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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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841 | 2025-07-24 |
A pre-menopausal single-cell atlas for ovarian drug discovery
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660779
PMID:40666883
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研究论文 | 本文介绍了一个针对绝经前女性的单细胞图谱(PreMeno Atlas),旨在促进卵巢生物学研究和避孕靶点发现 | 首次整合了绝经前女性的单细胞数据集,包括14个组织的511,365个细胞,特别关注卵巢细胞基因特征和潜在药物靶点 | 研究主要基于绝经前女性数据,可能不适用于其他年龄段人群 | 促进对绝经前阶段卵巢生物学的理解,并支持针对年轻人群(如生育管理)的卵巢基因靶点识别 | 绝经前女性的卵巢细胞和其他13种组织细胞 | 单细胞生物学 | 生育管理 | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 511,365个细胞(来自14个组织) |
842 | 2025-07-24 |
MHCIIhiLYVE1loCCR2hi Interstitial Macrophages Promote Medial Fibrosis in Pulmonary Arterioles and Contribute to Pulmonary Hypertension
2025-Jun-20, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326173
PMID:40357547
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research paper | 该研究探讨了间质巨噬细胞(iMΦ)在肺动脉高压(PH)中促进肺动脉中膜纤维化的作用及其机制 | 首次发现MHCIIhiLYVE1loCCR2hi iMΦs通过WNT11/PCP通路促进肺动脉平滑肌细胞向成纤维细胞样表型转化,从而加剧肺动脉中膜纤维化 | 研究主要基于动物模型和体外实验,临床样本验证相对有限 | 阐明间质巨噬细胞在肺动脉高压发病机制中的作用 | 肺动脉高压患者和实验性PH动物的肺组织样本 | 病理生理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、组织学分析、共培养实验、转基因动物实验 | 动物模型(Sugen-5416+缺氧+常氧刺激模型) | 基因表达数据、组织学图像数据 | 患者样本和实验动物样本(具体数量未明确说明) |
843 | 2025-07-24 |
Dissecting the liver inflammation ecosystem identifies annexin A1 as a pro-resolving target for liver failure
2025-Jun-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001427
PMID:40560812
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,解析了急性-慢性肝衰竭(ACLF)中的免疫景观,并发现ANXA1作为潜在的治疗靶点 | 首次全面描述了ACLF的免疫特征,并鉴定出ANXA1-FPR1轴作为炎症调控的关键通路 | 研究主要基于观察性数据,需要进一步实验验证ANXA1的治疗效果 | 解析ACLF的免疫机制并寻找治疗靶点 | 急性-慢性肝衰竭患者的肝脏组织和免疫细胞 | 免疫学 | 肝衰竭 | 单细胞RNA测序、空间测序、生物信息学分析 | NA | RNA测序数据 | ACLF患者、急性肝衰竭患者、失代偿性肝硬化患者和对照组的肝脏样本 |
844 | 2025-07-24 |
Serum amyloid A1-induced intrahepatic regulatory T-cell dysfunction drives autoimmune hepatitis progression
2025-Jun-09, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001419
PMID:40489740
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研究论文 | 本研究探讨了自身免疫性肝炎(AIH)中调节性T细胞(Tregs)的功能障碍及其与血清淀粉样蛋白A1(SAA1)的关系 | 揭示了AIH中肝内Tregs功能受损的机制,并发现SAA1通过toll样受体2影响Tregs功能,提出了针对SAA1的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类AIH患者中进行验证 | 探究AIH中Tregs功能障碍的机制及潜在治疗靶点 | 自身免疫性肝炎(AIH)小鼠模型中的调节性T细胞(Tregs) | 免疫学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序(10× Genomics平台)、AAV8介导的基因治疗 | FoxP3-DTR/eGFP小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量,使用AIH小鼠模型进行研究 |
845 | 2025-07-24 |
Deficient FANCL Predisposes Endothelial Damage: A New Therapeutic Target for Pulmonary Hypertension
2025-Jun-06, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202408-1655OC
PMID:40479584
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research paper | 该研究探讨了FANCL缺陷如何促进肺动脉高压(PAH)的发展,并提出靶向修复FANCL作为治疗PAH的新策略 | 首次揭示了FANCL缺陷在PAH发病机制中的关键作用,并通过基因补充和药物干预验证了其治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人体临床试验中验证 | 阐明FA通路、DNA损伤与PAH之间的相互作用机制 | FANCL基因缺陷小鼠模型、PAH患者肺标本和肺动脉内皮细胞、野生成和Fanclkf/kf小鼠的原代培养肺微血管内皮细胞 | 分子病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、腺相关病毒介导的基因过表达 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 临床样本(PAH患者肺标本和PAECs)、小鼠模型和体外培养细胞 |
846 | 2025-07-24 |
A single-cell spatial chart of the airway wall reveals proinflammatory cellular ecosystems and their interactions in health and asthma
2025-Jun, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02161-3
PMID:40399607
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研究论文 | 应用单细胞空间转录组学揭示健康和哮喘状态下气道壁的细胞生态系统及其相互作用 | 首次揭示了健康和哮喘气道壁中促炎性细胞生态系统的空间分布及其相互作用机制 | 研究样本可能不足以代表所有哮喘亚型,且未探讨其他呼吸道疾病中的类似现象 | 解析气道壁细胞的空间分布及其在健康和哮喘状态下的相互作用 | 健康和哮喘患者的气道壁细胞 | 单细胞空间转录组学 | 哮喘 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 健康和哮喘患者的气道壁样本 |
847 | 2025-07-24 |
Single-cell transcriptome analyses reveal the mechanism of mitochondrial activity in erectile dysfunction
2025-Jun, Sexual medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1093/sexmed/qfaf049
PMID:40689149
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了线粒体功能在勃起功能障碍(ED)中的机制 | 首次在单细胞水平上系统性地描述了ED的细胞异质性,并识别了与ED相关的线粒体基因和功能通路 | 样本代表性有限且缺乏直接实验验证 | 探究线粒体功能对勃起功能障碍细胞异质性的影响 | 勃起功能障碍患者的组织样本 | 单细胞转录组学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 64,993个高质量细胞 |
848 | 2025-07-24 |
Preterm birth increases susceptibility to hyperglycemia induced glomerular alterations in male mice
2025-May-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-00103-5
PMID:40442182
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research paper | 该研究探讨了早产对高血糖诱导的肾小球改变的影响 | 首次研究了早产对糖尿病肾病进展的影响,并揭示了早产如何增加高血糖诱导的肾损伤的易感性 | 研究仅针对雄性小鼠,未涉及雌性小鼠或人类数据 | 确定早产对高血糖暴露后肾脏健康的影响 | 早产和足月出生的CD-1小鼠 | NA | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序、组织学、分子和成像技术 | NA | 分子和成像数据 | 早产和足月出生的CD-1小鼠 |
849 | 2025-07-24 |
D-SPIN constructs gene regulatory network models from multiplexed scRNA-seq data revealing organizing principles of cellular perturbation response
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.19.537364
PMID:37131803
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research paper | 介绍了一种名为D-SPIN的计算框架,用于从单细胞mRNA测序数据中构建基因调控网络模型 | D-SPIN能够从数千种不同扰动条件下的单细胞mRNA测序数据中构建基因调控网络的定量模型,揭示细胞对扰动的响应机制 | 未明确提及具体局限性 | 揭示细胞信息处理和生理控制的原则 | 单细胞mRNA测序数据 | computational biology | NA | scRNA-seq | D-SPIN | gene expression data | 数千种不同扰动条件下的数据 |
850 | 2025-07-24 |
Engineered vasculature induces functional maturation of pluripotent stem cell-derived islet organoids
2025-May-20, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.024
PMID:40412386
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研究论文 | 该研究通过工程化血管系统,促进了多能干细胞来源的胰岛类器官的功能成熟 | 首次在非灌注模型和微流体装置中构建了三维血管化的SC-胰岛类器官,揭示了血管化对SC-β细胞功能成熟的关键作用 | 研究主要基于体外和小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 探索血管化对多能干细胞来源胰岛类器官功能成熟的影响 | 人多能干细胞来源的胰岛类器官(SC-islets)、人原代内皮细胞(ECs)和成纤维细胞 | 组织工程 | 糖尿病 | scRNA-seq、微流体技术 | NA | 基因表达数据、生理功能数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及体外培养的细胞和小鼠模型 |
851 | 2025-07-24 |
Quantification of single cell-type-specific alternative transcript initiation
2025-May-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.29.651292
PMID:40654755
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研究论文 | 开发了一种新的生物信息学方法TSRdetector,用于检测不同组织、细胞类型或疾病中基因转录起始区域(TSR)的显著使用变化 | TSRdetector是一种专门设计用于检测基因TSR在不同条件下使用变化的新方法,能够处理单细胞RNA测序和批量RNA测序数据 | 未明确提及方法的局限性 | 探索基因转录起始区域(TSR)在不同组织和细胞类型中的选择性激活机制 | 人类健康与糖尿病肾脏、小鼠B细胞分化、人类胚胎干细胞多能性转变 | 生物信息学 | 糖尿病 | scRNA-seq, bulk-RNA-seq, Smart-seq2 | NA | RNA-seq数据 | 10X snRNA-seq数据集、Smart-seq2数据集、批量RNA-seq数据集 |
852 | 2025-07-24 |
Neural signaling contributes to heart formation and growth in the invertebrate chordate, Ciona robusta
2025-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.28.651085
PMID:40654768
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研究论文 | 该研究揭示了神经肽tachykinin与经典Wnt信号通路在调控脊索动物模型心肌祖细胞增殖中的作用 | 首次阐明了神经肽tachykinin及其受体在心肌祖细胞增殖和心肌心管形成中的具体作用机制 | 研究仅基于Ciona robusta模型,在高等脊椎动物中的普适性有待验证 | 探究神经信号对心脏发育和生长的调控机制 | Ciona robusta(一种脊索动物)的心脏发育过程 | 发育生物学 | 心血管疾病 | scRNA-seq(单细胞RNA测序), CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 成年Ciona robusta心脏组织 |
853 | 2025-07-24 |
Integrating Single-Cell Sequencing and Transcriptome Analysis to Investigate the Role of Ferroptosis in Ischemic Stroke and the Molecular Mechanisms of Immune Checkpoints
2025-05, World neurosurgery
IF:1.9Q2
DOI:10.1016/j.wneu.2025.123908
PMID:40118372
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和转录组分析,探讨铁死亡在缺血性卒中中的作用及免疫检查点的分子机制 | 利用单细胞转录组数据和机器学习算法识别了与铁死亡相关的关键基因,并验证了其诊断价值 | 研究仅基于公开数据集,缺乏实验验证 | 识别缺血性卒中中铁死亡相关的关键基因,探索其分子机制和潜在生物标志物 | 缺血性卒中患者和对照组的星形胶质细胞及T细胞亚群 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | 单细胞转录组测序,Lasso回归,支持向量机算法 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 公开数据集GSE247474 |
854 | 2025-07-24 |
Distinct adipose progenitor cells emerging with age drive active adipogenesis
2025-Apr-25, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adj0430
PMID:40273250
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研究论文 | 研究揭示了中年时期脂肪祖细胞(APCs)在促进内脏脂肪形成中的关键作用及其机制 | 发现了一种新的脂肪祖细胞亚群CP-A,其在中年时期活跃增殖并促进脂肪生成,揭示了白血病抑制因子受体信号在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类中的相关性需要进一步验证 | 探究年龄依赖性脂肪重塑的分子机制 | 小鼠脂肪祖细胞(APCs) | 细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、移植实验 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
855 | 2025-07-24 |
AI-based phenotyping of hepatic fiber morphology to inform molecular alterations in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2025-Apr-22, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001360
PMID:40262132
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研究论文 | 利用AI技术对代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)中的肝纤维形态进行表型分析,以揭示其分子改变 | 开发了基于AI的FibroNest算法,用于量化肝纤维形态表型,并发现这些表型能更敏感地捕捉MASLD相关分子改变 | 样本量较小(94例肝活检),且仅部分样本(13%)同时患有HCC | 全面表征MASLD中肝纤维形态表型及其相关分子改变 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)患者的肝活检样本 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 多层组学分析、空间单细胞转录组(CosMx) | FibroNest算法 | 肝活检图像、转录组数据 | 94例MASLD患者的肝活检样本(其中12例并发HCC) |
856 | 2025-07-24 |
Glutathione accelerates the cell cycle and cellular reprogramming in plant regeneration
2025-04-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.019
PMID:39755116
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研究论文 | 该研究探讨了谷胱甘肽在植物细胞周期和细胞重编程中的作用 | 发现谷胱甘肽通过缩短G1期加速细胞分裂和重编程,并提出了一个模型解释其在伤口附近的细胞周期调控机制 | 研究仅限于拟南芥根部细胞,尚未在其他植物或组织中验证 | 研究细胞周期在细胞重编程中的作用 | 拟南芥根部细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序、活体成像 | NA | 基因表达数据、图像数据 | NA |
857 | 2025-07-24 |
Integrating short-read and long-read single-cell RNA sequencing for comprehensive transcriptome profiling in mouse retina
2025-Apr-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279167.124
PMID:40050124
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研究论文 | 本文通过整合短读长和长读长单细胞RNA测序技术,对小鼠视网膜进行了全面的转录组分析 | 开发了一种结合短读长和长读长测序技术的方法,显著提高了转录异构体的识别能力,发现了大量先前未表征的转录异构体 | 研究仅限于小鼠视网膜细胞,结果在人类或其他组织中的适用性尚需验证 | 建立一种高效方法来表征组织样本中的转录异构体 | 小鼠视网膜细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(短读长Illumina测序和长读长Oxford Nanopore测序) | NA | RNA测序数据 | 约30,000个小鼠视网膜细胞,包含15.4亿条Illumina短读长和14亿条Oxford Nanopore长读长数据 |
858 | 2025-07-24 |
A simplified preparation method for single-nucleus RNA-sequencing using long-term frozen brain tumor tissues
2025-Apr-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97053-9
PMID:40229354
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研究论文 | 本文优化了一种从长期冷冻的儿童胶质瘤组织中分离完整细胞核的方法,用于单核RNA测序 | 提出了一种快速、简单且低成本的细胞核分离方案,适用于冷冻脑肿瘤组织,并改进了3'测序文库以包含更短的RNA片段 | 方法主要针对冷冻脑肿瘤组织,可能不适用于其他类型的组织或新鲜样本 | 优化单核RNA测序方法,以研究罕见肿瘤实体 | 长期冷冻的儿童胶质瘤组织 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 冷冻的原发性胶质瘤组织 |
859 | 2025-07-24 |
Long-lasting B cell convergence to distinct broadly reactive epitopes following vaccination with chimeric influenza virus hemagglutinins
2025-Apr-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.025
PMID:40132593
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和B细胞受体库测序,确定了嵌合血凝素(cHA)疫苗接种诱导的B细胞的特异性、功能和亚群 | 研究发现cHA疫苗能够诱导B细胞对血凝素茎部保守区域的广泛中和表位产生持久的反应,并重塑HA特异性记忆B细胞池 | 研究仅基于一期临床试验数据,样本量和长期效果需要进一步验证 | 评估嵌合血凝素疫苗诱导的B细胞反应的特异性和持久性 | 接种cHA疫苗的受试者的B细胞 | 免疫学 | 流感 | 单细胞RNA测序,B细胞受体库测序 | NA | RNA序列数据 | 一期临床试验的受试者 |
860 | 2025-07-24 |
Expansion of OSMR expression and signaling in the human dorsal root ganglion links OSM to neuropathic pain
2025-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.26.645611
PMID:40236060
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研究论文 | 该研究探讨了OSM-OSMR信号在人类背根神经节(DRG)中的表达及其与神经病理性疼痛的关联 | 揭示了OSM通过MAPK信号通路直接激活人类感觉神经元的新机制,并发现OSM单独即可诱导与疼痛相关的转录组特征 | 研究主要基于体外实验和测序数据,需要更多体内实验验证 | 探究OSM-OSMR信号通路在人类神经病理性疼痛中的作用机制 | 人类背根神经节(hDRG)组织及培养的神经元 | 神经生物学 | 神经病理性疼痛 | RNA测序(RNA-seq)、单核RNA测序(single-nuclei RNA-seq)、单细胞RNA测序(single-cell RNA-seq)、CRISPR编辑、免疫组化、膜片钳电生理 | NA | 基因表达数据、电生理数据 | 来自神经病理性疼痛患者的hDRG组织 |