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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8541 | 2025-10-07 |
Single-cell and Spatial Transcriptomics Illuminate Bat Immunity and Barrier Tissue Evolution
2025-Feb-03, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaf017
PMID:39836373
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学技术研究埃及果蝠免疫系统及屏障组织进化特征 | 首次在蝙蝠中揭示补体系统基因在肺和肠道上皮关键区域的独特高表达模式,并与快速进化的编码序列相关联 | 研究主要聚焦于埃及果蝠,其他蝙蝠物种的免疫特征仍需进一步验证 | 探究蝙蝠对病原体抵抗力的分子机制 | 埃及果蝠的肠道、肺部和血细胞,并与小鼠和人类进行比较 | 单细胞生物学 | 传染病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 埃及果蝠、小鼠和人类的多种组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
8542 | 2025-10-07 |
Cotton2035: From genomics research to optimized breeding
2025-Feb-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.01.010
PMID:39844464
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综述 | 本文回顾棉花基因组学研究进展并展望从基因组学到育种应用的发展路径 | 提出棉花ENCODE项目构想,倡导整合单细胞测序、时空组学与人工智能技术推动棉花育种 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于现有研究进展提出前瞻性观点 | 实现从棉花基因组学研究到优化育种的转化应用 | 棉花(Gossypium)野生与栽培物种 | 植物基因组学 | NA | 单细胞测序、时空组学、基因组编辑、人工智能 | NA | 基因组组装、重测序数据、多组学数据 | 多种棉花种群 | NA | 单细胞测序、时空组学 | NA | NA |
8543 | 2025-10-07 |
Development of BACE2-IN-1/tranylcypromine-based compounds to induce steroidogenesis-dependent neuroprotection
2025-Feb, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.117851
PMID:39837213
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研究论文 | 本研究开发了基于BACE2-IN-1/反苯环丙胺的化合物,通过诱导类固醇生成实现神经保护作用 | 将LSD1抑制剂反苯环丙胺整合到BACE2抑制模板中,并对其进行结构修饰以增强对创伤性脑损伤的治疗效果 | NA | 开发新型神经保护剂以解决创伤性脑损伤未满足的临床需求 | Neuro-2a细胞系和小鼠模型 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序,药物化学设计,行为学测试 | NA | 基因表达数据,行为学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8544 | 2025-10-07 |
Attractor Landscape Analysis Reveals a Reversion Switch in the Transition of Colorectal Tumorigenesis
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412503
PMID:39840939
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研究论文 | 开发了一个名为REVERT的系统框架,通过单细胞转录组数据分析结直肠肿瘤发生过程中的细胞命运转变机制 | 提出了能够重建核心分子调控网络模型并识别逆转开关的系统框架REVERT | NA | 研究结直肠肿瘤发生过程中的细胞命运转变机制 | 患者来源的结肠癌和正常结肠匹配类器官 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | 分子调控网络模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8545 | 2025-10-07 |
IFN-γ reprograms cardiac microvascular endothelial cells to mediate doxorubicin transport and influences the sensitivity of mice to doxorubicin-induced cardiotoxicity
2025-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01389-7
PMID:39843977
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研究论文 | 本研究揭示了IFN-γ通过重编程心脏微血管内皮细胞调节多柔比星转运,影响小鼠对多柔比星诱导心脏毒性的敏感性 | 首次发现IFN-γ信号通路在调节多柔比星心脏毒性敏感性中的关键作用,并阐明其通过上调P-糖蛋白表达促进多柔比星外排的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究多柔比星诱导心脏毒性敏感性差异的分子机制 | 小鼠模型和心脏微血管内皮细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 表面增强拉曼光谱,单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据,光谱数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8546 | 2025-10-07 |
Integrative proteogenomic analysis identifies COL6A3-derived endotrophin as a mediator of the effect of obesity on coronary artery disease
2025-Feb, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02052-7
PMID:39856218
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研究论文 | 通过整合蛋白质组学和基因组学分析,发现COL6A3衍生的内脂素是肥胖影响冠状动脉疾病的中介因子 | 首次通过多组学整合分析确定COL6A3衍生的内脂素作为肥胖与冠状动脉疾病关联的关键介质 | 研究主要基于遗传学证据,需要进一步实验验证机制 | 探究肥胖导致心血管代谢疾病的蛋白质中介机制 | 循环蛋白质、冠状动脉疾病、中风和2型糖尿病 | 生物信息学 | 冠状动脉疾病 | 蛋白质组范围孟德尔随机化、共定位分析、表观基因组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、蛋白质组数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8547 | 2025-10-07 |
Single cell approaches define neural stem cell niches and identify microglial ligands that can enhance precursor-mediated oligodendrogenesis
2025-01-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115194
PMID:39823226
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术解析神经干细胞微环境,发现小胶质细胞分泌的配体可促进少突胶质细胞生成 | 首次通过单细胞空间转录组学定义神经干细胞微环境,并鉴定出两种能促进少突胶质细胞生成的小胶质细胞配体 | 研究主要基于动物模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 研究神经干细胞微环境在白质损伤后的变化及其对少突胶质细胞生成的调控机制 | 前脑神经干细胞及其微环境细胞 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
8548 | 2025-10-07 |
Adenosine diphosphate stimulates VEGF-independent choroidal endothelial cell proliferation: A potential escape from anti-VEGF therapy
2025-Jan-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2418752122
PMID:39835893
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研究论文 | 本研究发现了腺苷二磷酸(ADP)能够独立于VEGF途径刺激脉络膜内皮细胞增殖 | 首次揭示ADP通过P2Y1受体而非VEGF途径促进脉络膜内皮细胞增殖,为抗VEGF治疗逃逸机制提供了新解释 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索组织特异性内皮细胞对普遍代谢物的血管功能反应 | 脉络膜内皮细胞(牛源和人源)、小鼠脉络膜新生血管模型 | 细胞生物学 | 脉络膜新生血管疾病 | 单细胞转录组测序、生化纯化、磷酸化分析 | NA | 基因表达数据、细胞增殖数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8549 | 2025-10-07 |
WWC proteins-mediated compensatory mechanism restricts schwannomatosis driven by NF2 loss of function
2025-Jan-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp4765
PMID:39841844
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研究论文 | 本研究揭示了WWC蛋白通过补偿机制限制NF2功能缺失导致的神经鞘瘤病,并建立了快速可移植的小鼠模型 | 发现NF2通过招募E3泛素连接酶β-TrCP1/2促进WWC1-3泛素化和降解的机制,并首次构建了完全外显率、短潜伏期的合成小鼠模型 | NA | 研究NF2相关神经鞘瘤病的发病机制并建立有效的临床前研究模型 | 神经鞘瘤细胞、小鼠模型 | 分子生物学 | 神经鞘瘤病 | 单细胞转录组分析、组织学分析、药物筛选 | NA | 基因表达数据、组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8550 | 2025-10-07 |
Tremor in the Age of Omics: An Overview of the Transcriptomic Landscape of Essential Tremor
2025-Jan-24, Cerebellum (London, England)
DOI:10.1007/s12311-025-01793-3
PMID:39853640
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综述 | 本文综述了原发性震颤的转录组学研究进展,重点关注生物学通路发现和研究前景 | 首次系统总结转录组学在原发性震颤研究中的应用,特别强调轴突导向和钙信号通路的跨研究一致性发现 | 现有研究样本量有限,难以充分揭示疾病临床和病理异质性 | 梳理原发性震颤转录组学研究现状,识别关键生物学通路并探索未来研究方向 | 原发性震颤相关转录组学研究文献 | 自然语言处理 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
8551 | 2025-10-07 |
Specific types of male infertility are correlated with T cell exhaustion or senescence signatures
2025-Jan-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56193-2
PMID:39856063
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研究论文 | 本研究通过多参数表型分析和单细胞RNA测序揭示了男性不育症与免疫状态之间的关联 | 首次发现不同类型男性不育症具有独特的T细胞耗竭或衰老特征,并揭示不育男性存在与健康老年人类似的促炎症环境 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证;机制性研究尚不充分 | 探讨男性不育症与免疫状态之间的关联机制 | 不育男性的精液和外周血免疫细胞 | 生殖医学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 多参数表型分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表型数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8552 | 2025-10-07 |
Identification of cold tumor induction-related markers in pancreatic cancer and the clinical implication of PCDH7
2025-Jan-24, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-025-06095-z
PMID:39856454
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研究论文 | 本研究通过识别胰腺癌中与冷肿瘤诱导相关的标志基因,揭示了PCDH7在肿瘤免疫微环境调控和预后评估中的重要作用 | 首次在胰腺癌中系统鉴定冷肿瘤诱导相关基因,并发现PCDH7作为新的预后标志物与CD8+ T细胞浸润负相关 | 研究样本量有限,仅使用10个原代培养物,且机制研究不够深入 | 识别胰腺导管腺癌中与冷肿瘤免疫微环境诱导相关的标志基因 | 胰腺导管腺癌细胞、小鼠模型、人类PDAC样本 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、单细胞数据、组织图像数据 | 10个小鼠PDAC原代培养物,人类PDAC样本 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
8553 | 2025-10-07 |
Insights from the single-cell level: lineage trajectory and somatic-germline interactions during spermatogenesis in dwarf surfclam Mulinia lateralis
2025-Jan-24, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11266-w
PMID:39856558
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了矮蛤精子发生过程中的细胞谱系轨迹和体细胞-生殖细胞相互作用 | 首次在矮蛤中构建了精子发生的单细胞转录组图谱,识别了关键转录因子和细胞间通讯网络 | 研究仅限于矮蛤这一特定物种,结果在其他双壳类动物中的普适性有待验证 | 探究无脊椎动物精子发生的分子机制和关键驱动基因 | 矮蛤睾丸细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析(WGCNA),伪时间分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 4,600多个睾丸细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8554 | 2025-10-07 |
Inhibition of vascular smooth muscle cell PERK/ATF4 ER stress signaling protects against abdominal aortic aneurysms
2025-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.183959
PMID:39846252
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研究论文 | 本研究通过抑制血管平滑肌细胞中的PERK/ATF4内质网应激信号通路,探索预防腹主动脉瘤扩张的新策略 | 首次在人类AAA组织单细胞RNA测序中发现PERK/eIF2α/ATF4通路激活,并证实靶向抑制该通路可有效保护VSMC功能并减少AAA扩张 | 研究主要基于动物模型,人类临床应用效果仍需进一步验证 | 探索预防腹主动脉瘤扩张的有效治疗策略 | 血管平滑肌细胞和腹主动脉瘤 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类AAA组织样本和动物模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8555 | 2025-10-07 |
CD34hi subset of synovial fibroblasts contributes to fibrotic phenotype of human knee osteoarthritis
2025-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.183690
PMID:39846253
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人膝关节滑膜组织,鉴定出与骨关节炎病理相关的滑膜细胞亚群 | 首次在单细胞分辨率上识别出CD34hi成纤维细胞亚群与纤维化表型骨关节炎的关联,并发现CD34hiCD70hi成纤维细胞促进Treg增殖的新机制 | 研究样本量有限,机制研究仍需进一步验证 | 鉴定导致骨关节炎病理生理的滑膜细胞亚群 | 人膝关节滑膜组织样本 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,RNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
8556 | 2025-10-07 |
SUMOylation of TRIM28 is positively modulated by the BTB/POZ domain of Kaiso
2025-Jan-23, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10257-0
PMID:39847191
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研究论文 | 本研究揭示了Kaiso蛋白的BTB/POZ结构域在促进TRIM28蛋白SUMO化修饰中的关键作用 | 首次发现Kaiso的BTB/POZ结构域(而非其最接近的同源物ZBTB4)足以有效促进TRIM28的超SUMO化 | 未观察到单个TRIM28结构域在Kaiso存在下的SUMO化,表明TRIM28结构完整性的重要性尚未完全阐明 | 探究Kaiso蛋白中哪些结构元件对TRIM28的超SUMO化是必需的 | TRIM28蛋白和Kaiso蛋白的结构域及其相互作用 | 分子生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8557 | 2025-10-07 |
Heterogeneity analysis and prognostic model construction of HPV negative oral squamous cell carcinoma T cells using ScRNA-seq and bulk-RNA analysis
2025-Jan-23, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01525-6
PMID:39849233
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和bulk-RNA分析,构建了HPV阴性口腔鳞状细胞癌T细胞的异质性分析及预后模型 | 首次在HPV阴性OSCC中系统分析T细胞异质性并建立基于T细胞相关基因的预后风险模型 | 样本量相对有限(14个肿瘤样本和6个正常样本) | 评估HPV阴性口腔鳞状细胞癌中T细胞标记基因表达谱,构建预后风险模型并分析其与免疫治疗反应的相关性 | HPV阴性口腔鳞状细胞癌患者 | 单细胞基因组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, qRT-PCR | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据, bulk RNA测序数据 | 14个HPV阴性OSCC样本和6个正常样本,共28,000个细胞,其中4,635个T细胞 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
8558 | 2025-10-07 |
Consensus representation of multiple cell-cell graphs from gene signaling pathways for cell type annotation
2025-Jan-23, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02128-8
PMID:39849579
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研究论文 | 提出scMCGraph计算框架,通过整合基因表达和通路活性来准确注释单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 构建基于多个通路数据库的路径特异性视图,并将其整合为共识图用于细胞类型注释 | NA | 开发稳健准确的计算方法用于单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 共识图模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8559 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing highlights the role of distinct natural killer subsets in sporadic amyotrophic lateral sclerosis
2025-Jan-23, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03347-0
PMID:39849490
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了散发性肌萎缩侧索硬化症患者外周血免疫细胞的特征性变化 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究ALS患者外周血免疫细胞在疾病病理生理中的作用 | 样本量相对较小(14例ALS患者和14例健康对照) | 表征ALS患者外周血免疫细胞特征并鉴定与疾病相关的免疫改变 | 14例散发性ALS患者和14例年龄性别匹配的健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞测序分析 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据 | 28例样本(14例ALS患者,14例健康对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8560 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq data augmentation using generative Fourier transformer
2025-Jan-22, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07552-8
PMID:39843603
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研究论文 | 提出一种无需训练的生成式傅里叶变换器scGFT,用于单细胞RNA测序数据增强 | 开发了首个无需训练、以细胞为中心的生成模型,通过解析机制合成具有天然基因表达谱的单细胞数据 | 未提及具体的数据集规模限制或计算资源需求 | 解决单细胞RNA测序数据稀缺问题,提高统计可靠性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 罕见疾病 | 单细胞RNA测序 | 生成式傅里叶变换器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |