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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8601 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing and immune microenvironment analysis reveal PLOD2-driven malignant transformation in cervical cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522655
PMID:39840054
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫微环境分析揭示PLOD2驱动宫颈癌恶性转化的机制 | 识别了宫颈癌中8种细胞类型和5个恶性上皮细胞亚群,建立了NNMT CAEPCs风险评分模型,并验证了PLOD2基因的预后价值 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索宫颈癌肿瘤微环境特征并识别潜在治疗靶点 | 宫颈癌恶性上皮细胞及其微环境 | 数字病理 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 生物信息学分析 | Cox回归模型, 风险评分模型 | 基因表达数据 | 来自UCSC和ArrayExpress数据库的测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
8602 | 2025-10-07 |
Targeting immune cellular populations and transcription factors: unraveling the therapeutic potential of JQF for NAFLD
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1445924
PMID:39840059
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了降糖清热方(JQF)通过调节免疫细胞亚群和转录因子治疗非酒精性脂肪肝病(NAFLD)的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统解析JQF治疗NAFLD的免疫调节机制,识别出关键免疫细胞亚群和调控转录因子 | 研究基于小鼠模型,需要进一步临床试验验证 | 探究降糖清热方治疗非酒精性脂肪肝病的作用机制 | 高脂饮食诱导的NAFLD小鼠模型 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, SCENIC分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 高脂饮食诱导的NAFLD小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
8603 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals the heterogeneity and function of mast cells in human ccRCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494025
PMID:39840068
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示人类透明细胞肾癌中肥大细胞的异质性和功能 | 首次在ccRCC中系统研究肥大细胞的异质性,发现VEGFA+肥大细胞亚群与IL1B+巨噬细胞共定位的新现象 | 样本量较小(仅4例患者),需要更大规模研究验证 | 探究肥大细胞在透明细胞肾癌中的异质性和功能作用 | 透明细胞肾癌患者组织样本中的肥大细胞 | 单细胞转录组学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 组织图像数据 | 4例ccRCC患者样本,整合TCGA数据库数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量组织测序 | NA | NA |
8604 | 2025-10-07 |
Comprehensive bioinformatics analysis identifies metabolic and immune-related diagnostic biomarkers shared between diabetes and COPD using multi-omics and machine learning
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1475958
PMID:39845878
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研究论文 | 通过多组学和机器学习方法识别糖尿病与COPD共享的代谢和免疫相关诊断生物标志物 | 首次通过跨疾病交叉分析识别糖尿病与COPD共享的分子机制和诊断标志物 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证分子机制 | 探索糖尿病与慢性阻塞性肺疾病之间的共同分子机制 | 糖尿病和COPD患者的多中心队列数据 | 生物信息学 | 糖尿病,慢性阻塞性肺疾病 | 多组学分析,机器学习,单细胞测序 | WGCNA,多种机器学习算法 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 多中心患者队列 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
8605 | 2025-10-07 |
Deciphering hub genes and immune landscapes related to neutrophil extracellular traps in rheumatoid arthritis: insights from integrated bioinformatics analyses and experiments
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1521634
PMID:39845946
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析和实验验证,揭示了类风湿关节炎中中性粒细胞胞外诱捕网相关的关键基因和免疫景观 | 首次阐明RA滑膜微环境中中性粒细胞的异质性及其与成纤维细胞的通讯机制,识别并验证了4个NET相关关键基因 | 研究样本量有限,需要更大规模的临床验证 | 探索中性粒细胞胞外诱捕网在类风湿关节炎发病机制中的分子机制和关键基因 | 类风湿关节炎患者滑膜组织、佐剂诱导关节炎大鼠模型、临床队列样本 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, 免疫组织化学, 实时定量PCR, 机器学习 | 列线图诊断模型, 多种机器学习技术 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 微阵列数据 | 多个GEO数据集, 临床队列, 动物模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
8606 | 2025-10-07 |
Impact of glioma metabolism-related gene ALPK1 on tumor immune heterogeneity and the regulation of the TGF-β pathway
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1512491
PMID:39845963
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研究论文 | 本研究通过整合多源胶质瘤数据集,开发了一种创新的预后风险评估框架,并探讨了代谢相关基因ALPK1对肿瘤免疫异质性和TGF-β通路的调控作用 | 采用101种机器学习技术组合确定最优一致性指数构建预测模型,首次系统阐明ALPK1在胶质瘤免疫调控中的作用 | 研究基于回顾性数据集,需要进一步实验验证 | 探索胶质瘤分子分型、识别新的预后生物标志物并理解其免疫微环境特征 | 胶质瘤患者 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 非负矩阵分解(NMF), 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 单细胞测序, 机器学习 | LASSO+GBM | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 多源胶质瘤数据集 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
8607 | 2025-10-07 |
Exploring the shared mechanism of fatigue between systemic lupus erythematosus and myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome: monocytic dysregulation and drug repurposing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1440922
PMID:39845969
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研究论文 | 本研究探索系统性红斑狼疮和肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征之间疲劳症状的共同机制,聚焦于单核细胞失调和药物重定位 | 首次通过生物信息学分析和实验验证揭示SLE和ME/CFS疲劳症状的共享免疫机制,识别关键靶点并预测潜在治疗药物 | 研究主要基于体外细胞模型,需要进一步体内实验验证;药物预测需要临床前和临床试验确认 | 探索SLE和ME/CFS疲劳症状的共同机制并预测潜在治疗药物 | 系统性红斑狼疮和肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征患者相关基因和单核细胞 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 生物信息学分析,RT-qPCR,单细胞测序,分子对接 | PPI网络,ROC曲线,TF-mRNA-miNA共调控网络 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 58个重叠基因,THP-1细胞炎症模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
8608 | 2025-10-07 |
Exploring the role of metabolic pathways in TNBC immunotherapy: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1528248
PMID:39850483
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综述 | 探讨代谢通路在三阴性乳腺癌免疫治疗中的作用,重点关注单细胞和空间转录组学技术的应用 | 整合单细胞和空间转录组学技术揭示TNBC肿瘤异质性和免疫微环境中代谢重编程与免疫功能的相互作用机制 | NA | 阐明代谢通路如何调节三阴性乳腺癌免疫微环境并影响免疫检查点抑制剂疗效 | 三阴性乳腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞群体 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
8609 | 2025-10-07 |
Integrated single-cell RNA sequencing reveals the tumor heterogeneity and microenvironment landscape during liver metastasis in adenocarcinoma of esophagogastric junction
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1484234
PMID:39850884
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示食管胃结合部腺癌肝转移过程中的肿瘤异质性和微环境景观 | 首次在单细胞水平揭示AEGJ肝转移中成纤维细胞和周细胞的特定作用,并发现SFRP2基因在周细胞中的高表达及其通过Wnt通路影响血管稳定性和血管生成的新机制 | 样本量有限,需要更大规模的研究验证发现 | 探索食管胃结合部腺癌肝转移的细胞和分子机制 | 食管胃结合部腺癌肝转移患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 食管胃结合部腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8610 | 2025-10-07 |
Combining single-cell analysis and molecular docking techniques to construct a prognostic model for colon adenocarcinoma and uncovering inhibin subunit βb as a novel therapeutic target
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1524560
PMID:39850875
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞分析和分子对接技术构建结肠腺癌预后模型,并发现抑制素亚基βb作为新型治疗靶点 | 首次将失巢凋亡相关基因与结肠腺癌预后关联,通过单细胞RNA测序分析肿瘤微环境,并验证INHBB作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证和临床样本确认 | 构建结肠腺癌预后模型并探索新的治疗靶点 | 结肠腺癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 基因敲除, Cox比例风险模型, Lasso回归 | 预后特征模型 | 转录组数据, 临床信息 | TCGA和GEO数据库中的结肠腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8611 | 2025-10-07 |
Macrophage heterogeneity and oncogenic mechanisms in lung adenocarcinoma: insights from scRNA-seq analysis and predictive modeling
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1491872
PMID:39850883
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肺腺癌中巨噬细胞异质性并建立基于巨噬细胞相关基因的预后预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序揭示肺腺癌巨噬细胞亚群复杂性,并构建基于巨噬细胞标志基因的预后模型 | NA | 探索肺腺癌中巨噬细胞特征及其对预后的影响 | 肺腺癌患者和巨噬细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,RT-PCR,细胞实验 | Lasso回归,多元Cox回归 | 单细胞RNA测序数据,临床数据 | TCGA数据集和多个外部验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8612 | 2025-10-07 |
The emergence of DNAM-1 as the facilitator of NK cell-mediated killing in ovarian cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1477781
PMID:39835114
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序分析卵巢癌患者NK细胞的表型和功能特征 | 首次系统揭示卵巢癌中DNAM-1作为NK细胞杀伤功能关键调节因子的作用机制 | 样本量有限(80例患者),主要基于观察性研究 | 探索卵巢癌中NK细胞的表型特征及其与临床预后的关系 | 卵巢癌患者的血液、原发肿瘤和转移组织中的NK细胞 | 免疫肿瘤学 | 卵巢癌 | 流式细胞术, scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 80名卵巢癌女性患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8613 | 2025-10-07 |
Integrating single cell analysis and machine learning methods reveals stem cell-related gene S100A10 as an important target for prediction of liver cancer diagnosis and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1534723
PMID:39840058
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研究论文 | 本研究结合单细胞分析和机器学习方法,发现干细胞相关基因S100A10可作为肝癌诊断和免疫治疗的重要预测靶点 | 首次整合单细胞RNA测序与机器学习算法识别肝癌干细胞相关关键基因,并验证S100A10的诊断和预后价值 | NA | 提高肝细胞癌诊断精度并推进有效免疫治疗方法 | 肝细胞癌干细胞相关基因 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | XGBoost | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8614 | 2025-05-03 |
Charting the Single-Cell and Spatial Landscape of IDH-Wildtype Glioblastoma with GBmap
2025-May-02, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf113
PMID:40312969
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research paper | 该研究通过整合单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据,构建了GBmap,一个全面的单细胞和空间图谱,以揭示IDH野生型胶质母细胞瘤的细胞异质性和空间结构 | 构建了GBmap,一个统一的单细胞图谱,并开发了肿瘤结构评分(TSS)来量化肿瘤组织,揭示了缺氧依赖性肿瘤微环境与不良预后的关联 | 研究依赖于已有数据集,可能受限于数据质量和样本多样性 | 揭示IDH野生型胶质母细胞瘤的细胞异质性、空间结构及其临床相关性 | IDH野生型胶质母细胞瘤的肿瘤微环境和空间组织 | digital pathology | glioblastoma | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 240名患者的110万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
8615 | 2025-10-07 |
Dissecting the Single-Cell Diversity and Heterogeneity Underlying Cervical Precancerous Lesions and Cancer Tissues
2025-May, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-024-01695-5
PMID:39354287
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研究论文 | 通过整合单细胞数据研究宫颈癌前病变到宫颈鳞癌的细胞多样性和异质性 | 首次系统揭示宫颈癌进展过程中七个细胞类型的组成变化,鉴定出95个关键转录因子和上皮细胞亚群标志物KRT8/KRT15 | 研究样本量有限,需要更大规模验证;部分机制仍需进一步功能实验证实 | 解析宫颈癌前病变到宫颈鳞癌的细胞多样性和异质性机制 | 宫颈正常组织、癌旁组织、癌前病变组织和宫颈肿瘤组织 | 单细胞组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, RT-qPCR, 免疫组化 | 逻辑回归模型 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 基因表达数据 | 四个单细胞数据集(包含正常组织、癌旁组织、癌前病变和宫颈肿瘤) | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | NA |
8616 | 2025-10-07 |
Chronic Rejection After Kidney Transplantation
2025-04-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000005187
PMID:39192468
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综述 | 探讨肾脏移植后慢性排斥反应的免疫机制及新兴治疗策略 | 提出CD38单抗felzartamab通过靶向NK细胞效应功能治疗抗体介导排斥反应的新策略 | 现有临床试验结果多为阴性,felzartamab尚处于探索性二期试验阶段 | 解析肾脏移植慢性排斥的免疫机制并评估新型治疗方案的潜力 | 肾脏移植受者的慢性排斥反应过程 | 移植免疫学 | 肾脏移植排斥 | 免疫组织化学、转录组学、功能遗传学 | NA | 分子表达数据、形态学数据 | NA | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
8617 | 2025-10-07 |
Protocol for mitochondrial variant enrichment from single-cell RNA sequencing using MAESTER
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103564
PMID:39817913
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研究论文 | 介绍一种从单细胞RNA测序数据中富集线粒体DNA变异以同时研究细胞状态和克隆结构的实验方案 | 开发了从3'端条形码全长cDNA中富集mtDNA变异的protocol,可同时获取细胞状态和克隆信息 | NA | 建立同时分析细胞状态和组织克隆结构的实验方法 | 人类原代组织 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序, mtDNA变异富集, 双端测序 | maegatk | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 3'端条形码全长cDNA |
8618 | 2025-10-07 |
The Microscope and Beyond: Current Trends in the Characterization of Kidney Allograft Rejection From Tissue Samples
2025-03-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000005153
PMID:39436268
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综述 | 本文综述了当前用于增强肾脏移植排斥反应特征描述的新兴技术工具 | 整合了数字病理学、深度学习、多重免疫组化、转录组学和空间转录组学等创新工具,有望解决Banff分类系统的局限性 | Banff分类系统主要依赖活检组织,缺乏可重复性和精细度,组织病理学损伤和批量组织转录组学分析在准确推断排斥反应发病机制方面存在疑问 | 增强从组织样本中表征肾脏移植排斥反应的能力 | 肾脏移植排斥反应的组织样本 | 数字病理学 | 肾脏移植排斥反应 | 深度学习, 多重免疫组化, 转录组学, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | 深度学习 | 组织切片图像, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
8619 | 2025-10-07 |
Biological and clinical significance of tumour-infiltrating lymphocytes in the era of immunotherapy: a multidimensional approach
2025-Mar, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-024-00984-x
PMID:39820025
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综述 | 本文探讨肿瘤浸润淋巴细胞在免疫治疗时代的生物学和临床意义,并提出系统性研究框架 | 提出多维度的TIL研究概念框架,整合单细胞技术、空间平台和计算模型的最新进展 | 缺乏标准化的TIL量化策略,对不同TIL亚群功能特征和空间分布的研究不足 | 系统评估肿瘤浸润淋巴细胞的生物学特性和作为免疫检查点抑制剂生物标志物的潜力 | 肿瘤浸润淋巴细胞及其亚群 | 肿瘤免疫学 | 实体肿瘤 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、空间组学 | 计算模型 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
8620 | 2025-10-07 |
Intratumoral Collagen Deposition Supports Angiogenesis Suggesting Anti-angiogenic Therapy in Armored and Cold Tumors
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409147
PMID:39823457
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研究论文 | 本研究系统分析了胶原沉积与肿瘤血管生成的关系,发现装甲冷肿瘤具有最高血管生成活性并验证了抗血管生成治疗的疗效 | 首次系统揭示胶原沉积通过SOX18上调驱动肿瘤血管生成的机制,并提出装甲冷肿瘤作为抗血管生成治疗的新型生物标志物 | 研究主要聚焦肺腺癌,在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探究胶原沉积对肿瘤血管生成的影响及治疗意义 | 实体肿瘤(重点关注肺腺癌)、成纤维细胞、内皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,体外实验 | NA | 基因表达数据,空间分布数据 | 多个晚期肺腺癌队列 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |