单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 8541 - 8560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8541 | 2024-09-23 |
Yet uninfected? Resolving cell states of plants under pathogen attack
2023-07-24, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100538
PMID:37533641
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了植物细胞在面对细菌病原体攻击时的异质性反应 | 首次采用单细胞转录组分析方法，深入研究了植物细胞在病原体攻击下的个体细胞反应 | NA | 旨在填补对植物细胞在病原体攻击下个体细胞反应理解的空白 | 植物细胞在细菌病原体攻击下的反应 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 8542 | 2024-09-23 |
A contamination focused approach for optimizing the single-cell RNA-seq experiment
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107242
PMID:37496679
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研究论文 | 本文提出了一种基于污染控制的方法来优化单细胞RNA测序实验 | 引入了一套基于污染的定量指标来更有效地评估数据质量，并通过一系列控制实验展示了减少环境污染的方法 | 文中提到的许多参数在商业平台上难以实现 | 优化单细胞RNA测序实验以减少环境污染 | 单细胞RNA测序数据中的环境污染问题 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 8543 | 2024-09-23 |
p53 Regulates the Extent of Fibroblast Proliferation and Fibrosis in Left Ventricle Pressure Overload
2023-07-21, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.121.320324
PMID:37409456
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研究论文 | 研究p53在左心室压力超负荷下调节成纤维细胞增殖和纤维化的机制 | 揭示了p53通过调控细胞周期控制成纤维细胞积累和ECM分泌的机制 | NA | 探讨p53在心脏成纤维细胞增殖和纤维化中的作用 | 心脏成纤维细胞和ECM | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Tcf21MerCreMer小鼠模型进行研究 |
| 8544 | 2024-09-23 |
Smooth muscle-derived adventitial progenitor cells promote key cell type transitions controlling plaque stability in atherosclerosis in a Klf4-dependent manner
2023-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.18.549539
PMID:37503181
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研究论文 | 研究了血管平滑肌来源的间质前体细胞在动脉粥样硬化中的作用及其对斑块稳定性的影响 | 首次探讨了血管平滑肌来源的间质前体细胞在慢性动脉粥样硬化中的作用，并揭示了Klf4依赖性调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨血管平滑肌来源的间质前体细胞在动脉粥样硬化中的作用及其对斑块稳定性的影响 | 血管平滑肌来源的间质前体细胞及其在动脉粥样硬化中的分化和功能 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | scRNA-Seq, 流式细胞术, 组织学方法 | NA | 细胞 | 小鼠模型 |
| 8545 | 2024-09-23 |
TimiGP: Inferring cell-cell interactions and prognostic associations in the tumor immune microenvironment through gene pairs
2023-07-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101121
PMID:37467716
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研究论文 | 开发了一种名为TimiGP的计算方法，用于推断肿瘤免疫微环境中细胞间相互作用及其与预后的关联 | 提出了TimiGP方法，通过基因对推断细胞间相互作用，揭示免疫细胞相对丰度与预后的关联 | NA | 理解肿瘤微环境中不同免疫细胞类型的预后关联，并开发新的治疗策略 | 肿瘤免疫微环境中的细胞间相互作用及其与预后的关联 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 七个独立的黑色素瘤数据集 |
| 8546 | 2024-09-23 |
HATCHet2: clone- and haplotype-specific copy number inference from bulk tumor sequencing data
2023-Jul-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.13.548855
PMID:37502835
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研究论文 | 介绍了一种名为HATCHet2的新方法，用于从多个肿瘤样本中同时推断单倍型和克隆特异性的拷贝数变异 | 引入了新的统计量mirrored haplotype B-allele frequency (mhBAF)，用于识别不同肿瘤克隆中具有不同亲本单倍型拷贝数的镜像亚克隆拷贝数变异 | NA | 开发一种新方法，从多个肿瘤样本中同时推断单倍型和克隆特异性的拷贝数变异 | 前列腺癌样本中的拷贝数变异 | 数字病理学 | 前列腺癌 | DNA测序 | NA | DNA序列数据 | 50个前列腺癌样本，来自10名患者 |
| 8547 | 2024-09-23 |
A novel cuproptosis-related diagnostic gene signature and differential expression validation in atherosclerosis
2023-Jul-14, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-023-00131-5
PMID:37442861
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研究论文 | 研究探讨了铜死亡相关基因在动脉粥样硬化中的诊断价值和差异表达验证 | 首次报道了铜死亡相关基因FDX1、SLC31A1和GLS在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 揭示铜死亡相关基因在动脉粥样硬化中的分子机制和诊断价值 | 动脉粥样硬化中的铜死亡相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | NA |
| 8548 | 2024-09-23 |
Multiplex enzymatic synthesis of DNA with single-base resolution
2023-07-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi0263
PMID:37418522
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研究论文 | 本文介绍了一种基于酶的多重DNA合成方法，通过单碱基分辨率实现了高度并行的DNA合成 | 本文创新性地使用微机电系统喷墨分配终端脱氧核苷酸转移酶和3'阻断核苷酸，并通过批量滑动洗涤去除3'阻断基团，实现了微尺度空间控制核酸序列和长度 | NA | 开发一种适用于蛋白质工程和空间转录组学等需要高序列多样性的寡核苷酸池或阵列的酶促DNA合成方法 | 酶促DNA合成方法及其在微尺度空间控制核酸序列和长度中的应用 | NA | NA | 酶促DNA合成 | NA | NA | NA |
| 8549 | 2024-09-23 |
Single-Cell RNA Sequencing: Opportunities and Challenges for Studies on Corneal Biology in Health and Disease
2023-07-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12131808
PMID:37443842
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在人类角膜生物学研究中的应用，重点讨论了其在健康和疾病中的机遇与挑战 | 单细胞RNA测序作为一种革命性工具，能够识别角膜组织中的细胞状态 | 目前对角膜中特定细胞类型的各种细胞状态和关键基因的理解尚不充分 | 探讨单细胞RNA测序在角膜生物学研究中的应用及其在健康和疾病中的机遇与挑战 | 人类角膜的细胞状态和关键基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8550 | 2024-09-23 |
Age-related alterations in meningeal immunity drive impaired CNS lymphatic drainage
2023-07-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221929
PMID:37027179
|
研究论文 | 研究揭示了年龄相关的小胶质淋巴管免疫变化如何导致中枢神经系统淋巴引流受损 | 首次证明了年龄相关的小胶质淋巴管免疫变化是导致淋巴引流功能下降的关键因素 | 研究仅在老年小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨年龄相关的小胶质淋巴管功能下降的机制及其潜在治疗策略 | 小胶质淋巴管内皮细胞和免疫细胞 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 老年小鼠的小胶质淋巴管内皮细胞 |
| 8551 | 2024-09-23 |
Drivers of heterogeneity in synovial fibroblasts in rheumatoid arthritis
2023-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01527-9
PMID:37277655
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研究论文 | 研究类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞异质性的驱动因素 | 首次使用配对的单细胞RNA和ATAC测序、多重成像和空间转录组学以及体外细胞外因子信号建模，探讨了类风湿性关节炎患者发炎关节中滑膜成纤维细胞异质性的驱动因素 | 对人类炎症性疾病中移民细胞和常驻细胞类型之间的局部交流理解仍不充分 | 探讨类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞异质性的驱动因素 | 类风湿性关节炎患者发炎关节中的滑膜成纤维细胞 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、ATAC测序、多重成像、空间转录组学 | NA | RNA、ATAC、图像 | NA |
| 8552 | 2024-09-23 |
Efficient Generation of Paired Single-Cell Multiomics Profiles by Deep Learning
2023-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202301169
PMID:37114830
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研究论文 | 本文开发了一种基于深度学习的框架scMOG，用于从实验可用的单细胞RNA-seq数据中生成单细胞转座酶可及染色质（ATAC）数据，反之亦然 | scMOG能够准确地在RNA和ATAC之间进行跨组学生成，并在一种组学实验不可用且超出训练数据集时生成具有生物学意义的配对多组学数据 | NA | 开发一种高效生成配对单细胞多组学数据的方法 | 单细胞RNA和ATAC数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | NA | 单细胞RNA和ATAC数据 | NA |
| 8553 | 2024-09-23 |
Inferring Cell-Cell Communications from Spatially Resolved Transcriptomics Data Using a Bayesian Tweedie Model
2023-06-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14071368
PMID:37510272
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研究论文 | 提出了一种基于贝叶斯Tweedie模型的方法，用于从空间分辨转录组数据中推断细胞间通信 | 提出了BATCOM方法，通过广义线性回归模型估计细胞类型间的通信分数，并考虑了它们之间的距离，提供了通信方向和配体受体相互作用的信息 | NA | 推断细胞间通信并理解生物机制 | 细胞间通信 | 生物信息学 | NA | 空间分辨转录组学 | 贝叶斯Tweedie模型 | 转录组数据 | NA |
| 8554 | 2024-09-23 |
Self-formation of concentric zones of telencephalic and ocular tissues and directional retinal ganglion cell axons
2023-Jun-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.22.533827
PMID:36993285
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研究论文 | 研究报告了人类端脑-眼类器官的自发形成，这些类器官包含沿着中心-周边轴排列的端脑、视神经、视盘和神经视网膜组织 | 首次展示了人类端脑-眼类器官的自发形成，并揭示了视网膜神经节细胞轴突定向生长的机制 | NA | 探讨端脑和眼组织在人类中的协调发育，以及视网膜神经节细胞轴突的定向生长 | 人类端脑、视神经、视盘和神经视网膜组织 | NA | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8555 | 2024-09-23 |
Reciprocal interactions between alveolar progenitor dysfunction and aging promote lung fibrosis
2023-06-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85415
PMID:37314162
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研究论文 | 研究探讨了衰老和肺泡祖细胞功能障碍之间的相互作用如何促进肺纤维化 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了衰老和肺损伤对肺泡上皮细胞基因表达程序的协同影响，并发现了与肺纤维化相关的基因表达特征 | 研究主要基于小鼠模型和IPF患者样本，可能无法完全反映人类肺纤维化的复杂性 | 探讨衰老和肺泡祖细胞功能障碍在肺纤维化中的作用机制 | 肺泡上皮细胞（AEC2s）及其在衰老和肺损伤中的基因表达变化 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠的肺组织样本，IPF患者和健康捐赠者的肺组织样本 |
| 8556 | 2024-09-23 |
RETROFIT: Reference-free deconvolution of cell-type mixtures in spatial transcriptomics
2023-Jun-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.07.544126
PMID:37333291
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研究论文 | 提出了一种名为RETROFIT的无参考贝叶斯方法，用于空间转录组学数据中细胞类型的去卷积 | RETROFIT无需单细胞转录组参考数据，能够生成稀疏且可解释的解决方案，独立于单细胞转录组参考数据进行细胞类型去卷积 | NA | 开发一种无需参考数据的空间转录组学数据细胞类型去卷积方法 | 空间转录组学数据中的细胞类型 | 空间转录组学 | NA | 贝叶斯方法 | NA | 转录组数据 | 合成数据和真实数据，包括Slide-seq和Visium平台的数据 |
| 8557 | 2024-09-23 |
Interleukin-21 Drives a Hypermetabolic State and CD4+ T Cell-associated Pathogenicity in Chronic Intestinal Inflammation
2023-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.02.543518
PMID:37333332
|
研究论文 | 研究IL-21在慢性肠道炎症中驱动CD4+ T细胞相关病原性和高代谢状态的作用 | 首次揭示了IL-21通过影响线粒体-内质网接触位点，导致Treg细胞代谢功能障碍，从而加剧炎症反应 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未在人体内验证 | 探讨细胞代谢在Treg细胞相关肠道稳态中的作用 | Treg细胞在慢性肠道炎症中的代谢功能 | NA | 肠道炎症 | 电子显微镜、共聚焦成像、近端连接分析、免疫印迹、质谱流式细胞术、流式细胞术、代谢组学、基因表达分析、实时代谢分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用了克罗恩病患者的单细胞RNA测序数据和基因修饰的Treg细胞在小鼠结肠炎模型中的应用 |
| 8558 | 2024-09-23 |
CAR T-cell design dependent remodeling of the brain tumor immune microenvironment identify macrophages as key players that inhibit or promote anti-tumor activity
2023-Jun-06, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2972427/v1
PMID:37333156
|
研究论文 | 研究了CAR T细胞设计对脑肿瘤免疫微环境的影响，并识别出巨噬细胞在抑制或促进抗肿瘤活性中的关键作用 | 首次探讨了CAR T细胞设计对脑肿瘤免疫微环境的影响，并揭示了巨噬细胞在抗肿瘤反应中的双重作用 | 研究仅限于特定的B7-H3 CAR T细胞和免疫功能正常的胶质瘤模型 | 探讨CAR T细胞设计对脑肿瘤免疫微环境的影响，以开发更有效的T细胞免疫疗法 | B7-H3特异性CAR T细胞及其在胶质瘤模型中的抗肿瘤活性 | 免疫学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 六个不同设计的B7-H3 CAR T细胞 |
| 8559 | 2024-09-23 |
ENPP1 is an innate immune checkpoint of the anticancer cGAMP-STING pathway
2023-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.01.543353
PMID:37333273
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研究论文 | 本文探讨了ENPP1作为抗癌cGAMP-STING通路的固有免疫检查点的机制 | 发现ENPP1通过抑制cGAMP-STING介导的抗肿瘤免疫和激活免疫抑制性eADO信号来促进乳腺癌的生长和转移 | NA | 研究ENPP1在乳腺癌中的作用及其作为免疫检查点的机制 | ENPP1在乳腺癌中的表达及其对cGAMP-STING通路的影响 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 乳腺癌患者样本 |
| 8560 | 2024-09-23 |
p38MAPKα Stromal Reprogramming Sensitizes Metastatic Breast Cancer to Immunotherapy
2023-06-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-0907
PMID:36883955
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研究论文 | 研究通过抑制p38MAPKα来重编程转移性乳腺癌的肿瘤微环境，增强免疫疗法的效果 | 首次展示了p38MAPKα抑制剂与OX40激动剂联合使用在减少转移性生长和提高总体生存率方面的协同作用 | 研究主要在动物模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 探索通过重编程肿瘤微环境来提高转移性乳腺癌对免疫疗法的敏感性 | 转移性乳腺癌及其肿瘤微环境 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |