单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
821	2025-07-18	Targeting KIT With Antibody-Drug Conjugates in Chromophobe Renal Cell Carcinoma 2025-Aug, Clinical genitourinary cancer IF:2.3Q2 DOI:10.1016/j.clgc.2025.102359 PMID:40408838	研究论文	该研究探讨了在嗜铬肾细胞癌（ChRCC）中靶向KIT的抗体-药物偶联物（ADC）的治疗潜力	首次在ChRCC中测试了靶向KIT的ADC，并证实其有效性	研究仅基于细胞系和有限的患者样本，未进行大规模临床试验	探索KIT作为ChRCC治疗靶点的可行性	嗜铬肾细胞癌（ChRCC）细胞系和患者样本	肿瘤学	肾细胞癌	单细胞RNA测序、Western blot分析	NA	RNA表达数据、蛋白质表达数据	15例转移性ChRCC样本和5个ChRCC细胞系
822	2025-07-18	SOX11 and GLIS2: Novel Biomarkers for Understanding the Progression of Oral Leukoplakia 2025-Aug, International dental journal IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.identj.2025.100872 PMID:40543136	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和大块RNA测序数据，探讨了口腔白斑病（LP）进展中的转录调控机制，并鉴定了SOX11和GLIS2作为潜在的生物标志物	首次将单细胞RNA测序技术应用于LP研究，发现SOX11和GLIS2作为LP特异性分子标志物，并揭示其通过调控EMT和血管生成影响疾病进展	研究样本量有限，且主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平的功能验证	探索口腔白斑病进展的分子机制并寻找潜在生物标志物	口腔白斑病（LP）组织样本和口腔鳞状细胞癌（OSCC）样本	数字病理学	口腔癌	单细胞RNA测序，大块RNA测序，免疫组化染色	NA	RNA测序数据，临床生存数据	LP组织样本和TCGA数据库中的OSCC样本
823	2025-07-18	Decoding Cellular Landscapes: Unravelling Periodontitis and Periapical Periodontitis at the Single-Cell Frontier 2025-Aug, International dental journal IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.identj.2025.100851 PMID:40554261	研究论文	通过分析单细胞RNA测序数据，揭示了牙周炎和根尖周炎在牙槽骨中关键基因表达和细胞异质性的差异	首次在单细胞水平上比较了牙周炎和根尖周炎的关键基因表达和细胞异质性，并识别了疾病特异性的关键基因和细胞类型	研究仅基于公开可用的单细胞RNA测序数据集，未进行独立实验验证	阐明牙周炎和根尖周炎在牙槽骨中的分子和细胞差异	牙周炎和根尖周炎患者的牙槽骨组织	单细胞组学	牙周炎和根尖周炎	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)	NA	单细胞RNA测序数据	两个公开数据集(GSE171213和GSE181688)
824	2025-07-18	Integrated Analyses to Identify the Roles of GPX1 in Frailty and Hypertension 2025-Aug, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979) DOI:10.1161/HYPERTENSIONAHA.125.24664 PMID:40575858	研究论文	通过整合分析确定GPX1在衰弱和高血压中的作用	首次通过两样本孟德尔随机化分析评估2532个可药物化基因对衰弱和高血压的因果效应，并利用RNA表达谱和单细胞RNA测序进行验证	研究主要基于遗传学和分子水平分析，缺乏临床干预实验验证	确定衰弱和高血压的有效药物靶点	老年人群中的衰弱和高血压患者	生物医学研究	老年疾病	两样本孟德尔随机化分析, RNA表达谱, 单细胞RNA测序, 分子对接	NA	遗传数据, RNA测序数据	2532个可药物化基因的分析
825	2025-07-18	Interleukin (IL)-34 promotes the inflammatory role of IL-1β-producing myeloid cells in pemphigus lesions 2025-Jul-17, The British journal of dermatology DOI:10.1093/bjd/ljaf130 PMID:40203120	研究论文	研究探讨了髓系细胞在天疱疮病变中形成异位淋巴样结构（ELS）的作用，并揭示了IL-34/CSF-1R通路作为潜在治疗靶点	首次发现IL-1β产生的髓系细胞（IL1B_Macro）是天疱疮病变中的主要髓系亚群，并揭示IL-34和TNF-α协同促进其分化	研究主要基于体外实验和单细胞测序数据，尚未进行体内功能验证	探究髓系细胞在天疱疮病变中形成ELS的机制并寻找潜在治疗靶点	天疱疮患者的皮肤病变组织	免疫病理学	天疱疮	scRNA-seq, IHC, 免疫荧光, 流式细胞术, bulk RNA-seq, Transwell趋化实验	NA	单细胞转录组数据, 免疫组织化学数据, 流式细胞数据	天疱疮患者的皮肤病变组织样本（未明确数量）
826	2025-07-18	An unbiased genomewide screen uncovers 7 genes that drive hematopoietic stem cell fate from mouse embryonic stem cells 2025-Jul-17, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024027742 PMID:40209065	研究论文	通过全基因组CRISPR激活筛选，发现了7个基因在小鼠胚胎干细胞向造血干细胞分化过程中的关键作用	采用了一种新颖且无偏的全基因组CRISPR激活筛选方法，首次鉴定了7个在造血干细胞命运决定中起关键作用的基因	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类细胞中验证	探索体外生成造血干细胞的关键调控因素	小鼠胚胎干细胞和造血干细胞	再生医学	血液系统疾病	全基因组CRISPR激活筛选、单细胞RNA测序	小鼠模型	基因组数据、转录组数据	未明确说明具体样本数量，使用了小鼠胚胎干细胞和免疫缺陷NSG小鼠
827	2025-07-18	PLAUR+ Neutrophils Drive Anti-PD-1 Therapy Resistance in Patients with Hepatocellular Carcinoma by Shaping an Immunosuppressive Microenvironment 2025-Jul-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202507167 PMID:40673864	研究论文	该研究揭示了PLAUR+中性粒细胞在肝细胞癌患者中通过塑造免疫抑制微环境驱动抗PD-1治疗耐药的作用	首次发现PLAUR+中性粒细胞在免疫治疗无应答者中富集，并通过多组学分析揭示其在塑造免疫抑制微环境中的关键作用，同时发现一种新型PLAUR抑制剂可逆转中性粒细胞的免疫抑制表型	研究主要基于临床队列和临床前模型，需要进一步在更大规模的临床试验中验证PLAUR抑制剂的疗效	探索肝细胞癌中免疫治疗耐药的机制并寻找潜在的治疗策略	肝细胞癌患者和临床前模型中的PLAUR+中性粒细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	多组学分析、空间转录组学、单细胞RNA测序、基于结构的虚拟筛选	NA	临床数据、测序数据	未明确提及具体样本数量，涉及临床队列和多种体内肿瘤模型
828	2025-07-18	ER-phagy Activation by AMFR Attenuates Cardiac Fibrosis Post-Myocardial Infarction via mTORC1 Pathway 2025-Jul-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202504552 PMID:40673870	研究论文	本研究探讨了自分泌运动因子受体(AMFR)通过激活ER-phagy减轻心肌梗死后心脏纤维化的机制	首次揭示了AMFR通过调节FAM134B介导的ER-phagy活性抑制心脏纤维化的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证	探究ER-phagy在心肌梗死后心脏纤维化中的作用机制	心肌梗死后的小鼠心脏组织和心脏成纤维细胞	心血管疾病	心血管疾病	scRNA-seq分析	基因敲除小鼠模型	基因表达数据	小鼠心脏组织和体外培养的心脏成纤维细胞
829	2025-07-18	The Evolutionary Trajectory and Prognostic Value of GITR+ Tregs Reprogramed by Tumor-Intrinsic PD-1/c-MET Signaling in Pancreatic Cancer 2025-Jul-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202500806 PMID:40673866	研究论文	本研究探讨了胰腺导管腺癌(PDAC)中肿瘤固有PD-1/c-MET信号通路对GITR+ Tregs的进化轨迹和预后价值的影响	首次揭示了MET-IL-23-STAT4轴在PDAC中介导GITR+ Tregs免疫逃逸的机制，并证明MET抑制与GITR激动剂联合治疗可增强抗肿瘤免疫	研究主要基于临床前模型，需要进一步临床试验验证	探究PDAC中肿瘤固有PD-1/c-MET信号通路的免疫调节作用及其治疗潜力	胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本和原位PDAC模型	肿瘤免疫学	胰腺癌	单细胞RNA测序	原位PDAC模型	基因表达数据	未明确说明患者样本数量，使用原位PDAC模型
830	2025-07-18	Antibiotic treatment limits survival of peripheral and bone marrow B cell populations 2025-Jul-16, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2024013694 PMID:40668665	研究论文	该研究探讨了长期或广谱抗生素治疗对小鼠骨髓和外周B细胞群体的影响	首次发现抗生素治疗会导致骨髓B细胞在所有发育阶段的显著耗竭，并揭示了MYC信号通路在维持B细胞祖细胞存活中的关键作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究抗生素治疗对造血系统特别是B细胞群体的影响机制	小鼠骨髓和外周B细胞群体	免疫学	NA	单细胞RNA测序、流式细胞术	小鼠模型	基因表达数据、细胞计数数据	NA
831	2025-07-18	Systemic administration of an RNA binding and cell-penetrating antibody targets therapeutic RNA to multiple mouse models of cancer 2025-Jul-16, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adk1868 PMID:40668891	研究论文	本研究开发了一种名为TMAB3的抗体，能够与RNA形成稳定的复合物，实现RNA在肿瘤细胞中的特异性递送，并在多种癌症小鼠模型中展现出抗肿瘤效果	利用具有肿瘤靶向、细胞穿透和RNA结合能力的单克隆抗体TMAB3，形成稳定的抗体/RNA复合物，实现RNA在肿瘤细胞中的高效特异性递送	研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	开发一种能够特异性递送治疗性RNA至肿瘤细胞的抗体平台，用于癌症治疗	胰腺癌、髓母细胞瘤和黑色素瘤的小鼠模型	肿瘤治疗	胰腺癌、髓母细胞瘤、黑色素瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术	小鼠模型	RNA测序数据、流式细胞数据	多种癌症小鼠模型（具体数量未明确说明）
832	2025-07-18	Excitatory synaptic transmission is differentially modulated by opioid receptors along the claustro-cingulate pathway 2025-Jul-16, eNeuro IF:2.7Q3 DOI:10.1523/ENEURO.0219-25.2025 PMID:40670155	research paper	研究阿片受体如何调节claustro-cingulate通路中的兴奋性突触传递	揭示了KOR、MOR和DOR阿片受体在CLA-ACC通路中对突触传递的不同调节作用，特别是KOR的独特作用	研究仅在小鼠中进行，尚未在人类中验证	探究阿片受体对claustro-cingulate环路中谷氨酸能信号传递的调节作用	小鼠的claustrum（CLA）和前扣带回皮层（ACC）	神经科学	疼痛和情绪障碍	空间转录组学、脑片电生理学、光遗传学和药理学方法	NA	电生理数据	小鼠（性别未具体说明数量）
833	2025-07-18	Long-read RNA sequencing of transposable elements from single cells using CELLO-seq 2025-Jul-16, Nature protocols IF:13.1Q1 DOI:10.1038/s41596-025-01203-2 PMID:40670609	研究论文	介绍了一种名为CELLO-seq的单细胞长读RNA测序协议，用于将转座元件(TEs)来源的读数映射到独特的基因组位点	CELLO-seq通过整合长50核苷酸独特分子标识符和高PCR重复数，实现了对长读的错误校正，从而能够高保真地将表达数据映射到高度序列相似的年轻TEs以及基因和TE异构体	需要具备分子生物学和转录组分析经验的用户，且从细胞分离到定量需要一周时间完成	开发一种能够高保真映射转座元件(TEs)表达数据到独特基因组位点的单细胞长读RNA测序方法	转座元件(TEs)和基因在单细胞中的表达	基因组学	NA	长读RNA测序(CELLO-seq)	NA	RNA序列数据	NA
834	2025-07-18	Ongoing genome doubling shapes evolvability and immunity in ovarian cancer 2025-Jul-16, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-09240-3 PMID:40670783	研究论文	探讨全基因组加倍（WGD）对卵巢癌体细胞进化和免疫逃逸的影响	首次在单细胞分辨率下研究WGD对卵巢癌的影响，并开发了新的WGD时序分析方法doubleTime	研究样本仅限于高级别浆液性卵巢癌，可能不适用于其他癌症类型	理解WGD在卵巢癌发展和免疫逃逸中的作用	高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤样本	癌症基因组学	卵巢癌	单细胞全基因组测序，单细胞RNA测序，高分辨率免疫荧光显微镜	NA	基因组数据，转录组数据，图像数据	41名患者的70个高级别浆液性卵巢癌样本（30,260个肿瘤基因组）
835	2025-07-18	A Machine Learning-Based Strategy Predicts Selective and Synergistic Drug Combinations for Relapsed Acute Myeloid Leukemia 2025-Jul-15, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3840 PMID:40354625	研究论文	本研究开发了一种基于机器学习的策略，用于预测复发/难治性急性髓系白血病（AML）的选择性和协同药物组合	利用单细胞转录组学和单药响应谱，结合机器学习，个性化预测针对治疗耐药性癌细胞的药物组合	初步实验仅在临床试验样本中进行，需要更大规模的验证	改善复发/难治性急性髓系白血病（AML）患者的治疗效果	复发/难治性急性髓系白血病（AML）患者	机器学习	急性髓系白血病	单细胞转录组学	机器学习	转录组数据	临床试验样本（具体数量未提及）
836	2025-07-18	Interferon-responsive HEVs drive tumor tertiary lymphoid structure formation and predict immunotherapy response in nasopharyngeal carcinoma 2025-Jul-15, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102200 PMID:40543508	研究论文	该研究通过整合空间转录组学和泛癌单细胞图谱，揭示了鼻咽癌中三级淋巴结构（TLSs）的特征，并发现了一类干扰素反应性高内皮小静脉（IFN-HEVs）与肿瘤特异性趋化因子CXCL9的关联	首次揭示了IFN-HEVs在肿瘤TLS形成中的作用，并开发了预测免疫检查点阻断（ICB）治疗效果的CTRscore评分系统	研究主要聚焦于鼻咽癌，其他癌症类型中IFN-HEVs的作用尚不明确	探究肿瘤TLS形成的驱动因素及其在免疫治疗中的作用	鼻咽癌患者样本	肿瘤免疫学	鼻咽癌	空间转录组学、单细胞测序	NA	转录组数据	三个独立的鼻咽癌队列
837	2025-07-18	Cardiolipin-mimic lipid nanoparticles without antibody modification delivered senolytic in vivo CAR-T therapy for inflamm-aging 2025-Jul-15, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102209 PMID:40602406	研究论文	本研究开发了一种基于mRNA的体内CAR-T细胞疗法，使用模拟心磷脂的脂质纳米颗粒递送senolytic药物，无需抗体修饰	首次发现心磷脂类似物二磷酰胺脂质可提高T细胞转染效率，无需靶向配体，并利用PL40脂质纳米颗粒递送靶向uPAR的CAR mRNA	未明确说明该疗法的长期安全性和潜在副作用	开发更高效的体内CAR-T细胞疗法以治疗衰老相关炎症性疾病	T细胞、衰老相关炎症性疾病（如肝纤维化和类风湿性关节炎）	生物医学工程	类风湿性关节炎、肝纤维化	mRNA递送技术、单细胞测序、scFv人源化筛选	NA	实验数据、单细胞测序数据	未明确说明具体样本数量，但涉及体外和体内实验
838	2025-07-18	Deciphering the role of CAPZA2 in neurodevelopmental disorders: insights from mouse models 2025-Jul-15, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-025-08385-1 PMID:40659881	research paper	本研究通过小鼠模型探讨CAPZA2基因在神经发育障碍中的作用	首次使用CAPZA2杂合敲除和点突变小鼠模型揭示CAPZA2在神经发育中的关键作用	研究仅限于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证	阐明CAPZA2基因在神经发育障碍中的分子机制	CAPZA2杂合敲除(CAPZA2)和点突变(CAPZA2)小鼠模型	神经科学	神经发育障碍	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	小鼠基因编辑模型	基因表达数据、行为学数据、形态学数据	未明确说明具体数量，使用CAPZA2和CAPZA2两种基因编辑小鼠品系
839	2025-07-18	Blocking calcium-MYC regulatory axis inhibits early dedifferentiation of chondrocytes and contributes to cartilage regeneration 2025-Jul-15, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-025-04483-3 PMID:40660304	研究论文	本研究通过单细胞测序和转座酶可及染色质测序技术，揭示了软骨细胞体外扩增过程中的去分化现象及其机制，并提出了通过抑制钙-MYC调控轴来优化软骨再生系统的新策略	首次发现钙内流增加与软骨细胞早期去分化密切相关，并证实抑制钙信号可逆转细胞表型并促进软骨再生	研究主要基于体外实验，未在体内模型中验证钙-MYC调控轴的作用	阐明软骨细胞去分化机制并优化软骨再生系统	耳廓软骨细胞	组织工程	软骨缺损	单细胞测序、转座酶可及染色质测序(ATAC-seq)	NA	单细胞转录组数据、染色质可及性数据	不同传代次数的软骨细胞(P3和P6)
840	2025-07-18	In-depth patient-specific analysis of tumor heterogeneity in melanoma brain metastasis: Insights from spatial transcriptomics and multi-region bulk sequencing 2025-Jul-15, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102468 PMID:40669378	研究论文	本研究通过多组学方法对黑色素瘤脑转移患者的肿瘤异质性进行了深入分析	整合空间转录组学与多区域批量外显子组、蛋白质组和转录组分析，揭示了患者特异性免疫细胞浸润和肿瘤异质性	样本量较小（仅4例患者样本），可能影响结果的普遍性	探索黑色素瘤脑转移的分子和细胞特征，以指导有效治疗策略的开发	黑色素瘤脑转移患者的肿瘤组织	数字病理学	黑色素瘤	空间转录组学、批量外显子组测序、蛋白质组分析、转录组分析	NA	空间转录组数据、外显子组数据、蛋白质组数据、转录组数据	4例患者样本