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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8481 | 2025-10-07 |
Accelerating Single-Cell Sequencing Data Analysis with SciDAP: A User-Friendly Approach
2024-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582604
PMID:38464095
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研究论文 | 介绍用于加速单细胞测序数据分析的用户友好平台SciDAP | 开发了基于通用工作流语言(CWL)的可移植和可重复分析流程,为非计算专业的生物学家提供单细胞数据分析解决方案 | 未提及平台在处理特定数据类型或大规模数据集时的性能限制 | 解决单细胞测序数据分析的复杂性和可重复性问题 | 单细胞RNA测序、ATAC测序和多组学测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、单细胞多组学测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | SciDAP | 基于通用工作流语言(CWL)的科学数据分析平台 |
8482 | 2025-10-07 |
The Mas-related G protein-coupled receptor d (Mrgprd) mediates pain hypersensitivity in painful diabetic neuropathy
2024-May-01, Pain
IF:5.9Q1
DOI:10.1097/j.pain.0000000000003120
PMID:38147415
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现Mrgprd在糖尿病神经痛模型中的关键作用,并证实其介导疼痛过敏的机制 | 首次揭示Mrgprd在疼痛性糖尿病神经病变中通过增强背根神经节伤害感受器兴奋性介导神经病理性疼痛的新机制 | 研究仅限于高脂饮食小鼠模型,尚未在人类样本或临床环境中验证 | 探索疼痛性糖尿病神经病变中背根神经节伤害感受器超兴奋性的分子机制 | 高脂饮食诱导的疼痛性糖尿病神经病变小鼠模型的背根神经节神经元 | 神经科学 | 糖尿病神经病变 | 单细胞RNA测序, 体内钙成像 | NA | 基因表达数据, 钙信号数据 | 高脂饮食小鼠模型的背根神经节组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8483 | 2025-10-07 |
ALDH2 as an immunological and prognostic biomarker: Insights from pan-cancer analysis
2024-Apr-19, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037820
PMID:38640328
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研究论文 | 通过泛癌分析揭示ALDH2作为免疫和预后生物标志物的潜力 | 首次在泛癌水平系统分析ALDH2表达与免疫细胞浸润的关联 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 评估ALDH2在泛癌中的生物学意义和临床价值 | 多种癌症类型和正常组织 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 单细胞测序、免疫组化染色、生物信息学分析 | 多种算法(EPIC, MCPCOUNTER, TIDTIMER, xCell, CIBERSORT, quanTIseq) | 基因组数据、表达数据、临床数据 | TCGA等多数据库的泛癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8484 | 2024-08-07 |
A prognostic risk prediction model based on ferroptosis-related long non-coding RNAs in bladder cancer: A bulk RNA-seq research and scRNA-seq validation: Erratum
2024-Mar-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037547
PMID:38489743
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
8485 | 2025-10-07 |
Bitter taste receptors in the reproductive system: Function and therapeutic implications
2024-02, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31179
PMID:38219077
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综述 | 本文综述了苦味受体在生殖系统中的功能及其治疗潜力 | 系统总结了苦味受体在生殖系统各组织中的非味觉功能,并提出了其在生殖疾病治疗中的新策略 | 缺乏遗传学和功能学研究证据 | 探讨苦味受体在生殖系统中的功能及治疗应用前景 | 人类和小鼠生殖系统组织及细胞 | 生殖医学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8486 | 2025-10-07 |
Single-Cell Mapping of Large and Small Arteries During Hypertensive Aging
2024-02-01, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glad188
PMID:37531301
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了高血压衰老过程中大、小动脉的细胞图谱,系统解析了血管壁细胞多样性和动态通讯变化 | 首次从血管衰老、高血压和血管类型三个维度整合12个数据集,系统描绘高血压衰老过程中血管细胞组成变化和细胞间通讯网络 | 研究仅使用雄性Wistar Kyoto大鼠和自发性高血压大鼠,未涉及雌性模型;样本量相对有限 | 解析高血压与衰老在血管系统中的相互作用机制 | 雄性Wistar Kyoto大鼠和自发性高血压大鼠的主动脉、股动脉和肠系膜动脉 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自16周和72周龄大鼠的12个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8487 | 2025-10-07 |
Genetic variation in IL-4 activated tissue resident macrophages alters the epigenetic state to determine strain specific synergistic responses to LPS
2024-Jan-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3759654/v1
PMID:38712032
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研究论文 | 本研究探讨了C57BL/6和BALB/c小鼠品系中组织驻留巨噬细胞对IL-4激活的差异表观遗传反应及其对LPS协同响应的影响 | 首次揭示遗传背景通过改变IL-4诱导的表观遗传重编程决定巨噬细胞对LPS的品系特异性协同反应 | 研究仅限于腹膜腔组织驻留巨噬细胞,未涉及其他组织来源的巨噬细胞 | 解析遗传变异如何影响巨噬细胞整合多重刺激的表观遗传机制 | C57BL/6和BALB/c小鼠品系的腹膜腔组织驻留巨噬细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 表观基因组分析 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 两个小鼠品系的组织驻留巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8488 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics and chromatin accessibility profiling elucidate the kidney-protective mechanism of mineralocorticoid receptor antagonists
2024-01-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI157165
PMID:37906287
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和染色质可及性分析揭示盐皮质激素受体拮抗剂的肾脏保护机制 | 首次结合单细胞表达和染色质可及性工具系统阐明盐皮质激素在肾脏中的靶基因和细胞类型,并比较不同降压药物的肾脏保护效果 | 研究基于大鼠模型,人类样本验证尚不充分 | 探究盐皮质激素受体拮抗剂在高血压相关肾脏疾病中的保护机制 | 大鼠肾脏细胞及人类肾脏样本 | 单细胞多组学 | 肾脏疾病 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性分析 | NA | 单细胞基因表达数据, 染色质可及性数据 | 大鼠模型及人类肾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
8489 | 2025-10-07 |
Tuberculous meningitis diagnosis and treatment: classic approaches and high-throughput pathways
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1543009
PMID:39867878
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综述 | 本文综述结核性脑膜炎的经典诊断治疗方法及高通量技术新途径 | 系统评估核酸检测、宏基因组测序和单细胞测序等新兴技术,探索代谢组学和蛋白质组学生物标志物的诊断潜力 | NA | 优化结核性脑膜炎诊断策略并推动多组学技术的临床转化 | 结核性脑膜炎的诊断和治疗技术 | NA | 结核性脑膜炎 | 核酸检测、宏基因组下一代测序、单细胞测序、代谢组学、蛋白质组学 | NA | 基因组数据、代谢组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 宏基因组下一代测序, 单细胞测序 | Xpert Ultra | NA |
8490 | 2025-10-07 |
Infiltrating lipid-rich macrophage subpopulations identified as a regulator of increasing prostate size in human benign prostatic hyperplasia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494476
PMID:39867899
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了良性前列腺增生中富含脂质的巨噬细胞亚群,并探讨其与前列腺体积增大的关系 | 首次在良性前列腺增生中鉴定出TREM2高表达和MARCO高表达两种新型巨噬细胞亚群,揭示了脂质代谢重编程在巨噬细胞表型转变中的关键作用 | 样本量相对有限,需要进一步研究验证这些巨噬细胞亚群作为治疗靶点的潜力 | 探究巨噬细胞表型变化与良性前列腺增生发展的关系 | 人类良性前列腺增生组织中的CD45+过渡区白细胞 | 单细胞生物学 | 前列腺增生 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 20例人类前列腺组织(10例大于90克,10例小于40克) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8491 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis of medaka lymphocytes reveals absence of fully mature T cells in the thymus and the T-lineage commitment in the kidney
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1517467
PMID:39867910
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析比较野生型和突变型青鳉淋巴细胞,揭示其T细胞发育的独特特征 | 首次在青鳉中发现胸腺中缺乏完全成熟的T细胞,并在肾脏中鉴定出已定向T系发育的淋巴祖细胞 | 研究仅聚焦于青鳉和斑马鱼的比较,未涵盖其他硬骨鱼物种 | 探究硬骨鱼类淋巴细胞发育的分子和细胞机制差异 | 青鳉(野生型和V(D)J重组缺陷突变型)的胸腺和肾脏淋巴细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型和突变型青鳉的胸腺和肾脏淋巴细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8492 | 2025-10-07 |
Identification of a pancreatic stellate cell gene signature and lncRNA interactions associated with type 2 diabetes progression
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1532609
PMID:39872314
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研究论文 | 本研究通过识别胰腺星状细胞基因特征和lncRNA相互作用,揭示了2型糖尿病进展的新机制 | 首次发现COL1A2hi/VCANhi/SULF1hi胰腺星状细胞特异性特征及其在2型糖尿病中的独特作用,并构建了相关的lncRNA-mRNA调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证 | 探索2型糖尿病中胰腺星状细胞的基因表达特征及其通过lncRNA-mRNA相互作用在疾病进展中的调控机制 | 2型糖尿病患者的胰岛细胞、胰腺星状细胞和外周血单个核细胞 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个2型糖尿病和1型糖尿病数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
8493 | 2025-10-07 |
Identification and validation of BATF as a prognostic biomarker and regulator of immune cell infiltration in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1429855
PMID:39872530
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,发现BATF是急性髓系白血病中免疫细胞浸润的调节因子和预后生物标志物 | 首次系统揭示BATF在AML中的预后价值及其通过调节CD8+T细胞和NK细胞比例影响免疫细胞浸润的新机制 | 研究主要基于公共数据库和细胞系实验,需要更多临床样本验证BATF的临床应用价值 | 探索BATF在急性髓系白血病中的预后价值和免疫调节作用 | 急性髓系白血病患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA-seq, qRT-PCR, Western blotting, 流式细胞术, 单细胞测序 | C1498小鼠AML模型 | 基因组数据, 临床数据, 实验数据 | TCGA-LAML和GEO(GSE37642)数据库样本 | NA | 单细胞测序, RNA-seq | NA | NA |
8494 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq reveals immune cell heterogeneity and increased Th17 cells in human fibrotic skin diseases
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522076
PMID:39872534
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示纤维化皮肤疾病中免疫细胞的异质性及Th17细胞增加现象 | 首次通过CD45+免疫细胞富集构建纤维化皮肤疾病的单细胞图谱,发现Th17细胞通过IL-17A促进瘢痕疙瘩成纤维细胞功能 | 研究样本量有限,仅针对瘢痕疙瘩等特定纤维化皮肤疾病 | 探究纤维化皮肤疾病中免疫细胞的细胞景观和Th17细胞的作用机制 | 瘢痕疙瘩和正常瘢痕组织中的CD45+免疫细胞及成纤维细胞 | 单细胞测序分析 | 纤维化皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 荧光激活细胞分选, Ki-67染色, 划痕实验, 实时PCR, Western blotting | NA | 单细胞基因表达数据 | 瘢痕疙瘩和正常瘢痕组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8495 | 2025-10-07 |
Upregulation of interferon-γ response genes in monocytes and T cells identified by single-cell transcriptomics in patients with anti-citrullinated peptide antibody-positive early rheumatoid arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1439082
PMID:39877346
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析比较了ACPA阳性和阴性早期类风湿关节炎患者的免疫系统差异 | 首次在单细胞水平揭示了ACPA+早期RA患者中干扰素-γ反应基因在单核细胞和T细胞中的普遍上调 | 样本量相对有限,仅分析了37,318个细胞 | 探究ACPA阳性和阴性早期类风湿关节炎患者的免疫系统差异 | 抗瓜氨酸肽抗体阳性和阴性的早期类风湿关节炎患者 | 单细胞转录组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序,多重细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据,血清细胞因子数据 | 37,318个CD45+细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8496 | 2025-10-07 |
Immunometabolic alterations in type 2 diabetes mellitus revealed by single-cell RNA sequencing: insights into subtypes and therapeutic targets
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1537909
PMID:39877357
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示2型糖尿病中的免疫代谢改变,识别疾病亚型和潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平系统分析T2DM患者PBMCs的免疫代谢特征,基于代谢异质性定义三种疾病亚型,并识别关键转录因子和潜在治疗药物 | 样本量相对有限(37例患者和11例对照),仅分析外周血单个核细胞,未涉及组织特异性免疫代谢改变 | 阐明2型糖尿病的免疫代谢机制并识别治疗靶点 | 2型糖尿病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序,基因集变异分析,机器学习 | 机器学习分类模型 | 单细胞转录组数据 | 37例2型糖尿病患者和11例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8497 | 2025-10-07 |
Characterization of NOD-like receptor-based molecular heterogeneity in glioma and its association with immune micro-environment and metabolism reprogramming
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1498583
PMID:39882240
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研究论文 | 本研究通过分析胶质母细胞瘤患者的转录组数据,揭示了NOD样受体信号通路在肿瘤免疫微环境和代谢重编程中的关键作用 | 首次基于NLR基因表达谱将GBM患者分为具有不同临床预后的亚型,并鉴定TRIP6基因为NLR通路中的关键枢纽基因 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索NOD样受体信号通路在胶质母细胞瘤临床异质性中的作用机制 | 496例具有完整预后信息的胶质母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序,单细胞测序,LASSO回归,COX回归,随机森林算法 | NMF聚类,LASSO,COX,随机森林 | 基因表达数据 | 496例GBM患者 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
8498 | 2025-10-07 |
Pancancer analysis reveals the role of disulfidptosis in predicting prognosis, immune infiltration and immunotherapy response in tumors
2023-Dec-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000036830
PMID:38206694
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研究论文 | 通过泛癌分析揭示双硫死亡在肿瘤预后预测、免疫浸润和免疫治疗反应中的作用 | 首次系统性地在33种肿瘤中分析双硫死亡相关基因的表达特征及其与肿瘤免疫微环境、治疗反应的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探索双硫死亡在肿瘤中的生物学作用及其临床意义 | 33种肿瘤的多组学数据 | 生物信息学 | 多种癌症 | 多组学数据分析,单样本基因集富集分析,单细胞测序 | 生物信息学分析算法 | 基因组数据,转录组数据,临床数据 | 33种肿瘤的多组学数据集 | UCSC, STRING, TIMER, TISCH, TCIA | 多组学数据分析,单细胞测序 | UCSC Xena数据库,STRING数据库,TIMER数据库,TISCH数据库,TCIA数据库 | 生物信息学分析平台和数据库 |
8499 | 2025-10-07 |
Machine learning-based metabolism-related genes signature, single-cell RNA sequencing, and experimental validation in hypersensitivity pneumonitis
2023-Oct-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000034940
PMID:37800807
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别了过敏性肺炎的代谢相关基因诊断标志物,并验证了其与M2巨噬细胞的关联 | 首次结合机器学习、单细胞RNA测序和实验验证,系统分析了过敏性肺炎中代谢相关基因的诊断价值及其与M2巨噬细胞的关联 | 样本来源仅限于公共数据库和部分实验验证,需要更大样本量进一步验证 | 识别过敏性肺炎的代谢相关基因诊断标志物并研究其与免疫细胞的关系 | 过敏性肺炎患者和健康对照的基因表达数据及外周血样本 | 生物信息学 | 过敏性肺炎 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 流式细胞术, 生物信息学分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
8500 | 2025-10-07 |
Bulk RNA-seq and scRNA-seq reveal SLC7A11, a key regulatory molecule of ferroptosis, is a prognostic-related biomarker and highly related to the immune system in lung adenocarcinoma
2023-Sep-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000034876
PMID:37713821
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研究论文 | 本研究通过整合分析bulk RNA-seq和scRNA-seq数据,揭示SLC7A11作为铁死亡关键调控分子在肺腺癌中的预后价值和免疫系统相关性 | 首次系统性地结合bulk和单细胞转录组数据,证实SLC7A11在肺腺癌中的预后价值及其与免疫状态的密切关联 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探讨SLC7A11在肺腺癌中的预后价值和免疫治疗疗效预测作用 | 肺腺癌组织和正常肺组织 | 生物信息学 | 肺腺癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | Cox回归分析, 基因集富集分析 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |