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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2026-04-11 |
Long-lasting B cell convergence to distinct broadly reactive epitopes following vaccination with chimeric influenza virus hemagglutinins
2025-Apr-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.025
PMID:40132593
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和B细胞受体库测序,分析了嵌合血凝素疫苗诱导的B细胞特异性、功能和亚群,发现该疫苗能诱导针对血凝素茎部保守域的持久且广泛的B细胞应答 | 首次结合单细胞RNA测序和B细胞受体库测序技术,详细解析了嵌合血凝素疫苗诱导的B细胞应答的克隆重叠性和持久性,揭示了疫苗对记忆B细胞库的重塑作用 | 研究基于一期临床试验,样本量可能有限,且未涉及长期保护效果或不同人群的验证 | 评估嵌合血凝素疫苗诱导的B细胞应答的特异性、功能和持久性,以验证其针对流感病毒保守域的广谱保护潜力 | 接种嵌合血凝素疫苗的临床试验参与者的B细胞 | 免疫学 | 流感 | 单细胞RNA测序,B细胞受体库测序 | NA | 单细胞转录组数据,B细胞受体序列数据 | 一期临床试验参与者(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 822 | 2026-04-11 |
Tumor-derived arachidonic acid reprograms neutrophils to promote immune suppression and therapy resistance in triple-negative breast cancer
2025-Apr-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.03.002
PMID:40157359
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研究论文 | 本研究揭示了三阴性乳腺癌细胞通过积累脂质并释放携带花生四烯酸的细胞外囊泡,重编程中性粒细胞,从而促进免疫抑制和疗法抵抗的机制 | 首次发现三阴性乳腺癌细胞通过脂质积累和细胞外囊泡介导的花生四烯酸传递,重编程中性粒细胞,驱动免疫抑制和疗法抵抗 | NA | 探究三阴性乳腺癌对免疫检查点阻断和化疗联合疗法产生获得性抵抗的机制 | 三阴性乳腺癌细胞、中性粒细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 823 | 2026-04-11 |
Mapping epidermal and dermal cellular senescence in human skin aging
2025-Jan, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14358
PMID:39370688
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,绘制了人类皮肤老化过程中表皮和真皮细胞衰老的图谱,并探讨了衰老细胞在光老化和时序老化中的作用 | 开发了皮肤特异性细胞衰老基因集SenSkin™,并通过单细胞和空间分析揭示了衰老细胞在皮肤中的聚集趋势及其对色素沉着和胶原合成的影响 | NA | 通过细胞衰老的视角表征与年龄相关的皮肤功能障碍 | 人类皮肤中的表皮细胞(如黑色素细胞)和真皮细胞(如网状真皮成纤维细胞) | 数字病理学 | 皮肤老化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 824 | 2026-04-11 |
RARS1 inhibits ENO1 ubiquitination and degradation to protect against ferroptosis in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1686597
PMID:41451236
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研究论文 | 本研究探讨了RARS1基因在肝细胞癌进展中的作用,揭示了其通过调控ENO1泛素化与降解来抑制铁死亡,并作为潜在的治疗靶点 | 首次将RARS1与ENO1的泛素化降解及铁死亡抑制联系起来,并基于AR-DEGs对LIHC进行分子亚型分类,识别了AH.6809作为潜在RARS1抑制剂 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内模型验证,且临床转化潜力需进一步评估 | 探究RARS1在肝细胞癌进展中的功能机制及其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌患者数据、LIHC细胞系 | 生物信息学与分子生物学 | 肝细胞癌 | 差异表达分析、Cox回归分析、非负矩阵分解、转录组学、单细胞测序、空间转录组学、分子生物学技术 | NA | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 825 | 2026-04-11 |
Side- and Disease-Dependent Changes in Human Aortic Valve Cell Population and Transcriptomic Heterogeneity Determined by Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15121623
PMID:39766890
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了人类主动脉瓣膜中细胞群体和转录组异质性在瓣膜不同侧面及疾病进展中的变化 | 首次采用新的取样方法,独立收集主动脉瓣膜纤维侧和心室侧的富集内皮细胞样本进行单细胞RNA测序,揭示了瓣膜内皮细胞在侧面和疾病依赖下的高度异质性,并识别出多个与疾病相关的独特细胞亚群和转录因子 | 样本量较小(仅5名捐赠者),且样本涵盖了从非病变到纤维钙化阶段的不同疾病状态,可能限制了统计效力或对特定疾病阶段的深入分析 | 探究钙化性主动脉瓣膜病(CAVD)在瓣膜纤维侧优先发展的细胞和分子机制 | 人类主动脉瓣膜细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5名捐赠者的主动脉瓣膜小叶,共分析82,356个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 826 | 2026-04-11 |
Altered Purinergic Signaling and CD8+ T Cell Dysregulation in STAT3 GOF Syndrome
