单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8541 - 8560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8541 | 2025-10-07 |
Integrative proteogenomic analysis identifies COL6A3-derived endotrophin as a mediator of the effect of obesity on coronary artery disease
2025-Feb, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02052-7
PMID:39856218
|
研究论文 | 通过整合蛋白质组学和基因组学分析，发现COL6A3衍生的内脂素是肥胖影响冠状动脉疾病的中介因子 | 首次通过多组学整合分析确定COL6A3衍生的内脂素作为肥胖与冠状动脉疾病关联的关键介质 | 研究主要基于遗传学证据，需要进一步实验验证机制 | 探究肥胖导致心血管代谢疾病的蛋白质中介机制 | 循环蛋白质、冠状动脉疾病、中风和2型糖尿病 | 生物信息学 | 冠状动脉疾病 | 蛋白质组范围孟德尔随机化、共定位分析、表观基因组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、蛋白质组数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8542 | 2025-10-07 |
Single cell approaches define neural stem cell niches and identify microglial ligands that can enhance precursor-mediated oligodendrogenesis
2025-01-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115194
PMID:39823226
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术解析神经干细胞微环境，发现小胶质细胞分泌的配体可促进少突胶质细胞生成 | 首次通过单细胞空间转录组学定义神经干细胞微环境，并鉴定出两种能促进少突胶质细胞生成的小胶质细胞配体 | 研究主要基于动物模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 研究神经干细胞微环境在白质损伤后的变化及其对少突胶质细胞生成的调控机制 | 前脑神经干细胞及其微环境细胞 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 8543 | 2025-10-07 |
Adenosine diphosphate stimulates VEGF-independent choroidal endothelial cell proliferation: A potential escape from anti-VEGF therapy
2025-Jan-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2418752122
PMID:39835893
|
研究论文 | 本研究发现了腺苷二磷酸(ADP)能够独立于VEGF途径刺激脉络膜内皮细胞增殖 | 首次揭示ADP通过P2Y1受体而非VEGF途径促进脉络膜内皮细胞增殖，为抗VEGF治疗逃逸机制提供了新解释 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型，临床转化价值需进一步验证 | 探索组织特异性内皮细胞对普遍代谢物的血管功能反应 | 脉络膜内皮细胞(牛源和人源)、小鼠脉络膜新生血管模型 | 细胞生物学 | 脉络膜新生血管疾病 | 单细胞转录组测序、生化纯化、磷酸化分析 | NA | 基因表达数据、细胞增殖数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8544 | 2025-10-07 |
WWC proteins-mediated compensatory mechanism restricts schwannomatosis driven by NF2 loss of function
2025-Jan-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp4765
PMID:39841844
|
研究论文 | 本研究揭示了WWC蛋白通过补偿机制限制NF2功能缺失导致的神经鞘瘤病，并建立了快速可移植的小鼠模型 | 发现NF2通过招募E3泛素连接酶β-TrCP1/2促进WWC1-3泛素化和降解的机制，并首次构建了完全外显率、短潜伏期的合成小鼠模型 | NA | 研究NF2相关神经鞘瘤病的发病机制并建立有效的临床前研究模型 | 神经鞘瘤细胞、小鼠模型 | 分子生物学 | 神经鞘瘤病 | 单细胞转录组分析、组织学分析、药物筛选 | NA | 基因表达数据、组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8545 | 2025-10-07 |
Tremor in the Age of Omics: An Overview of the Transcriptomic Landscape of Essential Tremor
2025-Jan-24, Cerebellum (London, England)
DOI:10.1007/s12311-025-01793-3
PMID:39853640
|
综述 | 本文综述了原发性震颤的转录组学研究进展，重点关注生物学通路发现和研究前景 | 首次系统总结转录组学在原发性震颤研究中的应用，特别强调轴突导向和钙信号通路的跨研究一致性发现 | 现有研究样本量有限，难以充分揭示疾病临床和病理异质性 | 梳理原发性震颤转录组学研究现状，识别关键生物学通路并探索未来研究方向 | 原发性震颤相关转录组学研究文献 | 自然语言处理 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 8546 | 2025-10-07 |
Specific types of male infertility are correlated with T cell exhaustion or senescence signatures
2025-Jan-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56193-2
PMID:39856063
|
研究论文 | 本研究通过多参数表型分析和单细胞RNA测序揭示了男性不育症与免疫状态之间的关联 | 首次发现不同类型男性不育症具有独特的T细胞耗竭或衰老特征，并揭示不育男性存在与健康老年人类似的促炎症环境 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证；机制性研究尚不充分 | 探讨男性不育症与免疫状态之间的关联机制 | 不育男性的精液和外周血免疫细胞 | 生殖医学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 多参数表型分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表型数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8547 | 2025-10-07 |
Identification of cold tumor induction-related markers in pancreatic cancer and the clinical implication of PCDH7
2025-Jan-24, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-025-06095-z
PMID:39856454
|
研究论文 | 本研究通过识别胰腺癌中与冷肿瘤诱导相关的标志基因，揭示了PCDH7在肿瘤免疫微环境调控和预后评估中的重要作用 | 首次在胰腺癌中系统鉴定冷肿瘤诱导相关基因，并发现PCDH7作为新的预后标志物与CD8+ T细胞浸润负相关 | 研究样本量有限，仅使用10个原代培养物，且机制研究不够深入 | 识别胰腺导管腺癌中与冷肿瘤免疫微环境诱导相关的标志基因 | 胰腺导管腺癌细胞、小鼠模型、人类PDAC样本 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、单细胞数据、组织图像数据 | 10个小鼠PDAC原代培养物，人类PDAC样本 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 8548 | 2025-10-07 |
Insights from the single-cell level: lineage trajectory and somatic-germline interactions during spermatogenesis in dwarf surfclam Mulinia lateralis
2025-Jan-24, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11266-w
PMID:39856558
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了矮蛤精子发生过程中的细胞谱系轨迹和体细胞-生殖细胞相互作用 | 首次在矮蛤中构建了精子发生的单细胞转录组图谱，识别了关键转录因子和细胞间通讯网络 | 研究仅限于矮蛤这一特定物种，结果在其他双壳类动物中的普适性有待验证 | 探究无脊椎动物精子发生的分子机制和关键驱动基因 | 矮蛤睾丸细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析(WGCNA)，伪时间分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 4,600多个睾丸细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8549 | 2025-10-07 |
Inhibition of vascular smooth muscle cell PERK/ATF4 ER stress signaling protects against abdominal aortic aneurysms
2025-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.183959
PMID:39846252
|
研究论文 | 本研究通过抑制血管平滑肌细胞中的PERK/ATF4内质网应激信号通路，探索预防腹主动脉瘤扩张的新策略 | 首次在人类AAA组织单细胞RNA测序中发现PERK/eIF2α/ATF4通路激活，并证实靶向抑制该通路可有效保护VSMC功能并减少AAA扩张 | 研究主要基于动物模型，人类临床应用效果仍需进一步验证 | 探索预防腹主动脉瘤扩张的有效治疗策略 | 血管平滑肌细胞和腹主动脉瘤 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类AAA组织样本和动物模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8550 | 2025-10-07 |
CD34hi subset of synovial fibroblasts contributes to fibrotic phenotype of human knee osteoarthritis
2025-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.183690
PMID:39846253
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人膝关节滑膜组织，鉴定出与骨关节炎病理相关的滑膜细胞亚群 | 首次在单细胞分辨率上识别出CD34hi成纤维细胞亚群与纤维化表型骨关节炎的关联，并发现CD34hiCD70hi成纤维细胞促进Treg增殖的新机制 | 研究样本量有限，机制研究仍需进一步验证 | 鉴定导致骨关节炎病理生理的滑膜细胞亚群 | 人膝关节滑膜组织样本 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,RNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8551 | 2025-10-07 |
SUMOylation of TRIM28 is positively modulated by the BTB/POZ domain of Kaiso
2025-Jan-23, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10257-0
PMID:39847191
|
研究论文 | 本研究揭示了Kaiso蛋白的BTB/POZ结构域在促进TRIM28蛋白SUMO化修饰中的关键作用 | 首次发现Kaiso的BTB/POZ结构域（而非其最接近的同源物ZBTB4）足以有效促进TRIM28的超SUMO化 | 未观察到单个TRIM28结构域在Kaiso存在下的SUMO化，表明TRIM28结构完整性的重要性尚未完全阐明 | 探究Kaiso蛋白中哪些结构元件对TRIM28的超SUMO化是必需的 | TRIM28蛋白和Kaiso蛋白的结构域及其相互作用 | 分子生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8552 | 2025-10-07 |
Heterogeneity analysis and prognostic model construction of HPV negative oral squamous cell carcinoma T cells using ScRNA-seq and bulk-RNA analysis
2025-Jan-23, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01525-6
PMID:39849233
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和bulk-RNA分析，构建了HPV阴性口腔鳞状细胞癌T细胞的异质性分析及预后模型 | 首次在HPV阴性OSCC中系统分析T细胞异质性并建立基于T细胞相关基因的预后风险模型 | 样本量相对有限（14个肿瘤样本和6个正常样本） | 评估HPV阴性口腔鳞状细胞癌中T细胞标记基因表达谱，构建预后风险模型并分析其与免疫治疗反应的相关性 | HPV阴性口腔鳞状细胞癌患者 | 单细胞基因组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, qRT-PCR | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据, bulk RNA测序数据 | 14个HPV阴性OSCC样本和6个正常样本，共28,000个细胞，其中4,635个T细胞 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 8553 | 2025-10-07 |
Consensus representation of multiple cell-cell graphs from gene signaling pathways for cell type annotation
2025-Jan-23, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02128-8
PMID:39849579
|
研究论文 | 提出scMCGraph计算框架，通过整合基因表达和通路活性来准确注释单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 构建基于多个通路数据库的路径特异性视图，并将其整合为共识图用于细胞类型注释 | NA | 开发稳健准确的计算方法用于单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 共识图模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8554 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing highlights the role of distinct natural killer subsets in sporadic amyotrophic lateral sclerosis
2025-Jan-23, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03347-0
PMID:39849490
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了散发性肌萎缩侧索硬化症患者外周血免疫细胞的特征性变化 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究ALS患者外周血免疫细胞在疾病病理生理中的作用 | 样本量相对较小（14例ALS患者和14例健康对照） | 表征ALS患者外周血免疫细胞特征并鉴定与疾病相关的免疫改变 | 14例散发性ALS患者和14例年龄性别匹配的健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞测序分析 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据 | 28例样本（14例ALS患者，14例健康对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8555 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq data augmentation using generative Fourier transformer
2025-Jan-22, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07552-8
PMID:39843603
|
研究论文 | 提出一种无需训练的生成式傅里叶变换器scGFT，用于单细胞RNA测序数据增强 | 开发了首个无需训练、以细胞为中心的生成模型，通过解析机制合成具有天然基因表达谱的单细胞数据 | 未提及具体的数据集规模限制或计算资源需求 | 解决单细胞RNA测序数据稀缺问题，提高统计可靠性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 罕见疾病 | 单细胞RNA测序 | 生成式傅里叶变换器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8556 | 2025-10-07 |
Neutrophil extracellular traps (NETs) are increased in rheumatoid arthritis-associated interstitial lung disease
2025-Jan-22, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03111-1
PMID:39844268
|
研究论文 | 本研究探讨中性粒细胞胞外诱捕网在类风湿关节炎相关间质性肺病中的作用机制 | 首次揭示NR4A3调控NETs形成及其促进肺成纤维细胞分化的机制，并建立基于血浆生物标志物的RA-ILD亚型诊断模型 | 动物模型与人类疾病存在差异，临床样本量有限，未涉及长期干预研究 | 阐明NETs在RA-ILD发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | ZYM诱导的SKG小鼠模型、HL-60细胞、MRC-5细胞、RA-ILD患者血浆样本 | 单细胞测序 | 类风湿关节炎相关间质性肺病 | 单细胞测序, ELISA, ROC曲线分析 | 动物疾病模型 | 单细胞测序数据, 血浆生物标志物数据 | RA-ILD患者分组（RA-NSIP和RA-UIP）及健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8557 | 2025-10-07 |
Identification of glutamine as a potential therapeutic target in dry eye disease
2025-Jan-22, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-02119-1
PMID:39837870
|
研究论文 | 本研究通过代谢重塑策略识别谷氨酰胺作为干眼病的潜在治疗靶点 | 首次发现谷氨酰胺在干眼病治疗中的关键作用，并提出通过抑制GLS1酶增强谷氨酰胺代谢的新策略 | NA | 探索干眼病的代谢治疗新靶点 | 干眼病临床病例和啮齿类动物模型 | NA | 干眼病 | 基质辅助激光解吸/电离质谱成像(MALDI-MSI), 单细胞测序 | NA | 代谢组学数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 8558 | 2025-10-07 |
Multiomic analysis reveals cellular, transcriptomic and epigenetic changes in intestinal pouches of ulcerative colitis patients
2025-Jan-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56212-2
PMID:39837850
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了溃疡性结肠炎患者回肠储袋的细胞、转录组和表观遗传变化 | 首次构建了回肠储袋的细胞类型解析转录组和表观遗传图谱，发现了储袋特异性上皮细胞群 | 样本量较小（6名患者和6名健康对照），且为观察性研究 | 研究溃疡性结肠炎患者回肠储袋的细胞组成和分子特征变化 | 溃疡性结肠炎患者的回肠储袋组织和健康对照的末端回肠及升结肠组织 | 单细胞组学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观遗传数据 | 6名溃疡性结肠炎患者（4男2女）和6名健康个体（3男3女）的配对活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 8559 | 2025-10-07 |
TGF-β signaling orchestrates cancer-associated fibroblasts in the tumor microenvironment of human hepatocellular carcinoma: unveiling insights and clinical significance
2025-Jan-21, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13435-2
PMID:39838288
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肝细胞癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞亚型及其与TGF-β信号的相互作用 | 首次在肝细胞癌中鉴定出两种成纤维细胞亚型，并揭示TGF-β信号在肿瘤细胞与CAFs相互作用中的关键角色 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证；样本量有限 | 探索肝细胞癌肿瘤微环境中TGF-β信号与癌症相关成纤维细胞的相互作用机制 | 肝细胞癌组织样本和肿瘤微环境中的细胞组分 | 肿瘤微环境研究 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 组织图像数据 | 组织微阵列中的肝细胞癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8560 | 2025-10-07 |
Transcriptomic dynamics and cell-to-cell communication during the transition of prospermatogonia to spermatogonia revealed at single-cell resolution
2025-Jan-21, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11244-2
PMID:39838296
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示前精原细胞向精原细胞转变过程中的转录组动态和细胞间通讯 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了前精原细胞向精原细胞转变过程中的基因表达动态，并发现bHLH转录因子在此过程中的关键调控作用 | 研究仅聚焦于小鼠胚胎期和新生期的特定发育阶段，未涵盖整个精子发生过程 | 解析前精原细胞向精原细胞转变的分子调控机制 | 小鼠前精原细胞、精原细胞和睾丸体细胞 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4个发育阶段（E12.5、E17.5、P1、P6）的小鼠睾丸细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |