | 2025-10-07 |
Novel biomarkers related to mitochondrial permeability transition driven-necrosis in hypertrophic cardiomyopathy
2025-Apr-28, Journal of cardiology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.jjcc.2025.04.008
PMID:40306461
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研究论文 | 本研究通过转录组学和孟德尔随机化分析,探索线粒体通透性转换驱动的坏死相关基因在肥厚型心肌病中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序、转录组测序和孟德尔随机化分析识别与肥厚型心肌病中线粒体通透性转换驱动坏死相关的新基因 | 研究基于公共数据库的基因表达数据,需要进一步实验验证 | 探索线粒体通透性转换驱动坏死相关基因与肥厚型心肌病的关联 | 肥厚型心肌病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 肥厚型心肌病 | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 孟德尔随机化分析, 基因集富集分析 | NA | 基因表达数据 | 三个GEO数据集:GSE36961(训练集)、GSE141910(验证集)、GSE174691(单细胞数据集) | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
8719 | 2025-10-07 |
Ferroptosis and low-grade Glioma: The breakthrough potential of NUAK2
2025-Apr-24, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析发现NUAK2基因是低级别胶质瘤中铁死亡相关基因的关键调控因子,并验证其作为潜在治疗靶点的价值 | 首次系统鉴定低级别胶质瘤中铁死亡相关基因的预后价值,并通过单细胞RNA测序和实验验证揭示NUAK2在肿瘤进展和免疫抑制中的关键作用 | 研究队列规模有限,需要更大样本验证NUAK2的临床应用价值 | 探索铁死亡相关基因在低级别胶质瘤预后和肿瘤微环境调控中的作用 | 低级别胶质瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 低级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序,多组学数据分析,假时序轨迹分析,体外和体内实验验证 | NA | 基因组数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA、CGGA和GEO数据库的多组学数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8720 | 2025-10-07 |
Vitamin A treatment restores vision failures arising from Leber's hereditary optic neuropathy-linked mtDNA mutation
2025-Apr-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.188962
PMID:40036074
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研究论文 | 本研究通过维生素A治疗成功恢复了由Leber遗传性视神经病变相关mtDNA突变引起的视力缺陷 | 首次揭示LHON相关mtDNA突变导致维生素A代谢异常,并证明维生素A补充能有效改善视网膜功能和线粒体形态 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探究LHON相关mtDNA突变的视网膜细胞特异性机制并开发有效治疗方法 | 携带LHON相关ND6P25L突变的小鼠模型及其视网膜细胞 | 线粒体视网膜病变研究 | Leber遗传性视神经病变 | 单细胞RNA测序,电生理学检测 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据,形态学数据,电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |