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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8461 | 2025-10-07 |
Extracellular Vesicles From Bone Marrow-Derived Macrophages Enriched in ARG1 Enhance Microglial Phagocytosis and Haematoma Clearance Following Intracerebral Haemorrhage
2025-Jan, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70041
PMID:39868438
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研究论文 | 本研究揭示了骨髓源性巨噬细胞通过富含ARG1的细胞外囊泡增强小胶质细胞吞噬功能促进脑出血后血肿清除的新机制 | 首次发现骨髓源性巨噬细胞通过细胞外囊泡递送ARG1增强小胶质细胞吞噬能力,揭示了脑出血后新的细胞间通讯通路 | NA | 探究脑出血后骨髓源性巨噬细胞通过细胞外囊泡调控小胶质细胞吞噬功能的机制 | 骨髓源性巨噬细胞、小胶质细胞、细胞外囊泡 | 神经科学 | 脑出血 | 多组学分析、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8462 | 2025-10-07 |
Integrative Machine Learning of Glioma and Coronary Artery Disease Reveals Key Tumour Immunological Links
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70377
PMID:39868675
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研究论文 | 结合机器学习和单细胞RNA测序探索胶质瘤肿瘤微环境,发现与癌症和心血管疾病相关的遗传变异 | 首次整合机器学习、单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法,揭示胶质瘤与冠状动脉疾病之间的免疫学联系 | NA | 探索胶质瘤肿瘤微环境的异质性及其对治疗反应的影响 | 胶质瘤肿瘤微环境中的细胞和分子相互作用 | 机器学习 | 胶质瘤,冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序,全基因组关联研究,孟德尔随机化 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8463 | 2025-10-07 |
A single-cell atlas of the Culex tarsalis midgut during West Nile virus infection
2025-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012855
PMID:39869679
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建了库蚊中肠细胞图谱,并研究了西尼罗河病毒感染动态 | 首次在库蚊中肠建立单细胞图谱,揭示了特定细胞类型对病毒感染的易感性差异 | 未检测到典型蚊虫抗病毒免疫基因在中肠整体水平的上调 | 研究西尼罗河病毒在库蚊中肠的感染动态和细胞特异性反应 | 库蚊中肠细胞 | 单细胞测序 | 西尼罗河病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8464 | 2025-10-07 |
Multi-omics analysis reveals distinct gene regulatory mechanisms between primary and organoid-derived human hepatocytes
2025-Jan-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.050883
PMID:39878507
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组和染色质可及性分析揭示原代人类肝细胞与类器官来源肝细胞之间的基因调控机制差异 | 首次应用整合单细胞多组学分析揭示AP-1因子与肝特异性转录因子在成熟肝细胞中的协同调控机制,并发现ELF3在类器官来源肝细胞中的独特作用 | 研究主要关注转录调控机制,可能未完全涵盖其他层面的生物学差异 | 探究原代人类肝细胞与肝类器官来源肝细胞之间的基因调控差异 | 原代人类肝细胞和肝内胆管细胞类器官来源的人类肝细胞 | 单细胞多组学 | 肝脏疾病 | 单细胞转录组测序, 单细胞染色质可及性分析 | 整合分析 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
8465 | 2025-10-07 |
Application of Spatial Transcriptomics in Digestive System Tumors
2024-Dec-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15010021
PMID:39858416
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综述 | 介绍空间转录组学技术在消化系统肿瘤研究中的应用进展与前景 | 整合空间转录组学与单细胞RNA测序、人工智能和机器学习技术的研究策略 | 未提及具体研究数据和方法细节 | 探讨空间转录组学在消化系统肿瘤研究中的应用价值 | 消化系统肿瘤 | 空间转录组学 | 消化系统肿瘤 | 空间转录组学, scRNA-seq | 机器学习, 人工智能 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8466 | 2025-10-07 |
S100A11 is a potential prognostic biomarker and correlated with tumor immunosuppressive microenvironment in glioma
2024-Dec-20, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000040701
PMID:39705426
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研究论文 | 本研究探讨S100A11作为胶质瘤相关巨噬细胞潜在生物标志物的作用及其与胶质母细胞瘤免疫抑制微环境的关系 | 首次发现S100A11在胶质瘤相关巨噬细胞中高表达,并证实其与巨噬细胞浸润存在强相关性 | NA | 更好理解胶质瘤免疫微环境,探索S100A11作为生物标志物的潜力 | 胶质瘤相关巨噬细胞(GAMs)和胶质母细胞瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | Western blot, 免疫组织化学, 免疫荧光分析, 单细胞测序, 免疫浸润分析 | NA | 蛋白质表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8467 | 2025-10-07 |
Deciphering cell states and the cellular ecosystem to improve risk stratification in acute myeloid leukemia
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf028
PMID:39865982
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研究论文 | 通过构建急性髓系白血病单细胞转录组图谱和开发sciNMF工作流程,系统解析细胞异质性并建立ACE特征以改善预后预测 | 提出了sciNMF工作流程识别26种白血病和免疫细胞状态,首次定义了AML细胞生态系统(ACE)概念并开发了12基因特征(ACEsig) | 研究基于单细胞转录组数据,需要进一步验证其在更广泛临床场景中的应用效果 | 改善急性髓系白血病的风险分层策略 | 急性髓系白血病患者的白血病细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解(NMF) | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,但包含公共RNA-seq队列验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8468 | 2025-10-07 |
Salmonella dry surface biofilm: morphology, single-cell landscape, and sanitization
2024-Nov-20, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01623-24
PMID:39494899
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研究论文 | 本研究比较了鼠伤寒沙门氏菌干表面生物膜和湿表面生物膜的形成特征,并通过单细胞转录组学分析其功能异质性,最后评估了黄酮类化合物与异丙醇联合使用的消毒效果 | 首次全面研究干表面生物膜的特性并探索其潜在生存机制,提出溶解于70%异丙醇的桑色素作为高效干式消毒剂 | 研究仅针对鼠伤寒沙门氏菌,未涉及其他食源性病原体 | 探究干表面生物膜的形成特征、功能异质性及消毒方法 | 鼠伤寒沙门氏菌干表面生物膜和湿表面生物膜 | 微生物学 | 食源性疾病 | 共聚焦激光扫描显微镜,电子显微镜,单细胞转录组学 | NA | 显微镜图像,转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
8469 | 2025-10-07 |
Inhibition of SUMOylation Induces Adaptive Antitumor Immunity against Pancreatic Cancer through Multiple Effects on the Tumor Microenvironment
2024-Nov-04, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-23-0572
PMID:39150446
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研究论文 | 本研究通过抑制SUMOylation探索了胰腺癌治疗的新机制,发现该过程通过调节肿瘤微环境诱导适应性抗肿瘤免疫 | 首次揭示SUMOylation抑制在体内通过T细胞依赖性机制诱导适应性抗肿瘤免疫,而非直接抑制肿瘤细胞增殖 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用效果仍需进一步验证 | 探究SUMOylation抑制对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的影响及其治疗机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)小鼠模型及肿瘤微环境中的各类细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序,流式细胞术,免疫荧光,免疫组化,Western blot,qPCR | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,基因表达数据 | 临床相关原位PDAC小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8470 | 2025-10-07 |
CRISPR Screening of Transcribed Super-Enhancers Identifies Drivers of Triple-Negative Breast Cancer Progression
2024-Nov-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3995
PMID:39186674
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研究论文 | 通过CRISPR筛选技术鉴定三阴性乳腺癌进展的关键调控元件 | 首次系统分析三阴性乳腺癌特异性超级增强子及其eRNA转录本,结合CRISPR干扰和染色质互作图谱揭示调控机制 | 研究聚焦于前30个eRNA产生的超级增强子,可能未覆盖所有相关调控元件 | 揭示三阴性乳腺癌中超级增强子驱动的基因调控网络 | 三阴性乳腺癌细胞系和动物模型 | 功能基因组学 | 三阴性乳腺癌 | CRISPR干扰筛选,RNA测序,Hi-C染色质构象捕获,单细胞RNA测序,ATAC-seq | NA | 基因组学数据,转录组数据,表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,染色质可及性测序 | NA | NA |
8471 | 2025-10-07 |
Pharmacological targets and validation of remdesivir for the treatment of COVID-19-associated pulmonary fibrosis: A network-based pharmacology and bioinformatics study
2024-Sep-27, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039062
PMID:39331891
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研究论文 | 通过生物信息学和网络药理学方法研究瑞德西韦治疗COVID-19相关肺纤维化的靶点和分子机制 | 首次系统整合网络药理学、分子对接和单细胞测序数据验证瑞德西韦对COVID-19相关肺纤维化的多靶点作用机制 | 研究主要基于公开数据库的预测分析,需要后续实验验证 | 探究瑞德西韦治疗COVID-19相关肺纤维化的药理靶点和作用机制 | 瑞德西韦、COVID-19和肺纤维化的共同靶点 | 生物信息学 | COVID-19相关肺纤维化 | 网络药理学、生物信息学分析、分子对接、单细胞测序 | 蛋白互作网络分析、转录因子调控网络分析 | 组学数据、测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
8472 | 2025-10-07 |
Bioinformatics analysis of the tumor microenvironment in melanoma - Constructing a prognostic model based on CD8+ T cell-related genes: An observational study
2024-Aug-09, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000038924
PMID:39121331
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研究论文 | 本研究通过分析黑色素瘤肿瘤微环境中CD8+ T细胞相关基因构建预后模型 | 整合单细胞测序和多组学分析识别CD8+ T细胞特异性转录因子并构建预后模型 | 观察性研究设计,需要进一步实验验证 | 探索黑色素瘤肿瘤微环境并构建预后预测模型 | 黑色素瘤患者和肿瘤微环境中的CD8+ T细胞 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序,多组学分析,生物信息学分析 | COX回归模型,LASSO回归模型 | 单细胞测序数据,基因表达数据 | 使用GSE65904和GSE35640数据集进行验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8473 | 2025-10-07 |
The predictive value of E2F7 in immunotherapy efficacy for lung adenocarcinoma: An observational study
2024-Jun-21, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000038574
PMID:38905387
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研究论文 | 本研究探讨E2F7在肺腺癌免疫治疗疗效中的预测价值 | 首次系统评估E2F7表达与肺腺癌免疫治疗反应的关系,并揭示其通过影响髓系细胞功能发挥免疫抑制作用的机制 | 观察性研究设计,需要进一步实验验证机制 | 探索E2F7作为肺腺癌免疫治疗反应生物标志物的潜力 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞测序,生物信息学分析 | NA | 基因表达数据,临床数据 | 基于癌症基因组图谱和基因表达综合数据库的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8474 | 2025-10-07 |
A Regularized Bayesian Dirichlet-multinomial Regression Model for Integrating Single-cell-level Omics and Patient-level Clinical Study Data
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.04.597391
PMID:38895417
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研究论文 | 提出一种正则化贝叶斯狄利克雷-多项回归框架,用于整合单细胞RNA测序数据与患者临床数据 | 采用新型分层树结构在不同细胞类型水平识别关联关系 | NA | 研究单细胞水平组学数据与患者水平临床数据之间的关系 | 肺纤维化、COVID-19和非小细胞肺癌患者 | 生物信息学 | 肺纤维化,COVID-19,非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | 正则化贝叶斯狄利克雷-多项回归模型 | 单细胞组学数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8475 | 2025-10-07 |
Large-scale neurophysiology and single-cell profiling in human neuroscience
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07405-0
PMID:38898291
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观点文章 | 本文探讨了大规模神经生理学和单细胞分析技术在人类神经科学研究中的整合应用与发展前景 | 提出了将功能映射的人类脑组织样本进行体外培养并进行多模态细胞和功能分析的工作流程 | NA | 为人类神经科学研究提供统一框架,探索大脑网络水平活动的细胞基础 | 人类脑组织样本 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,神经电生理记录 | NA | 神经电生理数据,基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,神经电生理记录 | Neuropixels | NA |
8476 | 2025-10-07 |
Accelerating Single-Cell Sequencing Data Analysis with SciDAP: A User-Friendly Approach
2024-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582604
PMID:38464095
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研究论文 | 介绍用于加速单细胞测序数据分析的用户友好平台SciDAP | 开发了基于通用工作流语言(CWL)的可移植和可重复分析流程,为非计算专业的生物学家提供单细胞数据分析解决方案 | 未提及平台在处理特定数据类型或大规模数据集时的性能限制 | 解决单细胞测序数据分析的复杂性和可重复性问题 | 单细胞RNA测序、ATAC测序和多组学测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、单细胞多组学测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | SciDAP | 基于通用工作流语言(CWL)的科学数据分析平台 |
8477 | 2025-10-07 |
The Mas-related G protein-coupled receptor d (Mrgprd) mediates pain hypersensitivity in painful diabetic neuropathy
2024-May-01, Pain
IF:5.9Q1
DOI:10.1097/j.pain.0000000000003120
PMID:38147415
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现Mrgprd在糖尿病神经痛模型中的关键作用,并证实其介导疼痛过敏的机制 | 首次揭示Mrgprd在疼痛性糖尿病神经病变中通过增强背根神经节伤害感受器兴奋性介导神经病理性疼痛的新机制 | 研究仅限于高脂饮食小鼠模型,尚未在人类样本或临床环境中验证 | 探索疼痛性糖尿病神经病变中背根神经节伤害感受器超兴奋性的分子机制 | 高脂饮食诱导的疼痛性糖尿病神经病变小鼠模型的背根神经节神经元 | 神经科学 | 糖尿病神经病变 | 单细胞RNA测序, 体内钙成像 | NA | 基因表达数据, 钙信号数据 | 高脂饮食小鼠模型的背根神经节组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8478 | 2025-10-07 |
ALDH2 as an immunological and prognostic biomarker: Insights from pan-cancer analysis
2024-Apr-19, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037820
PMID:38640328
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研究论文 | 通过泛癌分析揭示ALDH2作为免疫和预后生物标志物的潜力 | 首次在泛癌水平系统分析ALDH2表达与免疫细胞浸润的关联 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 评估ALDH2在泛癌中的生物学意义和临床价值 | 多种癌症类型和正常组织 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 单细胞测序、免疫组化染色、生物信息学分析 | 多种算法(EPIC, MCPCOUNTER, TIDTIMER, xCell, CIBERSORT, quanTIseq) | 基因组数据、表达数据、临床数据 | TCGA等多数据库的泛癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8479 | 2024-08-07 |
A prognostic risk prediction model based on ferroptosis-related long non-coding RNAs in bladder cancer: A bulk RNA-seq research and scRNA-seq validation: Erratum
2024-Mar-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037547
PMID:38489743
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
8480 | 2025-10-07 |
Bitter taste receptors in the reproductive system: Function and therapeutic implications
2024-02, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31179
PMID:38219077
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综述 | 本文综述了苦味受体在生殖系统中的功能及其治疗潜力 | 系统总结了苦味受体在生殖系统各组织中的非味觉功能,并提出了其在生殖疾病治疗中的新策略 | 缺乏遗传学和功能学研究证据 | 探讨苦味受体在生殖系统中的功能及治疗应用前景 | 人类和小鼠生殖系统组织及细胞 | 生殖医学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |