单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
8481	2024-09-22	Deciphering breast cancer dynamics: insights from single-cell and spatial profiling in the multi-omics era 2024-Sep-18, Biomarker research IF:9.5Q1 DOI:10.1186/s40364-024-00654-1 PMID:39294728	研究论文	本文综述了单细胞测序和空间组学技术在乳腺癌研究中的应用及其最新进展	介绍了单细胞测序和空间组学技术在乳腺癌研究中的创新应用，提供了对恶性肿瘤生物行为的全面见解	NA	探讨乳腺癌的发病机制和肿瘤异质性，以及这些技术在临床诊断和治疗中的应用	乳腺癌的单细胞和空间组学数据	数字病理学	乳腺癌	单细胞测序	NA	单细胞和空间组学数据	NA
8482	2024-09-22	Tumor endothelium-derived PODXL correlates with immunosuppressive microenvironment and poor prognosis in cervical cancer patients receiving radiotherapy or chemoradiotherapy 2024-Sep-18, Biomarker research IF:9.5Q1 DOI:10.1186/s40364-024-00655-0 PMID:39294825	研究论文	研究探讨了宫颈癌患者接受放疗或放化疗后，肿瘤内皮细胞来源的PODXL蛋白与免疫抑制微环境和预后的关系	首次揭示了PODXL在宫颈癌肿瘤内皮细胞中的表达，并探讨了其在放疗或放化疗后的作用及其对患者预后的影响	研究样本量有限，且仅限于接受放疗或放化疗的宫颈癌患者	探讨PODXL在宫颈癌中的表达及其对患者预后的影响	宫颈癌患者及其肿瘤内皮细胞	数字病理学	宫颈癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	180例免疫染色数据，29,453个单细胞RNA测序数据，187例宫颈癌样本的批量RNA测序数据
8483	2024-09-22	UnTWISTing intestinal fibrosis: single-cell transcriptomics deciphers fibroblast heterogeneity, uncovers molecular pathways, and identifies therapeutic targets 2024-Sep-17, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI184112 PMID:39286981	研究论文	本研究利用单细胞转录组测序技术揭示了肠道纤维化过程中成纤维细胞的异质性，并发现了关键的分子通路和治疗靶点	本研究首次鉴定了TWIST1+FAP+成纤维细胞亚群及其与CXCL9+巨噬细胞的相互作用，揭示了TWIST1在纤维化微环境中的核心调控作用	NA	揭示肠道纤维化的分子机制并寻找潜在的治疗靶点	肠道纤维化中的成纤维细胞和巨噬细胞	数字病理学	炎症性肠病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
8484	2024-09-22	S100A9 and HMGB1 orchestrate MDSC-mediated immunosuppression in melanoma through TLR4 signaling 2024-Sep-11, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-009552 PMID:39266214	研究论文	研究探讨了S100A9和HMGB1通过TLR4信号传导在黑色素瘤中调控MDSC介导的免疫抑制的作用	揭示了TLR4和RAGE信号在将单核细胞转化为MDSC样细胞中的关键作用，并提出了靶向S100A9以防止这种转化的潜力	NA	研究TLR4和RAGE信号及其配体S100A9和HMGB1在黑色素瘤中MDSC介导的免疫抑制中的作用	MDSC、单核细胞、TLR4信号、RAGE信号、S100A9、HMGB1	NA	黑色素瘤	ELISA、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA数据	来自晚期黑色素瘤患者的外周血MDSC和健康供体来源的单核细胞
8485	2024-09-22	Binomial models uncover biological variation during feature selection of droplet-based single-cell RNA sequencing 2024-Sep, PLoS computational biology IF:3.8Q1 DOI:10.1371/journal.pcbi.1012386 PMID:39241106	研究论文	本文提出了一种名为“差异分布基因”（DDGs）的简单特征选择模型，用于区分单细胞RNA测序数据中的技术噪声和生物变异	提出的DDG模型在区分真实生物变异基因、减少邻域失真和准确划分细胞类型方面优于现有方法	NA	区分单细胞RNA测序数据中的技术噪声和生物变异	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	二项式模型	基因表达数据	NA
8486	2024-09-22	Single-cell RNA sequencing reveals melanoma cell state-dependent heterogeneity of response to MAPK inhibitors 2024-Sep, EBioMedicine IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105308 PMID:39216232	研究论文	研究使用单细胞RNA测序技术分析黑色素瘤细胞在MAPK抑制剂治疗下的状态依赖性异质性反应	引入了一种综合计算方法来识别不同转录细胞状态下的响应和非响应黑色素瘤细胞	NA	研究黑色素瘤细胞在MAPK抑制剂治疗下的反应和耐药性	免疫治疗前和免疫治疗抵抗的黑色素瘤肿瘤	数字病理学	黑色素瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
8487	2024-09-21	UBAP2 contributes to radioresistance by enhancing homologous recombination through SLC27A5 ubiquitination in hepatocellular carcinoma 2024-Dec, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167481 PMID:39186963	研究论文	研究UBAP2通过增强SLC27A5的泛素化促进同源重组，从而在肝细胞癌中导致放射抵抗的机制	首次揭示UBAP2通过泛素-蛋白酶体系统降解抗肿瘤基因SLC27A5，减少同源重组相关基因RAD51的表达，从而在肝细胞癌中产生放射抵抗	NA	探讨放射抵抗的机制，为肝细胞癌的治疗提供新的选择	肝细胞癌中的放射抵抗机制	NA	肝细胞癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	转录组数据	NA
8488	2024-09-21	CD36-mediated accumulation of MDSCs exerts abscopal immunosuppressive responses in hepatocellular carcinoma after insufficient microwave ablation 2024-Dec, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167493 PMID:39233261	研究论文	研究微波消融不足后肝细胞癌远处未消融肿瘤的免疫微环境变化	发现CD36介导的MDSCs积累在微波消融不足后肝细胞癌的远处未消融肿瘤中引起免疫抑制反应，并提出CD36抑制剂作为新的免疫治疗靶点	研究样本量较小，仅包括两名患者	阐明微波消融不足后肝细胞癌远处未消融肿瘤的免疫微环境	肝细胞癌患者及小鼠模型的远处未消融肿瘤	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序、多色免疫荧光、RNA测序和流式细胞术	NA	单细胞RNA测序数据	两名患者及小鼠模型
8489	2024-09-21	Imaging macular carotenoids and their related proteins in the human retina with confocal resonance Raman and fluorescence microscopy 2024-Oct, Experimental eye research IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.exer.2024.110043 PMID:39151780	研究论文	研究使用共聚焦共振拉曼和荧光显微镜成像人视网膜黄斑中的类胡萝卜素及其相关蛋白	首次使用共聚焦共振拉曼显微镜结合荧光模式，研究了人黄斑中十二种已知的类胡萝卜素相关蛋白的分布	研究仅限于黄斑区域，未涉及视网膜其他部分	探讨类胡萝卜素及其相关蛋白在人视网膜黄斑中的分布和作用	人视网膜黄斑中的类胡萝卜素及其相关蛋白	NA	NA	共聚焦共振拉曼显微镜、荧光显微镜、Western blot分析、单细胞RNA测序	NA	图像、蛋白质表达数据、基因表达数据	NA
8490	2024-09-21	Single-Cell RNA-Sequencing of Soybean Reveals Transcriptional Changes and Antiviral Functions of GmGSTU23 and GmGSTU24 in Response to Soybean Mosaic Virus 2024-Sep-20, Plant, cell & environment DOI:10.1111/pce.15164 PMID:39301882	研究论文	研究通过单细胞RNA测序揭示大豆在响应大豆花叶病毒感染时GmGSTU23和GmGSTU24的转录变化及其抗病毒功能	首次通过单细胞RNA测序技术在大豆中研究大豆花叶病毒感染后的转录变化，并发现GmGSTU23和GmGSTU24在抗病毒反应中的重要作用	研究仅限于大豆和烟草的实验，未涉及其他植物或病毒	深入理解大豆在响应大豆花叶病毒感染时的转录网络变化及其抗病毒机制	大豆的表皮细胞、叶肉细胞和维管细胞	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	50,294个原生质体
8491	2024-09-21	Molecular pathology, developmental changes and synaptic dysfunction in (pre-) symptomatic human C9ORF72-ALS/FTD cerebral organoids 2024-Sep-18, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1 DOI:10.1186/s40478-024-01857-1 PMID:39289761	研究论文	研究了C9ORF72基因突变相关的ALS/FTD患者及其无症状携带者的脑类器官模型，揭示了分子病理、发育变化和突触功能障碍	首次在脑类器官模型中观察到C9ORF72-ALS/FTD患者的分子病理和发育变化，并检测到突触结构和功能的改变	研究仅限于脑类器官模型，未能完全模拟人类大脑的复杂性	揭示C9ORF72-ALS/FTD早期病理变化，为理解疾病发病机制和设计治疗策略提供依据	C9ORF72-ALS/FTD患者及其无症状携带者的脑类器官模型	数字病理学	肌萎缩侧索硬化症	单细胞RNA测序、膜片钳电生理学	NA	细胞	C9-ALS/FTD患者、无症状C9ORF72-HRE携带者和对照组的脑类器官模型
8492	2024-09-21	Iron chelation as a new therapeutic approach to prevent senescence and liver fibrosis progression 2024-Sep-17, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-07063-0 PMID:39289337	研究论文	研究探讨了铁螯合剂在预防衰老和肝纤维化进展中的作用	首次探讨了铁过载与细胞衰老在肝纤维化中的机制联系，并验证了铁螯合剂在预防肝纤维化和细胞衰老中的效果	铁螯合剂对不同诱导剂引起的衰老和激活标记的影响有限	探讨铁过载与细胞衰老在肝纤维化中的机制联系，并验证铁螯合剂的治疗潜力	肝纤维化模型中的铁积累、细胞衰老及相关基因表达	NA	肝病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	包括CCl处理的小鼠、人肝细胞HH4细胞和肝星状细胞LX-2细胞
8493	2024-09-21	High ratio of resident to exhausted CD4 + T cells predicts favorable prognosis and potentially better immunotherapeutic efficacy in hepatocellular carcinoma 2024-Sep-17, BMC cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12885-024-12916-0 PMID:39289669	研究论文	研究探讨了肝细胞癌中肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）的驻留和耗竭状态对预后和免疫治疗效果的影响	首次揭示了驻留与耗竭CD4+ T细胞比例在肝细胞癌中的独立预后价值，并发现SASS6基因作为免疫荒漠亚型的关键预测因子	研究主要基于单细胞RNA测序数据，未来需进一步验证临床样本中的发现	探讨肝细胞癌中肿瘤浸润淋巴细胞的驻留和耗竭状态对预后和免疫治疗效果的影响	肝细胞癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞及其驻留和耗竭状态	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	未明确具体数量
8494	2024-09-21	Dual role of targeting NAE1 in nasopharyngeal carcinoma: Antitumor effects yet inducing radiotherapy resistance 2024-Sep-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37219 PMID:39296043	研究论文	研究NAE1在鼻咽癌中的双重作用，即抑制肿瘤生长但增加放疗抵抗性	首次探讨了NAE1抑制剂MLN4924在鼻咽癌中的双重作用，即抑制肿瘤生长同时增加放疗抵抗性	研究主要集中在体外和体内实验，缺乏更大规模的临床试验验证	探讨NAE1在鼻咽癌中的作用及其对放疗敏感性的影响	鼻咽癌细胞及其对放疗的敏感性	数字病理学	鼻咽癌	单细胞RNA测序和批量RNA测序	机器学习模型	RNA	体外和体内实验样本
8495	2024-09-21	Single-cell transcriptomics reveals the cellular identity of a novel progenitor population crucial for murine neural tube closure 2024-Sep-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37259 PMID:39296075	研究论文	通过单细胞转录组学揭示了在小鼠神经管闭合中起关键作用的新型前体细胞群体的细胞身份	发现了在神经管闭合过程中起关键作用的新型前体细胞群体，并揭示了其细胞身份	NA	研究小鼠神经管闭合过程中关键的前体细胞群体	小鼠神经管闭合过程中的前体细胞群体	单细胞转录组学	脊柱裂	单细胞转录组学	NA	转录组数据	E8.5时期的小鼠神经管前体细胞群体
8496	2024-09-21	Neutrophil extracellular trap genes predict immunotherapy response in gastric cancer 2024-Sep-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37357 PMID:39296112	研究论文	研究探讨了中性粒细胞外陷阱（NET）相关基因在胃癌（GC）中的表达模式及其与临床病理特征、预后、肿瘤微环境（TME）特征和免疫治疗疗效的关系	首次构建了NET相关基因特征，并验证了其在预测胃癌免疫治疗反应中的高准确性	NA	研究NET相关基因在胃癌中的表达及其与免疫治疗反应的关系	胃癌患者的中性粒细胞外陷阱相关基因表达	数字病理学	胃癌	转录组测序和单细胞RNA测序	LASSO回归	基因表达数据	共1033例胃癌样本，来自TCGA-STAD（415例）、GSE62254（300例）、GSE15459（192例）和GSE183904（26例）
8497	2024-09-21	Performance comparison of high throughput single-cell RNA-Seq platforms in complex tissues 2024-Sep-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37185 PMID:39296129	研究论文	本文系统比较了两种高吞吐量的3'-scRNAseq平台（10× Chromium和BD Rhapsody）在复杂肿瘤组织中的性能	首次全面比较了10× Chromium和BD Rhapsody在复杂肿瘤组织中的性能，并探讨了它们在不同条件下的表现差异	研究仅限于两种平台，未涵盖所有scRNAseq系统	比较不同单细胞RNA测序平台在复杂组织中的性能	10× Chromium和BD Rhapsody平台在肿瘤组织中的性能	单细胞测序	NA	单细胞RNA测序（scRNAseq）	NA	基因表达数据	来自同一肿瘤的新鲜和人工损伤样本
8498	2024-09-21	The contribution of adiponectin to diabetic retinopathy progression: Association with the AGEs-RAGE pathway 2024-Sep-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36111 PMID:39296166	研究论文	研究探讨了脂联素在糖尿病视网膜病变进展中的作用及其与AGEs-RAGE通路的关系	首次揭示了脂联素在AGEs-RAGE轴中的中心作用，并通过scRNA-seq和ELISA验证了其在糖尿病视网膜病变进展中的关键角色	研究样本量较小，且仅限于特定人群和动物模型，可能影响结果的普适性	阐明脂联素在糖尿病视网膜病变进展中的分子机制	脂联素及其在AGEs-RAGE轴中的作用	生物信息学	糖尿病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、ELISA	NA	基因表达数据	31名患者和11名对照组受试者，以及小鼠模型
8499	2024-09-21	Ferrostatin-1 alleviates skin inflammation and inhibits ferroptosis of neutrophils and CD8+ T cells in allergic contact dermatitis 2024-Aug-29, Journal of dermatological science IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.jdermsci.2024.08.004 PMID:39299894	研究论文	研究了铁死亡在过敏性接触性皮炎中的作用及Ferrostatin-1对其的抑制效果	首次揭示了铁死亡在过敏性接触性皮炎中的作用，并证明了Ferrostatin-1对中性粒细胞和CD8+ T细胞铁死亡的抑制作用	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证	探讨铁死亡在过敏性接触性皮炎中的作用及Ferrostatin-1的治疗效果	过敏性接触性皮炎中的铁死亡现象及Ferrostatin-1的作用	NA	皮肤炎症	单细胞RNA测序	NA	RNA	使用1-氯-2,4-二硝基氯苯诱导的过敏性接触性皮炎小鼠模型
8500	2024-09-21	Identification of Siglec-10 as a new dendritic cell checkpoint for cervical cancer immunotherapy 2024-Aug-28, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-009404 PMID:39209455	研究论文	研究揭示了Siglec-10在宫颈癌免疫治疗中的新作用，作为树突状细胞的检查点	首次发现Siglec-10作为宫颈癌中树突状细胞的抑制性检查点，并提出靶向Siglec-10可能是宫颈癌免疫治疗的新途径	NA	揭示宫颈癌微环境与先天免疫细胞之间的相互作用，寻找潜在的治疗策略	宫颈癌患者的单细胞RNA测序数据和原发性肿瘤样本	数字病理学	宫颈癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	宫颈癌患者的原发性肿瘤样本