单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 38610 篇文献，本页显示第 841 - 860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2026-04-11 |
Gut microbiota-derived indole-3-lactic acid suppresses anti-PD-1 efficacy in esophageal squamous cell carcinoma
2026-Apr-08, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2026.02.019
PMID:41881017
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研究论文 | 本研究揭示了唾液乳杆菌通过产生吲哚-3-乳酸抑制抗PD-1免疫疗法在食管鳞状细胞癌中疗效的机制 | 首次将特定肠道菌（唾液乳杆菌）及其代谢产物（吲哚-3-乳酸）与ESCC免疫治疗耐药性联系起来，并阐明其通过AhR/NF-κB信号通路抑制NKG7⁺CD8⁺ Tpex细胞的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，在人体中的直接验证仍需进一步扩大样本量；未探讨其他可能共存的菌群或代谢物影响 | 探究肠道菌群影响食管鳞状细胞癌抗PD-1免疫疗法疗效的机制 | 食管鳞状细胞癌患者、人源化微生物组小鼠模型、原位ESCC小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 人源化微生物组小鼠模型、原位肿瘤小鼠模型 | 粪便样本、单细胞转录组数据 | 122例ESCC患者粪便样本（含两个验证队列） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 842 | 2026-04-11 |
Identification and comparison of orthologous cell types from primate embryoid bodies shows limits of marker gene transferability
2026-Apr-08, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.105398
PMID:41949281
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研究论文 | 本研究通过分析四种灵长类动物胚胎样体的单细胞RNA测序数据，开发了一种半自动化计算流程来识别跨物种的同源细胞类型，并揭示了物种间标记基因的可转移性有限 | 开发了结合分类和基于标记的聚类注释的半自动化计算流程，首次在四种灵长类动物胚胎样体数据中系统识别同源细胞类型并评估标记基因的跨物种保守性 | 研究仅基于体外诱导多能干细胞衍生的胚胎样体模型，未涵盖体内发育环境；物种数量有限（四种灵长类），且细胞类型为连续发育谱系，增加了注释难度 | 开发跨物种同源细胞类型识别方法并评估标记基因的跨物种可转移性 | 人类、猩猩、食蟹猴和恒河猴的诱导多能干细胞衍生的胚胎样体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 分类与聚类分析的计算流程 | 单细胞转录组数据 | 四种灵长类物种的诱导多能干细胞衍生的胚胎样体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 843 | 2026-04-11 |
ACAT1-mediated lactylation reprogramming governs immune-stromal crosstalk in ulcerative colitis
2026-Apr-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116626
PMID:41955702
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研究论文 | 本研究通过整合分析发现ACAT1作为乳酰化修饰的关键枢纽基因，在溃疡性结肠炎中调控乳酸代谢和免疫-基质互作网络 | 首次系统性地将乳酰化修饰与溃疡性结肠炎发病机制联系起来，并鉴定ACAT1为核心调控因子，建立了乳酰化亚型分层系统 | 研究主要基于生物信息学分析和体外/小鼠模型验证，缺乏大规模临床样本的直接实验证据 | 阐明乳酰化修饰在溃疡性结肠炎发病机制中的作用，并寻找潜在诊断标志物和治疗靶点 | 溃疡性结肠炎患者的基因表达数据、结肠上皮细胞、小鼠结肠炎模型 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 差异表达分析、WGCNA、PPI网络、单细胞RNA测序、分子对接 | 高斯混合模型、支持向量机、随机森林、梯度提升机、XGBoost、LASSO回归 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | GEO数据集中的溃疡性结肠炎与健康对照样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 844 | 2026-04-11 |
Mapping plant cell-type-specific responses to environmental stresses
2026-Apr-08, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.03.003
PMID:41956877
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综述 | 本文综述了单细胞/核RNA测序和空间转录组学在绘制植物细胞类型特异性响应环境胁迫转录程序方面的最新进展 | 利用单细胞和空间转录组学技术，在空间、时间和细胞类型特异性维度上解析植物对胁迫的响应，弥补了传统批量RNA测序的不足 | NA | 通过高分辨率技术加深对植物细胞水平响应环境胁迫的理解，以推动气候智能型农业策略的发展 | 植物细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞/核RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 845 | 2026-04-11 |
Reconstructing biologically coherent cellular profiles from imaging-based spatial transcriptomics
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.08.710395
PMID:41959255
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研究论文 | 本文提出了一种名为TRACER的方法，用于在基于成像的空间转录组学中重构生物学上一致的细胞轮廓，以改善转录本到细胞的分配和下游分析质量 | TRACER通过利用数据中直接观察到的基因-基因一致性和转录本空间共定位，无需外部注释或参考图谱，即可解决混合细胞轮廓问题并重构未检测到细胞核的部分细胞 | 未在摘要中明确提及 | 改善基于成像的空间转录组学中细胞轮廓的重构，以提升下游生物学解释的准确性 | 基于成像的空间转录组学数据中的细胞轮廓 | 空间转录组学 | NA | 成像空间转录组学 | NA | 空间转录组学成像数据 | NA | NA | 成像空间转录组学 | NA | NA |
| 846 | 2026-04-11 |
Prostaglandin E2-driven dedifferentiation of Schwann cells leads to perineural invasion in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Apr-07, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02648-x
PMID:41946682
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管腺癌（PDAC）中前列腺素E2（PGE₂）驱动雪旺细胞去分化，进而促进神经周围浸润（PNI）的新机制 | 首次通过整合RNA-seq、空间转录组学和单细胞分析，发现PNI区域去分化雪旺细胞的富集，并阐明PDAC来源的PGE₂通过驱动雪旺细胞去分化及分泌促侵袭因子（LIF和ADAMTS-1）促进PNI的旁分泌轴 | 研究主要基于体外共培养模型和临床样本分析，体内动物模型的验证可能有限 | 阐明胰腺导管腺癌中神经周围浸润的分子机制，以寻找新的治疗靶点 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者临床样本、雪旺细胞、胰腺癌细胞系（PANC-1和BxPC-3） | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞分析, 共培养实验, 3D共培养模型, 功能实验 | 体外共培养模型, 3D共培养模型 | 转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞数据 | 临床样本（具体数量未明确说明） | NA | RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | NA |
| 847 | 2026-04-11 |
Effect of aging on rat testicular interstitial compartment: functional losses in endothelial and mesenchymal cells and activation of immune cells
2026-Apr-07, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glag089
PMID:41955433
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组化技术，分析了年轻与老年BN大鼠睾丸间质细胞的调控图谱和细胞间相互作用，揭示了衰老过程中间质细胞的功能丧失和免疫细胞激活的机制 | 首次建立了衰老大鼠睾丸间质细胞的调控细胞图谱，揭示了衰老过程中间质细胞异质性和随机性变化，以及从先天免疫向适应性免疫转变的转录组学特征 | 研究仅基于大鼠模型，可能不完全适用于人类衰老过程，且样本量有限，未涉及更广泛的年龄组或物种比较 | 探究衰老对大鼠睾丸间质细胞功能的影响及细胞间相互作用的机制 | 年轻（3个月）和老年（21个月）BN大鼠的睾丸间质细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫组化 | NA | RNA序列数据, 图像数据 | 年轻和老年BN大鼠睾丸间质细胞（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 848 | 2026-04-11 |
Heterogeneity and Clinical Relevance of Group 2 Innate Lymphoid Cells Subsets in Nasal Polyps
2026-Apr-07, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.03.021
PMID:41956382
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，揭示了鼻息肉中2型固有淋巴细胞亚群的异质性及其与临床严重程度的相关性 | 首次在鼻息肉中鉴定出四种具有不同激活状态的ILC2亚群，并明确了其与临床评分和症状严重度的关联 | 样本量较小（6例鼻息肉组织），且为观察性研究，需进一步验证 | 探究慢性鼻窦炎伴鼻息肉中T2炎症的细胞来源、ILC2亚群异质性及其临床意义 | 鼻息肉组织及外周血中的ILC2细胞和CD4+ T细胞 | 单细胞组学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 6例鼻息肉组织样本和4例外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 849 | 2026-04-11 |
Ammonia Detoxification Inhibits Liver Metastasis by Reshaping Hepatic Microenvironment
2026-Apr-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521098
PMID:41933927
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研究论文 | 本研究揭示了病理性氨积累通过重塑肝脏微环境促进肝转移，并提出L-鸟氨酸-L-天冬氨酸作为潜在治疗策略 | 首次发现病理性氨积累是肝转移微环境形成的关键驱动因素，并验证了氨解毒剂LOLA的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床转化效果需进一步验证 | 探究肝转移的分子机制并开发有效治疗策略 | 肝转移微环境、氨代谢、免疫细胞 | 肿瘤生物学 | 肝转移癌 | 代谢组学、转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 代谢数据、基因表达数据 | 肝转移小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 850 | 2026-04-11 |
Single-cell, clonal and spatial atlases of cranial placodes illuminate their specification and evolution
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715621
PMID:41959073
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞、空间和克隆图谱，解析了颅骨板发育过程中的谱系分离动态 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和高分辨率克隆追踪技术，揭示了颅骨板与邻近祖细胞形成连续转录景观，并发现域边界细胞存在双潜能状态 | 研究主要聚焦于发育早期阶段，对后期分化成熟过程的机制解析相对有限 | 阐明脊椎动物颅骨板的身份决定、多样化及进化起源机制 | 脊椎动物颅骨板及其邻近祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 克隆追踪 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 851 | 2026-04-11 |
Linking Genetic Risk to Disease-Relevant Cellular States via Metacell-Informed Modeling with ICePop
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715877
PMID:41959181
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ICePop的框架，通过元细胞分辨率进行疾病-细胞类型关联分析，以解决GWAS与单细胞转录组学数据整合中的统计功效与异质性检测之间的权衡问题 | ICePop在元细胞分辨率下进行疾病-细胞类型关联分析，既保持了与细胞类型水平方法相当的统计功效，又能检测细胞类型内的异质性疾病信号 | NA | 将GWAS识别的遗传风险位点与疾病相关的特定细胞状态联系起来 | 复杂疾病的遗传风险位点、单细胞转录组学数据、细胞类型和细胞状态 | 计算生物学 | 溃疡性结肠炎、自闭症谱系障碍、肺功能相关疾病 | 单细胞RNA测序 | ICePop | 单细胞转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 852 | 2026-04-11 |
Circulating Immune Cells are Associated with Non-Inflammatory Pain in Rheumatoid Arthritis
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.31.715669
PMID:41959259
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研究论文 | 本研究通过分析类风湿关节炎患者的循环免疫细胞，揭示了其与非炎症性疼痛（即中枢敏化或伤害可塑性疼痛）的关联 | 首次在关节炎症已得到控制的类风湿关节炎患者中，结合定量感觉测试、患者报告结果和多参数流式细胞术及单细胞RNA测序，系统性地将循环免疫细胞特征与非炎症性疼痛联系起来 | 样本量较小（共39例，其中单细胞RNA测序仅22例），且为观察性研究，无法确定因果关系 | 表征与类风湿关节炎患者中枢敏化疼痛相关的免疫细胞状态改变 | 类风湿关节炎患者 | NA | 类风湿关节炎 | 多参数光谱流式细胞术，单细胞RNA测序，定量感觉测试 | NA | 流式细胞术数据，单细胞RNA测序数据，问卷调查数据，临床测试数据 | 39名类风湿关节炎患者（其中22名进行了单细胞RNA测序） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 853 | 2026-04-11 |
A Tissue Virus Microenvironment with Activated Stress Responses Underlies Durable SIV Persistence
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716177
PMID:41959291
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学等方法，揭示了在抗逆转录病毒治疗期间，肠道相关淋巴组织中存在一种支持HIV/SIV病毒库持久性的空间组织化病毒微环境 | 首次定义了支持病毒库持久性的空间组织化病毒微环境，并揭示了其与肿瘤微环境的相似性 | 研究基于SIV感染的恒河猴模型，结果向人类HIV感染的转化需进一步验证 | 探究HIV/SIV在抗逆转录病毒治疗期间持久存在的机制，并识别病毒库持久性的决定因素 | SIV感染的恒河猴肠道相关淋巴组织 | 空间转录组学 | HIV/AIDS | 空间转录组学，免疫PET/CT，免疫荧光显微镜，机器学习 | 机器学习 | 空间转录组数据，影像数据，显微镜图像 | SIV感染的恒河猴 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 854 | 2026-04-11 |
Targeting TPO/MPL Signaling to Mitigate JAK2V617F-driven Cardiac Microvascular Disease
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715884
PMID:41959476
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研究论文 | 本研究揭示了JAK2V617F突变造血通过激活心内膜内皮细胞中的TPO/MPL信号通路，导致心脏微血管疾病，并证明MPL抑制可改善心脏病理 | 首次发现JAK2V617F突变造血通过心内膜内皮细胞中的TPO/MPL信号通路驱动心脏微血管疾病，并证明靶向MPL可改善心脏功能 | 研究基于小鼠模型，尚未在人体中得到验证；高脂/高胆固醇饮食模型可能无法完全模拟人类心血管疾病的复杂性 | 探究JAK2V617F突变相关心血管并发症的机制，并寻找潜在治疗靶点 | 携带JAK2V617F突变造血细胞的小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，骨髓移植，组织学分析 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据，组织图像数据 | 未明确说明具体样本数量，使用小鼠模型进行研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 855 | 2026-04-11 |
Monocyte Lineage Expansion Drives Transcriptomic Individuality in Genetically Identical Armadillo Quadruplets
2026-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.30.715171
PMID:41959222
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研究论文 | 本文通过研究九带犰狳四胞胎，探讨了转录组个体差异如何与免疫细胞组成的持久差异相关联 | 首次将转录组个体差异与持久的免疫细胞组成差异联系起来，揭示了早期随机事件如何导致遗传相同个体间的生物学差异 | 研究主要基于犰狳模型，可能无法完全推广到人类或其他物种 | 探究转录组个体差异是否反映功能性生物学差异 | 九带犰狳四胞胎 | 单细胞组学 | 麻风病 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | RNA-seq数据, ATAC-seq数据 | 五个队列的遗传相同四胞胎，跨越三个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 856 | 2026-04-11 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Hair Cell-Specific Molecular Responses to Polystyrene Nanoplastics in a Zebrafish Embryo Model
2026-Apr, Biotechnology and applied biochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/bab.70028
PMID:40641182
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析揭示了斑马鱼胚胎中毛细胞对聚苯乙烯纳米塑料的特异性分子响应 | 首次在斑马鱼胚胎模型中，通过单细胞RNA测序技术，系统揭示了毛细胞对聚苯乙烯纳米塑料暴露的特异性分子响应机制，包括细胞类型比例变化和基因表达调控 | 研究仅关注了聚苯乙烯纳米塑料在环境相关浓度下的短期暴露效应，未评估长期暴露或更高浓度下的毒性影响，且主要基于胚胎模型，成年个体的响应可能不同 | 探究聚苯乙烯纳米塑料对斑马鱼胚胎的生理和分子影响，评估其生态风险 | 斑马鱼胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确指定样本数量，但基于斑马鱼胚胎模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 857 | 2026-04-11 |
Multiomic, Histologic, and scRNA-seq Profiling of Pleural Mesothelioma Reveals Negative Prognosis Associated With a Novel Uncommitted Molecular Phenotype
2026-Apr, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2025.11.019
PMID:41319863
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了胸膜间皮瘤中一种新的未定型分子表型与不良预后相关 | 发现了一种新型未定型恶性细胞状态，并鉴定了TGF-β和GAS6-AXL信号通路作为潜在驱动因子 | 需要进一步实验探索和临床验证来确认这些发现 | 识别胸膜间皮瘤恶性细胞状态的候选驱动因子和预后生物标志物 | 胸膜间皮瘤患者组织样本 | 数字病理学 | 胸膜间皮瘤 | 单细胞RNA测序, 外显子组测序, RNA测序, 光学基因组图谱, 空间转录组学, 组织学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 外显子组数据, RNA测序数据, 空间转录组数据, 组织学图像 | 来自40名患者的93个样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 858 | 2026-04-11 |
LINC01116, a hypoxia-lncRNA marker of pathological lymphangiogenesis and poor prognosis in lung adenocarcinoma
2026-Apr, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70175
PMID:41367062
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研究论文 | 本研究识别了LINC01116作为肺腺癌中缺氧诱导的长链非编码RNA，与不良预后和病理性淋巴管生成相关 | 首次将LINC01116确立为肺腺癌中缺氧微环境下的特异性淋巴管内皮细胞生物标志物，并揭示其在病理性淋巴管生成中的作用 | 在肿瘤细胞系中未发现LINC01116的明确调控作用，其具体分子机制仍需进一步探索 | 探究LINC01116在肺腺癌缺氧微环境及淋巴管生成中的功能与临床意义 | 肺腺癌患者队列、肺腺癌细胞系、淋巴管内皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、RNA荧光原位杂交、CRISPRi、RNA干扰 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、图像数据 | 肺腺癌患者队列（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 859 | 2026-04-11 |
Immune involvement in neuropsychiatric disorders: Insights from single-cell transcriptomic studies
2026-Apr, Psychiatry and clinical neurosciences
IF:5.0Q1
DOI:10.1111/pcn.70018
PMID:41454738
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在神经精神疾病中免疫相关机制研究中的应用与发现 | 整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）技术，克服批量RNA测序的平均化效应，揭示神经精神疾病中细胞类型特异性免疫改变 | 单细胞转录组学方法仍面临技术挑战，如细胞捕获效率、数据解析复杂性以及样本处理偏差 | 探讨免疫系统在神经精神疾病中的作用机制，并整合批量与单细胞转录组学方法以弥补研究空白 | 精神疾病（如精神分裂症、双相情感障碍、重度抑郁症、自闭症谱系障碍、注意力缺陷多动障碍）和神经系统疾病（如阿尔茨海默病、帕金森病、路易体痴呆、多发性硬化症、抗NMDA受体脑炎） | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单核RNA测序（snRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单核RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 860 | 2026-04-11 |
Neuronal phenotypic alterations and the therapeutic potential of Anxa2 in traumatic brain injury recovery
2026-Apr, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究探讨了创伤性脑损伤（TBI）后神经元表型变化及其对恢复的影响，并发现Anxa2基因在TBI恢复中具有积极作用 | 通过单细胞RNA测序识别TBI后神经元表型变化，并首次验证Anxa2在TBI恢复中的治疗潜力 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；分子对接分析仅为预测性，需实验验证 | 探索TBI后神经元表型变化对恢复的影响，并评估Anxa2作为治疗靶点的潜力 | 小鼠皮质组织中的神经元 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，分子对接分析 | NA | RNA测序数据 | 公开可用的GEO数据库中的小鼠皮质组织数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |