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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2026-06-26 |
Recent advances in detection techniques regarding predictive, prognostic, and diagnostic biomarkers in solid cancers and its future challenges
2026, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2025.12.006
PMID:42167840
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综述 | 综述了基于预测性、预后性和诊断性生物标志物在实体瘤中检测技术的最新进展及其未来挑战 | 全面整合液体活检、ctDNA、microRNA、外泌体分析及多组学平台等多种先进技术,并强调人工智能和机器学习在生物标志物分析中的应用潜力 | 存在肿瘤异质性、跨人群交叉验证不足、新兴生物标志物向临床转化困难等问题 | 探讨预测性、预后性和诊断性生物标志物检测技术的进展及其在实体瘤临床应用中的未来方向 | 实体瘤(如乳腺癌、肺癌、结直肠癌、前列腺癌)中的生物标志物及其检测技术 | 机器学习 | 肺癌, 结直肠癌, 前列腺癌, 乳腺癌 | 液体活检, ctDNA, microRNA, 外泌体分析, 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 842 | 2026-06-26 |
Biomarkers for cancer screening, diagnosis and targeted therapeutic approaches
2026, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2025.12.008
PMID:42167844
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综述 | 探讨高通量分子技术推动癌症生物标志物在早期筛查、诊断和靶向治疗中的应用,并指出标准化和伦理等挑战 | 全面概述了包括单细胞测序、CRISPR诊断和人工智能在内的新兴技术如何进一步革新肿瘤异质性解析和多组学数据整合 | 未深入讨论生物标志物验证中的具体标准化方案及成本效益分析 | 综述癌症生物标志物发现与应用的分子技术进展及其临床转化 | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和表观遗传组的生物标志物 | 机器学习 | 肺癌 | NGS,质谱,PCR技术,单细胞测序,CRISPR诊断 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 843 | 2026-06-26 |
A Mitoxyperilysis-Related Single-Cell and Machine-Learning Framework Defines an Immune-Cold Melanoma Phenotype and a Robust Prognostic Signature
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/9909803
PMID:42170303
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研究论文 | 通过单细胞RNA-seq和机器学习框架,定义了与mitoxyperilysis相关的黑色素瘤免疫冷表型及预后特征 | 首次将单细胞分辨的mitoxyperilysis相关转录程序与大规模多队列机器学习验证相结合,既解析免疫代谢异质性的机制,又实现黑色素瘤临床风险分层 | 未提及具体局限性 | 探讨mitoxyperilysis(线粒体依赖的膜溶解过程)在黑色素瘤中的临床相关性,并建立预后模型 | 黑色素瘤肿瘤微环境中的细胞类型(包括恶性亚群)和患者队列 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq | 梯度提升机(GBM) | 基因表达数据 | TCGA-SKCM队列及6个独立GEO队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 844 | 2026-06-26 |
Complement C5a receptor 1 antagonist attenuates alveolar hypoplasia induced by pulmonary hypoperfusion and its underlying mechanisms
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1802250
PMID:42199402
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研究论文 | 探索补体C5a受体1拮抗剂在肺低灌注诱导肺泡发育不全中的作用及其分子机制 | 首次阐明C5a通过IL-1β/NF-κB轴抑制SEMA3a驱动肺泡发育不全,并验证C5aR1拮抗剂的治疗潜力 | 未明确PHypo模型中C5a激活的源头,以及C5aR1拮抗剂在人类临床中的应用仍需验证 | 阐明补体C5a在肺低灌注诱导肺泡发育不全中的作用机制 | 新生儿大鼠(P1)及肺低灌注儿童血清样本 | 机器学习 | 肺发育不全 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据, 组织切片图像 | 大鼠肺组织样本(P7和P14)及儿童血清样本 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 845 | 2026-06-26 |
Alterations of sphingosine-1-phosphate and its receptors in type 1 diabetes mellitus: an integrated clinical and single-cell transcriptomic study
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1838952
PMID:42338584
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和临床分析,探讨1型糖尿病中鞘氨醇-1-磷酸及其受体的变化 | 首次通过单细胞RNA测序结合临床样本,系统揭示了1型糖尿病中S1P-S1PR1通路的改变,包括肠道免疫细胞中S1PR1表达降低、循环总S1P升高及功能性HDL结合S1P下降 | 未提及明确限制 | 研究1型糖尿病中鞘氨醇-1-磷酸(S1P)及其受体S1PR1的变化 | 1型糖尿病患者和非肥胖糖尿病小鼠(NOD小鼠) | NA | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1型糖尿病患者和健康对照者的结肠组织;NOD小鼠(4周和12周龄) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 846 | 2026-06-26 |
Differentiation defects reposition sebaceous glands as inflammatory instigators in the early pathogenesis of hidradenitis suppurativa
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1785747
PMID:42338586
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研究论文 | 本研究揭示了皮脂腺分化缺陷在化脓性汗腺炎早期发病机制中作为炎症引发因素的作用 | 首次证明皮脂腺紧密连接破坏和CLDN1缺乏是HS早期发病的原发事件,并阐明皮脂腺来源的LPC作为新型生物标志物和治疗靶点的潜力 | 信息未提供 | 确定皮脂腺异常是否为HS早期发病的原发性驱动因素,并阐明其潜在机制 | HS患者的非病变皮肤、早期病变皮肤以及健康对照皮肤组织,以及人SZ95皮脂腺细胞和HaCaT角质细胞 | 数字病理学 | 化脓性汗腺炎 | 组织学、单细胞RNA测序、体外功能实验、基因敲低、批量RNA测序、脂质组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据、组织学图像 | 6例非病变皮肤、12例早期病变皮肤、8例健康对照样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 847 | 2026-06-26 |
Multi-omics analysis of kidney renal cell carcinoma in silico with preliminary in vivo validation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1732965
PMID:42338588
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研究论文 | 通过多组学整合分析鉴定肾透明细胞癌关键预后生物标志物CRHBP及潜在治疗靶点 | 首次整合转录组、甲基化、拷贝数变异及免疫浸润等多组学数据,结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和计算机模拟基因敲除,系统揭示CRHBP-UCN2轴在肾透明细胞癌预后和免疫微环境重塑中的调控作用 | 主要基于公共数据库和计算机模拟分析,体内实验验证仅通过初步的qPCR在少量小鼠和人类组织中进行 | 鉴定肾透明细胞癌的预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 肾透明细胞癌(KIRC) | 机器学习和数字病理 | 肾癌 | 多组学整合分析、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接、定量PCR | 无 | 转录组数据、甲基化数据、拷贝数变异数据、免疫浸润数据、单细胞RNA测序数据 | 公共数据库KIRC患者样本用于多组学分析;人类KIRC组织和小鼠KIRC组织用于qPCR验证(具体数量未提及) | 无 | 单细胞RNA测序 | 无 | 无 |
| 848 | 2026-06-26 |
Identification and multi-layered validation of seven diagnostic biomarkers for dilated cardiomyopathy via integrative machine learning, single-cell transcriptomics, and Mendelian randomization
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1851275
PMID:42343898
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研究论文 | 通过整合机器学习、单细胞转录组学和孟德尔随机化方法,识别并多层级验证扩张型心肌病的七种诊断生物标志物 | 首次结合四种机器学习算法(LASSO、随机森林、SVM-RFE和XGBoost)与单细胞转录组数据及孟德尔随机化分析,系统识别并优先排序扩张型心肌病的组织级候选生物标志物 | 特征选择未嵌套在交叉验证内,可能导致性能估计偏高;外部验证显示部分标志物(如AQP3、CSDC2、TUBA3E)的稳健性不足;研究主要基于疾病响应性生物标志物,而非疾病驱动性治疗靶点或可直接应用的临床测试 | 识别并优先排序扩张型心肌病(DCM)的组织级、疾病响应性候选生物标志物 | 扩张型心肌病(DCM)患者的心肌组织样本 | 机器学习、数字病理学 | 扩张型心肌病、心血管疾病 | RNA-seq、微阵列、单核RNA测序(snRNA-seq) | LASSO、随机森林、SVM-RFE、XGBoost、逻辑回归、孟德尔随机化 | 转录组表达数据 | 发现队列(GSE57338)包含DCM患者和非衰竭心脏捐献者样本;外部微阵列验证队列(GSE26887、GSE42955、GSE79962)及独立RNA-seq验证队列(GSE116250)总计包含多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 849 | 2026-06-26 |
Peripheral B cell immune dysregulation genetically contributes to stage-dependent neuroinflammation and identifies priority therapeutic targets in Parkinson's disease: a computational integration of Mendelian randomization and single-cell transcriptomics
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1853077
PMID:42344507
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研究论文 | 通过整合孟德尔随机化和单细胞转录组学,揭示外周B细胞免疫失调在帕金森病中的遗传贡献及治疗靶点 | 首次将B细胞亚型特异性sc-eQTLs与PD GWAS数据整合,结合多维度计算分析(贝叶斯共定位、伪批量分析、细胞通讯推断和分子对接),系统识别PD的潜在因果基因和治疗靶点 | 结果仅具有假设生成性质,需要实验和临床验证;早期变化基因的表达差异仅在小型探索性队列中观察到;亚群分析中的精细分类与MR暴露类别不等同 | 评估B细胞基因表达的遗传预测是否影响PD风险,并确定候选治疗靶点 | 帕金森病患者的外周B细胞 | 机器学习 | 帕金森病 | 孟德尔随机化、单细胞RNA-seq、贝叶斯共定位、细胞通讯推断、分子对接 | NA | 单细胞转录组数据、GWAS数据 | PD病例33,674例,对照449,056例;10,466个CD19+细胞 | Illumina | 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序用于B细胞亚群精细定位 |
| 850 | 2026-06-26 |
In vivo immune engineering via mRNA therapeutics: reprogramming the post-infarction cardiac microenvironment
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1873905
PMID:42344919
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综述 | 探讨利用mRNA治疗药物在体内进行免疫工程改造,重新编程心肌梗死后的心脏微环境 | 提出整合空间转录组学、性别分层给药策略和多mRNA配方技术的新型框架,旨在实现个性化心脏免疫重编程 | mRNA-LNP技术在缺血组织中的免疫原性挑战,以及从临床转化角度需要解决重复给药策略等问题 | 探索mRNA技术与心脏免疫学的跨学科进展,建立个性化心脏免疫重编程的可行途径 | 心肌梗死后的免疫反应和心脏微环境 | 机器学习 | 心血管疾病 | mRNA技术 | NA | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 851 | 2026-06-26 |
Single-cell transcriptomic insights into the immune heterogeneity of immune checkpoint inhibitors related organ toxicities
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1823949
PMID:42344912
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综述 | 利用单细胞转录组学分析免疫检查点抑制剂相关器官毒性的免疫异质性 | 通过单细胞RNA测序比较免疫检查点抑制剂相关结肠炎和心脏毒性的共享与器官特异性机制,为精准预防和治疗提供新见解 | 作为综述,依赖已有研究,可能覆盖范围有限 | 阐明免疫检查点抑制剂相关结肠炎和心脏毒性的免疫异质性,并探索潜在生物标志物和治疗靶点 | 免疫检查点抑制剂相关的结肠炎和心脏毒性,涉及免疫细胞异质性和分子机制 | 机器学习 | 肺癌, 前列腺癌, 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 852 | 2026-06-26 |
Immunological dynamics in orthotopic compared with subcutaneous murine models of HPV-positive oropharyngeal cancer
2025-12-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052311
PMID:40899264
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术,比较HPV阳性口咽鳞癌原位与皮下小鼠模型的免疫动态,揭示不同模型反映人类肿瘤免疫阶段的准确性 | 首次系统比较了HPV阳性口咽鳞癌皮下与原位小鼠模型在免疫特征和药物反应方面的差异,发现皮下模型更准确反映早期免疫原性阶段,原位模型更匹配晚期免疫排斥阶段 | 未提及具体局限性 | 评估HPV阳性口咽鳞癌小鼠模型在免疫治疗临床前研究中的可靠性 | HPV阳性口咽鳞癌的皮下和原位(舌根)小鼠模型 | 单细胞生物学 | HPV阳性口咽鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 853 | 2026-06-26 |
Cell Type-Specific Expression of Long Noncoding RNAs in Human Diabetic Kidneys Identifies TARID as a Key Regulator of Podocyte Function
2025-11-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0272
PMID:40902080
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研究论文 | 利用单细胞核RNA测序数据识别人类糖尿病肾脏中细胞类型特异性长非编码RNA,并发现TARID在足细胞功能中的关键调控作用 | 首次在单细胞水平上系统分析糖尿病肾病中长非编码RNA的细胞类型特异性表达,并揭示TARID通过调控肌动蛋白细胞骨架重组影响足细胞功能 | NA | 探索长非编码RNA在肾脏细胞类型中的特异性表达及其在糖尿病肾病中的功能 | 人类肾脏样本中的细胞类型,特别是足细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5名健康个体和6名糖尿病肾病患者的肾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 854 | 2026-06-26 |
The involvement of microglia and the CXCL16-CXCR6 axis in the recruitment of CD8+ T cells to an amyloidogenic mouse brain
2025-Oct-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-22137-5
PMID:41174156
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研究论文 | 研究了小胶质细胞和CXCL16-CXCR6轴在招募CD8+ T细胞到淀粉样变性小鼠大脑中的作用 | 揭示了CXCL16-CXCR6轴在AD病理下招募CD8+ T细胞中的潜在作用,并发现PLX5622敏感的小胶质细胞在招募过程中并非必需 | PLX5622处理后,耐药性小胶质细胞或其他脑驻留髓系细胞补偿性表达Cxcl16,可能掩盖了关键机制;未来需体内分析进一步解析机制 | 探究小胶质细胞和CXCL16-CXCR6轴在CD8+ T细胞招募到AD模型小鼠大脑中的作用 | APP/PS1小鼠和野生型小鼠的脑组织,以及体外培养的永生化和原代小鼠细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 公开单细胞RNA测序数据集;APP/PS1小鼠和野生型小鼠;体外永生化和原代细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 855 | 2026-06-26 |
How Single-Cell Transcriptomics of Hydractinia Is Informing the Evolution of Cnidarian Sensory Systems
2025-09-26, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icaf090
PMID:40504553
|
综述 | 利用单细胞转录组学揭示水螅虫感觉系统的进化信息 | 通过构建更新的成年水螅虫群体单细胞转录组图谱,系统研究感觉细胞类型(如刺细胞和神经元)及其基因表达的进化 | 尚未明确说明研究的具体局限性 | 探究水螅虫感觉系统的细胞生物学和进化机制 | 两种水螅虫物种:H. symbiolongicarpus 和 H. echinata 的成年群体 | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 856 | 2026-06-26 |
Shedding Light on Patterns of Unconventional Expression of Opsin Genes in Hydra vulgaris
2025-09-26, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icaf100
PMID:40581592
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研究论文 | 通过分析水螅单细胞RNA测序和染色质可及性数据,揭示了视蛋白基因在神经元和非神经元细胞类型中的非常规表达模式 | 首次系统描绘了刺胞动物水螅中视蛋白基因在非神经元细胞中的广泛表达及其与发育基因的共调控关系 | 基于已发表数据的再分析,可能受限于原始实验的覆盖度和分辨率 | 探究刺胞动物水螅中视蛋白基因的非神经元表达模式及其潜在功能 | 水螅(Hydra vulgaris)的多种细胞类型及其分化状态 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序, 转座酶可及性染色质测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 已发表的水螅单细胞RNA测序和ATAC测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 857 | 2026-06-26 |
Cancer-associated fibroblast-derived extracellular vesicles loaded with GLUT1 inhibitor synergize anti-PD-L1 to suppress tumor growth via degrading matrix stiffness and remodeling tumor microenvironment
2025-09-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2025.113998
PMID:40609836
|
研究论文 | 本研究首次利用癌症相关成纤维细胞来源的细胞外囊泡装载GLUT1抑制剂BAY-876,通过降解基质刚性和重塑肿瘤微环境,协同抗PD-L1治疗抑制肿瘤生长 | 首次将CAFs来源的细胞外囊泡作为药物载体靶向GLUT1高表达的CAFs和肿瘤细胞,实现肿瘤基质特异性治疗以增强免疫检查点抑制剂的疗效 | 未提供明确的局限性信息 | 开发一种靶向肿瘤微环境代谢的联合免疫疗法,通过抑制GLUT1改善基质刚性和免疫抑制状态 | 肺癌细胞系、癌症相关成纤维细胞、小鼠肺癌模型 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 公共数据库中的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 858 | 2026-06-26 |
Spatial transcriptomic profiling of the human aortic valve reveals cellular sex differences near sites of calcification
2025-Aug-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.671175
PMID:40894684
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析人类主动脉瓣,揭示了钙化点附近细胞水平的性别差异 | 首次结合单细胞测序和空间转录组学技术,系统阐明了主动脉瓣钙化部位附近瓣膜间质细胞和巨噬细胞的性别特异性基因表达模式及细胞间互作机制 | 未明确提及研究局限性 | 探究驱动主动脉瓣组织中性别依赖性钙化的潜在细胞机制 | 人类男性和女性主动脉瓣组织 | 机器学习和生物信息学 | 主动脉瓣狭窄 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、RNA荧光原位杂交 | 细胞间通讯分析模型 | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、组织学图像 | 人类主动脉瓣组织样本,分为健康和疾病组,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | NA |
| 859 | 2026-06-26 |
SOX2 regulates foregut squamous epithelial homeostasis and is lost during Barrett's esophagus development
2025-08-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI190374
PMID:40587339
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研究论文 | 研究SOX2在食管鳞状上皮稳态维持中的作用及其在Barrett食管发生过程中的表达丢失 | 首次利用人Barrett食管类器官生物库结合单细胞转录组学和条件性基因敲除小鼠模型,揭示SOX2通过调控分化与增殖平衡影响Barrett食管发生的分子机制 | 未明确SOX2表达丢失的上游调控因素,且仅基于动物模型和体外类器官研究,需进一步在临床样本中验证 | 探究SOX2转录因子在Barrett食管形成中的分子机制及其对食管腺癌发生的影响 | 人Barrett食管类器官、Krt5CreER/+ Sox2Δ/Δ ROSA26tdTomato/+小鼠的鳞状上皮组织 | 机器学习和数字病理学(涉及转录组学分析) | 食管腺癌、Barrett食管 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、CUT&RUN | 类器官模型、条件性基因敲除小鼠模型 | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 人Barrett食管类器官生物库(含多个病例样本)、小鼠组织样本(数量未具体说明) | Illumina | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq(推测,未明确) | NA |
| 860 | 2026-06-26 |
CAF-derived GLUT1 and its role in modulating ovarian cancer progression: a multi-dimensional analysis of the tumor microenvironment
2025-Jul-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08380-6
PMID:40629043
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研究论文 | 揭示卵巢癌中CAF来源的GLUT1通过TGF-β1/p38/MMP2/MMP9通路促进肿瘤进展的机制 | 首次明确CAF中GLUT1通过TGF-β1/p38/MMP2/MMP9通路调控卵巢癌细胞增殖和迁移的代谢-信号串扰机制 | 未提及具体局限性 | 解析卵巢癌微环境中CAF的葡萄糖代谢重编程及其对肿瘤进展的影响 | 卵巢癌相关成纤维细胞(CAFs)及卵巢癌细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、3D生物打印 | NA | 单细胞转录组数据、3D模型图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |