单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27924 篇文献，本页显示第 8701 - 8720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8701 | 2024-09-23 |
Genetic activation of glycolysis in osteoblasts preserves bone mass in type I diabetes
2023-09-21, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2023.07.003
PMID:37562406
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研究论文 | 研究探讨了I型糖尿病中骨形成受损的机制，并发现通过激活成骨细胞中的糖酵解可以维持骨量 | 首次揭示了I型糖尿病中成骨细胞糖代谢缺陷是骨质疏松的致病机制，并提出增强成骨细胞糖酵解可能是一种潜在的骨形成疗法 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探讨I型糖尿病中骨形成受损的机制，并寻找潜在的治疗策略 | I型糖尿病小鼠的成骨细胞和骨组织 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、稳定同位素示踪 | NA | RNA序列数据 | 小鼠模型 |
| 8702 | 2024-09-23 |
Bulk brain tissue cell-type deconvolution with bias correction for single-nuclei RNA sequencing data using DeTREM
2023-Sep-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05476-w
PMID:37726653
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研究论文 | 本文提出了一种名为DeTREM的改进方法，用于校正单核RNA测序数据与批量RNA测序数据之间的偏差，以提高脑组织细胞类型反卷积的准确性 | DeTREM方法通过补偿单核RNA测序与批量RNA测序数据之间的差异，提高了细胞类型反卷积的准确性，并优于其他反卷积方法 | NA | 提高脑组织细胞类型反卷积的准确性 | 人脑组织的细胞类型反卷积 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 (snRNA-seq) | MuSiC | RNA测序数据 | NA |
| 8703 | 2024-09-23 |
SiGra: single-cell spatial elucidation through an image-augmented graph transformer
2023-09-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41437-w
PMID:37699885
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研究论文 | 本文提出了一种名为SiGra的方法，通过图像增强的图变换器来揭示单细胞空间域并增强稀疏和噪声的转录组数据 | SiGra方法结合了多通道免疫组化图像信息，通过混合图变换器在单细胞空间图上进行处理，显著提高了模型性能 | NA | 开发一种方法来利用图像信息揭示空间域并增强转录组数据 | 单细胞和斑点级别的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 免疫组化 | 图变换器 | 图像 | 复杂组织中的单细胞和斑点级别的空间转录组数据 |
| 8704 | 2024-09-23 |
Alk1 acts in non-endothelial VE-cadherin+ perineurial cells to maintain nerve branching during hair homeostasis
2023-09-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40761-5
PMID:37699906
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研究论文 | 研究了VE-cadherin和Alk1在非内皮细胞中的作用，特别是在神经分支维持中的作用 | 发现VE-cadherin和Alk1不仅在内皮细胞中起作用，还在非内皮细胞中维持神经分支 | NA | 探讨VE-cadherin和Alk1在皮肤血管重塑和神经分支维持中的作用 | VE-cadherin阳性细胞和Alk1在皮肤中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠 |
| 8705 | 2024-09-23 |
Notch and retinoic acid signals regulate macrophage formation from endocardium downstream of Nkx2-5
2023-09-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41039-6
PMID:37669937
|
研究论文 | 研究揭示了Nkx2-5下游的Notch和视黄酸信号在心肌内膜向巨噬细胞分化的调控网络 | 首次揭示了Nkx2-5/Notch/RA信号通路在心肌内膜向巨噬细胞分化中的关键作用 | NA | 探讨心肌内膜向巨噬细胞分化的分子机制 | 心肌内膜、巨噬细胞、Nkx2-5、Notch信号、视黄酸信号 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8706 | 2024-09-23 |
NF-κB subunits direct kinetically distinct transcriptional cascades in antigen receptor-activated B cells
2023-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01561-7
PMID:37524800
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研究论文 | 研究了NF-κB家族中的Rel和RelA在B细胞受体激活后的基因表达调控中的不同功能 | 揭示了Rel和RelA在B细胞激活后基因表达调控中的不同动力学特征和功能对抗性 | NA | 探讨NF-κB家族成员在B细胞激活后的基因表达调控中的特异性功能 | Rel和RelA在B细胞中的基因表达调控功能 | NA | NA | 多组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8707 | 2024-09-23 |
Projecting RNA measurements onto single cell atlases to extract cell type-specific expression profiles using scProjection
2023-08-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40744-6
PMID:37626024
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scProjection的方法，用于将多模态RNA测量映射到深度测序的scRNA-seq图谱上，以提取细胞类型特异性的单细胞基因表达谱 | scProjection方法结合了多模态和scRNA-seq测量的优势，能够精确地进行单细胞的多模态测量 | NA | 开发一种方法，将多模态RNA测量映射到深度测序的scRNA-seq图谱上，以提取细胞类型特异性的单细胞基因表达谱 | 多模态RNA测量和scRNA-seq图谱 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | NA | RNA | NA |
| 8708 | 2024-09-23 |
Ret deficiency decreases neural crest progenitor proliferation and restricts fate potential during enteric nervous system development
2023-08-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2211986120
PMID:37585461
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研究论文 | 研究了RET受体酪氨酸激酶在肠神经系统发育中对神经嵴来源细胞命运的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了RET缺失对肠神经系统发育中细胞类型和状态特异性效应的影响 | 仅限于小鼠模型，未涉及人类数据 | 探讨RET在肠神经系统发育中的作用及其缺失对细胞命运和增殖的影响 | 肠神经系统中的神经嵴来源细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从胚胎第12.5天和第14.5天的RET缺失杂合和纯合小鼠的发育中肠道中提取的神经嵴来源细胞 |
| 8709 | 2024-09-23 |
Spatial organization of the mouse retina at single cell resolution by MERFISH
2023-08-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40674-3
PMID:37582959
|
研究论文 | 本文使用MERFISH技术生成了小鼠视网膜的单细胞空间图谱 | 首次揭示了小鼠视网膜中8种先前未知的移位无长突细胞亚型，并建立了细胞亚型的分子分类与其空间排列之间的联系 | NA | 研究小鼠视网膜中神经元亚型的空间组织 | 小鼠视网膜中的神经元亚型及其空间组织 | 数字病理学 | NA | 多重错误纠正荧光原位杂交（MERFISH） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过390,000个细胞 |
| 8710 | 2024-09-23 |
Characterizing cancer metabolism from bulk and single-cell RNA-seq data using METAFlux
2023-08-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40457-w
PMID:37573313
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为METAFlux的计算框架，用于从批量和单细胞RNA-seq数据中推断代谢通量，以表征癌症代谢 | 提出了METAFlux框架，能够从批量和单细胞RNA-seq数据中推断代谢通量，并验证了其在不同癌症和免疫治疗背景下的能力 | 尚未明确当前方法在肿瘤微环境表征中的可靠性 | 研究癌症研究中肿瘤微环境中的代谢重编程 | 癌症代谢的表征 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 涉及多种癌症和免疫治疗背景下的细胞系、TCGA数据和单细胞RNA-seq数据 |
| 8711 | 2024-09-23 |
spinDrop: a droplet microfluidic platform to maximise single-cell sequencing information content
2023-08-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40322-w
PMID:37553326
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为spinDrop的液滴微流控平台，通过荧光激活液滴分选和皮克注射技术，提高了单细胞测序的信息含量和质量 | 本文创新性地使用荧光激活液滴分选和皮克注射技术，实现了对高质量材料和特定细胞类型的富集，并进行了多步酶促反应，显著提高了基因检测率和降低了背景噪音 | NA | 提高单细胞测序的信息含量和质量 | 单细胞测序中的液滴微流控技术 | 生物技术 | NA | 荧光激活液滴分选，皮克注射 | NA | RNA | 小鼠脑发育和器官发生过程中的RNA |
| 8712 | 2024-09-23 |
Cas9-mediated knockout of Ndrg2 enhances the regenerative potential of dendritic cells for wound healing
2023-08-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40519-z
PMID:37550295
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研究论文 | 研究使用CRISPR/Cas9技术敲除Ndrg2基因，增强树突状细胞的再生潜力，以促进伤口愈合 | 首次使用CRISPR/Cas9技术精确编辑树突状细胞，增强其治疗慢性伤口的潜力 | 研究仅在非糖尿病和糖尿病小鼠模型中进行，尚未进行临床试验 | 开发一种新的细胞疗法，通过基因编辑增强树突状细胞的再生能力，以治疗慢性伤口 | 树突状细胞和慢性伤口 | 细胞疗法 | 慢性伤口 | CRISPR/Cas9 | NA | RNA序列 | 非糖尿病和糖尿病小鼠模型 |
| 8713 | 2024-09-23 |
SpaRx: Elucidate single-cell spatial heterogeneity of drug responses for personalized treatment
2023-Aug-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.03.551911
PMID:37577665
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于图的领域自适应模型SpaRx，用于揭示药物反应的空间细胞异质性，并优化个体化治疗 | SpaRx通过混合学习与动态对抗适应，将药物基因组学知识转移到单细胞空间转录组数据中，揭示了肿瘤细胞在肿瘤病变不同位置对药物的异质性敏感性或抗性 | NA | 揭示药物反应的空间细胞异质性，优化个体化治疗 | 肿瘤细胞对药物的反应及其空间异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞空间转录组学 | 图模型 | 转录组数据 | NA |
| 8714 | 2024-09-23 |
Distinct pulmonary and systemic effects of dexamethasone in severe COVID-19
2023-Aug-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3168149/v1
PMID:37577607
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研究论文 | 研究地塞米松在严重COVID-19患者中的肺部和全身效应 | 通过批量和单细胞RNA测序以及血浆细胞因子分析，揭示了地塞米松在严重COVID-19患者中的免疫细胞效应，并识别了不同部位和细胞类型的特定差异 | 研究仅限于严重COVID-19患者，且依赖于公开数据集 | 探讨地塞米松在严重COVID-19患者中的免疫调节机制 | 严重COVID-19患者的肺部和全身免疫细胞 | NA | COVID-19 | RNA测序，细胞因子分析 | NA | RNA数据，细胞因子数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 8715 | 2024-09-23 |
Applications of multi-omics analysis in human diseases
2023-Aug, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.315
PMID:37533767
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综述 | 本文综述了多组学技术在人类疾病研究中的应用 | 本文提供了对多组学技术的全面和系统介绍，特别是机器学习和深度学习在多组学数据整合中的应用 | 本文主要集中在多组学技术的综述，未涉及具体实验数据或结果 | 探讨多组学技术在精准医学中的应用及其未来发展方向 | 多组学技术及其在癌症、神经退行性疾病、衰老和药物靶点发现等医学研究中的应用 | NA | NA | 多组学技术 | 机器学习、深度学习 | 多组学数据 | NA |
| 8716 | 2024-09-23 |
Resolvin D1 prevents injurious neutrophil swarming in transplanted lungs
2023-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2302938120
PMID:37487095
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研究论文 | 研究了Resolvin D1在移植肺中防止中性粒细胞聚集的作用 | 首次揭示了Resolvin D1在移植肺早期免疫反应中的保护作用 | 研究主要在鼠模型中进行，尚未在临床中验证 | 探讨Resolvin D1在移植肺缺血再灌注损伤中的保护作用 | 移植肺中的中性粒细胞和脂质介质 | NA | NA | 代谢脂质组学、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及人类和鼠的肺移植样本 |
| 8717 | 2024-09-23 |
Global decoupling of cell differentiation from cell division in early embryo development
2023-Jul-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.29.551123
PMID:37546736
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研究论文 | 研究探讨了细胞分裂在早期胚胎发育中细胞分化的作用 | 首次展示了细胞分裂在早期胚胎发育中对细胞分化的非必要性，并结合单细胞RNA测序技术揭示了细胞分裂对细胞状态比例的影响 | 研究仅限于斑马鱼胚胎，结果可能不适用于其他物种 | 确定细胞分裂在细胞分化中的作用 | 斑马鱼胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个斑马鱼胚胎 |
| 8718 | 2024-09-23 |
Enhanced microglial dynamics and paucity of tau seeding in the amyloid plaque microenvironment contributes to cognitive resilience in Alzheimer's disease
2023-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.27.550884
PMID:37546928
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研究论文 | 研究了无症状阿尔茨海默病（AsymAD）病例的脑部病理机制，发现微胶质细胞动态增强和tau种子减少有助于认知恢复 | 发现AsymAD病例中微胶质细胞在淀粉样斑块微环境中的高效肌动蛋白细胞运动机制和tau种子减少，可能保护大脑健康并减缓阿尔茨海默病病理进展 | NA | 探讨无症状阿尔茨海默病病例中抵抗病理和认知衰退的机制 | 无症状阿尔茨海默病病例的脑部病理 | NA | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | NA | 一组无症状阿尔茨海默病病例的尸检脑样本 |
| 8719 | 2024-09-23 |
Yet uninfected? Resolving cell states of plants under pathogen attack
2023-07-24, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100538
PMID:37533641
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了植物细胞在面对细菌病原体攻击时的异质性反应 | 首次采用单细胞转录组分析方法，深入研究了植物细胞在病原体攻击下的个体细胞反应 | NA | 旨在填补对植物细胞在病原体攻击下个体细胞反应理解的空白 | 植物细胞在细菌病原体攻击下的反应 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 8720 | 2024-09-23 |
A contamination focused approach for optimizing the single-cell RNA-seq experiment
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107242
PMID:37496679
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研究论文 | 本文提出了一种基于污染控制的方法来优化单细胞RNA测序实验 | 引入了一套基于污染的定量指标来更有效地评估数据质量，并通过一系列控制实验展示了减少环境污染的方法 | 文中提到的许多参数在商业平台上难以实现 | 优化单细胞RNA测序实验以减少环境污染 | 单细胞RNA测序数据中的环境污染问题 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |