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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8381 | 2025-10-07 |
Transcriptomic and proteomic characterization of cell and protein biomarkers of checkpoint inhibitor-induced liver injury
2025-May-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04033-z
PMID:40317333
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研究论文 | 本研究通过多组学方法分析免疫检查点抑制剂引起的肝损伤患者的血液样本,揭示免疫和分子机制 | 首次结合转录组、T细胞受体谱和蛋白质组学全面分析ChILI的生物标志物,发现T细胞克隆性增加和PD-L1表达变化 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 研究免疫检查点抑制剂引起的肝损伤的细胞和蛋白质生物标志物 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者血液样本 | 生物信息学 | 药物性肝损伤 | 转录组测序, T细胞受体谱分析, 单细胞RNA测序, 质谱蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 细胞外囊泡分析 | NA | NA |
8382 | 2025-10-07 |
The immunosuppressive role of VSIG4 in colorectal cancer and its interaction with the tumor microenvironment
2025-May-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02411-8
PMID:40317372
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了VSIG4在结直肠癌免疫微环境中的免疫抑制功能 | 首次证实VSIG4、CYBBC3AR1和FCGR1A在结直肠癌免疫微环境中的关键作用,特别揭示了VSIG4通过调节CD8+T细胞免疫耗竭影响肿瘤微环境 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探究结直肠癌肿瘤微环境中关键基因的免疫调节功能 | 结直肠癌患者和相关的免疫细胞(特别是巨噬细胞和CD8+T细胞) | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, PCR, 生物信息学分析 | LASSO, 随机森林, 非负矩阵分解(NMF), Monocle2 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA-COAD数据集和GEO数据库中的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
8383 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a fibroblast gene signature that promotes T-cell infiltration in muscle-invasive bladder cancer
2025-May-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08094-9
PMID:40319103
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了肌层浸润性膀胱癌中成纤维细胞基因特征促进T细胞浸润的机制 | 首次在MIBC中发现两种干扰素响应性成纤维细胞亚群(F-ISG15和F-POSTN),并揭示了Tex细胞与CAFs通过IFN-γ-CXCL12-CXCR4轴形成的双向调控环路 | 样本量相对有限(12名患者的19个组织样本),需要在更大队列中验证 | 探究肌层浸润性膀胱癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞与耗竭T细胞的相互作用机制 | 肌层浸润性膀胱癌患者组织样本(包括MIBC、NMIBC和正常组织) | 单细胞组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 空间分析, 体内实验 | NA | 单细胞转录组数据, 空间分布数据 | 12名患者的19个组织样本(7个MIBC, 3个NMIBC, 9个正常组织) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8384 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveal the effects of chemoimmunotherapy on hypopharyngeal cancer and its tumor microenvironment
2025-May-03, Oral oncology
IF:4.0Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了化学免疫疗法对下咽癌及其肿瘤微环境的影响 | 首次在单细胞水平揭示下咽癌肿瘤微环境异质性与化学免疫疗法疗效的关系,并鉴定出S100A2基因和癌症相关成纤维细胞亚群作为潜在预测标志物 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 探索化学免疫疗法对下咽癌及其肿瘤微环境的影响机制,寻找治疗耐药性预测标志物 | 下咽癌患者的活检样本 | 单细胞转录组学 | 下咽癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量RNA测序数据 | 下咽癌患者治疗前后的活检样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
8385 | 2025-10-07 |
Heterogeneous Responses to High-Dose Testosterone in Castration-Resistant Prostate Cancer Tumors with Mixed Rb-Proficient and Rb-Deficient Cells
2025-May-02, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-24-0716
PMID:40116305
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了去势抵抗性前列腺癌中Rb通路正常和缺陷细胞对高剂量睾酮治疗的异质性反应 | 首次在单细胞水平揭示Rb缺陷细胞通过缺氧信号通路抵抗高剂量睾酮治疗,并提出联合HIF-1α抑制剂可恢复治疗敏感性 | 研究基于患者来源异种移植模型和细胞系,需要进一步临床验证 | 探究高剂量睾酮治疗去势抵抗性前列腺癌的分子机制及Rb蛋白家族在治疗反应中的作用 | 去势抵抗性前列腺癌肿瘤细胞,包括Rb通路正常和缺陷的细胞群体 | 单细胞测序分析 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,基因沉默,药物处理 | NA | 基因表达数据 | 患者来源异种移植模型和CRPC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8386 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals gut microbiota-immunotherapy synergy through modulating tumor microenvironment
2025-May-02, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02226-7
PMID:40312419
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肠道菌群通过调节肿瘤微环境增强免疫检查点抑制剂疗效的协同机制 | 首次在单细胞分辨率揭示肠道菌群与免疫治疗的协同作用机制,发现γδ T细胞-抗原呈递细胞-CD8 T细胞轴和SPP1相关巨噬细胞重编程的关键作用 | 研究基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究肠道菌群调节免疫检查点抑制剂疗效的分子机制 | 小鼠肿瘤模型中的免疫细胞和肿瘤微环境 | 单细胞生物学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8387 | 2025-10-07 |
Targeting HMGB2 acts as dual immunomodulator by bolstering CD8+ T cell function and inhibiting tumor growth in hepatocellular carcinoma
2025-May-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ads8597
PMID:40315321
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研究论文 | 本研究通过靶向HMGB2蛋白,在肝细胞癌中实现双重免疫调节作用,既能增强CD8+ T细胞功能又能抑制肿瘤生长 | 首次发现HMGB2在CD8+ T细胞中的表达与免疫耗竭相关,并揭示其在肿瘤微环境中的双重作用机制 | NA | 探索HMGB2在肝细胞癌免疫治疗中的作用机制及治疗潜力 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的CD8+ T细胞和肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8388 | 2025-10-07 |
FMO2+ cancer-associated fibroblasts sensitize anti-PD-1 therapy in patients with hepatocellular carcinoma
2025-May-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011648
PMID:40316306
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,鉴定出FMO2+癌症相关成纤维细胞亚群,并揭示其通过CCL19-CCR7轴增强肝细胞癌患者抗PD-1治疗疗效的机制 | 首次鉴定出FMO2+ CAF亚群与抗PD-1治疗良好反应相关,并阐明其通过竞争性结合GYS1调控CCL19表达的分子机制 | 研究样本量有限,机制研究主要依赖小鼠模型,临床转化需要进一步验证 | 探索肝细胞癌免疫治疗反应异质性的细胞和分子机制 | 肝细胞癌患者样本和小鼠原位肝癌模型 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 飞行时间细胞术, 转录组分析 | 小鼠原位肝癌模型, 共培养系统 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 转录组数据 | 肝细胞癌患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
8389 | 2025-10-07 |
Combination of HDAC inhibition and cytokine enhances therapeutic HPV vaccine therapy
2025-May-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011074
PMID:40316302
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研究论文 | 本研究评估了HPV治疗性疫苗PDS0101联合免疫细胞因子NHS-IL12及组蛋白去乙酰化酶抑制剂Entinostat对HPV16阳性肿瘤的疗效 | 首次在PD-1耐药模型中证明HDAC抑制剂Entinostat联合HPV疫苗和NHS-IL12的三联疗法优于αPD-1组合 | 研究基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 开发针对HPV相关恶性肿瘤的新型联合免疫疗法 | 携带HPV16阳性TC-1和mEER肿瘤的小鼠模型 | 免疫治疗 | HPV相关恶性肿瘤 | 流式细胞术、多重免疫荧光、细胞因子检测、单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据、免疫细胞表型数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | TCR富集的单细胞RNA测序 |
8390 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling unveils a geroprotective role of Procyanidin C1 in hematopoietic immune system via senolytic and senomorphic effects
2025-May-02, npj aging
IF:4.1Q2
DOI:10.1038/s41514-025-00222-3
PMID:40316527
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了原花青素C1通过清除衰老细胞和调节衰老表型的双重作用对造血免疫系统发挥抗衰老保护作用 | 首次发现原花青素C1同时具备清除衰老细胞和调节衰老表型的双重功能,并系统阐明其在造血免疫系统中的抗衰老机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用效果仍需进一步验证 | 探究原花青素C1对造血免疫系统衰老的保护作用及分子机制 | 小鼠骨髓和脾脏组织中的造血干细胞、B细胞、衰老细胞等免疫细胞 | 单细胞生物学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序,机器学习,基因集富集分析 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 老年小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8391 | 2025-10-07 |
Identification of leukemia-enriched signature through the development of a comprehensive pediatric single-cell atlas
2025-May-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59362-5
PMID:40316535
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研究论文 | 本研究通过开发全面的儿科单细胞图谱,识别出白血病富集的基因特征 | 构建了包含超过54万个细胞的儿科白血病单细胞图谱,首次鉴定出9个白血病富集基因特征 | 样本来源包含公开数据集,可能存在批次效应;样本量相对有限 | 识别儿科白血病特异性基因特征并构建单细胞图谱资源 | 159例儿科急性白血病(髓系、淋巴系、混合表型)和健康骨髓样本 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组测序, bulk RNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 超过540,000个细胞,来自159个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8392 | 2025-10-07 |
Identification of PANoptosis related biomarkers to predict hepatic ischemia‒reperfusion injury after liver transplantation
2025-May-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99264-6
PMID:40316717
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研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定与PANoptosis相关的生物标志物,用于预测肝移植后缺血再灌注损伤 | 首次整合bulk和单细胞RNA测序数据系统分析HIRI中的PANoptosis机制,并构建基于六基因标志物的诊断预测模型 | 基于生物信息学分析的预测模型需要进一步实验验证 | 阐明肝缺血再灌注损伤的分子机制并开发预测生物标志物 | 肝移植患者肝组织样本 | 生物信息学 | 肝缺血再灌注损伤 | RNA测序,单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
8393 | 2025-10-07 |
CD55 upregulation in T cells of COVID-19 patients suppresses type-I interferon responses
2025-May-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08066-z
PMID:40316776
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研究论文 | 本研究揭示了COVID-19重症患者T细胞中CD55上调对I型干扰素反应的抑制作用 | 首次发现CD55在COVID-19重症患者T细胞中的上调可抑制I型干扰素反应,揭示了一种新的免疫调节机制 | 研究主要关注重症和危重症患者,缺乏轻症患者的比较数据 | 探究补体调节蛋白在COVID-19发病机制中的作用 | COVID-19重症和危重症患者的免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,FACS分析,基因沉默 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据 | COVID-19重症和危重症患者的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8394 | 2025-10-07 |
Integrating analysis of multi-omics summary data identifies novel plasma protein biomarkers and drug targets for bladder cancer
2025-May-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02476-5
PMID:40316856
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研究论文 | 本研究通过整合多组学汇总数据,识别与膀胱癌风险相关的血浆蛋白生物标志物和药物靶点 | 首次采用多中心大样本孟德尔随机化方法系统鉴定膀胱癌致病相关血浆蛋白,并通过多层次验证和单细胞转录组分析确认 | 研究依赖于汇总数据而非原始个体数据,可能受限于数据集的异质性和样本代表性 | 解决膀胱癌的诊断和治疗挑战,识别致病相关血浆蛋白生物标志物 | 膀胱癌患者和血浆蛋白质组数据 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 孟德尔随机化, 单细胞转录组分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 贝叶斯共定位分析 | MR, SMR, 荟萃分析 | 基因组数据, 蛋白质组数据, 转录组数据 | 来自6个研究的9个血浆蛋白数据集(5538个血浆蛋白)和3个膀胱癌数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
8395 | 2025-10-07 |
Whole-body CT scanning radiation improves the immune microenvironment of tumor tissues to enhance the antitumor effect of ICI
2025-May-02, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14119-7
PMID:40316957
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研究论文 | 本研究探讨全身CT扫描辐射如何通过改善肿瘤免疫微环境增强免疫检查点抑制剂的抗肿瘤效果 | 首次揭示CT扫描辐射可增强ICI疗效,通过增加肿瘤浸润CD8+T细胞比例和IFNγ分泌 | 回顾性临床研究,样本量有限,需要更大规模前瞻性研究验证 | 研究免疫检查点抑制剂治疗期间频繁全身CT扫描对患者抗肿瘤免疫的影响 | IV期非小细胞肺癌患者和荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序,流式细胞术 | 荷瘤小鼠模型 | 临床数据,实验数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8396 | 2025-10-07 |
Exploring ribosome biogenesis in lung adenocarcinoma to advance prognostic methods and immunotherapy strategies
2025-May-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06489-0
PMID:40316986
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索核糖体生物发生与肺腺癌的关系,构建了核糖体生物发生相关特征作为预后生物标志物 | 首次在单细胞水平系统分析核糖体生物发生与肺腺癌T细胞亚群的关系,构建了优于140个已发表模型的预后特征 | 研究样本量有限,需要更大规模验证;机制研究深度有待进一步加强 | 探索核糖体生物发生在肺腺癌中的作用,开发预后评估方法和免疫治疗策略 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,体外功能实验 | 多种机器学习算法,monocle2发育轨迹分析 | 单细胞RNA测序数据,临床数据,实验数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8397 | 2025-10-07 |
Exploring secondary extramedullary myeloma disease: a five-predictor scoring system with spotlight on double-hit cytogenetics
2025-May-02, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04086-y
PMID:40316968
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研究论文 | 本研究开发了一个用于预测继发性髓外骨髓瘤疾病(sEMD)的五预测因子评分系统 | 首次建立了包含双打击细胞遗传学在内的五因子评分系统来预测sEMD风险,并通过单细胞RNA测序揭示了DH骨髓瘤促进sEMD的潜在机制 | 研究为单中心回顾性分析,样本量相对有限(77例sEMD患者) | 识别继发性髓外骨髓瘤疾病的预测标志物并开发风险评估系统 | 618例新诊断多发性骨髓瘤患者,其中77例发展为继发性髓外疾病 | 血液肿瘤学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,时间-事件模型分析 | 风险评估评分系统 | 临床数据,基因表达数据 | 618例新诊断多发性骨髓瘤患者(77例sEMD) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8398 | 2025-10-07 |
Decoding per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) in hepatocellular carcinoma: a multi-omics and computational toxicology approach
2025-May-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06517-z
PMID:40317014
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研究论文 | 本研究通过多组学和计算毒理学方法揭示PFAS暴露驱动肝细胞癌的分子机制 | 首次整合网络毒理学、机器学习、单细胞测序和空间转录组学系统解析PFAS在肝癌中的作用机制 | 研究主要基于公共数据库和计算模拟,需要更多实验验证 | 揭示PFAS暴露导致肝细胞癌的分子机制并建立预后风险模型 | 肝细胞癌患者样本和PFAS化合物 | 计算毒理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接模拟,RT-qPCR,免疫组化染色 | 机器学习,蛋白质-蛋白质相互作用网络,生存风险模型 | 转录组数据,基因表达数据 | 多个肝细胞癌队列的公共转录组数据 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
8399 | 2025-10-07 |
PD-1 regulates the anti-tumor immune function of macrophages through JAK2-STAT3 signaling pathway in colorectal cancer tumor microenvironment
2025-May-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06469-4
PMID:40317043
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研究论文 | 本研究揭示了PD-1通过JAK2-STAT3信号通路调控结直肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞功能的机制 | 首次发现肿瘤相关巨噬细胞表达PD-1并通过JAK2-STAT3通路调控其功能,揭示了PD-1在巨噬细胞中的新作用机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证有限 | 探究PD-1在肿瘤相关巨噬细胞中的表达和功能调控机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,荧光标记小鼠模型,骨髓来源巨噬细胞培养 | 小鼠肿瘤模型 | RNA测序数据,单细胞RNA测序数据,细胞功能数据 | CT26小鼠结直肠癌细胞系,骨髓来源巨噬细胞 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
8400 | 2025-10-07 |
SlideCNA: spatial copy number alteration detection from Slide-seq-like spatial transcriptomics data
2025-May-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03573-y
PMID:40317049
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研究论文 | 开发了一种从Slide-seq类空间转录组数据中检测空间拷贝数变异(CNA)的计算工具SlideCNA | 提出表达感知的空间分箱方法,在克服数据稀疏性限制的同时保持空间信号,首次从空间转录组数据中提取CNA信号 | 仅针对Slide-seq类数据进行了测试,数据稀疏性可能仍是挑战 | 利用RNA数据识别拷贝数变异,实现空间亚克隆检测 | 乳腺癌(包括转移性乳腺癌)肿瘤组织 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组测序 | 计算工具/算法 | 空间转录组数据 | 模拟数据和真实Slide-seq数据 | NA | 空间转录组学 | Slide-seq | Slide-seq类空间转录组技术 |