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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8681 | 2025-10-07 |
Claudin18.2-positive gastric cancer-specific changes in neoadjuvant chemotherapy-driven immunosuppressive tumor microenvironment
2025-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02981-y
PMID:40128286
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了CLDN18.2阳性胃癌在新辅助化疗驱动下肿瘤微环境的特异性免疫抑制变化 | 首次在单细胞水平揭示了CLDN18.2阳性胃癌对化疗的特异性免疫应答机制,发现了化疗诱导的独特细胞间相互作用网络 | 样本量较小(仅37例胃癌样本,其中11例CLDN18.2阳性),需要更大规模研究验证 | 探究CLDN18.2阳性胃癌在新辅助化疗作用下肿瘤微环境的免疫抑制变化机制 | 胃癌患者组织样本,特别关注CLDN18.2阳性亚型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,免疫荧光图像数据 | 37例胃癌样本(包含11例CLDN18.2阳性病例) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8682 | 2025-10-07 |
Micro-region transcriptomics profiling of cerebral organoids using a capillary-based microdissection system
2025-May-01, Analytical methods : advancing methods and applications
IF:2.7Q1
DOI:10.1039/d5ay00277j
PMID:40211824
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研究论文 | 开发了一种基于毛细管的组织微切割系统,用于脑类器官微区域的空间转录组分析 | 建立了毛细管组织微切割系统(CMS),实现了对培养脑类器官微区域的高效获取和mRNA测序 | NA | 探索脑类器官中细胞命运的空间发育轨迹 | 脑类器官中的神经祖细胞、中间祖细胞、成熟神经元和星形胶质细胞 | 空间转录组学 | NA | mRNA测序,基因本体(GO)分析,KEGG富集分析 | NA | 空间转录组数据,基因表达数据 | 第20天和第60天的脑类器官样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 毛细管组织微切割系统(CMS) | 毛细管组织微切割系统用于脑类器官微区域获取 |
8683 | 2025-10-07 |
Restoring mitochondrial function promotes hematopoietic reconstitution from cord blood following cryopreservation-related functional decline
2025-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI183607
PMID:40036065
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了脐带血冷冻保存对造血干细胞功能的影响机制,并发现萝卜硫素可改善线粒体功能恢复造血重建能力 | 首次系统评估不同冷冻时长对脐带血造血干细胞功能的影响,发现线粒体功能障碍是关键机制,并验证萝卜硫素的改善作用 | 研究样本时间跨度有限,临床验证需要进一步开展 | 探究冷冻保存对脐带血造血干细胞功能的影响及其机制 | 脐带血来源的CD34+造血干细胞和祖细胞及单个核细胞 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包含新鲜和冷冻1年、5年、10年、19年的脐带血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8684 | 2025-10-07 |
A Visible-Light Photocatalysis/Hydrolysis Hydrogen-Generating Nanoplatform for Dynamic Inflammation Management via Immune Metabolism Orchestration during Wound Repair
2025-Apr-30, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c00667
PMID:40117501
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研究论文 | 本研究开发了一种可见光催化/水解产氢纳米平台,通过免疫代谢调控实现伤口修复过程中的动态炎症管理 | 首次整合可见光光催化和水解反应实现可控氢释放,并揭示了氢疗法通过线粒体应激和HIF-1α诱导糖酵解调控免疫代谢的新机制 | 未明确说明动物模型样本量及临床转化潜力 | 开发可控氢释放纳米平台并研究其在伤口修复中的免疫代谢调控机制 | 炎症微环境中的先天免疫细胞和成纤维细胞 | 纳米医学 | 慢性伤口 | 可见光光催化、水解反应、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
8685 | 2025-05-02 |
Spatial transcriptomics: advances and challenges in peripheral nerve sheath tumor
2025-Apr-30, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf116
PMID:40305521
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
8686 | 2025-10-07 |
Innate immune training in the neonatal response to sepsis
2025-Apr-30, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01179-5
PMID:40307728
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研究论文 | 本研究揭示了新生儿接种卡介苗通过重编程骨髓生成增强对脓毒症免疫反应的机制 | 首次证明BCG疫苗接种通过同时重编程骨髓生成的多个方面来改善新生儿对脓毒症的生存率 | 训练免疫影响宿主保护性反应的具体机制仍未完全明确 | 探究先天免疫训练在新生儿脓毒症反应中的作用机制 | 新生儿(特别是早产儿)的免疫系统 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8687 | 2025-10-07 |
Microglia aging in the hippocampus advances through intermediate states that drive activation and cognitive decline
2025-Apr-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97671
PMID:40298588
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了海马区小胶质细胞在衰老过程中经历中间状态并驱动神经炎症激活和认知衰退的机制 | 首次识别了小胶质细胞衰老的中间状态,并证明这些状态通过异时共生实验和遗传模型驱动炎症激活和认知功能下降 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明小胶质细胞在衰老过程中从稳态到功能障碍的进展机制 | 小鼠海马区小胶质细胞 | 神经科学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序,假时间分析,条件性基因敲除 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据 | 成年小鼠生命周期和异时共生实验模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8688 | 2025-10-07 |
Autophagy disruption and mitochondrial stress precede photoreceptor necroptosis in multiple mouse models of inherited retinal disorders
2025-Apr-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59165-8
PMID:40301324
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了遗传性视网膜疾病中光感受器细胞死亡的共同分子通路 | 首次在多种遗传性视网膜疾病模型中发现自噬破坏和线粒体应激是触发光感受器坏死性凋亡的共同早期事件 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 探索遗传性视网膜疾病中光感受器细胞死亡的共同分子机制 | 人源化小鼠模型中的光感受器细胞 | 单细胞转录组学 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多种遗传性视网膜疾病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8689 | 2025-10-07 |
UHRF1-mediated epigenetic reprogramming regulates glycolysis to promote progression of B-cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Apr-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07532-0
PMID:40301374
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研究论文 | 本研究揭示了UHRF1通过表观遗传调控糖代谢促进B细胞急性淋巴细胞白血病进展的分子机制 | 首次发现UHRF1-SFRP5-WNT5A-P38 MAPK-HK2信号轴在白血病糖代谢重编程中的关键作用,并鉴定出UHRF1靶向抑制剂UM164 | NA | 探索B细胞急性淋巴细胞白血病进展的分子机制,寻找改善临床预后的潜在治疗策略 | B细胞急性淋巴细胞白血病细胞 | 单细胞转录组学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
8690 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome profiling of the human endometrium of patients with intrauterine adhesions
2025-Apr-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97433-1
PMID:40301474
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序比较宫腔粘连患者与健康对照者的子宫内膜细胞 | 首次在单细胞分辨率下对宫腔粘连患者子宫内膜进行转录组分析,发现成纤维细胞亚群3的特定富集和功能特征 | 样本量较小(仅5例子宫内膜组织),需要更大规模研究验证 | 探究宫腔粘连的病理生理机制和子宫内膜微环境紊乱 | 人类子宫内膜组织 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例子宫内膜组织(包含患者和健康对照),55,308个原代人类子宫内膜细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8691 | 2025-10-07 |
Integration of multi-omics data to unveil the molecular landscape and role of piRNAs in early-onset colorectal cancer
2025-Apr-29, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04074-2
PMID:40301858
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研究论文 | 通过整合多组学数据揭示早发性结直肠癌的分子特征及piRNAs的作用机制 | 首次系统鉴定PIWIL1/piRNA作为EOCRC的标志物,并发现FR019089等piRNAs具有抑制肿瘤转移的功能 | 样本量相对有限(69例EOCRC),功能验证实验需进一步扩展 | 阐明早发性结直肠癌的分子机制及其侵袭性表型的驱动因素 | 515例结直肠癌患者(69例早发性,446例晚发性)的肿瘤样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学分析(基因组、表观基因组、转录组)、RNA-seq、scRNA-seq、功能实验 | NA | 基因组数据、表观遗传数据、转录组数据 | 515例结直肠癌样本(69例早发性,446例晚发性) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
8692 | 2025-10-07 |
Inhibition of adenosine/A2A receptor signaling suppresses dermal fibrosis by enhancing fatty acid oxidation
2025-Apr-29, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02210-2
PMID:40301970
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研究论文 | 本研究揭示了腺苷/A2A受体信号通过抑制脂肪酸氧化促进皮肤纤维化的新机制 | 首次发现腺苷/A2A受体信号轴通过抑制CREB磷酸化下调CPT1A表达,从而抑制脂肪酸氧化促进皮肤纤维化 | 样本量相对有限(35例SSc患者),机制研究主要基于动物模型和体外实验 | 探索腺苷代谢在系统性硬化症相关皮肤纤维化中的作用机制 | 系统性硬化症患者、小鼠皮肤纤维化模型、人真皮成纤维细胞 | 代谢组学 | 系统性硬化症 | 代谢组学分析、单细胞RNA测序、RNA测序、Seahorse能量代谢分析 | 基因敲除小鼠模型 | 代谢组数据、转录组数据、单细胞测序数据 | 35例SSc患者血浆样本,多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序、代谢组学 | NA | NA |
8693 | 2025-10-07 |
Single-cell multi-dimensional data analysis decodes RNF19A-mediated drug resistance in rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes: mechanisms and biological insights
2025-Apr-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05707-8
PMID:40293542
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研究论文 | 本研究通过单细胞多维度数据分析揭示了RNF19A介导类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞药物耐药性的机制 | 首次发现RNF19A在耐药FLS中显著过表达,并阐明其通过泛素化降解MKP-1激活MAPK信号通路,形成正反馈循环的分子机制 | 基于公共数据库分析,需要进一步实验验证;机制研究主要在细胞水平进行 | 探索类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞药物耐药性的分子机制 | 骨关节炎和类风湿关节炎滑膜组织中的成纤维样滑膜细胞(FLS) | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 公共数据库中的骨关节炎和类风湿关节炎滑膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8694 | 2025-10-07 |
FOXM1 could serve as a bridge mediating prognosis and immunity for clear cell renal cell carcinoma via single-cell and bulk RNA-sequencing
2025-Apr-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02438-x
PMID:40293585
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析FOXM1在透明细胞肾细胞癌中的预后价值和免疫调节作用 | 首次通过单细胞和批量RNA测序相结合的方法,系统揭示FOXM1在ccRCC免疫微环境中的关键作用及其与免疫治疗耐药性的关联 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证FOXM1的具体作用机制 | 探讨FOXM1在透明细胞肾细胞癌预后和免疫调节中的作用 | 透明细胞肾细胞癌组织和癌旁组织 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组化, 实时定量PCR | Cox回归分析 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库中的ccRCC样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
8695 | 2025-10-07 |
Mapping immune cell dynamics and macrophage plasticity in breast cancer tumor microenvironment through single-cell analysis
2025-Apr-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02419-0
PMID:40293603
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示乳腺癌肿瘤微环境中免疫细胞动态和巨噬细胞可塑性 | 首次在单细胞水平系统分析乳腺癌中巨噬细胞亚型及其与肿瘤细胞的相互作用机制,发现SPP1-CD44和LGALS9-CD44信号网络的关键作用 | 研究样本量有限,未进行实验验证,分析主要基于计算工具 | 解析乳腺癌肿瘤微环境中免疫细胞动态和细胞间相互作用机制 | 乳腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞亚群和巨噬细胞亚型 | 单细胞分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,计算分析 | Sc-Type,infercnv,CellChat,CytoTRACE,Monocle | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8696 | 2025-10-07 |
Epigenetic silencing of DNA sensing pathway by FOXM1 blocks stress ligand-dependent antitumor immunity and immune memory
2025-Apr-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59186-3
PMID:40295473
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子FOXM1通过表观遗传沉默DNA感应通路抑制应激配体表达,从而塑造肿瘤免疫抑制微环境的机制 | 首次发现FOXM1通过DNMT1-UHRF1复合物表观遗传沉默STING蛋白,抑制ULBP1表达,阻断NKG2D-NKG2DL相互作用 | 未明确说明研究样本的具体数量和类型 | 探究肿瘤细胞内在转录因子如何表观遗传调控肿瘤免疫微环境 | 肿瘤细胞、肿瘤免疫微环境、自然杀伤细胞、T细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8697 | 2025-10-07 |
Strigolactones optimise plant water usage by modulating vessel formation
2025-Apr-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59072-y
PMID:40295470
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了独脚金内酯信号通路通过调节维管形成来优化植物水分利用的机制 | 首次在单细胞水平揭示独脚金内酯信号通路负调控导管分子形成及其对植物水分利用的影响 | 研究仅限于拟南芥模型,尚未在其他植物物种中验证 | 探究维管组织形成调控机制及其在植物水分平衡中的作用 | 拟南芥维管组织、形成层干细胞、导管分子 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8698 | 2025-10-07 |
Unveiling fine-scale spatial structures and amplifying gene expression signals in ultra-large ST slices with HERGAST
2025-Apr-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59139-w
PMID:40295488
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研究论文 | 提出HERGAST系统用于超大规模空间转录组数据的空间结构识别和信号放大 | 设计了专门针对空间转录组数据分析的Divide-Iterate-Conquer框架,并构建异构图网络整合局部和全局空间关系 | NA | 解决超大规模空间转录组数据的分析挑战,提升空间结构识别精度和基因表达信号 | 结直肠肿瘤和乳腺癌组织 | 空间转录组学 | 结直肠癌, 乳腺癌 | 空间转录组学 | 异构图网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
8699 | 2025-10-07 |
Disulfidptosis in tumor progression
2025-Apr-28, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02495-9
PMID:40295497
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综述 | 本文系统阐述二硫死亡在肿瘤代谢重编程中的关键作用及其分子机制 | 整合多组学数据与单细胞转录组学解析二硫死亡相关基因的异质表达模式,揭示其与免疫微环境重塑的动态互作 | NA | 探讨二硫死亡在肿瘤进展中的作用机制及治疗潜力 | 二硫死亡相关基因(DRGs)和长链非编码RNA(DRLs) | 肿瘤生物学 | 肿瘤 | 多组学整合分析, 单细胞转录组学 | NA | 多组学数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8700 | 2025-10-07 |
DNA damage in proximal tubules triggers systemic metabolic dysfunction through epigenetically altered macrophages
2025-Apr-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59297-x
PMID:40295524
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研究论文 | 本研究揭示了肾脏近端小管上皮细胞DNA损伤通过表观遗传改变巨噬细胞引发全身代谢功能障碍的机制 | 首次发现肾脏DNA损伤通过巨噬细胞表观遗传改变引发全身代谢功能障碍,揭示了肾脏-血液-代谢轴的新机制 | 未明确DNA损伤的具体诱因,且表观遗传改变的具体调控机制仍需进一步研究 | 探究肾脏DNA损伤对全身代谢功能的影响及其分子机制 | 肾脏近端小管上皮细胞、巨噬细胞、单核细胞及代谢组织(脂肪组织和肝脏) | 表观遗传学 | 代谢功能障碍 | 单细胞RNA测序、DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |