单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8441 - 8460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8441 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics identify a novel macrophage population associated with bone invasion in pituitary neuroendocrine tumors
2025-Jan-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03296-9
PMID:39865310
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现了一种与垂体神经内分泌肿瘤骨侵袭相关的新型TNF-α+ TAM巨噬细胞亚群 | 首次识别出TNF-α+ TAM巨噬细胞亚群，并阐明其通过IL34/CSF1R轴促进骨侵袭的机制 | 样本量相对有限（15例病例），需要更大规模研究验证 | 探究垂体神经内分泌肿瘤骨侵袭的分子机制 | 骨侵袭性和非骨侵袭性垂体神经内分泌肿瘤患者组织样本 | 单细胞转录组学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例病例（10例骨侵袭性，5例非骨侵袭性），共87,287个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8442 | 2025-10-07 |
Combined PARP14 inhibition and PD-1 blockade promotes cytotoxic T cell quiescence and modulates macrophage polarization in relapsed melanoma
2025-Jan-27, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010683
PMID:39870492
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研究论文 | 本研究探讨PARP14抑制剂联合PD-1阻断在复发性黑色素瘤中对T细胞静息状态和巨噬细胞极化的调节作用 | 首次揭示PARP14抑制联合PD-1阻断可诱导细胞毒性T细胞进入静息状态并调节巨噬细胞极化 | 肿瘤细胞通过激活替代性免疫逃逸通路产生适应性耐药 | 探索克服黑色素瘤免疫检查点抑制剂耐药的新策略 | 黑色素瘤临床前模型和单细胞RNA测序数据 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 临床前模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8443 | 2025-10-07 |
Integrating representation learning, permutation, and optimization to detect lineage-related gene expression patterns
2025-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56388-7
PMID:39870610
|
研究论文 | 开发了一种名为PORCELAN的计算方法，用于识别与细胞谱系紧密相关的基因表达模式 | 整合了表示学习、排列和优化三种计算方法来检测谱系相关的基因表达模式 | 方法仅在合成数据和特定生物系统（肺癌小鼠模型、小鼠和线虫胚胎发育）中进行了验证 | 检测与细胞谱系相关的基因表达模式，研究细胞状态记忆在分裂过程中的维持机制 | 肺癌小鼠模型、小鼠胚胎发育、秀丽隐杆线虫胚胎发育 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 表示学习模型 | 单细胞RNA测序数据、谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8444 | 2025-10-07 |
STAIG: Spatial transcriptomics analysis via image-aided graph contrastive learning for domain exploration and alignment-free integration
2025-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56276-0
PMID:39870633
|
研究论文 | 提出一种名为STAIG的深度学习模型，通过图像辅助图对比学习整合基因表达、空间坐标和组织学图像，用于空间转录组学分析 | 首次将图对比学习与高性能特征提取相结合，能够无需预对齐整合组织切片并消除批次效应，且支持多种平台数据输入 | NA | 开发空间转录组学分析工具，用于精确识别空间区域和探索肿瘤微环境 | 空间转录组学数据（基因表达、空间坐标、组织学图像） | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 图对比学习 | 基因表达数据、空间坐标、组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8445 | 2025-10-07 |
Monocytes serve as Shiga toxin carriers during the development of hemolytic uremic syndrome
2025-Jan-27, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-025-00689-8
PMID:39871175
|
研究论文 | 本研究揭示了单核细胞在志贺毒素诱导的溶血性尿毒症综合征中作为毒素载体的关键作用 | 首次确定单核细胞是志贺毒素2型向肾脏区域转运的主要载体，并发现其通过Toll样受体4与毒素结合 | 动物模型研究结果向人类临床应用的转化仍需进一步验证 | 阐明志贺毒素在溶血性尿毒症综合征发展过程中的转运机制 | 单核细胞、中性粒细胞、人肾小球内皮细胞、小鼠模型 | 单细胞测序 | 溶血性尿毒症综合征 | 单细胞测序分析、流式细胞术、细胞结合实验 | NA | 单细胞测序数据、流式细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8446 | 2025-10-07 |
Wnt signalling facilitates neuronal differentiation of cochlear Frizzled10-positive cells in mouse cochlea via glypican 6 modulation
2025-Jan-27, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02039-9
PMID:39871249
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠耳蜗中Frizzled10阳性细胞通过Wnt信号通路和glypican 6调控实现神经元分化的机制 | 首次鉴定出耳蜗FZD10+细胞作为神经前体细胞的重要亚群，并阐明Wnt信号通过GPC6调控其神经元分化的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，人类耳蜗中的相关性尚未验证 | 探究耳蜗FZD10+细胞的神经元分化能力及其调控机制 | 小鼠耳蜗Frizzled10阳性细胞 | 神经生物学 | 感音神经性听力损失 | 单细胞RNA测序，伪时序分析，信号通路网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8447 | 2025-10-07 |
HMOX1 as a potential drug target for upper and lower airway diseases: insights from multi-omics analysis
2025-Jan-27, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03124-w
PMID:39871287
|
研究论文 | 通过多组学分析探讨HMOX1作为上下气道疾病潜在药物靶点的作用 | 首次通过双向双样本孟德尔随机化分析确定HMOX1与上下气道疾病的因果关系，并结合单细胞RNA测序和分子对接技术筛选潜在治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索HMOX1在上下气道疾病中的潜在治疗作用 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)、过敏性鼻炎(AR)和哮喘(AS)患者 | 生物信息学 | 呼吸系统疾病 | 基因集富集分析,随机森林算法,双向双样本孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,分子对接 | 随机森林,孟德尔随机化模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的样本数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8448 | 2025-10-07 |
Tumor-associated-fibrosis and active collagen-CD44 axis characterize a poor-prognosis subtype of gastric cancer and contribute to tumor immunosuppression
2025-Jan-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06070-9
PMID:39871345
|
研究论文 | 本研究识别了一种以纤维化为特征的胃癌不良预后亚型，并揭示了胶原-CD44信号轴在肿瘤免疫抑制中的关键作用 | 首次系统识别了以纤维化为特征的胃癌亚型，并阐明胶原-CD44信号轴在介导肿瘤免疫抑制中的具体机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索胃癌中肿瘤相关纤维化的机制及其对免疫治疗的影响 | 胃癌患者样本 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 伪时间分析, CellChat分析, 共定位分析 | 共识聚类 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 375个TCGA胃癌样本, 15个GEO单细胞测序样本, 19个免疫治疗队列, 2个GWAS数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8449 | 2025-10-07 |
Intratumor heterogeneity of HPV integration in HPV-associated head and neck cancer
2025-Jan-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56150-z
PMID:39865078
|
研究论文 | 本研究通过全基因组测序分析HPV阳性头颈部鳞状细胞癌中HPV整合的瘤内异质性 | 首次系统揭示HPV整合在肿瘤内的异质性特征，发现44%的断点呈亚克隆分布，并鉴定出四种HPV物理状态 | 样本量相对有限（51例肿瘤），需要更大规模研究验证发现 | 探究HPV阳性头颈部鳞癌中HPV整合的分子特征及其与肿瘤发生的关系 | HPV阳性头颈部鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 癌症基因组学 | 头颈部癌 | 全基因组测序，单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 基因组测序数据，单细胞转录组数据，病理图像 | 51例肿瘤样本 | NA | 全基因组测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8450 | 2025-10-07 |
Statistical identification of cell type-specific spatially variable genes in spatial transcriptomics
2025-Jan-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56280-4
PMID:39865128
|
研究论文 | 提出一种名为Celina的统计方法，用于系统识别空间转录组中的细胞类型特异性空间可变基因 | 首个能够有效识别细胞类型特异性空间可变基因的统计方法，在点分辨率空间转录组数据中表现尤为突出 | NA | 开发统计方法以识别细胞类型特异性空间可变基因 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | 肺癌, 肾癌, 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 空间变系数模型 | 空间基因表达数据 | 五个真实数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8451 | 2025-10-07 |
Genetic variation in IL-4 activated tissue resident macrophages determines strain-specific synergistic responses to LPS epigenetically
2025-Jan-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56379-8
PMID:39863579
|
研究论文 | 本研究探讨不同遗传背景下IL-4激活的组织驻留巨噬细胞对LPS刺激的表观遗传调控机制 | 首次揭示遗传变异通过改变IL-4诱导的表观遗传重编程，决定不同品系巨噬细胞对LPS的协同反应差异 | 研究仅针对雄性小鼠的腹膜腔巨噬细胞，样本来源相对局限 | 探究遗传背景如何影响巨噬细胞在组织环境中整合多重刺激的机制 | C57BL/6和BALB/c品系雄性小鼠的腹膜腔组织驻留巨噬细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，表观基因组分析 | NA | 基因表达数据，表观遗传数据 | 两个小鼠品系（C57BL/6和BALB/c）的组织驻留巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8452 | 2025-10-07 |
Reverse-engineering the FLT3-PI3K/AKT axis to enhance TILs function and improve prognosis in ovarian and cervical cancers
2025-Jan-25, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01592-8
PMID:39863894
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了FLT3通过PI3K/AKT通路调控肿瘤浸润淋巴细胞功能，为卵巢癌和宫颈癌提供新的免疫治疗靶点 | 首次提供FLT3在卵巢癌和宫颈癌中免疫调节作用的空间解析证据 | 共享免疫机制仍不明确 | 探索卵巢癌和宫颈癌的免疫调控机制，寻找新的免疫治疗靶点 | 卵巢癌和宫颈癌患者样本 | 数字病理学 | 卵巢癌,宫颈癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | Seurat,Harmony | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Genomics平台 | 10x Genomics空间转录组技术 |
| 8453 | 2025-10-07 |
Integrative Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Identifies a Macrophage-Related Prognostic Signature for Predicting Prognosis and Therapy Responses in Colorectal Cancer
2025-Jan-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26020811
PMID:39859524
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，构建了一个巨噬细胞相关预后标志物，用于预测结直肠癌患者的预后和治疗反应 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据识别巨噬细胞相关基因，并构建了包含15个基因的预后特征模型 | NA | 开发结直肠癌预后预测工具并探索巨噬细胞在肿瘤进展中的作用机制 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,机器学习,伪时间轨迹分析 | 机器学习框架 | RNA测序数据 | 多个数据集的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 8454 | 2025-10-07 |
Novel Assignment of Gene Markers to Hematological and Immune Cells Based on Single-Cell Transcriptomics
2025-Jan-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26020805
PMID:39859519
|
研究论文 | 基于单细胞转录组学为血液和免疫细胞分配新型基因标记 | 开发了优化的计算工作流程，在膜蛋白编码基因和所有检测到的蛋白编码基因中发现了新的细胞类型标记基因，而不仅限于已知的CD标记 | 仅分析了三个单细胞数据集，样本来源有限 | 识别和验证血液和免疫系统中不同细胞类型的最佳基因标记 | 骨髓和外周血中的血液和免疫细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 单细胞转录组数据 | 三个单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8455 | 2025-10-07 |
Cellular Senescence in Hepatocellular Carcinoma: Immune Microenvironment Insights via Machine Learning and In Vitro Experiments
2025-Jan-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26020773
PMID:39859485
|
研究论文 | 通过机器学习和体外实验研究肝细胞癌中细胞衰老对免疫微环境的影响 | 结合三种机器学习方法识别肝细胞癌细胞衰老标志物，并通过单细胞RNA测序数据探索免疫微环境特征 | NA | 探索细胞衰老标志物在肝细胞癌免疫微环境中的作用机制 | 肝细胞癌组织和细胞 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RNA干扰, 共培养实验 | KNN, SVM, 随机森林 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8456 | 2025-10-07 |
Pro-cumulin addition in a biphasic in vitro oocyte maturation system modulates human oocyte and cumulus cell transcriptomes
2025-Jan-17, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf001
PMID:39862403
|
研究论文 | 本研究探讨了在双相体外卵母细胞成熟系统中添加pro-cumulin对人类卵母细胞和卵丘细胞转录组的影响 | 首次揭示pro-cumulin在人类双相IVM系统中调节卵丘细胞和卵母细胞转录组的作用机制 | 未在蛋白质组学水平验证结果，且未评估胚胎学结局 | 研究卵母细胞分泌因子对体外卵母细胞成熟的影响 | 人类卵丘-卵母细胞复合体 | 生殖医学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确样本数量的人类卵丘-卵母细胞复合体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8457 | 2025-10-07 |
Investigation of Exome-Wide Tumor Heterogeneity on Colorectal Tissue-Based Single Cells
2025-Jan-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26020737
PMID:39859451
|
研究论文 | 本研究通过单细胞外显子测序工作流程，探索结直肠癌组织中的肿瘤异质性模式 | 首次在单细胞水平上使用激光显微切割技术从组织切片不同位置获取样本进行外显子测序，比较了健康结肠、肿瘤相关正常组织和结直肠癌组织的异质性特征 | 研究仅基于组织来源的样本，未涉及其他样本类型；单细胞测序技术本身存在技术限制和覆盖度问题 | 研究结直肠癌在单细胞水平的肿瘤异质性模式 | 结直肠组织样本，包括健康结肠对照、肿瘤相关正常组织和结直肠癌组织 | 单细胞基因组学 | 结直肠癌 | 单细胞外显子测序，激光显微切割，全外显子组测序，cfDNA测序 | NA | 基因组测序数据 | NA | NA | 单细胞外显子测序，全外显子组测序，cfDNA测序 | NA | NA |
| 8458 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA-Seq Uncovers Robust Glial Cell Transcriptional Changes in Methamphetamine-Administered Mice
2025-Jan-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26020649
PMID:39859365
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究甲基苯丙胺对小鼠胶质细胞转录组的改变 | 首次在单细胞水平揭示甲基苯丙胺对胶质细胞转录组的全面影响，识别出关键的信号通路和转录因子失调 | 研究仅限于小鼠皮层区域，未涉及其他脑区；样本量相对有限 | 探究甲基苯丙胺如何破坏胶质细胞功能及其在神经发育和神经退行性过程中的作用 | 慢性甲基苯丙胺处理的小鼠皮层胶质细胞 | 单细胞基因组学 | 药物成瘾与神经毒性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4000个胶质细胞相关基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8459 | 2025-10-07 |
Identification of Downregulated MECR Gene in Parkinson's Disease Through Integrated Transcriptomic Analysis and Validation
2025-Jan-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26020550
PMID:39859268
|
研究论文 | 通过整合转录组分析识别帕金森病中下调的MECR基因并验证其作用 | 首次通过整合微阵列和单细胞RNA测序数据识别脂质代谢相关基因，发现MECR在帕金森病中的显著下调 | NA | 识别与帕金森病相关的脂质代谢相关基因 | 帕金森病患者和健康对照的转录组数据 | 生物信息学 | 帕金森病 | 微阵列, 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 8460 | 2025-10-07 |
Evaluation of the digestion protocol of mouse neonatal epidermis for single-cell RNA sequencing
2025-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.151159
PMID:39681052
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研究论文 | 比较三种酶消化方案对新生小鼠表皮单细胞RNA测序的影响 | 首次系统比较Trypsin、TrypLE和Liberase三种酶对新生小鼠表皮单细胞解离的效果差异 | 仅针对新生小鼠表皮组织，未验证其他发育阶段或组织类型 | 优化新生小鼠表皮单细胞RNA测序的组织解离方案 | 新生小鼠表皮组织 | 单细胞测序 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 新生小鼠表皮样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |