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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8641 | 2025-10-07 |
The High-Affinity IL-2 Receptor Affects White Matter Damage after Cerebral Ischemia by Regulating CD8 + T Lymphocyte Differentiation
2025-Jan-16, Journal of neuroimmune pharmacology : the official journal of the Society on NeuroImmune Pharmacology
IF:5.2Q1
DOI:10.1007/s11481-025-10169-7
PMID:39821696
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研究论文 | 本研究探讨高亲和力IL-2受体通过调节CD8+T淋巴细胞分化影响脑缺血后白质损伤的机制 | 首次揭示高亲和力IL-2R在CD8+T细胞中的特异性表达及其通过干扰素-α反应通路等机制促进脑缺血后白质损伤 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明高亲和力IL-2受体在脑缺血后免疫调节和白质损伤中的作用机制 | CD8+T淋巴细胞、脑缺血小鼠模型、内皮细胞 | 免疫学、神经科学 | 脑缺血、缺血性卒中 | 单细胞RNA测序、RNA-seq、qPCR、免疫荧光、多重检测、扩散张量成像、电生理学 | NA | 基因表达数据、影像数据、行为数据 | IL-2Rα基因敲除小鼠和对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | NA |
8642 | 2025-10-07 |
Inhibition of aortic CX3CR1+ macrophages mitigates thoracic aortic aneurysm progression in Marfan syndrome in mice
2025-Jan-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178198
PMID:39817456
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研究论文 | 本研究通过靶向CX3CR1+巨噬细胞及其分泌因子,揭示了其在马凡综合征胸主动脉瘤形成中的关键作用 | 首次发现主动脉内膜CX3CR1+巨噬细胞通过旁分泌TNF-α和IGF1驱动血管平滑肌细胞炎症,是胸主动脉瘤形成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化需进一步验证 | 探究免疫细胞介导的炎症在马凡综合征胸主动脉瘤发病机制中的作用 | Fbn1C1041G/+基因修饰小鼠和马凡综合征患者样本 | 单细胞生物学 | 胸主动脉瘤 | 单细胞RNA测序,骨髓移植,联体共生,shRNA慢病毒转导 | NA | 单细胞转录组数据,病理学数据 | 基因修饰小鼠模型和人类患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8643 | 2025-10-07 |
Aligned membranes regulate wound healing via MMP12 secreted by macrophages
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0317194
PMID:39813228
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研究论文 | 本研究揭示了排列电纺膜通过调控巨噬细胞分泌MMP12促进伤口愈合的机制 | 首次发现排列电纺膜通过上调MMP12表达抑制成纤维细胞迁移,从而促进无疤痕伤口愈合 | 未明确排列电纺膜调控MMP12表达的具体分子通路 | 阐明排列电纺纤维膜加速伤口愈合的分子机制 | 皮肤伤口愈合过程及相关细胞类型 | 组织工程 | 皮肤创伤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8644 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals Exercise-Induced Transcriptional Dynamics in Half-Marathon Runners
2025-Jan, Scandinavian journal of medicine & science in sports
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/sms.70018
PMID:39817606
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析半马拉松业余跑者耐力运动后外周血单个核细胞的转录动态变化 | 首次在单细胞水平揭示耐力运动诱导的免疫细胞转录组变化,并采用伪批量分析方法与传统单细胞分析形成互补 | 样本量较小(仅4名参与者),研究结果需要更大规模研究验证 | 探究耐力运动对免疫细胞转录动态的影响及其潜在机制 | 半马拉松业余跑者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名参与者在跑半马拉松前后的血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8645 | 2025-10-07 |
Integration of unpaired single cell omics data by deep transfer graph convolutional network
2025-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012625
PMID:39821189
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研究论文 | 提出基于图卷积网络的深度迁移模型scTGCN,用于整合未配对的单细胞组学数据 | 开发了能够保持生物变异性的深度迁移图卷积网络,可在低内存消耗下快速整合数十万个细胞 | 未在摘要中明确说明 | 提高单细胞组学数据中从scRNA-seq到scATAC-seq的标签迁移性能 | 单细胞RNA测序数据和单细胞染色质可及性数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞染色质可及性测序 | 图卷积网络(GCN) | 单细胞组学数据 | 数十万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 多模态组学 | NA | APSA-seq, CITE-seq |
8646 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals cellular reprogramming and changes of immune cell subsets following tetramethylpyrazine treatment in LPS-induced acute lung injury
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18772
PMID:39822976
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示川芎嗪在LPS诱导的急性肺损伤中对细胞重编程和免疫细胞亚群的影响 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示川芎嗪通过调节免疫细胞亚群和转录因子FOSL1/JunB发挥肺保护作用的新机制 | 研究仅基于小鼠模型,未进行临床验证;细胞亚群功能验证不够充分 | 探究川芎嗪对急性肺损伤肺组织微环境的保护作用及分子机制 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 单细胞组学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,免疫组织化学,酶联免疫吸附试验 | NA | 单细胞转录组数据 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8647 | 2025-10-07 |
Cellular Senescence Genes as Cutting-Edge Signatures for Abdominal Aortic Aneurysm Diagnosis: Potential for Innovative Therapeutic Interventions
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70323
PMID:39823264
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研究论文 | 本研究通过识别细胞衰老相关基因并验证其在腹主动脉瘤诊断中的潜力,揭示了细胞衰老在AAA进展中的关键作用 | 首次系统识别并验证ETS1和ITPR3作为腹主动脉瘤诊断生物标志物,结合机器学习算法和单细胞RNA测序技术 | 样本量相对有限,需要更大规模临床验证 | 识别与腹主动脉瘤发展相关的细胞衰老基因并评估其作为治疗靶点的潜力 | 腹主动脉瘤患者样本和小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, WB, IF, RT-qPCR, 机器学习算法 | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | 基因表达数据, 血清样本, 组织样本 | GSE57691训练集和两个独立验证数据集,人类血清样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
8648 | 2025-10-07 |
BuDDI: Bulk Deconvolution with Domain Invariance to predict cell-type-specific perturbations from bulk
2025-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012742
PMID:39823522
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研究论文 | 提出一种名为BuDDI的批量数据反卷积方法,通过域适应技术整合批量数据和单细胞RNA测序数据,预测细胞类型特异性扰动效应 | 利用域适应技术学习独立的潜在空间,能够在不使用单细胞扰动数据的情况下预测细胞类型特异性扰动响应 | NA | 开发能够从批量数据预测细胞类型特异性扰动效应的方法 | 批量RNA测序数据和单细胞RNA测序参考数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 变分自编码器(VAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
8649 | 2025-10-07 |
Macrophage Infiltration and ITGB2 Expression in ESCC: A Novel Correlation
2025-Jan, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70604
PMID:39825491
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据发现并验证了食管鳞癌中巨噬细胞浸润与ITGB2表达的正相关性 | 首次发现ITGB2在浸润巨噬细胞中的表达随其向促肿瘤表型极化而增加,并提出了ITGB2敲除M1巨噬细胞回输的新型免疫治疗策略 | NA | 探索食管鳞癌中与肿瘤免疫相关的关键分子和治疗策略 | 食管鳞癌组织样本和免疫细胞 | 生物信息学 | 食管鳞癌 | 高通量测序、基因芯片、单细胞测序、生物信息学分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8650 | 2025-10-07 |
Unveiling the mechanism of micro-and-nano plastic phytotoxicity on terrestrial plants: A comprehensive review of omics approaches
2025-Jan, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2025.109257
PMID:39818003
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综述 | 本文综述了组学方法在揭示微纳塑料对陆生植物毒性机制方面的应用 | 系统整合了多种前沿组学技术(包括4D组学、表型组学、空间转录组学和单细胞组学)在微纳塑料植物毒性研究中的应用 | NA | 阐明微纳塑料对陆生植物的毒性机制 | 陆生植物 | 环境毒理学 | NA | 蛋白质组学、代谢组学、转录组学、微生物组学、4D组学、表型组学、空间转录组学、单细胞组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞组学 | NA | NA |
8651 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals S100A8/A9hi neutrophils-induced endothelial cell death and lymphocyte infiltration after ischemic stroke
2024-12-31, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.151023
PMID:39579533
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示缺血性中风后S100A8/A9高中性粒细胞诱导的内皮细胞死亡和淋巴细胞浸润机制 | 首次发现S100A8/A9hi中性粒细胞亚群在缺血性中风中的关键作用,并证实S100A8/A9抑制剂paquinimod的神经保护作用 | 未明确说明样本来源和具体数量,机制研究仍需进一步验证 | 探究缺血性中风后免疫细胞与血脑屏障相互作用的分子机制 | 中性粒细胞、内皮细胞和T细胞 | 单细胞基因组学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8652 | 2025-10-07 |
Revealing the roles of IL-7R in abdominal aortic aneurysm through integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq
2024-12-31, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.151042
PMID:39586133
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研究论文 | 通过整合分析单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示IL-7R在腹主动脉瘤发病机制中的关键作用 | 首次通过整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据系统分析IL-7R在AAA中的作用机制,发现IL-7R通过JAK/STAT通路促进IFN-γ分泌并诱导平滑肌细胞表型转换 | 数据来源于公共数据库GEO,缺乏独立验证队列;样本数量未明确说明 | 探索腹主动脉瘤的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 腹主动脉瘤组织样本和CD4记忆T细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
8653 | 2025-10-07 |
Explainable deep neural networks for predicting sample phenotypes from single-cell transcriptomics
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae673
PMID:39814561
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研究论文 | 开发了一个名为singleDeep的端到端流程,利用深度神经网络分析单细胞转录组数据以预测样本表型 | 提出了首个专门针对单细胞RNA测序数据的端到端深度神经网络分析流程,能够同时提供表型预测和基因重要性解释 | 未明确说明模型在更大规模数据集上的可扩展性以及计算资源需求 | 开发能够有效分析单细胞转录组数据并预测样本表型的深度学习方法 | 系统性红斑狼疮、阿尔茨海默病和COVID-19患者的单细胞转录组数据 | 机器学习 | 自身免疫疾病,神经退行性疾病,传染病 | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8654 | 2025-10-07 |
scGO: interpretable deep neural network for cell status annotation and disease diagnosis
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf018
PMID:39820437
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研究论文 | 提出一种基于基因本体的可解释深度学习框架scGO,用于单细胞RNA测序数据的细胞状态注释和疾病诊断 | 利用稀疏神经网络整合基因、转录因子和GO术语之间的内在生物学关系,显著增强模型可解释性并降低计算成本 | 未在论文摘要中明确说明 | 开发可解释的深度学习模型用于细胞状态注释和疾病诊断 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习、稀疏神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8655 | 2025-10-07 |
Small Molecule Hydrogels Loading Small Molecule Drugs from Chinese Medicine for the Enhanced Treatment of Traumatic Brain Injury
2024-10-22, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c09097
PMID:39383335
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研究论文 | 开发了一种负载中药小分子药物的自组装水凝胶用于创伤性脑损伤的增强治疗 | 无需额外载药或添加非活性成分,仅利用源自中药的小分子药物在生理条件下自组装形成水凝胶 | 未提及临床转化面临的具体挑战和长期安全性数据 | 开发一种新型创伤性脑损伤治疗策略 | 创伤性脑损伤模型 | 生物医学工程 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8656 | 2025-10-07 |
Role of macrophages in regression of myocardial fibrosis following alleviation of left ventricular pressure overload
2024-05-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00240.2023
PMID:38363214
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研究论文 | 本研究探讨巨噬细胞在左心室压力超负荷缓解后心肌纤维化消退中的作用 | 首次揭示巨噬细胞在压力超负荷缓解后对胶原降解和间质纤维化部分消退的潜在益处 | 纤维化消退不完全,具体机制仍需进一步研究 | 确定巨噬细胞表型在压力超负荷和负荷缓解过程中的时间变化及其对胶原降解的影响 | 小鼠心肌组织 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 免疫组织化学,流式细胞术,RT-PCR,免疫印迹,单细胞测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,细胞表型数据 | 对照组,2周和4周TAC组,2周,4周和6周unTAC组小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
8657 | 2025-10-07 |
SOCS3 regulates pathological retinal angiogenesis through modulating SPP1 expression in microglia and macrophages
2024-May-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.03.025
PMID:38504518
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研究论文 | 本研究揭示了SOCS3通过调控小胶质细胞和巨噬细胞中SPP1表达在病理性视网膜血管生成中的作用机制 | 首次发现SOCS3/STAT3/SPP1轴在病理性视网膜血管生成中的关键调控作用,并确定SPP1是STAT3的直接转录靶基因 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性仍需进一步验证 | 探究髓系细胞在病理性眼血管生成中的分子机制 | 小鼠视网膜血管生成模型中的小胶质细胞和巨噬细胞 | 分子生物学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8658 | 2025-10-07 |
Macrophages in necrotic liver lesion repair: opportunities for therapeutical applications
2024-05-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00053.2024
PMID:38618702
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综述 | 本文综述了肝脏巨噬细胞在坏死性肝损伤修复中的不同作用及其治疗应用前景 | 通过特异性巨噬细胞标记物、靶向细胞清除和单细胞RNA测序技术,揭示了单核来源巨噬细胞亚群在肝损伤和修复中的不同功能 | NA | 探讨肝脏巨噬细胞在坏死性肝损伤修复中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 肝脏巨噬细胞(包括库普弗细胞和单核来源巨噬细胞) | NA | 急性肝衰竭、慢加急性肝衰竭 | 单细胞RNA测序、靶向细胞清除 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8659 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Response of Renal Lymphatic Endothelial Cells to Acute Kidney Injury
2024-May-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000325
PMID:38506705
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序首次描述了小鼠肾脏淋巴管内皮细胞在急性肾损伤中的异质性和分子响应机制 | 首次系统描述肾脏淋巴管内皮细胞异质性,揭示其在急性肾损伤中调控局部免疫反应的新分子通路 | 淋巴管内皮细胞在肾脏中相对稀少,可能影响测序数据的全面性 | 研究肾脏淋巴管内皮细胞在急性肾损伤中的分子响应机制 | 小鼠肾脏淋巴管内皮细胞 | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,定量PCR,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肾脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8660 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal Evolution of Developing Palate in Mice
2024-05, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241232317
PMID:38619065
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间增强分辨率组学测序技术,构建了小鼠腭部发育的时空转录图谱 | 首次整合scRNA-seq和stereo-seq技术解析腭部发育的时空动态变化,发现间充质和上皮细胞在空间上分为3个功能域 | 研究仅针对C57BL/6J小鼠特定胚胎时期,结果可能不适用于其他物种或发育阶段 | 探索腭部发育过程中的主要细胞群体及其功能作用 | C57BL/6J小鼠胚胎期12.5、14.5和16.5天的腭部组织 | 发育生物学 | 腭部发育异常 | 单细胞RNA测序, 空间增强分辨率组学测序 | CellTrek | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 3个发育时间点的小鼠腭部样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |