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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8681 | 2025-10-07 | Development of a hypoxia-responsive macrophage prognostic model using single-cell and bulk RNA sequencing in pancreatic cancer 
          2025, PloS one
          
          IF:2.9Q1
          
         
          DOI:10.1371/journal.pone.0322618
          PMID:40315225
         | 研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和TCGA-PAAD数据库数据,开发了一个包含13个关键基因的缺氧反应性巨噬细胞预后模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据构建胰腺癌缺氧相关预后模型,并发现KRTCAP2作为关键生物标志物 | NA | 构建胰腺癌缺氧相关预后模型以预测化疗敏感性和总生存期 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Cox回归, Lasso回归, Kaplan-Meier生存分析 | 基因表达数据 | TCGA-PAAD数据库及单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA | 
| 8682 | 2025-10-07 | Integration of single-cell and bulk RNA sequencing identifies and validates T cell-related prognostic model in hepatocellular carcinoma 
          2025, PloS one
          
          IF:2.9Q1
          
         
          DOI:10.1371/journal.pone.0322706
          PMID:40315269
         | 研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,构建并验证了肝细胞癌中T细胞相关的预后模型 | 首次结合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据识别T细胞相关预后基因,并构建包含PTTG1、LMNB1、SLC38A1和BATF的四基因预后模型 | 样本量相对有限,单细胞数据仅来自10名患者,验证队列规模较小 | 开发肝细胞癌的预后预测模型,改善患者风险分层和个性化治疗策略 | 肝细胞癌患者及其肿瘤组织中的T细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,免疫组化,LASSO回归,Cox回归分析 | LASSO回归模型,Cox比例风险模型,列线图 | 基因表达数据,临床预后数据,免疫组化图像 | 10例HCC患者的scRNA-seq数据(6,281个T细胞),TCGA和ICGC数据库的bulk RNA-seq数据,25例患者组织的IHC验证 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA | 
| 8683 | 2025-10-07 | Multiomics Approach Distinguishes SPTBN4 as a Key Molecule in Diagnosis, Prognosis, and Immune Suppression of Testicular Seminomas 
          2025, International journal of genomics
          
          IF:2.6Q2
          
         
          DOI:10.1155/ijog/3530098
          PMID:40321316
         | 研究论文 | 本研究通过多组学方法识别SPTBN4作为睾丸精原细胞瘤诊断、预后和免疫抑制的关键分子标志物 | 首次整合单细胞转录组测序、高维加权基因共表达网络分析和药物敏感性分析,系统揭示SPTBN4在睾丸精原细胞瘤中的核心作用 | 研究主要基于公共数据集和计算分析,需要进一步实验验证 | 探索睾丸精原细胞瘤的分子异质性并识别关键生物标志物 | 睾丸精原细胞瘤组织样本 | 生物信息学 | 睾丸精原细胞瘤 | 单细胞RNA转录组测序, 高维加权基因共表达网络分析, 药物敏感性分析 | hdWGCNA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 临床生存数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 8684 | 2025-10-07 | Inferred developmental origins of brain tumors from single-cell RNA-sequencing data 
          2025 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
          
          IF:3.7Q2
          
         
          DOI:10.1093/noajnl/vdaf016
          PMID:40321621
         | 研究论文 | 本研究开发了COORS计算工具,通过单细胞RNA测序数据推断脑肿瘤的发育起源 | 开发了基于发育人脑单细胞数据训练的COORS计算工具,能够注释脑肿瘤中的发育样细胞状态 | NA | 识别脑肿瘤的发育起源 | 脑肿瘤单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 多层感知机 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8685 | 2025-10-07 | A prognostic glycolysis-related gene signature in osteosarcoma: implications for metabolic programming, immune microenvironment, and drug response 
          2025, PeerJ
          
          IF:2.3Q2
          
         
          DOI:10.7717/peerj.19369
          PMID:40321814
         | 研究论文 | 本研究建立了一个基于糖酵解相关基因的骨肉瘤预后风险特征模型 | 首次基于糖酵解相关基因构建骨肉瘤预后风险特征,并探索其与肿瘤微环境和药物反应的关系 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 建立骨肉瘤糖酵解相关基因风险特征并评估其预后价值 | 骨肉瘤患者 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | mRNA表达谱分析,单细胞RNA测序,RT-PCR | 非负矩阵分解,Cox回归分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的三个数据集(GSE16091, GSE39058, GSE21257) | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 8686 | 2025-10-07 | Single-cell sequencing of peripheral blood mononuclear cells reveals immune landscape of monkeypox patients with HIV 
          2025-Dec, Emerging microbes & infections
          
          IF:8.4Q1
          
         
          DOI:10.1080/22221751.2025.2459136
          PMID:39868995
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析猴痘患者外周血单个核细胞,揭示HIV感染者免疫景观特征 | 首次在单细胞分辨率下比较HIV感染与非感染猴痘患者的免疫反应差异,发现单核细胞和中性粒细胞介导的细胞互作异常 | 样本量较小(仅6例患者),HIV感染者病毒载量低于检测限可能影响结果代表性 | 探究HIV感染对猴痘患者免疫病理机制的影响 | 猴痘住院患者的外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞组学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例猴痘患者(3例HIV+,3例HIV-) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8687 | 2025-10-07 | Mitigation of ischemia/reperfusion injury via selenium nanoparticles: Suppression of STAT1 to inhibit cardiomyocyte oxidative stress and inflammation 
          2025-Jul, Biomaterials
          
          IF:12.8Q1
          
         | 研究论文 | 本研究通过静脉注射模板法合成的球形硒纳米颗粒,探索其在心肌缺血/再灌注损伤中的保护作用及机制 | 首次发现球形硒纳米颗粒通过抑制STAT1信号通路,打破STAT1-ROS循环,从而减轻心肌细胞氧化应激和炎症反应 | NA | 开发新型纳米材料治疗心肌缺血/再灌注损伤 | 心肌细胞、巨噬细胞 | 纳米医学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 测序数据、功能指标 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8688 | 2025-10-07 | Unraveling diabetic kidney disease: insights from single-cell RNA sequencing 
          2025-Jun, International urology and nephrology
          
          IF:1.8Q3
          
         
          DOI:10.1007/s11255-025-04362-z
          PMID:39799255
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究糖尿病肾病的病理机制和临床特征 | 首次应用单细胞RNA测序技术系统分析糖尿病肾病患者的肾脏组织、血液和尿液样本,揭示组织功能、细胞相互作用和疾病进展机制 | 未提及具体样本量和实验设计的局限性 | 深入理解糖尿病肾病的病理生理机制,改善早期筛查和个性化管理 | 糖尿病肾病患者的肾脏组织、血液和尿液样本 | 单细胞组学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8689 | 2025-10-07 | Revealing the therapeutic targets, mechanisms, and heterogeneity of Huatan Jieyu Granules for Parkinson's disease through single-cell sequencing 
          2025-May-15, Journal of pharmaceutical and biomedical analysis
          
          IF:3.1Q2
          
         
          DOI:10.1016/j.jpba.2025.116679
          PMID:39864142
         | 研究论文 | 通过单细胞测序技术研究化痰解郁颗粒对帕金森病的治疗靶点、作用机制和细胞异质性 | 首次结合单细胞测序和中药研究,系统揭示化痰解郁颗粒治疗帕金森病的关键基因和细胞类型 | 研究仅使用MPTP诱导的小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探索化痰解郁颗粒治疗帕金森病的分子机制和细胞靶点 | MPTP诱导的帕金森病小鼠模型 | 单细胞测序 | 帕金森病 | 单细胞测序,免疫荧光,行为学测试 | PPI网络拓扑分析 | 单细胞基因表达数据 | 空白组、PD模型组和药物治疗组小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8690 | 2025-10-07 | A Bifunctional Antibody Targeting PD-1 and TGF-β Signaling Has Antitumor Activity in Combination with Radiotherapy and Attenuates Radiation-Induced Lung Injury 
          2025-May-02, Cancer immunology research
          
          IF:8.1Q1
          
         
          DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0903
          PMID:39878763
         | 研究论文 | 研究双特异性抗体JS-201联合放疗的抗肿瘤效果及其对放射性肺损伤的保护作用 | 首次发现靶向PD-1和TGF-β信号的双功能抗体JS-201不仅能增强放疗抗肿瘤效果,还能减轻放射性肺损伤 | 临床前研究阶段,尚未进行人体临床试验 | 评估JS-201联合放疗的抗肿瘤疗效及其对放射性肺损伤的防护作用 | 肿瘤模型小鼠和放射性肺损伤模型 | 免疫治疗 | 肺癌 | 转录组测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多种肿瘤模型和放射性肺损伤模型 | NA | 转录组测序, 单细胞测序 | NA | NA | 
| 8691 | 2025-10-07 | Inhibition of DKK-1 by WAY262611 Inhibits Osteosarcoma Metastasis 
          2025-May-02, Molecular cancer therapeutics
          
          IF:5.3Q1
          
         
          DOI:10.1158/1535-7163.MCT-24-0744
          PMID:39781890
         | 研究论文 | 本研究通过小分子抑制剂WAY262611抑制DKK-1,证实其可激活经典Wnt信号通路并抑制骨肉瘤转移 | 首次证明小分子DKK-1抑制剂在体外和体内均能抑制骨肉瘤转移,为开发预防骨肉瘤转移的新生物制剂提供临床前依据 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞系实验,尚未进行人体临床试验 | 验证DKK-1作为骨肉瘤治疗靶点的潜力,探索通过调控Wnt信号通路预防骨肉瘤转移的新策略 | 骨肉瘤细胞系、患者来源的骨肉瘤异种移植模型、原位植入/截肢骨肉瘤转移小鼠模型 | 癌症研究 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、细胞增殖检测、caspase激活检测、细胞周期分析、信号通路激活分析 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据 | 多种骨肉瘤细胞系和患者来源的异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8692 | 2025-10-07 | Identification of novel hub gene and biological pathways associated with ferroptosis in In-Stent restenosis 
          2025-Apr-15, Gene
          
          IF:2.6Q2
          
         
          DOI:10.1016/j.gene.2025.149287
          PMID:39880339
         | 研究论文 | 通过整合分析GEO数据库和单细胞测序数据,识别支架内再狭窄中铁死亡相关的关键基因和生物通路 | 首次将铁死亡机制与支架内再狭窄联系起来,鉴定SP1作为关键调控因子并构建ceRNA调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 揭示铁死亡在血管平滑肌细胞调控新生内膜形成中的分子靶点 | 支架内再狭窄患者数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 8693 | 2025-10-07 | Single-cell Rapid Capture Hybridization sequencing reliably detects isoform usage and coding mutations in targeted genes 
          2025-Apr-14, Genome research
          
          IF:6.2Q1
          
         
          DOI:10.1101/gr.279322.124
          PMID:39794120
         | 研究论文 | 开发了一种单细胞快速捕获杂交测序方法,用于可靠检测目标基因的异构体使用和编码突变 | 开发了scRaCH-seq方法,通过探针面板捕获目标转录本,结合长读长测序技术实现对特定基因突变状态和转录本使用的深度分析 | 方法主要针对目标基因进行分析,可能无法覆盖全转录组的复杂性 | 开发高特异性、高效率的单细胞长读长测序方法,用于分析目标基因的突变状态和转录本使用 | 慢性淋巴细胞白血病患者的单细胞样本 | 单细胞基因组学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞长读长测序,快速捕获杂交测序 | NA | 单细胞cDNA,长读长测序数据 | NA | Oxford Nanopore Technologies | 单细胞RNA-seq,长读长测序 | Oxford Nanopore平台 | 使用条形码引物进行混合和高效测序 | 
| 8694 | 2025-10-07 | Deficiency of Secreted Phosphoprotein 1 Alleviates Hyperoxia-induced Bronchopulmonary Dysplasia in Neonatal Mice 
          2025-Apr, Inflammation
          
          IF:4.5Q2
          
         
          DOI:10.1007/s10753-024-02088-1
          PMID:38951356
         | 研究论文 | 本研究探讨分泌磷蛋白1(SPP1)在新生儿高氧诱导支气管肺发育不良中的作用机制 | 首次揭示SPP1通过PI3K-AKT和ERK/MAPK通路调控氧化应激和炎症反应加剧BPD进展 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究SPP1在支气管肺发育不良发病机制中的作用 | 新生小鼠、肺泡肌成纤维细胞、BPD患者样本 | 分子生物学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, GO分析, KEGG富集分析 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | 新生小鼠模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 8695 | 2025-10-07 | High expression of SERPINE1 and CTSL in keratinocytes in pressure injury caused by ischemia-reperfusion injury 
          2025-Apr, Tissue & cell
          
          IF:2.7Q3
          
         
          DOI:10.1016/j.tice.2025.102746
          PMID:39864211
         | 研究论文 | 本研究通过多组学数据分析识别缺血再灌注损伤导致的压力性损伤潜在生物标志物 | 首次整合转录组测序、单细胞测序数据库和GeneCards数据库,结合三种机器学习算法识别SERPINE1和CTSL作为压力性损伤的新型生物标志物 | 研究仅基于大鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探索缺血再灌注损伤导致压力性损伤的分子机制和生物标志物 | 压力性损伤大鼠模型皮肤组织 | 生物信息学 | 压力性损伤 | 转录组测序, 单细胞测序, 免疫组织化学, 机器学习 | 三种机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 压力性损伤大鼠模型 | NA | 转录组测序, 单细胞测序 | NA | NA | 
| 8696 | 2025-10-07 | Trends in Research of Odontogenic Keratocyst and Ameloblastoma 
          2025-Apr, Journal of dental research
          
          IF:5.7Q1
          
         
          DOI:10.1177/00220345241282256
          PMID:39876078
         | 综述 | 本文综述了牙源性角化囊肿和成釉细胞瘤研究的最新进展与技术趋势 | 整合单细胞组学、空间转录组学、三维培养技术和人工智能在牙源性肿瘤研究中的创新应用 | 牙源性角化囊肿的可靠体外和体内模型仍然稀缺 | 总结牙源性角化囊肿和成釉细胞瘤研究的最新进展与发展趋势 | 牙源性角化囊肿和成釉细胞瘤 | 数字病理学 | 口腔颌面部肿瘤 | 单细胞组学, 空间转录组学, 三维培养, 人工智能 | 机器学习, 深度学习 | 影像组学, 病理组学 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 8697 | 2025-10-07 | Pharmacological blocking of microfibrillar-associated protein 4 reduces retinal neoangiogenesis and vascular leakage 
          2025-Mar-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
          
          IF:12.1Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.ymthe.2025.01.038
          PMID:39863929
         | 研究论文 | 研究抗MFAP4抗体hAS0326在视网膜新生血管形成和血管渗漏中的治疗作用 | 首次发现通过药理学阻断MFAP4可抑制视网膜新生血管形成和血管渗漏,并证明其作用机制与整合素受体相互作用相关 | 研究主要基于动物模型,尚未进行人体临床试验 | 探索MFAP4在视网膜血管疾病中的作用及靶向治疗的可行性 | 视网膜血管内皮细胞、脉络膜血管壁细胞、视网膜星形胶质细胞和Müller细胞 | 眼科疾病研究 | 年龄相关性黄斑变性、糖尿病黄斑水肿 | 单细胞转录组学、体外细胞实验、动物模型实验 | NA | 基因表达数据、病理学数据 | 激光诱导脉络膜新生血管小鼠模型、链脲佐菌素诱导视网膜病变模型、DL-2-氨基己二酸诱导的非人灵长类视网膜病变模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8698 | 2025-10-07 | Potential therapeutic effect of dimethyl fumarate on Treg/Th17 cell imbalance in biliary atresia 
          2025-Mar, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
          
         
          DOI:10.1016/j.clim.2025.110439
          PMID:39863040
         | 研究论文 | 探讨富马酸二甲酯对胆道闭锁中Treg/Th17细胞失衡的潜在治疗作用及机制 | 首次发现胆道闭锁患者肝门淋巴结存在Treg/Th17细胞失衡,并证实DMF可通过Nrf2/ARE通路纠正这一失衡 | 研究样本量有限,机制研究主要基于动物模型和体外实验 | 研究DMF对胆道闭锁Treg/Th17细胞平衡的调节作用及其分子机制 | 胆道闭锁患者肝组织和肝门淋巴结、胆道闭锁小鼠模型 | 免疫学 | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,酶联免疫吸附试验,定量PCR,Western blot | 动物模型 | 基因表达数据,蛋白质数据,细胞频率数据 | 胆道闭锁和胆总管囊肿患者组织样本,小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8699 | 2025-10-07 | Kushenol O Regulates GALNT7/NF-κB axis-Mediated Macrophage M2 Polarization and Efferocytosis in Papillary Thyroid Carcinoma 
          2025-Mar, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
          
          IF:6.7Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.phymed.2025.156373
          PMID:39864368
         | 研究论文 | 本研究探讨了苦参酚O通过调控GALNT7/NF-κB轴介导的巨噬细胞M2极化和胞葬作用在甲状腺乳头状癌中的作用机制 | 首次发现GALNT7作为PTC治疗新靶点,并阐明苦参酚O通过抑制GALNT7表达调控NF-κB轴的新机制 | 研究主要基于细胞实验,缺乏体内动物模型验证,临床转化价值需进一步评估 | 探究苦参酚O对甲状腺乳头状癌细胞增殖和侵袭能力的影响及其作用机制 | 甲状腺乳头状癌细胞系 | 肿瘤免疫学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, EdU检测, CCK-8, 分子模拟 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8700 | 2025-10-07 | PerC B-Cells Activation via Thermogenetics-Based CXCL12 Generator for Intraperitoneal Immunity Against Metastatic Disseminated Tumor Cells 
          2025-Mar, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
          
         
          DOI:10.1002/adma.202411731
          PMID:39865939
         | 研究论文 | 本研究开发了一种基于热遗传学的CXCL12生成器,通过激活腹膜腔B细胞亚群实现抗肿瘤免疫 | 首次提出不依赖树突细胞的下一代腹腔免疫疗法,通过程序化调控CXCL12表达来招募播散性肿瘤细胞并激活B细胞免疫 | 研究主要基于原位胃癌和转移模型,尚未在人类临床试验中验证 | 开发针对腹膜转移癌的新型腹腔免疫治疗策略 | 腹膜腔B细胞亚群和播散性肿瘤细胞 | 免疫治疗 | 胃癌腹膜转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |