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当前共找到 32005 篇文献，本页显示第 8621 - 8640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8621 | 2025-05-07 |
Integrating Tissue Microarray to GeoMx® Digital Spatial Profiler : Spatial Transcriptomics Assay with Bioinformatics Analysis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4276-4_9
PMID:39900760
|
研究论文 | 本文介绍了如何将组织微阵列整合到GeoMx®数字空间分析仪中，进行空间转录组学检测及生物信息学分析 | 详细描述了数字空间分析仪（DSP）的NGS检测协议及生物信息学分析流程，特别关注组织微阵列的整合及GeoMx RNA检测的特定方法 | 依赖于NanoString公司提供的GeoMX DSP指南和GeoMx数据分析手册的当前版本，需定期检查更新 | 推动空间转录组学技术在疾病研究和治疗中的应用 | 组织微阵列和GeoMx RNA检测 | 空间转录组学 | NA | NGS, RNA-Seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8622 | 2025-05-07 |
Analysis of downstream targets of PAX6 and LHX2, fundamental regulators of the developing mammalian neocortex
2025, Journal of biosciences
IF:2.1Q2
PMID:39912400
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研究论文 | 分析PAX6和LHX2这两个哺乳动物大脑皮层发育中的基本调控因子的下游靶基因 | 比较了PAX6和LHX2的染色质占据情况以及各自缺失时的转录失调，识别了共同直接和间接靶基因，并分析了它们在神经发生过程中的表达模式 | 未进行实验验证所提出的假设 | 探究PAX6和LHX2在哺乳动物大脑皮层发育中的基因调控网络 | PAX6和LHX2转录因子及其下游靶基因 | 发育生物学 | NA | 染色质占据分析、单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8623 | 2025-05-07 |
Cell-type deconvolution for bulk RNA-seq data using single-cell reference: a comparative analysis and recommendation guideline
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf031
PMID:39899596
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研究论文 | 本文通过系统评估九种基于单细胞RNA测序数据的反卷积方法，提出了在不同场景下选择合适方法的推荐指南 | 首次系统比较了多种基于单细胞RNA测序数据的反卷积方法，并提出了实用推荐指南 | 研究仅评估了九种方法，可能未涵盖所有现有方法 | 评估和比较基于单细胞RNA测序数据的反卷积方法在组织细胞类型比例估计中的准确性和鲁棒性 | 九种反卷积方法和五组单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，流式细胞术 | NA | RNA测序数据 | 五组单细胞RNA测序数据集和真实批量数据 | NA | NA | NA | NA |
| 8624 | 2025-05-07 |
Characterizing tumor biology and immune microenvironment in high-grade serous ovarian cancer via single-cell RNA sequencing: insights for targeted and personalized immunotherapy strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1500153
PMID:39896800
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究高级别浆液性卵巢癌的肿瘤生物学特性及免疫微环境，为靶向和个性化免疫治疗策略提供见解 | 利用单细胞RNA测序技术系统研究HGSOC的肿瘤异质性和免疫微环境，发现与不良预后相关的C2 IGF2+肿瘤细胞亚型及其与肿瘤进展的关联 | 研究依赖于公开数据库的scRNA-seq数据，可能受限于样本量和数据质量 | 揭示HGSOC进展和治疗抵抗的分子机制，开发更有效的个性化治疗策略 | 高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）的肿瘤细胞亚型及其免疫微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 预后模型 | RNA测序数据 | 从GEO数据库获取的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 8625 | 2025-05-07 |
Elucidating the causal associations and mechanisms between circulating immune cells and idiopathic pulmonary fibrosis: new insights from Mendelian randomization and transcriptomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1437984
PMID:39896814
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和转录组学分析，探讨循环免疫细胞与特发性肺纤维化之间的因果关系及潜在生物标志物 | 结合孟德尔随机化和转录组学数据，首次系统性地研究了免疫细胞表型与IPF的因果关系，并鉴定了三个新的生物标志物 | 研究依赖于公开数据库的GWAS数据，可能存在样本选择偏倚 | 阐明循环免疫细胞与特发性肺纤维化之间的因果关系及机制 | 循环免疫细胞表型和特发性肺纤维化患者 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 孟德尔随机化分析、转录组学分析、单细胞RNA测序 | IVW等五种孟德尔随机化方法 | 基因组关联研究数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 来自公开数据库的GWAS数据和IPF患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8626 | 2025-05-07 |
Novel pyroptosis-immune-related lncRNA signature exhibits a distinct immune cell infiltration landscape in breast cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522327
PMID:39906743
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研究论文 | 本研究通过分析焦亡和免疫相关的长链非编码RNA（lncRNA），构建了一个六-lncRNA特征，用于预测乳腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次构建了一个结合焦亡和免疫相关lncRNA的特征，用于预测乳腺癌预后和免疫治疗反应，并揭示了不同的免疫细胞浸润模式 | 研究依赖于TCGA数据集，需要进一步的外部验证 | 识别乳腺癌的潜在治疗靶点，并预测患者的预后和免疫治疗反应 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | Pearson相关系数、单变量Cox回归分析、LASSO方法、单细胞测序 | 六-lncRNA特征模型 | RNA-seq数据、单细胞测序数据 | TCGA数据集中的乳腺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8627 | 2025-10-07 |
Construction of monocyte-related prognosis model based on comprehensive analysis of bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq in high-grade serous ovarian cancer
2023-Dec-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000036548
PMID:38115318
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研究论文 | 基于批量RNA-seq和单细胞RNA-seq综合分析构建高级别浆液性卵巢癌的单核细胞相关预后模型 | 首次结合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据识别单核细胞相关基因并构建HGSOC预后风险模型 | 研究依赖于公共数据库数据，缺乏独立验证队列 | 开发高级别浆液性卵巢癌的预后预测模型并探索单核细胞在肿瘤发展中的作用机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析 | Cox风险比例模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的HGSOC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8628 | 2025-10-07 |
Identification of central genes for endometriosis through integration of single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing analysis
2023-Dec-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000036707
PMID:38115253
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序分析识别子宫内膜异位症的核心基因并构建预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，采用细胞通讯分析识别关键细胞亚型，并通过LASSO模型筛选出4个核心基因 | NA | 识别子宫内膜异位症发展的关键基因并构建诊断预测模型 | 子宫内膜异位症相关基因和细胞亚型 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,生物信息学分析 | LASSO模型,WGCNA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8629 | 2025-10-07 |
Secretory GFP reconstitution labeling of neighboring cells interrogates cell-cell interactions in metastatic niches
2023-12-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43855-2
PMID:38052804
|
研究论文 | 开发了一种名为sGRAPHIC的分泌型GFP重组标记系统，用于研究转移灶中癌细胞与邻近组织驻留细胞的相互作用 | 改进了基于分裂GFP的基因编码系统，开发出能高效标记深部组织中与癌细胞相邻的组织驻留细胞的sGRAPHIC技术 | 研究基于小鼠肝脏转移模型，在人类临床应用的转化价值仍需进一步验证 | 阐明转移灶中细胞间相互作用的机制 | 转移灶中的癌细胞和邻近组织驻留细胞（特别是肝细胞） | 单细胞生物学 | 癌症转移 | 单细胞RNA测序，基因编码荧光标记系统 | NA | 单细胞转录组数据，荧光成像数据 | 小鼠肝脏转移模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8630 | 2025-10-07 |
Interaction dynamics between innate and adaptive immune cells responding to SARS-CoV-2 vaccination in non-human primates
2023-12-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43420-x
PMID:38042809
|
研究论文 | 通过单细胞测序研究猕猴接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后先天免疫与适应性免疫细胞的相互作用动态 | 首次整合分析mRNA-1273疫苗接种后先天免疫细胞与抗原特异性B/T细胞的单细胞转录组和适应性免疫受体 | 研究仅使用非人灵长类动物模型，样本量较小 | 揭示SARS-CoV-2疫苗接种后先天免疫与适应性免疫系统的双向信号传导机制 | 恒河猴的先天免疫细胞和抗原特异性外周B细胞、T细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据、适应性免疫受体数据 | 猕猴免疫细胞样本（包含疫苗接种前和两剂疫苗接种后时间点） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8631 | 2025-10-07 |
Young infants display heterogeneous serological responses and extensive but reversible transcriptional changes following initial immunizations
2023-12-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43758-2
PMID:38042900
|
研究论文 | 本研究分析了2月龄婴儿在初次免疫接种后的血清学反应和转录组变化 | 首次在婴儿疫苗接种研究中结合全血转录组和单细胞RNA测序，揭示了免疫反应的异质性和可逆的转录变化 | 样本量相对有限，仅观察了短期免疫反应 | 探究婴儿对常规疫苗的免疫反应特征 | 2月龄婴儿 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞RNA测序, 全血转录组分析 | NA | 转录组数据, 血清学数据 | 两个队列的2月龄婴儿 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 8632 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics deconvolution at single-cell resolution using Redeconve
2023-12-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43600-9
PMID:38040768
|
研究论文 | 提出Redeconve算法，实现空间转录组数据在单细胞分辨率下的解卷积分析 | 首次实现空间转录组数据在单细胞分辨率而非仅细胞类型分辨率下的解卷积 | NA | 开发高分辨率空间转录组数据解卷积方法 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | Redeconve算法 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8633 | 2025-10-07 |
Preventing recurrence in Sonic Hedgehog Subgroup Medulloblastoma using the OLIG2 inhibitor CT-179
2023-Jun-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2949436/v1
PMID:37333134
|
研究论文 | 本研究探讨了OLIG2抑制剂CT-179在预防Sonic Hedgehog亚型髓母细胞瘤复发中的作用 | 首次证明OLIG2抑制剂CT-179可通过破坏OLIG2二聚化、DNA结合和磷酸化过程，靶向治疗耐药性肿瘤干细胞群 | 研究主要基于临床前模型，尚未进行人体临床试验 | 开发预防髓母细胞瘤复发的新治疗策略 | Sonic Hedgehog亚型髓母细胞瘤 | 癌症研究 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 患者来源类器官、患者来源异种移植肿瘤和基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8634 | 2025-10-07 |
Systems biology of Haemonchus contortus - Advancing biotechnology for parasitic nematode control
2025 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108567
PMID:40127743
|
综述 | 本文综述了捻转血矛线虫分子生物学研究的关键进展及其在寄生虫控制中的生物技术应用 | 整合基因组学、转录组学和蛋白质组学技术解析关键分子通路，并应用机器学习和人工智能工具增强基因功能注释能力 | NA | 推动寄生虫线虫控制的生物技术发展 | 捻转血矛线虫及其与宿主的相互作用 | 生物信息学 | 寄生虫感染 | 基因组学, 转录组学, 蛋白质组学, 单细胞测序, 空间转录组学 | 机器学习算法, 人工智能驱动的蛋白质结构预测 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8635 | 2025-10-07 |
TREM2+ macrophages accumulate in childhood IgA nephropathy and soluble TREM2 represents a reliable non-invasive biomarker
2025-May-05, Experimental physiology
IF:2.6Q2
DOI:10.1113/EP092716
PMID:40321057
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现儿童IgA肾病中TREM2+巨噬细胞积累，并证实血浆可溶性TREM2可作为该病的非侵入性生物标志物 | 首次在儿童IgA肾病中发现TREM2+巨噬细胞亚群的积累，并验证血浆sTREM2水平与疾病严重程度的相关性 | 样本量有限（38例患者），需更大规模研究验证 | 探索儿童IgA肾病的发病机制并寻找非侵入性生物标志物 | 儿童IgA肾病患者 | 单细胞测序 | IgA肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 38例儿童IgA肾病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8636 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics of human skin reveals age-associated specificity of distinct cell populations
2025-May-05, Archives of dermatological research
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00403-025-04222-x
PMID:40323328
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示人类皮肤细胞在衰老过程中的功能特化和分子变化 | 首次在避光区域皮肤中系统揭示衰老相关的细胞特异性变化和细胞间通讯减少 | 样本量相对有限，仅关注健康供体的避光区域皮肤 | 阐明皮肤细胞在衰老过程中的分子和功能动态变化 | 人类皮肤细胞，重点关注真皮成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序，差异基因表达分析，GO富集分析，KEGG通路分析，伪时序分析，CellChat分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过5,000个细胞，包括成纤维细胞、角质形成细胞和免疫细胞等多种皮肤细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8637 | 2025-10-07 |
TREM2 Impedes Recovery After Spinal Cord Injury by Regulating Microglial Lysosomal Membrane Permeabilization-Mediated Autophagy
2025-May-04, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70047
PMID:40320759
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研究论文 | 本研究探讨TREM2通过调节小胶质细胞溶酶体膜通透性介导的自噬影响脊髓损伤恢复的机制 | 首次揭示TREM2通过Syk磷酸化-TFEB核转位途径调控溶酶体膜通透性和自噬的新机制，为基于基因治疗的临床转化策略提供新靶点 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证；机制研究尚未完全阐明所有信号通路细节 | 探究TREM2在脊髓损伤中的作用机制及其对小胶质细胞功能的调控 | 野生型和Trem2敲除小鼠的小胶质细胞及脊髓组织 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞测序，免疫荧光，3D步态分析，运动诱发电位，H&E染色，Masson染色 | NA | 单细胞测序数据，图像数据，行为学数据，电生理数据 | 野生型和Trem2敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8638 | 2025-10-07 |
Exome and Transcriptome Analysis Links Calcium Channel Pathway Aberrations to Botox Resistance in Hailey-Hailey Disease
2025-May-03, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf112
PMID:40317184
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨了Hailey-Hailey病患者对肉毒毒素A治疗反应异质性的机制 | 首次将钙通道通路异常与Hailey-Hailey病的肉毒毒素耐药性联系起来，并发现ORAI1/SOCE通路上调可能是治疗抵抗的生物标志物 | 样本量较小（仅12例患者），需要更大规模研究验证发现 | 识别Hailey-Hailey病患者对肉毒毒素A治疗反应异质性的生物标志物和机制 | 12名Hailey-Hailey病患者和HaCat细胞系 | 数字病理学 | Hailey-Hailey病 | 全外显子组测序, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 体外实验 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | 12名HHD患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 8639 | 2025-10-07 |
Transcriptomic and proteomic characterization of cell and protein biomarkers of checkpoint inhibitor-induced liver injury
2025-May-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04033-z
PMID:40317333
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法分析免疫检查点抑制剂引起的肝损伤患者的血液样本，揭示免疫和分子机制 | 首次结合转录组、T细胞受体谱和蛋白质组学全面分析ChILI的生物标志物，发现T细胞克隆性增加和PD-L1表达变化 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 研究免疫检查点抑制剂引起的肝损伤的细胞和蛋白质生物标志物 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者血液样本 | 生物信息学 | 药物性肝损伤 | 转录组测序, T细胞受体谱分析, 单细胞RNA测序, 质谱蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 细胞外囊泡分析 | NA | NA |
| 8640 | 2025-10-07 |
The immunosuppressive role of VSIG4 in colorectal cancer and its interaction with the tumor microenvironment
2025-May-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02411-8
PMID:40317372
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了VSIG4在结直肠癌免疫微环境中的免疫抑制功能 | 首次证实VSIG4、CYBBC3AR1和FCGR1A在结直肠癌免疫微环境中的关键作用，特别揭示了VSIG4通过调节CD8+T细胞免疫耗竭影响肿瘤微环境 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 探究结直肠癌肿瘤微环境中关键基因的免疫调节功能 | 结直肠癌患者和相关的免疫细胞（特别是巨噬细胞和CD8+T细胞） | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, PCR, 生物信息学分析 | LASSO, 随机森林, 非负矩阵分解(NMF), Monocle2 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA-COAD数据集和GEO数据库中的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |