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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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8441 | 2024-09-23 |
Image-seq: spatially resolved single-cell sequencing guided by in situ and in vivo imaging
2022-12, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01673-2
PMID:36424441
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Image-seq的技术,该技术通过图像引导从特定空间位置分离细胞,并进行单细胞转录组测序,从而保留目标细胞的空间信息 | Image-seq技术结合了空间信息和高度敏感的RNA测序结果,能够记录被分析细胞的时间和动态历史 | NA | 开发一种能够保留细胞空间信息并进行单细胞转录组测序的技术 | 骨髓和白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 图像 | NA |
8442 | 2024-09-23 |
Combined MEK and STAT3 Inhibition Uncovers Stromal Plasticity by Enriching for Cancer-Associated Fibroblasts With Mesenchymal Stem Cell-Like Features to Overcome Immunotherapy Resistance in Pancreatic Cancer
2022-12, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2022.07.076
PMID:35948109
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研究论文 | 研究探讨了联合使用MEK和STAT3抑制剂在胰腺癌中克服免疫治疗抵抗的作用 | 首次揭示了联合MEK和STAT3抑制剂通过改变癌症相关成纤维细胞的特性,克服胰腺癌的免疫治疗抵抗 | 研究主要基于小鼠模型和单一临床病例,需要更多临床试验验证 | 探讨联合MEK和STAT3抑制剂在胰腺癌中克服免疫治疗抵抗的机制 | 胰腺癌中的癌症相关成纤维细胞和免疫微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和单一临床病例 |
8443 | 2024-09-23 |
Targeted Assessment of Mucosal Immune Gene Expression Predicts Clinical Outcomes in Children with Ulcerative Colitis
2022-Nov-23, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjac075
PMID:35665804
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研究论文 | 本文研究了靶向基因表达面板在预测儿童溃疡性结肠炎临床结果中的应用 | 首次使用靶向基因表达面板预测儿童溃疡性结肠炎的临床结果,并探讨了预测基因在发病机制中的潜在作用 | 研究样本仅限于新诊断的儿童溃疡性结肠炎患者,且结果主要基于52周的随访数据 | 确定靶向基因表达面板是否能预测儿童溃疡性结肠炎的临床结果,并探讨预测基因的潜在致病作用 | 313例新诊断的儿童溃疡性结肠炎患者的直肠RNA样本 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 实时PCR微流体阵列,RNA测序 | NA | RNA | 313例新诊断的儿童溃疡性结肠炎患者的直肠RNA样本 |
8444 | 2024-09-23 |
Systematic single-cell pathway analysis to characterize early T cell activation
2022-11-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111697
PMID:36417885
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研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞通路分析的统计框架,并通过scRNA-seq数据展示了其在早期T细胞激活中的应用 | 开发了一种敏感且无分布假设的多样本分布测试统计框架,并将其应用于单细胞通路分析 | NA | 开发和验证一种新的单细胞通路分析工具,并揭示T细胞激活过程中的调控机制 | T细胞及其在早期激活过程中的通路活动 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个组织的T细胞样本 |
8445 | 2024-09-23 |
Endocardium-to-coronary artery differentiation during heart development and regeneration involves sequential roles of Bmp2 and Cxcl12/Cxcr4
2022-11-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.10.007
PMID:36347256
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研究论文 | 本文研究了心脏发育和再生过程中Bmp2和Cxcl12/Cxcr4在心内膜向冠状动脉分化中的顺序作用 | 通过使用小鼠遗传学和单细胞RNA测序,确定了心内膜血管生成调控因子,并精确评估了CXCL12/CXCR4信号通路的作用 | NA | 揭示心内膜血管生成的分子机制,并寻找促进心脏损伤后血管再生的潜在治疗靶点 | 心内膜细胞、冠状动脉内皮细胞、Bmp2和Cxcl12/Cxcr4信号通路 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
8446 | 2024-09-23 |
Ischemic Stroke Impacts the Gut Microbiome, Ileal Epithelial and Immune Homeostasis
2022-Nov-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105437
PMID:36388972
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研究论文 | 本文研究了缺血性中风对肠道微生物群、回肠上皮细胞和免疫稳态的影响 | 首次揭示了中风通过炎症机制影响回肠上皮细胞的分子和代谢途径 | NA | 探讨缺血性中风对肠道微生物群和回肠上皮细胞的影响及其分子机制 | 肠道微生物群、回肠上皮细胞、免疫细胞 | NA | 中风 | 多组学方法、单细胞RNA测序 | NA | 转录组、代谢组 | NA |
8447 | 2024-09-23 |
Transcriptional Profiling of Phagocytic Leukocytes and Microglia Reveals a Critical Role for Reactive Oxygen Species in Biofilm Containment during Staphylococcus aureus Craniotomy Infection
2022-11-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200503
PMID:36426943
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研究论文 | 研究探讨了在金黄色葡萄球菌颅骨切开术感染中,吞噬性白细胞和微胶质细胞的转录谱,并揭示了活性氧在生物膜控制中的关键作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了吞噬性和非吞噬性细胞的转录特征,并发现活性氧在控制金黄色葡萄球菌生物膜中的重要作用 | 研究主要基于小鼠模型,结果的临床相关性需要进一步验证 | 探讨金黄色葡萄球菌颅骨切开术感染中吞噬性白细胞和微胶质细胞的转录特征及其在生物膜控制中的作用 | 吞噬性白细胞、微胶质细胞、金黄色葡萄球菌 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型,包括NADPH氧化酶2敲除小鼠和野生型小鼠 |
8448 | 2024-09-23 |
Monocyte/Macrophage Heterogeneity during Skin Wound Healing in Mice
2022-11-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200365
PMID:36426946
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术探索小鼠皮肤伤口愈合过程中单核细胞/巨噬细胞的异质性和状态转换 | 首次使用单细胞RNA测序技术全面探索皮肤伤口愈合过程中单核细胞/巨噬细胞的异质性和状态转换 | 研究仅限于C57BL/6小鼠模型,结果可能不适用于其他物种 | 深入了解皮肤伤口愈合过程中单核细胞/巨噬细胞的异质性和功能 | 小鼠皮肤伤口愈合过程中的单核细胞/巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 2813个高质量细胞 |
8449 | 2024-09-23 |
Multiomic analysis reveals conservation of cancer-associated fibroblast phenotypes across species and tissue of origin
2022-11-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.09.015
PMID:36270275
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了癌症相关成纤维细胞表型在不同物种和组织来源中的保守性 | 本文首次通过配对的染色质可及性和转录组分析,综合分析了癌症相关成纤维细胞的亚群,并识别出三种超群:稳态样、机械应答和免疫调节型成纤维细胞 | NA | 研究癌症相关成纤维细胞的异质性及其在不同物种和组织中的保守性 | 癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、染色质可及性分析 | NA | 转录组、蛋白质组 | 多个组织类型和物种的样本 |
8450 | 2024-09-23 |
Cellular and molecular profiles of larval and adult Xenopus corneal epithelia resolved at the single-cell level
2022-11, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2022.08.007
PMID:36049533
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了青蛙角膜上皮细胞在幼体和成体阶段的细胞和分子特征 | 揭示了角膜发育和成熟过程中细胞多样性的增加以及转录组、基因调控网络和细胞间通讯动力学的显著变化,并识别出潜在的幼体和成体角膜上皮干细胞 | NA | 探索角膜上皮干细胞及其增殖后代在维持角膜透明度和稳态中的作用 | 青蛙幼体和成体角膜上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 幼体和成体青蛙角膜细胞 |
8451 | 2024-09-23 |
Directed differentiation of human pluripotent stem cells into diverse organ-specific mesenchyme of the digestive and respiratory systems
2022-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-022-00733-3
PMID:35978039
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研究论文 | 本文描述了一种将人类多能干细胞定向分化为消化和呼吸系统中多种器官特异性间充质的协议 | 利用单细胞转录组学揭示的小鼠前肠器官发生中的信号网络和分子标记,成功将人类多能干细胞分化为多种器官特异性间充质 | 目前主要集中在间充质的生成,尚未涉及复杂人体组织的工程化 | 开发一种将人类多能干细胞定向分化为消化和呼吸系统中多种器官特异性间充质的方法 | 人类多能干细胞及其分化产物 | 再生医学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 4-7天的培养时间,不同类型的间充质细胞比例为60-90%纯度的肝隔膜横纹肌样细胞,70-80%纯度的肝样成纤维细胞,以及约35%的呼吸样、胃样或食管样间充质细胞 |
8452 | 2024-09-23 |
Loss of non-motor kinesin KIF26A causes congenital brain malformations via dysregulated neuronal migration and axonal growth as well as apoptosis
2022-10-24, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.09.011
PMID:36228617
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研究论文 | 研究了非运动驱动蛋白KIF26A缺失导致先天性脑畸形的机制 | 首次揭示了KIF26A在脑发育中的功能,并解释了其在神经元迁移、轴突生长和凋亡中的作用 | NA | 探讨KIF26A缺失对脑发育的影响及其分子机制 | KIF26A基因、先天性脑畸形患者、小鼠和人类iPSC衍生的类器官模型 | NA | 先天性脑畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包含KIF26A功能缺失变异的患者队列、小鼠模型和人类iPSC衍生的类器官模型 |
8453 | 2024-09-23 |
Impact of T-cell immunity on chemotherapy response in childhood acute lymphoblastic leukemia
2022-09-29, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2021014495
PMID:35675514
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研究论文 | 本文研究了T细胞免疫对儿童急性淋巴细胞白血病化疗反应的影响 | 首次系统评估了T细胞免疫对Ph+ ALL治疗结果的影响,并揭示了T细胞免疫在抑制耐药白血病细胞生长中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和少量儿童样本,需要进一步的人体临床研究验证 | 探讨T细胞免疫在儿童急性淋巴细胞白血病化疗反应中的作用 | T细胞免疫、Ph+ ALL、化疗反应 | NA | 白血病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 102名儿童 |
8454 | 2024-09-23 |
DNMT3A mutations define a unique biological and prognostic subgroup associated with cytotoxic T cells in PTCL-NOS
2022-09-15, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2021015019
PMID:35639959
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研究论文 | 研究探讨了DNMT3A突变在PTCL-NOS中的作用及其与细胞毒性T细胞的关系 | 首次发现DNMT3A突变在PTCL-TBX21中与细胞毒性T细胞基因特征的显著富集相关,并验证了其在免疫组化和基因表达层面的影响 | 研究主要集中在PTCL-TBX21和PTCL-GATA3亚型,其他PTCL亚型的研究较少 | 探讨DNMT3A突变在PTCL-NOS中的生物学意义及其对预后的影响 | PTCL-NOS中的DNMT3A突变及其与细胞毒性T细胞的关系 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括PTCL-TBX21和PTCL-GATA3亚型的多个病例,以及CD8+ T细胞系和原代CD3+ T细胞培养 |
8455 | 2024-09-23 |
Single-cell analyses reveal early thymic progenitors and pre-B cells in zebrafish
2022-09-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20220038
PMID:35938989
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了斑马鱼骨髓和胸腺中的约70,000个细胞,揭示了斑马鱼免疫细胞发育的基因表达图谱 | 首次在斑马鱼中发现了早期胸腺祖细胞和前B细胞,并揭示了B细胞和T细胞的发育轨迹 | NA | 阐明斑马鱼淋巴细胞发育的关键方面,并探索其效应功能的广度 | 斑马鱼的免疫细胞发育 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约70,000个细胞 |
8456 | 2024-09-23 |
Secretory Cells Are the Primary Source of pIgR in Small Airways
2022-09, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2021-0548OC
PMID:35687143
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研究论文 | 研究探讨了慢性阻塞性肺疾病(COPD)小气道中分泌性IgA(SIgA)丢失的原因及其与pIgR表达的关系 | 首次在单细胞分辨率下定义和量化了人类气道中pIgR表达的细胞类型,并评估了中性粒细胞弹性蛋白酶和非类型细菌分泌的蛋白酶对SIgA降解的影响 | 研究主要集中在人类和小鼠模型上,可能无法完全代表所有COPD患者的复杂情况 | 探讨COPD小气道中SIgA丢失的原因及其与pIgR表达的关系 | 人类和小鼠的气道细胞,特别是分泌细胞和纤毛细胞 | NA | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA杂交、免疫染色、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠的气道细胞样本 |
8457 | 2024-09-23 |
Single-cell Transcriptomics Reveals Dynamic Role of Smooth Muscle Cells and Enrichment of Immune Cell Subsets in Human Abdominal Aortic Aneurysms
2022-09-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000005551
PMID:35762613
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学揭示了平滑肌细胞和免疫细胞亚群在人类腹主动脉瘤中的动态作用 | 首次全面描述了人类腹主动脉瘤组织中的细胞景观,并通过单细胞RNA测序识别了17个代表8种细胞谱系的集群 | NA | 确定与腹主动脉瘤发展相关的细胞特异性基因表达谱 | 腹主动脉瘤组织和对照组织中的细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
8458 | 2024-09-23 |
Diverse stem cells for periodontal tissue formation and regeneration
2022-09, Genesis (New York, N.Y. : 2000)
DOI:10.1002/dvg.23495
PMID:35916433
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研究论文 | 本文探讨了牙周组织形成和再生中多种干细胞的作用 | 利用单细胞RNA测序分析揭示了牙周组织中细胞的异质性和细胞类型特异性标记,以及它们与牙囊中前体细胞的发育关系 | NA | 揭示牙周组织中间充质祖细胞的基本特性,为未来开发更有效的基于干细胞的牙周组织再生疗法提供新知识 | 牙周组织中的间充质干细胞(PDLSCs)及其在牙周再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
8459 | 2024-09-23 |
Distinct cellular dynamics associated with response to CAR-T therapy for refractory B cell lymphoma
2022-09, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-01959-0
PMID:36097221
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研究论文 | 研究了CAR-T疗法对难治性B细胞淋巴瘤患者的细胞动力学特征 | 揭示了不同CAR-T产品在治疗反应中的细胞动力学差异,并发现了CAR-T调节细胞在非应答者中的作用 | 仅分析了32名患者的样本,可能无法全面代表所有患者的情况 | 探讨CAR-T疗法在难治性B细胞淋巴瘤患者中的治疗反应机制 | 32名接受CAR-T治疗的难治性B细胞淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 105个治疗前后的外周血单核细胞样本和输注产品 |
8460 | 2024-09-23 |
Donor Macrophages Modulate Rejection After Heart Transplantation
2022-08-23, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究捐赠者巨噬细胞在心脏移植后调节排斥反应的作用 | 首次揭示了捐赠者巨噬细胞在心脏移植排斥反应中的关键作用,并提出了通过靶向MYD88信号通路来抑制排斥反应的新疗法 | 研究仅在老鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探讨捐赠者巨噬细胞在心脏移植后急性细胞排斥反应中的作用 | 捐赠者和受者的巨噬细胞及其在心脏移植后的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序、基因敲除、细胞消融 | NA | RNA | 老鼠模型中的心脏移植样本 |