2024-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.12.626682
PMID:39713308
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研究论文 | 本研究探讨了STAT3功能获得性突变综合征中CD8+ T细胞功能失调的分子机制,重点关注嘌呤能信号通路的改变 | 首次揭示STAT3 GOF变异通过改变CD39、CD73和A2AR表达,导致嘌呤能信号失调,从而驱动CD8+ T细胞病理 | 研究主要基于患者样本和小鼠模型,机制细节仍需进一步验证 | 阐明STAT3 GOF变异导致CD8+ T细胞功能失调的分子机制 | STAT3 GOF患者和小鼠模型中的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 原发性免疫调节障碍 | 单细胞RNA测序、高维免疫分析、功能评估 | NA | 基因表达数据、功能数据 | STAT3 GOF患者和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 827 | 2026-04-11 |
Isolation and Comprehensive Analysis of Cochlear Tissue-Derived Small Extracellular Vesicles
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408964
PMID:39497619
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研究论文 | 本研究评估了三种耳蜗组织消化及耳蜗组织来源的小细胞外囊泡(CDsEV)分离方法,首次提出使用胶原酶D和DNase I结合蔗糖密度梯度离心作为最优分离方法,并全面分析了CDsEV的内容物和细胞来源 | 首次提出并验证了使用胶原酶D和DNase I结合蔗糖密度梯度离心作为耳蜗组织来源小细胞外囊泡(CDsEV)的最优分离方法,并首次通过单CDsEV测序与单细胞RNA测序数据的联合分析来追踪CDsEV的细胞来源 | 研究主要基于方法学优化和初步分析,未深入探讨CDsEV在耳蜗疾病中的具体作用机制或进行大规模临床验证 | 评估耳蜗组织来源小细胞外囊泡(CDsEV)的分离方法,并分析其内容物和细胞来源,以增强对耳蜗内CDsEV功能的理解 | 耳蜗组织来源的小细胞外囊泡(CDsEV)及其内容物(miRNAs和蛋白质) | 生物医学研究 | 听力相关疾病 | 小RNA测序、蛋白质组学、单CDsEV测序、单细胞RNA测序 | NA | 测序数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 828 | 2026-04-11 |
Targeting immune-fibroblast cell communication in heart failure
2024-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08008-5
PMID:39443792
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞分析揭示了心力衰竭中免疫细胞与成纤维细胞间的通讯机制,并验证了靶向IL-1β信号通路可减轻心肌纤维化并改善心脏功能 | 首次在人类心脏疾病中系统解析免疫-成纤维细胞通讯的分子机制,并发现CCR2巨噬细胞通过IL-1β信号驱动FAP/POSTN成纤维细胞分化的空间特异性机制 | 样本量相对有限(45例),且主要依赖观察性数据和动物模型验证,未涉及长期临床疗效评估 | 探究人类心脏疾病中免疫细胞与成纤维细胞通讯的分子机制,并开发针对心肌纤维化的治疗策略 | 健康供体、急性梗死和慢性心力衰竭的人类心脏组织样本,以及小鼠心脏损伤模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞多组学分析(基因表达、表位定位、染色质可及性)、空间转录组学、遗传谱系追踪 | NA | 单细胞基因表达数据、表位数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 45例人类心脏样本(包括健康、急性梗死和慢性心力衰竭)及多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 829 | 2026-04-11 |
Multiplex, single-cell CRISPRa screening for cell type specific regulatory elements
2024-09-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52490-4
PMID:39294132
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研究论文 | 本文提出了一种结合多重CRISPRa扰动与单细胞RNA测序的实验框架,用于识别细胞类型特异性的顺式调控元件及其调控基因 | 开发了一种将高度多重CRISPRa扰动与scRNA-seq结合的新方法,首次在单细胞水平上系统评估细胞类型特异性增强子和启动子对基因表达的调控作用 | 研究仅针对K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元两种细胞类型,未涵盖更广泛的细胞类型或体内环境 | 开发一种高通量筛选方法,以识别细胞类型特异性的CRISPRa响应顺式调控元件及其靶基因 | K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍和神经发育障碍 | CRISPRa, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用493个gRNA靶向候选顺式调控元件 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 830 | 2026-04-11 |
In vivo single-cell CRISPR uncovers distinct TNF programmes in tumour evolution
2024-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07663-y
PMID:39020166
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研究论文 | 本研究开发了一种体内单细胞CRISPR策略,系统性研究了150个最常见突变的鳞状细胞癌基因在组织范围内的克隆动态,揭示了肿瘤坏死因子(TNF)信号模块在肿瘤演化中的不同作用 | 开发了结合超声引导子宫内慢病毒显微注射、单细胞RNA测序和引导捕获的体内单细胞CRISPR筛选策略,首次在哺乳动物组织中纵向监测克隆扩张并记录其单细胞转录组水平的基因程序 | 研究主要聚焦于鳞状细胞癌相关基因,其他癌症类型的普适性有待验证;体内模型的复杂性可能限制某些机制的完全解析 | 探究正常组织中克隆扩张的机制,以及为何仅有少数克隆最终转化为恶性肿瘤 | 鳞状细胞癌相关基因、上皮组织克隆、肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞CRISPR筛选、单细胞RNA测序、引导捕获测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及150个最常见突变的鳞状细胞癌基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 831 | 2026-04-11 |
Elucidating the Transcriptional States of Spermatogenesis-Joint Analysis of Germline and Supporting Cell, Mice and Human, Normal and Perturbed, Bulk and Single-Cell RNA-Seq
2024-07-12, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070840
PMID:39062554
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综述 | 本文综述了精子发生研究的分子基础,强调通过整合分析(包括正常与病理状态、小鼠与人类数据、表型与分子谱、生殖细胞与支持细胞)来推进对男性不育精准医学的理解 | 提出了精子发生研究的四个整合轴,结合单细胞RNA测序等先进技术,揭示生殖细胞发育新阶段和睾丸微环境中的未知细胞亚型 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,且依赖于现有研究的整合,可能受限于当前技术和方法的不完全覆盖 | 阐明精子发生的转录状态,以促进对男性不育的精准医学诊断和治疗策略的开发 | 生殖细胞(如精原细胞)和支持细胞(如Sertoli细胞和Leydig细胞),涉及小鼠和人类样本 | 自然语言处理 | 男性不育 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 832 | 2026-04-11 |
Targeting Microglia in Alzheimer's Disease: Pathogenesis and Potential Therapeutic Strategies
2024-07-11, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070833
PMID:39062547
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综述 | 本文综述了小胶质细胞在阿尔茨海默病发病机制中的作用,并探讨了以该细胞为靶点的潜在治疗策略 | 系统总结了基于单细胞测序技术揭示的小胶质细胞在AD病程中的动态表型变化,并提出了针对小胶质细胞功能增强与神经炎症抑制的双重治疗策略框架 | NA | 阐明小胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用机制并探索相关治疗策略 | 小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 833 | 2026-04-11 |
Pan-cancer analysis of super-enhancer-induced LINC00862 and validation as a SIRT1-promoting factor in cervical cancer and gastric cancer
2024-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101982
PMID:38718436
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研究论文 | 本文通过泛癌分析探讨了LINC00862的生物学意义,并验证了其在宫颈癌和胃癌中作为SIRT1促进因子的作用 | 揭示了LINC00862作为超级增强子诱导的基因,通过竞争性结合miR-29c-3p释放SIRT1的促癌功能,并验证了其作为免疫治疗疗效预测生物标志物的潜力 | NA | 探索LINC00862在泛癌中的生物学意义及其作为免疫治疗生物标志物的潜力 | LINC00862基因在多种癌症中的表达及其调控机制 | 生物信息学 | 宫颈癌,胃癌 | 生物信息学分析,染色质免疫沉淀,RNA免疫沉淀,虚拟筛选,体外和体内实验 | NA | TCGA数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 834 | 2026-04-11 |
Accurate Identification of Spatial Domain by Incorporating Global Spatial Proximity and Local Expression Proximity
2024-06-09, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060674
PMID:38927077
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研究论文 | 本文提出了一种名为SECE的深度学习方法,用于准确识别空间转录组学数据中的空间域,通过整合全局空间邻近性和局部表达邻近性来优化组织微环境和生物功能分析 | SECE方法首次同时捕捉局部和全局空间关系,并利用表达相似性和空间相似性聚合信息,克服了现有方法仅基于局部或全局关系进行分割的局限性 | NA | 提高空间转录组学数据中空间域识别的准确性,以更好地阐明组织微环境和生物功能 | 空间转录组学数据中的空间点(spots) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 空间转录组学数据 | 六个真实空间转录组学数据集,涵盖四个不同平台 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 835 | 2026-04-11 |
MYCT1 controls environmental sensing in human haematopoietic stem cells
2024-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07478-x
PMID:38839950
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研究论文 | 本研究揭示了MYCT1在调控人类造血干细胞内吞和环境感知中的关键作用,以维持干细胞特性 | 首次将MYCT1识别为人类造血干细胞的关键调节因子,通过控制内吞作用和环境感知来维持干细胞特性,并发现其在细胞培养中下调是HSC扩增的脆弱点 | 研究主要基于胎儿肝脏和脐带血来源的HSPCs,未涉及成人或其他来源的造血干细胞,且机制细节如MYCT1与信号通路的相互作用需进一步探索 | 探究人类造血干细胞自我更新和移植能力的调控机制,以改善体外培养扩增功能 | 人类造血干细胞和祖细胞(HSPCs),包括胎儿肝脏和脐带血来源 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序,慢病毒介导的基因敲低和过表达 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类胎儿肝脏和脐带血HSPCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 836 | 2026-04-11 |
Multiplex, single-cell CRISPRa screening for cell type specific regulatory elements
2024-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.28.534017
PMID:37034704
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研究论文 | 本文介绍了一种结合多重CRISPRa扰动与单细胞RNA测序的实验框架,用于识别细胞类型特异性调控元件及其调控基因 | 开发了一种新方法,通过随机组合多个gRNA并利用单细胞RNA测序分析,系统性地测试CRISPRa对增强子和启动子的扰动效果,实现了细胞类型特异性调控元件的大规模筛选 | 方法可能依赖于细胞特定的染色质景观或额外作用因子,限制了在某些细胞类型中的普适性,且样本规模相对较小 | 旨在识别细胞类型特异性、CRISPRa响应的调控元件,以促进基因治疗中靶向基因激活的gRNA筛选 | K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元 | 基因编辑与单细胞组学 | 自闭症谱系障碍和神经发育障碍 | CRISPRa、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用493个gRNA靶向候选调控元件,在K562细胞和iPSC衍生神经元中进行测试 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 837 | 2026-04-11 |
Universal recording of immune cell interactions in vivo
2024-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07134-4
PMID:38448581
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研究论文 | 本文报道了一种名为uLIPSTIC的通用技术,用于在体内记录免疫细胞之间以及免疫与非免疫细胞之间的瞬时物理相互作用 | 开发了通用版本的LIPSTIC技术,不再依赖特定受体-配体通路,能够记录任意细胞间的物理相互作用 | 未明确提及技术本身的局限性,但暗示了先前版本仅能测量特定细胞间相互作用的限制 | 开发一种通用技术以在体内记录细胞间的物理相互作用 | 免疫细胞(如CD8 T细胞、树突状细胞、调节性T细胞、滤泡辅助T细胞)与非免疫细胞(如肠道上皮细胞) | 免疫学 | NA | LIPSTIC/uLIPSTIC技术,单细胞转录组学 | NA | 分子标记数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 838 | 2026-04-11 |
Transcription factor NFYa controls cardiomyocyte metabolism and proliferation during mouse fetal heart development
2023-12-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.10.012
PMID:37972593
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子NFYa在小鼠胎儿心脏发育过程中调控心肌细胞代谢和增殖的作用 | 揭示了NFYa通过与辅因子SP2相互作用,在转录水平激活连接代谢和增殖的基因,这是先前未被识别的心脏代谢转录调控机制 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类,且未深入探讨NFYa在成年心脏再生中的具体作用 | 探究NFYa在协调心肌细胞代谢和增殖中的机制,以理解胎儿心脏发育和再生的调控 | 小鼠胎儿心脏中的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组分析,单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 839 | 2026-04-11 |
Universal recording of cell-cell contacts in vivo for interaction-based transcriptomics
2023-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.533003
PMID:36993443
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研究论文 | 本文介绍了一种通用版本的LIPSTIC技术(uLIPSTIC),用于在体内记录细胞间物理相互作用,并结合单细胞转录组学分析免疫细胞与非免疫细胞间的互作网络 | 开发了不依赖于特定受体-配体对的通用细胞间接触记录技术,扩展了原LIPSTIC技术的应用范围 | 未明确说明技术灵敏度或可能存在的假阳性/假阴性问题 | 开发通用技术以研究免疫细胞与非免疫细胞间的瞬时物理相互作用 | 免疫细胞(CD8 T细胞、调节性T细胞、滤泡辅助T细胞)与肠道上皮细胞等非免疫细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 840 | 2026-04-11 |
Targeting Immune-Fibroblast Crosstalk in Myocardial Infarction and Cardiac Fibrosis
2023-Jan-26, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2402606/v1
PMID:36747878
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞分析揭示了人类心肌梗死和心脏纤维化中免疫-成纤维细胞交互作用的分子机制 | 首次在人类心脏疾病中系统探索免疫-成纤维细胞交互的分子机制,并识别出由IL-1β信号驱动的促纤维化成纤维细胞亚群 | 样本量相对有限(38名捐赠者),且动物模型与人类疾病表型的完全重现性仍有待验证 | 探究心肌梗死和心脏纤维化中免疫细胞与成纤维细胞之间的交互作用机制 | 人类心脏组织(急性梗死和慢性衰竭心脏)以及小鼠心脏损伤模型 | 单细胞多组学 | 心血管疾病 | 单细胞基因表达分析、表位映射、染色质可及性分析、空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据、空间转录组数据 | 38名捐赠者的人类心脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 | NA | NA |