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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8661 | 2025-10-07 |
Interleukin 21 Drives a Hypermetabolic State and CD4+ T-Cell-Associated Pathogenicity in Chronic Intestinal Inflammation
2024-05, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.01.026
PMID:38266738
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研究论文 | 本研究揭示了白细胞介素21通过调控调节性T细胞的代谢状态驱动慢性肠道炎症的机制 | 首次发现IL21通过破坏线粒体-内质网接触点,诱导调节性T细胞进入高代谢状态并增强其炎症反应 | 研究主要基于体外实验和动物模型,在人类疾病中的直接应用仍需进一步验证 | 探究细胞代谢在调节性T细胞维持肠道稳态中的作用机制 | 人类调节性T细胞和CD4+ T细胞诱导的小鼠结肠炎模型 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 电子显微镜、共聚焦成像、邻近连接分析、免疫印迹、质谱流式、代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、蛋白质、代谢物、基因表达 | NA | Agilent | 代谢分析 | Seahorse XF分析仪 | Seahorse XF实时代谢分析系统 |
8662 | 2025-10-07 |
Group 1 ILCs: Heterogeneity, plasticity, and transcriptional regulation
2024-05, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13327
PMID:38563448
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综述 | 本文系统综述了小鼠第1组先天淋巴细胞的异质性、可塑性及转录调控机制 | 整合单细胞RNA测序和命运图谱研究的最新发现,揭示第1组ILC的异质性和组织特异性特征 | 主要基于小鼠模型研究,人类第1组ILC的直接证据有限 | 探讨第1组先天淋巴细胞的发育程序、表型异质性和转录调控机制 | 小鼠第1组先天淋巴细胞(包括ILC1和自然杀伤细胞) | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 命运图谱技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8663 | 2025-10-07 |
Unveiling cell subpopulations in T1D mouse islets using single-cell RNA sequencing
2024-May-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00323.2023
PMID:38506753
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析1型糖尿病小鼠胰岛细胞亚群,揭示α和β细胞的异质性及其在疾病进展中的潜在作用 | 首次在STZ诱导的1型糖尿病小鼠模型中构建全面的胰岛单细胞图谱,发现11种主要细胞类型并揭示α和β细胞亚群的异质性 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证;样本数量未明确说明 | 探究1型糖尿病胰岛细胞的异质性及其在疾病发病机制中的作用 | STZ诱导的1型糖尿病小鼠模型的胰岛细胞 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8664 | 2025-10-07 |
Nfe2l3 promotes neuroprotection and long-distance axon regeneration after injury in vivo
2024-May, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2024.114741
PMID:38395216
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研究论文 | 本研究揭示了Nfe2l3在神经保护和长距离轴突再生中的新功能 | 首次发现Nfe2l3具有促进神经保护和轴突再生的功能,并鉴定其相关基因网络 | NA | 探究Nfe2l3在CNS损伤后神经保护和轴突再生中的作用 | 皮层和视网膜神经节细胞(RGC)CNS投射神经元 | 神经科学 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8665 | 2025-10-07 |
How Mycobacterium tuberculosis builds a home: Single-cell analysis reveals M. tuberculosis ESX-1-mediated accumulation of anti-inflammatory macrophages in infected mouse lungs
2024-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.20.590421
PMID:38712150
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究结核分枝杆菌ESX-1系统在感染小鼠肺部调控单核吞噬细胞异质性和抗炎反应的作用机制 | 首次揭示ESX-1系统通过招募和分化抗炎性单核吞噬细胞帮助结核分枝杆菌建立生存环境的机制 | 研究仅使用小鼠和鼠源骨髓衍生巨噬细胞模型,未在人体样本中验证 | 探究结核分枝杆菌ESX-1分泌系统对宿主单核吞噬细胞招募和分化的调控作用 | 感染结核分枝杆菌的小鼠肺部组织和鼠骨髓衍生巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 小鼠肺部组织和骨髓衍生巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
8666 | 2025-10-07 |
Multimodal hierarchical classification of CITE-seq data delineates immune cell states across lineages and tissues
2024-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.06.547944
PMID:37461466
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研究论文 | 提出一种基于标记的多模态分类方法MMoCHi,用于整合CITE-seq数据中的基因和蛋白表达信息进行细胞类型注释 | 开发了不依赖参考图谱的多模态层次分类方法,能够识别传统方法难以解析的免疫细胞亚群并发现新的亚群标记 | NA | 开发能够整合多模态单细胞数据的细胞类型分类方法 | 免疫细胞,特别是T淋巴细胞亚群和跨组织人类免疫细胞 | 生物信息学 | NA | CITE-seq,单细胞RNA测序 | 基于标记的分类器 | 单细胞转录组数据,表面蛋白组数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
8667 | 2025-10-07 |
Meta-analyses of mouse and human prostate single-cell transcriptomes reveal widespread epithelial plasticity in tissue regression, regeneration, and cancer
2024-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.30.578066
PMID:38352515
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研究论文 | 通过对小鼠和人类前列腺单细胞转录组进行荟萃分析,揭示组织退化、再生和癌症中广泛存在的上皮细胞可塑性 | 首次通过跨物种单细胞转录组荟萃分析系统揭示前列腺上皮细胞在正常状态、雄激素剥夺后退化及癌症中的广泛可塑性 | 基于已有数据集的分析,可能受原始实验设计和技术差异的影响 | 研究前列腺组织中细胞状态可塑性在组织维持和癌症中的作用 | 小鼠和人类前列腺组织样本 | 单细胞转录组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个已发表和新的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8668 | 2025-10-07 |
Cellular Senescence Contributes to the Progression of Hyperoxic Bronchopulmonary Dysplasia
2024-Feb, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0038OC
PMID:37874230
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研究论文 | 本研究探讨细胞衰老在高氧诱导的支气管肺发育不良进展中的作用机制 | 首次系统证实细胞衰老在BPD发病机制中的关键作用,并验证通过抑制髓过氧化物酶氧化产物、内质网应激和细胞衰老可改善BPD表型 | 研究主要基于动物模型,人类样本有限;治疗干预时间点和长期效果需进一步验证 | 阐明细胞衰老在支气管肺发育不良疾病进展中的作用机制 | 人类尸检肺组织、Sprague-Dawley大鼠幼崽(P1-P10) | 病理生理学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 转录组学, 免疫印迹, 组织学分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 组织图像 | 人类尸检肺样本和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8669 | 2025-10-07 |
Transcriptomic profiling of thymic dysregulation and viral tropism after neonatal roseolovirus infection
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1375508
PMID:38895117
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析新生儿玫瑰疹病毒感染后胸腺转录组变化和病毒嗜性 | 首次完整描绘新生儿感染后玫瑰疹病毒在胸腺中的嗜性特征,并建立首个体外MRV感染细胞培养系统 | 研究局限于小鼠模型,人类玫瑰疹病毒的直接影响仍需进一步验证 | 探究新生儿玫瑰疹病毒感染如何破坏胸腺功能并诱发自身免疫疾病 | 新生小鼠胸腺细胞和髓质胸腺上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq),伪时间分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8670 | 2025-10-07 |
Circadian regulation of lung repair and regeneration
2023-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.164720
PMID:37463053
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研究论文 | 本研究探讨生物钟对肺修复和再生的调控机制及其在呼吸道感染恢复中的作用 | 首次揭示生物钟通过不同通路调控肺再生:在气管细胞中通过Wnt/β-catenin通路,在肺泡上皮细胞中通过IL-1β | 未明确说明样本规模,且机制研究主要基于模型系统 | 探究生物钟在肺修复和再生过程中的作用机制 | 人类队列数据、肺类器官、气管细胞、肺泡上皮细胞 | 生物医学 | 呼吸道感染 | 单细胞RNA测序、类器官培养、病毒感染模型 | NA | 基因组数据、转录组数据、临床数据 | UK Biobank队列数据(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8671 | 2025-10-07 |
Cryobanking of Human Distal Lung Epithelial Cells for Preservation of Their Phenotypic and Functional Characteristics
2022-12, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2021-0507MA
PMID:36036918
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研究论文 | 本文详述了一种用于冷冻保存小鼠或人肺组织上皮细胞以保持其表型和功能特征的方法 | 开发了有效的远端肺组织上皮细胞冷冻保存方法,解决了远端气体交换区域功能上皮细胞类型长期保存的技术空白 | NA | 建立能够长期保存远端肺组织上皮细胞表型和功能特征的冷冻保存方法 | 小鼠和人肺组织中的远端肺上皮细胞,特别是肺泡2型细胞 | 细胞生物学 | 肺部疾病 | 流式细胞术、上皮类器官形成效率分析、单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8672 | 2025-10-07 |
Taurine ameliorates liver fibrosis by repressing Fpr2-regulated macrophage M1 polarization
2025-Jun-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.177614
PMID:40216178
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研究论文 | 本研究揭示牛磺酸通过抑制Fpr2/NF-κBp65通路调控巨噬细胞M1极化来改善肝纤维化的作用机制 | 首次阐明牛磺酸通过Fpr2/NF-κBp65信号轴调控巨噬细胞极化状态在肝纤维化中的保护作用 | NA | 探究牛磺酸对肝纤维化的保护作用及其分子机制 | 人类肝纤维化组织样本和两种不同的小鼠肝纤维化模型 | NA | 肝纤维化 | 氨基酸代谢组学, 基因表达微阵列分析, 单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据, 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8673 | 2025-10-07 |
Integrating Bulk RNA and Single-Cell Sequencing Data Unveils Efferocytosis Patterns and ceRNA Network in Ischemic Stroke
2025-Jun, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01255-8
PMID:38678526
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA和单细胞测序数据,揭示了缺血性脑卒中中的胞葬作用模式和ceRNA网络 | 首次整合bulk RNA和单细胞测序数据系统分析缺血性脑卒中中的胞葬作用,并构建了相关的ceRNA调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索缺血性脑卒中后炎症反应和胞葬作用的细胞分子机制及其对脑损伤和恢复的影响 | 缺血性脑卒中患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析 | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE137482, GSE30655, GSE174574等),包括小鼠和人类样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8674 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Revealed White Matter Repair Following Subarachnoid Hemorrhage
2025-Jun, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01265-6
PMID:38861152
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了蛛网膜下腔出血后白质修复的细胞机制 | 首次在SAH模型中识别出修复性小胶质细胞在白质富集区域的浸润和克隆扩增,并发现小胶质细胞相关多效蛋白通过mTOR信号通路调节少突胶质前体细胞 | 研究仅使用小鼠模型,结果向人类临床应用的转化需要进一步验证 | 阐明蛛网膜下腔出血急性期和亚急性期脑细胞亚群在白质修复中的作用机制 | 蛛网膜下腔出血模型小鼠 | 单细胞组学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 磁共振成像, 免疫荧光双染色, Western blot | NA | 单细胞转录组数据, 影像数据, 蛋白质数据 | SAH模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8675 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals a regulatory role of WT1 in mast cell proliferation in endometrial polyps
2025-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500116R
PMID:40304994
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研究论文 | 通过单细胞测序技术研究子宫内膜息肉中肥大细胞的调控机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示WT1转录因子调控子宫内膜息肉中肥大细胞增殖的新机制 | 样本量有限,需要进一步验证WT1调控机制的功能性实验 | 探索子宫内膜息肉的细胞异质性和分子机制 | 子宫内膜息肉组织和邻近正常子宫内膜组织 | 单细胞生物学 | 子宫内膜息肉 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | 转录调控网络分析 | 基因表达数据 | 子宫内膜息肉和邻近正常子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
8676 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics in a child with coenzyme Q10 nephropathy: potential of single-cell RNA sequencing in pediatric kidney disease
2025-May, Pediatric nephrology (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00467-024-06611-2
PMID:39805995
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了一名辅酶Q10肾病患儿的肾脏活检样本,揭示了该疾病中细胞类型比例和基因表达的变化 | 首次在辅酶Q10肾病中应用单细胞RNA测序技术,揭示了跨细胞类型的线粒体基因表达普遍下调 | 仅基于单个病例的研究,样本量有限 | 阐明辅酶Q10肾病在单细胞水平的基因表达变化 | 5岁辅酶Q10肾病患儿的肾脏活检组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患儿肾脏活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8677 | 2025-10-07 |
T-type calcium channels regulate medulloblastoma and can be targeted for therapy
2025-May, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-025-04967-5
PMID:39961940
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研究论文 | 本研究探讨T型钙通道在髓母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次对髓母细胞瘤中T型钙通道进行全面的多组学表征,为米贝地尔药物重新用于治疗提供临床前数据 | 研究主要基于临床前模型,需要进一步临床试验验证 | 研究T型钙通道在髓母细胞瘤中的作用机制及治疗靶向性 | 髓母细胞瘤肿瘤细胞和异种移植模型 | 癌症研究 | 髓母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 反向蛋白质阵列(RPPA), 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA) | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 超过30%的髓母细胞瘤肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
8678 | 2025-10-07 |
Differential cellular origins of the extracellular matrix of tumor and normal tissues according to colorectal cancer subtypes
2025-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02964-z
PMID:40032993
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研究论文 | 通过整合定量蛋白质组学和单细胞RNA测序数据,研究结直肠癌肿瘤微环境中细胞外基质的细胞来源异质性 | 首次系统鉴定结直肠癌中正常组织和肿瘤组织细胞外基质蛋白的差异细胞来源,并建立细胞-基质组数据库 | 样本量相对较小(21例患者),主要依赖公共数据集进行验证 | 解析结直肠癌肿瘤微环境中细胞外基质的异质性及其与临床预后的关系 | 结直肠癌患者组织样本和癌旁正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | TMT蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | CMS分子分型, 单细胞水平反卷积分析 | 蛋白质组数据, RNA测序数据 | 21例结直肠癌患者的24个组织样本及癌旁正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
8679 | 2025-10-07 |
Macrophage-mediated IL-6 signaling drives ryanodine receptor-2 calcium leak in postoperative atrial fibrillation
2025-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI187711
PMID:40048254
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示浸润性CCR2+巨噬细胞通过IL-6-STAT3-CaMKII信号通路驱动兰尼碱受体2钙泄漏,导致术后房颤发生 | 首次发现巨噬细胞介导的IL-6信号通过STAT3-CaMKII通路调控RyR2-S2814磷酸化,揭示术后房颤的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究术后房颤发生的细胞和分子机制 | 小鼠心房非肌细胞、人类心包液、分离的心房肌细胞 | 单细胞测序 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq、伪时间轨迹分析、共聚焦成像、条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据、钙成像数据 | 小鼠模型和人类心脏手术患者心包液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8680 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals distinct plasma cell populations in chronic thromboembolic pulmonary hypertension
2025-May, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1016/j.jtha.2025.02.010
PMID:39965671
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示慢性血栓栓塞性肺动脉高压中浆细胞的独特亚群特征 | 首次发现AHNAK和IGLC3两个新型浆细胞亚群,并揭示其分化轨迹和功能特征 | 样本量有限(5例患者和6例正常肺动脉),需要更大规模验证 | 识别CTEPH中浆细胞的表型改变和分化模式 | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压患者的肺动脉内膜切除组织和血浆样本 | 单细胞转录组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,蛋白电泳 | GeneSwitches分析,轨迹分析 | 单细胞转录组数据,蛋白质数据 | 5例CTEPH患者,6例正常肺动脉,273例CTEPH患者,259例IPAH患者,251例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |