单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 8581 - 8600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8581 | 2024-09-23 |
The end of the beginning: application of single-cell sequencing to chronic lymphocytic leukemia
2023-01-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2021014669
PMID:36095842
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在慢性淋巴细胞白血病（CLL）中的应用及其对疾病自然进展、新型疗法影响和与非恶性免疫细胞相互作用的新理解 | 单细胞分析技术的发展使得能够处理和分析数十万个体细胞，并实现多组学数据的整合，从而揭示更丰富的分子疾病亚型和细胞电路模式 | NA | 探讨单细胞测序技术在慢性淋巴细胞白血病中的应用及其对疾病研究和个性化治疗方案设计的潜在影响 | 慢性淋巴细胞白血病及其相关的免疫细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因组和转录组数据 | 数十万个体细胞 |
| 8582 | 2024-09-23 |
scTOP: physics-inspired order parameters for cellular identification and visualization
2023-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.25.525581
PMID:36747864
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研究论文 | 本文介绍了一种基于统计物理学的单细胞类型序参量（scTOP）方法，用于细胞识别和可视化 | scTOP方法无需特征选择、统计拟合或降维处理，能够快速准确地分类单细胞并生成可解释的发育轨迹可视化 | NA | 开发新的理论和计算框架，以理解细胞命运决定、从表达数据中准确分类细胞命运，并整合细胞图谱的知识 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类和发育轨迹可视化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多种人类和小鼠数据集 |
| 8583 | 2024-09-23 |
Multimodal characterization of antigen-specific CD8 + T cells across SARS-CoV-2 vaccination and infection
2023-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.24.525203
PMID:36747786
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研究论文 | 本文利用多模态测序技术对BNT162b2疫苗接种前后循环人白细胞进行纵向分析，揭示了SARS-CoV-2抗原特异性CD8+ T细胞的亚群特征 | 本文首次通过多模态整合工具定义了CD8+ T细胞的转录组、可及染色质景观和免疫表型，并识别了各模态中的独特生物标志物 | NA | 研究SARS-CoV-2疫苗接种和感染后抗原特异性CD8+ T细胞的特征 | SARS-CoV-2抗原特异性CD8+ T细胞 | NA | COVID-19 | 多模态测序技术 | NA | RNA-seq | NA |
| 8584 | 2024-09-23 |
YAP and TAZ couple osteoblast precursor mobilization to angiogenesis and mechanoregulated bone development
2023-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.20.524918
PMID:36711590
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研究论文 | 本文研究了YAP和TAZ信号在胚胎发育过程中如何将成骨细胞前体与血管生成和机械调节的骨发育联系起来 | 首次揭示了YAP/TAZ信号在胚胎发育过程中调控成骨细胞前体与血管生成的关系，并发现其在机械传导和骨形成中的作用 | NA | 探讨YAP和TAZ在胚胎骨发育中的作用及其与血管生成的关系 | 成骨细胞前体、血管生成、机械刺激 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8585 | 2024-09-23 |
Mapping transcriptional heterogeneity and metabolic networks in fatty livers at single-cell resolution
2023-Jan-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105802
PMID:36636354
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）小鼠肝脏中肝细胞和非实质细胞的转录异质性和代谢网络 | 揭示了先前未被识别的肝细胞簇，这些细胞簇具有高或低表达特征，并发现经典脂质合成驱动因子并不预测肝脂质积累，表明存在其他脂质代谢驱动因素 | NA | 研究非酒精性脂肪肝病的分子机制和代谢网络 | 非酒精性脂肪肝病小鼠的肝细胞和非实质细胞 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NAFLD小鼠和人类肝脏样本 |
| 8586 | 2024-09-23 |
Spatial transcriptomics reveals a conserved segment polarity program that governs muscle patterning in Nematostella vectensis
2023-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.09.523347
PMID:36711919
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研究论文 | 本文通过空间转录组学揭示了Nematostella vectensis中肌肉模式化的保守段极性程序 | 首次展示了在pre-bilaterian海葵发育幼虫中段极性路径的分子基础 | NA | 揭示早期动物进化中段极性路径的起源和机制 | Nematostella vectensis的发育幼虫 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8587 | 2024-09-23 |
Activation of Hedgehog signaling by the oncogenic RELA fusion reveals a primary cilia-dependent vulnerability in supratentorial ependymoma
2023-01-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac147
PMID:35640920
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研究论文 | 本研究探讨了Hedgehog信号通路在RELA融合阳性室管膜瘤中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示了Hedgehog信号通路在RELA融合阳性室管膜瘤中的关键作用，并提出了通过恢复初级纤毛功能来克服肿瘤耐药性的新策略 | 研究主要集中在体外和异种移植模型上，尚未在临床试验中验证其有效性 | 评估RELA融合依赖的信号模块，特别是Hedgehog通路在RELA融合阳性室管膜瘤中的作用 | RELA融合阳性的室管膜瘤 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 基因表达分析、微阵列、RNA测序、qRT-PCR、单细胞RNA测序、免疫印迹、免疫荧光、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 患者队列中的室管膜瘤样本 |
| 8588 | 2024-09-23 |
Integrating Spatial Transcriptomics and Single-nucleus RNA Sequencing Reveals the Potential Therapeutic Strategies for Uterine Leiomyoma
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.83510
PMID:37215998
|
研究论文 | 本研究首次通过整合空间转录组学和单核RNA测序，揭示了子宫平滑肌瘤及其周围假包膜的细胞结构和基因表达特征，并提出了潜在的治疗策略 | 首次整合空间转录组学和单核RNA测序技术，绘制了子宫平滑肌瘤及其周围假包膜的细胞结构和基因表达图谱 | NA | 揭示子宫平滑肌瘤及其周围假包膜的细胞结构和基因表达特征，并探索潜在的治疗策略 | 子宫平滑肌瘤及其周围假包膜的细胞结构和基因表达 | 数字病理学 | 妇科肿瘤 | 空间转录组学和单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8589 | 2024-09-23 |
Microenvironmental regulation of T-cells in pulmonary hypertension
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1223122
PMID:37497214
|
研究论文 | 研究肺动脉高压中肺纤维细胞对T细胞的微环境调节作用 | 首次揭示了肺动脉高压中肺纤维细胞通过分泌细胞因子和趋化因子，激活和极化T细胞，从而促进局部炎症和血管重塑 | 研究主要基于牛和人的样本，可能不完全适用于人类肺动脉高压的病理机制 | 探讨肺动脉高压中肺纤维细胞对T细胞的微环境调节机制 | 肺动脉高压中的肺纤维细胞和T细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、mRNA表达分析、呼吸测定分析 | NA | RNA | 牛和人的肺动脉样本，以及来自肺动脉高压和对照组患者的T细胞 |
| 8590 | 2024-09-23 |
Revisiting transplant immunology through the lens of single-cell technologies
2023-01, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-022-00958-0
PMID:35980400
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综述 | 本文通过单细胞技术重新审视移植免疫学 | 利用单细胞技术（如CyTOF、成像质谱流式细胞术和单细胞RNA测序）深入表征参与同种异体移植排斥和耐受的致病性免疫群体 | 处理和分析这些大型、高维数据集需要计算生物学技术的专业知识 | 回顾现有文献中关于单细胞技术在实体器官移植中的应用 | 实体器官移植中的同种异体移植排斥和耐受 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 单细胞数据 | NA |
| 8591 | 2024-09-23 |
TNF+ regulatory T cells regulate the stemness of gastric cancer cells through the IL13/STAT3 pathway
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1162938
PMID:37534250
|
研究论文 | 研究了TNF+调节性T细胞通过IL13/STAT3途径调控胃癌细胞干性的机制 | 首次揭示了TNF+调节性T细胞在胃癌组织中的招募及其与患者生存期的显著相关性，并阐明了其通过IL13/STAT3途径促进胃癌细胞干性的机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证 | 探讨调节性T细胞与胃癌细胞之间的相互作用及其对胃癌发展的影响 | 胃癌组织及其邻近组织中的调节性T细胞和胃癌细胞 | NA | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 胃癌及其邻近组织的单细胞RNA测序数据 |
| 8592 | 2024-09-23 |
An image-guided microfluidic system for single-cell lineage tracking
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0288655
PMID:37527253
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于图像引导的微流控系统，用于单细胞谱系追踪 | 该系统通过阀门控制的微流控技术，能够追踪单细胞在多代间的谱系决策过程，并结合图像处理自动化细胞加载和生长监测 | NA | 解决生物学中单细胞谱系追踪的长期未解问题 | 单细胞的谱系追踪和决策过程 | 生物技术 | NA | 微流控技术 | NA | 图像 | 6C2（鸡红白血病细胞）和T2EC（鸡红细胞原代前体）细胞，追踪两代，细胞存活率超过90% |
| 8593 | 2024-09-23 |
Elevating microglia TREM2 reduces amyloid seeding and suppresses disease-associated microglia
2022-12-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20212479
PMID:36107206
|
研究论文 | 研究探讨了在阿尔茨海默病早期阶段通过增强TREM2信号来减少淀粉样蛋白沉积和神经元退化的效果 | 首次展示了TREM2在阿尔茨海默病不同阶段对淀粉样蛋白沉积和疾病相关小胶质细胞的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探讨TREM2在阿尔茨海默病不同阶段的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 小胶质细胞中的TREM2表达及其对淀粉样蛋白沉积和疾病相关小胶质细胞的影响 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用微胶质细胞特异性诱导的小鼠模型进行研究 |
| 8594 | 2024-09-23 |
Single-cell RNA-sequencing of retrieved human oocytes and eggs in clinical practice and for human ovarian cell atlasing
2022-12, Molecular reproduction and development
IF:2.7Q2
DOI:10.1002/mrd.23648
PMID:36264989
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在人类卵巢细胞研究中的应用 | 探讨了单细胞RNA测序技术在人类卵巢细胞图谱构建和体外受精治疗中的应用 | 未提及 | 探讨单细胞RNA测序技术在人类卵巢细胞研究中的应用 | 人类卵巢细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未提及 |
| 8595 | 2024-09-23 |
Context-specific regulation and function of mRNA alternative polyadenylation
2022-12, Nature reviews. Molecular cell biology
DOI:10.1038/s41580-022-00507-5
PMID:35798852
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综述 | 本文综述了mRNA选择性多聚腺苷酸化的特定调控机制及其功能 | 讨论了单细胞RNA测序和CRISPR-Cas技术在解析选择性3' UTR中的最新进展，并介绍了基于APA的RNA疗法 | NA | 探讨APA的动态精细调控机制及其在基因调控程序中的整合作用 | mRNA选择性多聚腺苷酸化及其在细胞响应环境变化中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas技术 | NA | RNA | NA |
| 8596 | 2024-09-23 |
RS-FISH: precise, interactive, fast, and scalable FISH spot detection
2022-12, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01669-y
PMID:36396787
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RS-FISH的软件，用于在二维和三维显微镜图像中进行荧光原位杂交（FISH）点的精确检测 | RS-FISH软件提供了交互式参数调整功能，并能通过分布式处理在台式机、集群或云端上扩展到大型数据集和图像体积 | NA | 开发一种准确、快速且用户友好的软件，用于在显微镜图像中检测FISH点 | FISH点的检测 | 计算机视觉 | NA | 荧光原位杂交（FISH） | NA | 图像 | NA |
| 8597 | 2024-09-23 |
Image-seq: spatially resolved single-cell sequencing guided by in situ and in vivo imaging
2022-12, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01673-2
PMID:36424441
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Image-seq的技术，该技术通过图像引导从特定空间位置分离细胞，并进行单细胞转录组测序，从而保留目标细胞的空间信息 | Image-seq技术结合了空间信息和高度敏感的RNA测序结果，能够记录被分析细胞的时间和动态历史 | NA | 开发一种能够保留细胞空间信息并进行单细胞转录组测序的技术 | 骨髓和白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 图像 | NA |
| 8598 | 2024-09-23 |
Combined MEK and STAT3 Inhibition Uncovers Stromal Plasticity by Enriching for Cancer-Associated Fibroblasts With Mesenchymal Stem Cell-Like Features to Overcome Immunotherapy Resistance in Pancreatic Cancer
2022-12, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2022.07.076
PMID:35948109
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研究论文 | 研究探讨了联合使用MEK和STAT3抑制剂在胰腺癌中克服免疫治疗抵抗的作用 | 首次揭示了联合MEK和STAT3抑制剂通过改变癌症相关成纤维细胞的特性，克服胰腺癌的免疫治疗抵抗 | 研究主要基于小鼠模型和单一临床病例，需要更多临床试验验证 | 探讨联合MEK和STAT3抑制剂在胰腺癌中克服免疫治疗抵抗的机制 | 胰腺癌中的癌症相关成纤维细胞和免疫微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和单一临床病例 |
| 8599 | 2024-09-23 |
Targeted Assessment of Mucosal Immune Gene Expression Predicts Clinical Outcomes in Children with Ulcerative Colitis
2022-Nov-23, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjac075
PMID:35665804
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研究论文 | 本文研究了靶向基因表达面板在预测儿童溃疡性结肠炎临床结果中的应用 | 首次使用靶向基因表达面板预测儿童溃疡性结肠炎的临床结果，并探讨了预测基因在发病机制中的潜在作用 | 研究样本仅限于新诊断的儿童溃疡性结肠炎患者，且结果主要基于52周的随访数据 | 确定靶向基因表达面板是否能预测儿童溃疡性结肠炎的临床结果，并探讨预测基因的潜在致病作用 | 313例新诊断的儿童溃疡性结肠炎患者的直肠RNA样本 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 实时PCR微流体阵列，RNA测序 | NA | RNA | 313例新诊断的儿童溃疡性结肠炎患者的直肠RNA样本 |
| 8600 | 2024-09-23 |
Systematic single-cell pathway analysis to characterize early T cell activation
2022-11-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111697
PMID:36417885
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研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞通路分析的统计框架，并通过scRNA-seq数据展示了其在早期T细胞激活中的应用 | 开发了一种敏感且无分布假设的多样本分布测试统计框架，并将其应用于单细胞通路分析 | NA | 开发和验证一种新的单细胞通路分析工具，并揭示T细胞激活过程中的调控机制 | T细胞及其在早期激活过程中的通路活动 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个组织的T细胞样本 |