单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8561 - 8580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8561 | 2025-10-07 |
Single-cell atlas reveals multi-faced responses of losartan on tubular mitochondria in diabetic kidney disease
2025-Jan-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06074-5
PMID:39838394
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示氯沙坦对糖尿病肾病肾小管线粒体的多层面保护作用 | 首次利用单细胞测序技术系统描绘氯沙坦治疗对糖尿病肾病肾小管线粒体多维度稳态的调控网络 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，临床样本验证尚属初步阶段 | 探究氯沙坦对糖尿病肾病肾小管线粒体功能的保护机制 | 糖尿病肾病小鼠模型和HK-2人肾小管上皮细胞系 | 单细胞生物学 | 糖尿病肾病 | 单核RNA测序, 基因富集分析, 免疫荧光, 蛋白质印迹, 电子显微镜 | NA | 单细胞转录组数据, 显微镜图像, 蛋白质表达数据 | 小鼠肾脏组织样本和HK-2细胞系 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 8562 | 2025-10-07 |
Uncovering glycolysis-driven molecular subtypes in diabetic nephropathy: a WGCNA and machine learning approach for diagnostic precision
2025-Jan-21, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00601-6
PMID:39838413
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研究论文 | 本研究通过WGCNA和机器学习方法揭示了糖尿病肾病中糖酵解驱动的分子亚型及其诊断价值 | 首次基于糖酵解相关基因对糖尿病肾病进行分子分型，并鉴定出关键诊断标志物 | 研究主要基于公共数据集，需要更多独立队列验证 | 探索糖酵解相关基因在糖尿病肾病中的作用机制和诊断价值 | 糖尿病肾病样本和糖酵解相关基因 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | WGCNA, 机器学习, 单细胞测序, qRT-PCR | XGBoost | 基因表达数据 | 多个GSE数据集（GSE30122, GSE30528, GSE96804, GSE142153） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8563 | 2025-10-07 |
Comprehensive single-cell atlas of colorectal neuroendocrine tumors with liver metastases: unraveling tumor microenvironment heterogeneity between primary lesions and metastases
2025-Jan-21, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02231-y
PMID:39838423
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析结直肠神经内分泌肿瘤肝转移患者的原发灶和转移灶，揭示肿瘤微环境异质性 | 首次对结直肠神经内分泌肿瘤肝转移患者的原发灶和转移灶进行单细胞分析，发现COLEC11+基质癌相关成纤维细胞与转移灶癌细胞的特异性相互作用 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 阐明结直肠神经内分泌肿瘤肝转移患者原发灶和转移灶之间肿瘤微环境的异质性 | 结直肠神经内分泌肿瘤肝转移患者的原发灶和转移灶组织样本 | 数字病理学 | 结直肠神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 多重免疫组织化学/免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据, 蛋白质表达数据 | 结直肠神经内分泌肿瘤肝转移患者的新鲜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8564 | 2025-10-07 |
Unveiling cell-type-specific microRNA networks through alternative polyadenylation in glioblastoma
2025-Jan-21, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-02104-8
PMID:39838429
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据揭示胶质母细胞瘤中替代性多聚腺苷化调控microRNA网络和细胞状态转换的机制 | 首次在胶质母细胞瘤中发现替代性多聚腺苷化作为独立于基因表达变化的调控机制，并构建了细胞类型特异的microRNA-转录因子-靶基因网络 | 研究基于单细胞RNA测序数据的分析，需要进一步实验验证APA调控功能 | 探索胶质母细胞瘤中替代性多聚腺苷化在细胞状态转换和microRNA结合调控中的作用 | 胶质母细胞瘤中的少突胶质前体细胞和CD133+放射状胶质样肿瘤细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8565 | 2025-10-07 |
Orchestrated response from heterogenous fibroblast subsets contributes to repair from surgery-induced stress after airway reconstruction
2025-Jan-21, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.186263
PMID:39836476
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了气管重建术后异质性成纤维细胞亚群在手术应激反应中的协调作用机制 | 首次在气道重建模型中识别了5种功能特异的成纤维细胞亚群及其空间分布特征，揭示了CTHRC1+成纤维细胞在纤维化瘢痕形成中的关键作用 | 研究主要基于动物模型，人类组织的验证仍需进一步研究；单细胞测序技术本身存在技术偏差 | 探究气道重建术后手术应激反应中成纤维细胞的细胞和分子机制 | 气管支气管组织中的成纤维细胞亚群 | 单细胞生物学 | 气道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8566 | 2025-10-07 |
Ribosome profiling and single-cell RNA sequencing identify the unfolded protein response as a key regulator of pigeon lactation
2025-Jan-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 通过核糖体分析和单细胞RNA测序技术，揭示未折叠蛋白反应在鸽子泌乳过程中的关键调控作用 | 首次在鸽子泌乳研究中结合核糖体分析、RNA测序和单细胞转录组测序技术，发现成纤维细胞来源的BAFF信号通过激活未折叠蛋白反应促进分泌上皮细胞的蛋白质生产 | 研究样本仅包含雄性鸽子，未探讨雌性个体的泌乳机制；研究时间点较为有限 | 阐明鸽子泌乳过程的分子机制和细胞动态 | 225日龄未配对非泌乳雄性鸽子（MN）和孵化后第一天开始泌乳的雄性鸽子（ML）的嗉囊组织 | 单细胞生物学 | NA | RNA测序, 核糖体分析, 单细胞转录组测序, RNA荧光原位杂交 | NA | 转录组数据, 单细胞基因表达数据 | 两组雄性鸽子嗉囊组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 核糖体分析, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8567 | 2025-10-07 |
Cross-species single-cell transcriptomics reveals neuronal similarities and heterogeneity in amniote pallium
2025-Jan-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 通过跨物种单细胞转录组学分析羊膜动物大脑皮层的神经元相似性和异质性 | 首次在羊膜动物范围内进行跨物种单细胞转录组比较，揭示了抑制性神经元的保守性和兴奋性神经元的区域分化 | 研究主要基于转录组数据，缺乏功能验证实验 | 探究不同羊膜动物大脑皮层神经元的转录组保守性和物种特异性差异 | 猕猴、人类、小鼠、斑胸草雀、龟类和蜥蜴的大脑皮层组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过130,000个细胞核 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8568 | 2025-10-07 |
Multi-omics analysis and experimental verification reveal testicular fatty acid metabolism disorder in non-obstructive azoospermia
2025-Jan-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 通过多组学分析和实验验证揭示非梗阻性无精子症中睾丸脂肪酸代谢紊乱的机制 | 首次通过多组学方法系统揭示PPARG作为关键转录因子通过调控脂肪酸代谢影响血睾屏障完整性和精子发生 | 基于公共数据库数据，需要进一步实验验证具体分子机制 | 阐明脂肪酸代谢紊乱在非梗阻性无精子症发病机制中的作用 | 非梗阻性无精子症患者的睾丸组织和细胞 | 生物信息学 | 男性不育症 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,代谢组学 | NA | 基因表达数据,代谢物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,代谢组学 | NA | NA |
| 8569 | 2025-10-07 |
Multiomic analysis reveals cellular, transcriptomic and epigenetic changes in intestinal pouches of ulcerative colitis patients
2025-Jan-09, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.11.11.23298309
PMID:38014192
|
研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示溃疡性结肠炎患者肠道储袋的细胞、转录组和表观遗传变化 | 首次构建了回肠储袋的细胞类型解析的转录组和表观遗传图谱，发现了储袋特异性上皮细胞群体 | 样本量较小（6名患者，6名健康对照），仅包含配对活检样本 | 研究溃疡性结肠炎患者回肠储袋的细胞和分子特征 | 溃疡性结肠炎患者的回肠储袋组织和健康个体的末端回肠及升结肠组织 | 单细胞多组学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观遗传数据 | 6名溃疡性结肠炎患者（4男2女），6名健康个体（3男3女） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 8570 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals LEF1-Driven Wnt Pathway Activation as a Shared Oncogenic Program in Hepatoblastoma and Medulloblastoma
2025-Jan-09, Current oncology (Toronto, Ont.)
DOI:10.3390/curroncol32010035
PMID:39851951
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示LEF1驱动的Wnt通路激活是肝母细胞瘤和髓母细胞瘤共有的致癌程序 | 发现LEF1依赖的胚胎程序在两种不同儿科肿瘤中的共同转录激活机制 | NA | 研究肝母细胞瘤和髓母细胞瘤中共享的致癌程序 | 肝母细胞瘤和髓母细胞瘤肿瘤细胞 | 生物信息学 | 儿科肿瘤 | 单细胞RNA测序,多组学数据分析 | ROC曲线分析 | 转录组数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8571 | 2025-10-07 |
Single-Cell Insights Into Cellular Response in Abdominal Aortic Occlusion-Induced Hippocampal Injury
2025-Jan, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70154
PMID:39834143
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究腹主动脉闭塞诱导的海马损伤中的细胞反应 | 首次在单细胞水平揭示腹主动脉闭塞模型中海马区的转录组变化，识别出五种不同的星形胶质细胞亚型 | 研究仅使用雄性C57BL/6小鼠，样本来源单一 | 探究腹主动脉闭塞诱导的缺血再灌注损伤对海马区细胞的分子病理影响 | 雄性C57BL/6小鼠海马组织细胞 | 单细胞转录组学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序，组织学分析，行为学测试 | NA | 单细胞转录组数据，行为学数据 | 62,624个细胞，对应7种细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8572 | 2025-10-07 |
Data-driven model discovery and model selection for noisy biological systems
2025-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012762
PMID:39836686
|
研究论文 | 提出一种数据驱动的混合动力系统框架，用于从噪声生物数据中发现和选择微分方程模型 | 使用混合动力系统和神经网络相结合的方法，能够在高噪声环境下有效发现模型并填补部分已知的系统知识 | 方法主要针对部分已知机制的系统，在完全未知系统的情况下可能受限 | 开发能够处理噪声生物数据的模型发现和选择方法 | 生物系统的动态建模 | 机器学习 | NA | 稀疏识别非线性动力学(SINDy), 神经网络, 稀疏回归 | 混合动力系统, 神经网络 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8573 | 2025-10-07 |
Trajectory inference from single-cell genomics data with a process time model
2025-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012752
PMID:39836699
|
研究论文 | 提出一种基于过程时间模型从单细胞基因组学数据推断轨迹的新方法 | 用具有生物物理意义的过程时间替代传统伪时间概念，提供可识别且有物理意义的轨迹推断 | 过程时间推断具有挑战性，依赖数据集质量和仔细的模型评估 | 从单细胞转录组数据中推断细胞轨迹和动态信息 | 单细胞转录组数据中的异质细胞群体 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞转录组测序 | 过程时间模型(Chronocell) | 基因表达数据 | 多种数据集，从类聚类到连续分布 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8574 | 2025-10-07 |
Exploring Cervical Adenocarcinoma: Epidemiological Insights, Diagnostic and Therapeutic Challenges, and Pathogenetic Mechanisms
2025-Jan, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70620
PMID:39840708
|
综述 | 本文整合了宫颈腺癌的流行病学特征、诊疗挑战及最新研究进展，重点比较了其与鳞状细胞癌在肿瘤微环境特征上的异质性 | 系统比较宫颈腺癌与鳞状细胞癌在肿瘤微环境特征上的显著异质性，并总结了常用临床前模型的优缺点 | 基于文献综述的研究方法，缺乏原始实验数据支持 | 探讨宫颈腺癌的流行病学特征、诊疗挑战及发病机制 | 宫颈腺癌及其与鳞状细胞癌的比较 | 妇科肿瘤学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8575 | 2025-10-07 |
Predicting Outcomes in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Using scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq: A Model Development and Validation Study
2025-Jan, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70617
PMID:39840762
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研究论文 | 基于葡萄糖代谢相关基因开发食管鳞状细胞癌预后预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序筛选出4个葡萄糖代谢关键基因构建预后模型 | 样本量相对有限，需要进一步多中心验证 | 开发ESCC预后预测模型并验证其临床价值 | 食管鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,免疫组化 | 风险预后模型 | 基因表达数据 | GEO数据库8例，TCGA数据库99例，MSKCC中心140例 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 8576 | 2025-10-07 |
Integrated Analysis of Bulk RNA Sequencing, eQTL, GWAS, and Single-Cell RNA Sequencing Reveals Key Genes in Hepatocellular Carcinoma
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70359
PMID:39853609
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研究论文 | 通过整合分析多种组学数据鉴定肝细胞癌中的关键基因SERPING1和STEAP3 | 首次结合bulk RNA测序、eQTL、GWAS和单细胞RNA测序进行综合分析，发现SERPING1和STEAP3基因在肝细胞癌发生发展中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 发现肝细胞癌新的分子靶点用于检测和治疗 | 肝细胞癌(HCC) | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序,eQTL分析,GWAS,单细胞RNA测序,Western blotting,免疫组化,定量PCR | 孟德尔随机化分析,CIBERSORT分析,GSEA分析 | 基因表达数据,基因组数据,单细胞数据 | 三个公共HCC数据集(来自TCGA和GEO) | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8577 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Biomechanical Loading-Induced Imbalance in Bone and Fat, Leading to Ossification in Lumbar Intervertebral Disc Nucleus Pulposus Degeneration
2025-Jan, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31506
PMID:39854079
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示生物力学负荷通过骨-脂肪失衡导致腰椎间盘髓核退变中骨化的机制 | 首次识别出受生物力学负荷影响的CITED4+METRN+髓核软骨细胞亚群，并揭示MIF调控的骨-脂肪平衡在骨化过程中的关键作用 | 样本量较小（5例新鲜组织），部分验证采用回顾性石蜡样本 | 探究生物力学负荷对椎间盘退变中髓核骨化的细胞机制 | 腰椎L3-S1节段髓核组织，包括健康与退变样本 | 单细胞组学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序，组织病理学评估，免疫组织化学，免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 5例新鲜髓核组织，另加回顾性石蜡样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8578 | 2025-10-07 |
Exploring a pico-well based scRNA-seq method (HIVE) for simplified processing of equine bronchoalveolar lavage cells
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0317343
PMID:39854349
|
研究论文 | 评估HIVE™单细胞RNA测序方法在马哮喘支气管肺泡灌洗细胞处理中的应用效果 | 首次将pico-well基础的HIVE™ scRNA-seq技术应用于马支气管肺泡灌洗细胞分析，并发现该方法能检测到先前研究中未表征的嗜酸性粒细胞 | T细胞和巨噬细胞比例与细胞学预期存在偏差，T辅助细胞亚群定义不够清晰，粒细胞和肥大细胞检测数量低于预期 | 评估HIVE单细胞RNA测序方法在马哮喘研究中的应用可行性 | 马哮喘患者的支气管肺泡灌洗细胞 | 单细胞测序 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 马支气管肺泡灌洗细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | HIVE™ | pico-well基础的scRNA-seq技术 |
| 8579 | 2025-10-07 |
Preliminary screening of new biomarkers for sepsis using bioinformatics and experimental validation
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0317608
PMID:39854580
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证筛选脓毒症的新型生物标志物 | 首次通过整合WGCNA、荟萃分析和单细胞测序技术系统筛选出S100A11、QPCT和IFITM2作为脓毒症潜在生物标志物 | 研究样本来源为公共数据库，需要进一步扩大临床样本验证 | 筛选脓毒症的新型生物标志物 | 脓毒症相关RNA和基因 | 生物信息学 | 脓毒症 | 生物信息学分析，qPCR，单细胞测序，WGCNA，GSEA | NA | 基因表达数据，RNA测序数据 | 来自中国国家基因库和多个公共数据库的脓毒症数据 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8580 | 2025-10-07 |
Comprehensive transcriptomic analysis integrating bulk and single-cell RNA-seq with machine learning to identify and validate mitochondrial unfolded protein response biomarkers in patients with ischemic stroke
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1582252
PMID:40313716
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研究论文 | 通过整合bulk和单细胞RNA测序与机器学习方法，识别并验证缺血性卒中患者中线粒体未折叠蛋白反应的生物标志物 | 首次将bulk RNA-seq与单细胞RNA-seq相结合，利用机器学习识别UPRmt相关生物标志物，并通过虚拟敲除实验验证CLEC4D在炎症调节中的功能作用 | 研究样本量有限，主要基于公共数据库数据，需要更大规模临床验证 | 探索线粒体未折叠蛋白反应在缺血性卒中中的机制并识别相关生物标志物 | 缺血性卒中患者和大脑中动脉闭塞模型 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习, RT-qPCR, 免疫浸润分析 | 机器学习 | 基因表达数据 | GSE58294数据集，人类外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |