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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8581 - 8600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8581 | 2025-10-07 |
Data-driven model discovery and model selection for noisy biological systems
2025-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012762
PMID:39836686
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研究论文 | 提出一种数据驱动的混合动力系统框架，用于从噪声生物数据中发现和选择微分方程模型 | 使用混合动力系统和神经网络相结合的方法，能够在高噪声环境下有效发现模型并填补部分已知的系统知识 | 方法主要针对部分已知机制的系统，在完全未知系统的情况下可能受限 | 开发能够处理噪声生物数据的模型发现和选择方法 | 生物系统的动态建模 | 机器学习 | NA | 稀疏识别非线性动力学(SINDy), 神经网络, 稀疏回归 | 混合动力系统, 神经网络 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8582 | 2025-10-07 |
Trajectory inference from single-cell genomics data with a process time model
2025-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012752
PMID:39836699
|
研究论文 | 提出一种基于过程时间模型从单细胞基因组学数据推断轨迹的新方法 | 用具有生物物理意义的过程时间替代传统伪时间概念，提供可识别且有物理意义的轨迹推断 | 过程时间推断具有挑战性，依赖数据集质量和仔细的模型评估 | 从单细胞转录组数据中推断细胞轨迹和动态信息 | 单细胞转录组数据中的异质细胞群体 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞转录组测序 | 过程时间模型(Chronocell) | 基因表达数据 | 多种数据集，从类聚类到连续分布 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8583 | 2025-10-07 |
Exploring Cervical Adenocarcinoma: Epidemiological Insights, Diagnostic and Therapeutic Challenges, and Pathogenetic Mechanisms
2025-Jan, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70620
PMID:39840708
|
综述 | 本文整合了宫颈腺癌的流行病学特征、诊疗挑战及最新研究进展，重点比较了其与鳞状细胞癌在肿瘤微环境特征上的异质性 | 系统比较宫颈腺癌与鳞状细胞癌在肿瘤微环境特征上的显著异质性，并总结了常用临床前模型的优缺点 | 基于文献综述的研究方法，缺乏原始实验数据支持 | 探讨宫颈腺癌的流行病学特征、诊疗挑战及发病机制 | 宫颈腺癌及其与鳞状细胞癌的比较 | 妇科肿瘤学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8584 | 2025-10-07 |
Predicting Outcomes in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Using scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq: A Model Development and Validation Study
2025-Jan, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70617
PMID:39840762
|
研究论文 | 基于葡萄糖代谢相关基因开发食管鳞状细胞癌预后预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序筛选出4个葡萄糖代谢关键基因构建预后模型 | 样本量相对有限，需要进一步多中心验证 | 开发ESCC预后预测模型并验证其临床价值 | 食管鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,免疫组化 | 风险预后模型 | 基因表达数据 | GEO数据库8例，TCGA数据库99例，MSKCC中心140例 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 8585 | 2025-10-07 |
Integrated Analysis of Bulk RNA Sequencing, eQTL, GWAS, and Single-Cell RNA Sequencing Reveals Key Genes in Hepatocellular Carcinoma
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70359
PMID:39853609
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研究论文 | 通过整合分析多种组学数据鉴定肝细胞癌中的关键基因SERPING1和STEAP3 | 首次结合bulk RNA测序、eQTL、GWAS和单细胞RNA测序进行综合分析，发现SERPING1和STEAP3基因在肝细胞癌发生发展中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 发现肝细胞癌新的分子靶点用于检测和治疗 | 肝细胞癌(HCC) | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序,eQTL分析,GWAS,单细胞RNA测序,Western blotting,免疫组化,定量PCR | 孟德尔随机化分析,CIBERSORT分析,GSEA分析 | 基因表达数据,基因组数据,单细胞数据 | 三个公共HCC数据集(来自TCGA和GEO) | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8586 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Biomechanical Loading-Induced Imbalance in Bone and Fat, Leading to Ossification in Lumbar Intervertebral Disc Nucleus Pulposus Degeneration
2025-Jan, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31506
PMID:39854079
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示生物力学负荷通过骨-脂肪失衡导致腰椎间盘髓核退变中骨化的机制 | 首次识别出受生物力学负荷影响的CITED4+METRN+髓核软骨细胞亚群，并揭示MIF调控的骨-脂肪平衡在骨化过程中的关键作用 | 样本量较小（5例新鲜组织），部分验证采用回顾性石蜡样本 | 探究生物力学负荷对椎间盘退变中髓核骨化的细胞机制 | 腰椎L3-S1节段髓核组织，包括健康与退变样本 | 单细胞组学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序，组织病理学评估，免疫组织化学，免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 5例新鲜髓核组织，另加回顾性石蜡样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8587 | 2025-10-07 |
Exploring a pico-well based scRNA-seq method (HIVE) for simplified processing of equine bronchoalveolar lavage cells
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0317343
PMID:39854349
|
研究论文 | 评估HIVE™单细胞RNA测序方法在马哮喘支气管肺泡灌洗细胞处理中的应用效果 | 首次将pico-well基础的HIVE™ scRNA-seq技术应用于马支气管肺泡灌洗细胞分析，并发现该方法能检测到先前研究中未表征的嗜酸性粒细胞 | T细胞和巨噬细胞比例与细胞学预期存在偏差，T辅助细胞亚群定义不够清晰，粒细胞和肥大细胞检测数量低于预期 | 评估HIVE单细胞RNA测序方法在马哮喘研究中的应用可行性 | 马哮喘患者的支气管肺泡灌洗细胞 | 单细胞测序 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 马支气管肺泡灌洗细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | HIVE™ | pico-well基础的scRNA-seq技术 |
| 8588 | 2025-10-07 |
Preliminary screening of new biomarkers for sepsis using bioinformatics and experimental validation
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0317608
PMID:39854580
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证筛选脓毒症的新型生物标志物 | 首次通过整合WGCNA、荟萃分析和单细胞测序技术系统筛选出S100A11、QPCT和IFITM2作为脓毒症潜在生物标志物 | 研究样本来源为公共数据库，需要进一步扩大临床样本验证 | 筛选脓毒症的新型生物标志物 | 脓毒症相关RNA和基因 | 生物信息学 | 脓毒症 | 生物信息学分析，qPCR，单细胞测序，WGCNA，GSEA | NA | 基因表达数据，RNA测序数据 | 来自中国国家基因库和多个公共数据库的脓毒症数据 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8589 | 2025-10-07 |
Comprehensive transcriptomic analysis integrating bulk and single-cell RNA-seq with machine learning to identify and validate mitochondrial unfolded protein response biomarkers in patients with ischemic stroke
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1582252
PMID:40313716
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研究论文 | 通过整合bulk和单细胞RNA测序与机器学习方法，识别并验证缺血性卒中患者中线粒体未折叠蛋白反应的生物标志物 | 首次将bulk RNA-seq与单细胞RNA-seq相结合，利用机器学习识别UPRmt相关生物标志物，并通过虚拟敲除实验验证CLEC4D在炎症调节中的功能作用 | 研究样本量有限，主要基于公共数据库数据，需要更大规模临床验证 | 探索线粒体未折叠蛋白反应在缺血性卒中中的机制并识别相关生物标志物 | 缺血性卒中患者和大脑中动脉闭塞模型 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习, RT-qPCR, 免疫浸润分析 | 机器学习 | 基因表达数据 | GSE58294数据集，人类外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8590 | 2025-10-07 |
CITED2 Binding to EP300 Regulates Human Spermatogonial Stem Cell Proliferation and Survival Through HSPA6
2025, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/sci/2362489
PMID:40313859
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研究论文 | 本研究通过分析人类睾丸单细胞测序数据，揭示了CITED2通过结合EP300调控HSPA6基因表达，从而影响人类精原干细胞增殖与存活的新机制 | 首次发现CITED2在人类精原干细胞中的主导表达，并阐明其通过EP300-HSPA6轴调控干细胞增殖与凋亡的新信号通路 | 研究主要基于细胞系实验，缺乏体内验证；样本来源和数量未明确说明 | 探索人类精原干细胞自我更新与分化的调控机制 | 人类精原干细胞 | 单细胞生物学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序，RNA测序，免疫共沉淀 | NA | 单细胞测序数据，RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8591 | 2025-10-07 |
The malignant signature gene of cancer-associated fibroblasts serves as a potential prognostic biomarker for colon adenocarcinoma patients
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1589678
PMID:40313961
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别癌症相关成纤维细胞的恶性特征基因，并验证FNDC5作为结肠腺癌的潜在预后生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序与CNV推断、伪时间轨迹分析系统鉴定CAFs恶性相关基因，并发现FNDC5的独立预后价值 | 研究样本量相对有限（8,911个细胞），且主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 识别与癌症相关成纤维细胞恶性相关的基因标志物，建立结肠腺癌预后模型 | 结肠腺癌患者组织样本中的细胞，特别是癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序，CNV分析，伪时间轨迹分析，LASSO回归，Cox回归，细胞功能实验 | Cox回归模型，LASSO回归，诺莫图 | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 8,911个细胞（来自正常和肿瘤样本） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8592 | 2025-10-07 |
BTG2-deficient mast cells remodel the tumor and tumor-draining lymph node microenvironment leading to chemotherapy resistance in breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1562700
PMID:40313959
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现BTG2缺陷的肥大细胞通过调节肿瘤微环境和引流淋巴结导致乳腺癌化疗耐药 | 首次揭示BTG2缺陷的肥大细胞通过诱导Treg细胞产生和促进成纤维细胞分化导致化疗耐药的新机制 | 样本量较小（仅4例患者），需要在更大队列中验证 | 探究乳腺癌新辅助化疗耐药的免疫机制 | 乳腺癌患者肿瘤组织和转移性引流淋巴结中的细胞 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4例乳腺癌患者（化疗敏感与耐药各半） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8593 | 2025-10-07 |
Revisiting the role of cancer-associated fibroblasts in tumor microenvironment
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1582532
PMID:40313969
|
综述 | 深入分析肿瘤相关成纤维细胞在肿瘤微环境中的作用及当前研究面临的挑战 | 系统性地提出了CAF研究中的关键障碍并指明了未来研究方向 | CAF亚群命名缺乏标准化、特异性生物标志物缺失、体外培养难以维持原代特性、检测方法缺乏标准化 | 分析CAF研究挑战，提出未来研究方向，改进CAF靶向治疗策略 | 肿瘤相关成纤维细胞(CAFs) | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞转录组测序、抗体检测、mRNA探针 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8594 | 2025-10-07 |
Perivascular RELMα-positive synovial macrophages recruit monocytes at the onset of inflammatory arthritis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1567661
PMID:40313955
|
研究论文 | 本研究揭示了RELMα阳性滑膜巨噬细胞在炎症性关节炎起始阶段通过分泌CCL2招募单核细胞的机制 | 首次定位并证实RELMα阳性血管周围巨噬细胞在关节炎起始阶段通过CCL2介导单核细胞向滑膜间质招募的作用 | 主要使用小鼠模型研究，人类样本验证尚不充分 | 探究炎症性关节炎起始阶段滑膜巨噬细胞在单核细胞招募中的作用机制 | 滑膜巨噬细胞、单核细胞、中性粒细胞等髓系细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 报告基因小鼠模型 | 抗原诱导关节炎小鼠模型 | 基因表达数据、细胞定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8595 | 2025-10-07 |
TCR transgenic clone selection guided by immune receptor analysis and single-cell RNA expression of polyclonal responders
2024-Dec-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98344
PMID:39854619
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞测序和TCR谱分析快速筛选抗原特异性TCR序列并生成TCR转基因小鼠的新方法 | 利用单细胞测序和TCR谱分析技术替代传统的杂交瘤筛选方法，快速选择最佳TCR克隆 | NA | 开发快速生成抗原特异性TCR转基因小鼠的方法 | SARS-CoV-2刺突蛋白特异性CD8 T细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, TCR谱分析, PCR克隆 | NA | 单细胞RNA表达数据, TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8596 | 2025-10-07 |
NK cell exhaustion in Wilson's disease revealed by single-cell RNA sequencing predicts the prognosis of cholecystitis
2024-Dec-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98867
PMID:39854622
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示威尔逊病中NK细胞耗竭及其与胆囊炎预后的关联 | 首次在威尔逊病模型中揭示代谢异常导致NK细胞耗竭，并证实其与胆囊炎预后的直接关联 | 回顾性临床研究，样本来源单一，机制验证不够充分 | 探究肝脏疾病代谢异常影响胆囊炎风险的免疫机制 | 威尔逊病患者及胆囊炎患者 | 单细胞组学 | 肝胆疾病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据，临床数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8597 | 2025-10-07 |
scMMAE: masked cross-attention network for single-cell multimodal omics fusion to enhance unimodal omics
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf010
PMID:39851073
|
研究论文 | 提出一种基于掩码自编码器和交叉注意力机制的单细胞多组学融合框架scMMAE，用于增强单组学分析 | 首次将掩码自编码器与交叉注意力机制结合用于单细胞多组学融合，同时捕获共享特征和独特信息，并能将知识迁移到单组学分析 | NA | 开发单细胞多组学融合方法以增强单组学数据分析 | 单细胞转录组学和蛋白质组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 掩码自编码器, 交叉注意力网络 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 8598 | 2025-10-07 |
Complex hierarchical structures analysis in single-cell data with Poincaré deep manifold transformation
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae687
PMID:39851075
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研究论文 | 提出一种名为PoincaréDMT的新方法，用于分析单细胞RNA测序数据中的复杂层次结构 | 通过双曲庞加莱圆盘映射保留全局结构，结合数据增强实现局部结构校正，并整合批次图减轻批次效应 | NA | 解决单细胞数据分析中结构保留不完整和嵌入高失真问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度流形变换 | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8599 | 2025-10-07 |
Immunotherapy drives mesenchymal tumor cell state shift and TME immune response in glioblastoma patients
2024-08-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae085
PMID:38695342
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了免疫检查点抑制剂治疗胶质母细胞瘤时肿瘤细胞向间充质状态转变的耐药机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示了免疫治疗驱动的胶质母细胞瘤肿瘤细胞向间充质干细胞样状态转变的耐药机制 | 样本量相对有限，需要在更大队列中验证研究结果 | 探索胶质母细胞瘤对免疫检查点抑制剂治疗的耐药机制 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤样本 | 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 76个肿瘤样本（主要研究）+ 298个外部验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8600 | 2025-10-07 |
Integrated cancer cell-specific single-cell RNA-seq datasets of immune checkpoint blockade-treated patients
2024-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.17.576110
PMID:38328153
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研究论文 | 整合了免疫检查点阻断治疗患者的癌细胞特异性单细胞RNA-seq数据集 | 整合了来自9种癌症类型、174名患者的8个scRNA-seq数据集，创建了专门用于研究癌细胞对ICB治疗反应的独特资源 | 样本量相对有限，数据来源于已有的研究数据集 | 研究不同癌症类型中癌细胞对免疫检查点阻断治疗的反应机制 | 癌细胞 | 单细胞组学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 174名患者，90,270个癌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |