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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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821 | 2025-10-05 |
An integrated study to decipher immunosuppressive cellular communication in the PDAC environment
2023-11-10, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-023-00320-6
PMID:37945567
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研究论文 | 通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示胰腺导管腺癌免疫抑制微环境中肿瘤相关巨噬细胞通过LGALS9基因介导的细胞通讯机制 | 首次整合多种转录组学技术系统解析PDAC免疫抑制微环境中的细胞通讯网络,发现TAMs通过LGALS9-P4HB相互作用轴在免疫抑制中的核心作用 | 研究样本量有限,机制验证实验不足,需要进一步功能实验确认LGALS9-P4HB相互作用的生物学意义 | 解析胰腺导管腺癌免疫抑制微环境中的细胞通讯机制 | 胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的各类细胞,特别是肿瘤相关巨噬细胞 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
822 | 2025-10-05 |
Transgenic ferret models define pulmonary ionocyte diversity and function
2023-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06549-9
PMID:37730992
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研究论文 | 本研究通过构建转基因雪貂模型揭示肺离子细胞的多样性和功能 | 首次在非啮齿类哺乳动物中建立条件性遗传雪貂模型,用于研究肺离子细胞生物学 | 研究仅限于雪貂模型,需要进一步验证在人类中的适用性 | 阐明肺离子细胞在气道生理和囊性纤维化疾病中的作用 | 转基因雪貂模型和囊性纤维化雪貂模型 | 发育生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞转录组测序, 体内谱系追踪 | 条件性遗传模型 | 基因表达数据, 生理功能数据 | 多种转基因雪貂模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
823 | 2025-10-05 |
Single-cell brain organoid screening identifies developmental defects in autism
2023-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06473-y
PMID:37704762
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研究论文 | 开发CHOOSE系统用于自闭症高风险基因的脑类器官筛选,揭示这些基因对细胞命运决定的影响 | 开发了CRISPR-人类类器官-单细胞RNA测序(CHOOSE)系统,首次在嵌合类器官中进行高通量功能缺失筛选 | 研究仅限于36个高风险自闭症基因,且类器官模型可能无法完全模拟人脑发育的复杂性 | 研究自闭症谱系障碍相关基因在人类大脑发育过程中的作用机制 | 人类脑类器官和患者特异性诱导多能干细胞衍生的类器官 | 发育生物学 | 自闭症谱系障碍 | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 染色质分析 | 基因调控网络 | 单细胞转录组数据, 染色质数据 | 36个高风险自闭症基因的扰动分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
824 | 2025-10-05 |
Inferring and perturbing cell fate regulomes in human brain organoids
2023-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05279-8
PMID:36198796
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术分析人脑类器官发育过程,建立了基因调控网络推断框架Pando,并利用遗传扰动揭示了转录因子GLI3在端脑命运决定中的关键作用 | 开发了整合多组学数据的Pando框架来推断全局基因调控网络,并通过单细胞水平的遗传扰动验证转录因子功能 | 基于类器官模型的研究可能无法完全模拟体内大脑发育的复杂性 | 解析人脑发育过程中的基因调控网络 | 人多能干细胞衍生的神经类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序, 单细胞染色质可及性检测, 遗传扰动 | 基因调控网络推断模型 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 密集时间点的类器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
825 | 2025-10-05 |
A spatially resolved single-cell genomic atlas of the adult human breast
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06252-9
PMID:37380767
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研究论文 | 构建了成人乳腺单细胞和空间分辨率的综合基因组图谱 | 首次在单细胞和空间分辨率上构建了成人乳腺综合图谱,揭示了丰富的血管周围、内皮和免疫细胞群体以及高度多样化的管腔上皮细胞状态 | NA | 研究成人正常乳腺组织的细胞组成和空间结构 | 126名女性的714,331个细胞和20名女性的117,346个细胞核 | 单细胞基因组学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学,空间映射 | NA | 单细胞转录组数据,空间数据 | 714,331个细胞来自126名女性,117,346个细胞核来自20名女性 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | 使用了四种不同的空间映射技术 |
826 | 2025-10-05 |
Mammary duct luminal epithelium controls adipocyte thermogenic programme
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06361-5
PMID:37495690
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研究论文 | 本研究揭示了乳腺导管上皮细胞通过分泌因子调控脂肪细胞产热程序的新机制 | 首次发现乳腺导管上皮细胞通过分泌'乳腺因子'调控脂肪细胞UCP1表达,揭示了交感神经-乳腺导管接触点对脂肪产热的抑制作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类中的相关性需要进一步验证 | 探究乳腺导管上皮细胞在脂肪细胞产热调控中的作用机制 | 雌性小鼠皮下白色脂肪组织和乳腺导管上皮细胞 | 细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序,3D全组织免疫荧光成像 | NA | 基因表达数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
827 | 2025-10-05 |
Mitochondrial integrated stress response controls lung epithelial cell fate
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06423-8
PMID:37558881
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研究论文 | 本研究揭示了线粒体复合物I通过NAD再生调控肺上皮细胞命运的新机制 | 首次发现线粒体复合物I依赖的NAD再生在肺泡发育中通过抑制整合应激反应控制细胞命运 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需验证 | 探索肺上皮细胞命运的代谢调控机制 | 小鼠肺上皮细胞 | 细胞生物学 | 肺发育疾病 | 单细胞RNA测序, 基因敲除 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
828 | 2025-10-05 |
Diverse clonal fates emerge upon drug treatment of homogeneous cancer cells
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06342-8
PMID:37468627
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研究论文 | 本研究开发了FateMap框架,通过DNA条形码和单细胞RNA测序技术揭示了癌细胞在抗癌治疗中的克隆命运多样性 | 开发了结合DNA条形码和单细胞RNA测序的FateMap框架,首次系统揭示了癌细胞耐药类型的多样性及其内在决定机制 | NA | 探究遗传相同癌细胞在药物治疗下产生不同耐药类型的机制 | 单细胞来源的癌细胞系和患者样本 | 单细胞生物学 | 癌症 | DNA条形码技术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 数十万个克隆 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
829 | 2025-10-05 |
Pharmacological targeting of netrin-1 inhibits EMT in cancer
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06372-2
PMID:37532929
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研究论文 | 本研究通过药理学方法靶向netrin-1抑制癌症中的上皮间质转化 | 首次发现netrin-1在EMT中的关键作用,并开发了靶向netrin-1的单克隆抗体NP137作为新型治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类癌细胞系,需要更多临床验证 | 开发靶向上皮间质转化的癌症治疗新方法 | 皮肤鳞状细胞癌小鼠模型和A549人类癌细胞系 | 癌症生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,基因敲低 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
830 | 2025-10-05 |
A spatially resolved single cell genomic atlas of the adult human breast
2023-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.22.537946
PMID:37163043
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研究论文 | 构建了首个成人正常乳腺组织的单细胞和空间分辨率综合图谱 | 首次在单细胞和空间分辨率层面系统揭示成人乳腺组织的细胞组成和空间分布特征,发现导管和小叶中丰富的组织驻留免疫细胞生态系统 | 样本数量相对有限(62名女性),主要关注正常组织,疾病状态研究较少 | 建立成人正常乳腺组织的综合细胞参考图谱 | 成人女性乳腺组织 | 单细胞基因组学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 535,941个细胞(来自62名女性),120,024个细胞核(来自20名女性) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | 使用了三种空间定位技术 |
831 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics analysis of mild cognitive impairment in World Trade Center disaster responders
2021, Alzheimer's & dementia (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1002/dad2.12154
PMID:33665344
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究世贸中心救援人员轻度认知障碍的分子机制 | 首次在世贸中心救援人员群体中应用单细胞分辨率CITE-Seq技术分析轻度认知障碍的血液转录组特征 | 样本量相对较小(40名男性),仅包含男性受试者 | 探索轻度认知障碍的分子复杂性及其血液生物标志物 | 世贸中心灾难救援人员 | 单细胞组学 | 轻度认知障碍 | CITE-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 40名男性救援人员(发现队列:9名MCI和9名对照;验证队列:11名MCI和11名对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
832 | 2025-10-05 |
Exosomal gene signature in esophageal carcinoma: Insights from single-cell and bulk RNA sequencing
2025-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102490
PMID:40816225
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,开发并验证了一个用于食管癌预后预测的外泌体相关九基因标志物 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据构建食管癌外泌体相关基因标志物,并验证其在免疫治疗预测中的潜在价值 | 免疫治疗相关性分析基于膀胱癌队列而非食管癌特异性队列,需要进一步在食管癌免疫治疗队列中验证 | 开发食管癌预后预测和免疫治疗反应预测的生物标志物 | 食管鳞状细胞癌(ESCA)患者 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, LASSO-Cox回归分析 | LASSO-Cox回归风险模型 | RNA测序数据 | TCGA-ESCA、GSE53625、GSE196756等多个公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
833 | 2025-10-05 |
Single-cell omics reveal the mechanisms of traditional Chinese medicines
2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157204
PMID:40916282
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术在中医药研究中的应用及其在揭示中药作用机制方面的潜力 | 首次系统探讨单细胞组学技术在解析中药复杂成分和作用机制中的变革性潜力 | 存在技术限制和数据复杂性等挑战 | 探索单细胞组学在中医药现代化和科学验证中的作用 | 传统中药及其活性成分 | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 基因组, 转录组, 蛋白质组, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
834 | 2025-10-05 |
Integrated transcriptome and single-cell RNA sequencing analysis revealed the prognostic significance of GBP4 in pancreatic adenocarcinoma
2025-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102532
PMID:40944976
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序分析,揭示了GBP4在胰腺腺癌中的预后意义 | 首次系统性地确定了GBP4在胰腺腺癌中的预后价值,并通过单细胞分辨率揭示了其在肿瘤微环境中的表达动态 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步独立队列验证 | 确定GBP4基因对胰腺腺癌的影响 | 胰腺腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
835 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals palmitoylation-driven cellular heterogeneity and prognostic biomarkers in lung adenocarcinoma
2025-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102501
PMID:40811979
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示棕榈酰化驱动的肺腺癌细胞异质性并建立预后生物标志物 | 首次在单细胞水平系统分析棕榈酰化对肺腺癌细胞异质性的影响,并开发了基于棕榈酰化特征的12基因风险模型 | 研究结果需要在更多独立队列中进一步验证,实验验证主要集中于ASPH基因 | 探索棕榈酰化修饰在肺腺癌细胞异质性和预后预测中的作用 | 肺腺癌患者肿瘤细胞 | 数字病理 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,GSVA,ssGSEA,拷贝数变异分析,伪时间序列分析,细胞互作分析 | 风险预测模型 | 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 | TCGA数据集和多个GEO数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
836 | 2025-10-05 |
Elucidating the therapeutic mechanisms of resveratrol in benign prostatic hyperplasia via an integrated strategy of network pharmacology, multi-omics and molecular biology
2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157165
PMID:40839986
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研究论文 | 通过整合网络药理学、多组学分析和分子生物学方法,阐明白藜芦醇治疗良性前列腺增生的作用机制 | 首次整合网络药理学、单细胞转录组、分子对接和分子动力学模拟等多种方法系统研究白藜芦醇对BPH的治疗机制 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内实验验证 | 阐明白藜芦醇治疗良性前列腺增生的药理机制和关键信号通路 | 良性前列腺增生疾病模型和前列腺细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌相关疾病 | 网络药理学, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟, 体外实验验证 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据, 分子相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
837 | 2025-10-05 |
Genistein ameliorates thoracic aortic dissection by inhibiting CB1 receptor hyperactivation and modulating its-mediated cAMP-PKA signaling
2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157178
PMID:40845589
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研究论文 | 本研究探讨染料木黄酮通过抑制CB1受体过度激活并调节其介导的cAMP-PKA信号通路来改善胸主动脉夹层的作用机制 | 首次揭示CB1受体在胸主动脉夹层中的过度表达及其通过抑制cAMP-PKA信号通路促进疾病发展的机制,并发现染料木黄酮通过靶向该通路发挥治疗作用 | 研究主要聚焦于CB1受体-cAMP-PKA信号轴,可能还存在其他未被探索的分子机制参与胸主动脉夹层的发病过程 | 研究染料木黄酮通过抑制CB1受体和调节cAMP-PKA信号通路缓解胸主动脉夹层进展的潜力 | 血管平滑肌细胞(VSMCs)和胸主动脉夹层动物模型 | 心血管疾病研究 | 胸主动脉夹层 | 单细胞RNA测序,体外和体内实验 | NA | 基因表达数据,病理学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
838 | 2025-10-05 |
Immune cell transcriptional profiles from pre-vaccination peripheral blood predict immune response to preventative MUC1 cancer vaccine
2025-Oct-01, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
DOI:10.1016/j.ejca.2025.115685
PMID:40815873
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析疫苗接种前外周血免疫细胞转录谱,预测MUC1癌症预防疫苗的免疫反应 | 首次使用单细胞RNA测序技术结合机器学习方法识别疫苗免疫反应的预测性生物标志物 | 样本量较小(16名应答者和16名无应答者),需要在更大队列中进一步验证 | 预测癌症预防疫苗的免疫反应并识别相关生物标志物 | 曾患晚期结肠腺瘤的个体 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序,机器学习 | 贝叶斯图分析 | 单细胞转录组数据 | 32个疫苗接种前外周血单个核细胞样本(16名应答者和16名无应答者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
839 | 2025-10-05 |
Selective EPAC1 activators enhance endothelial function in models of vascular inflammation
2025-Oct, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107923
PMID:40848957
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研究论文 | 本研究通过体外和离体模型探讨选择性EPAC1激活剂在血管炎症中改善内皮功能的作用机制 | 首次系统验证选择性EPAC1激活剂在多种血管炎症模型中恢复内皮功能的作用,并揭示其通过上调SOCS3抑制JAK/STAT3信号通路的分子机制 | 研究主要基于体外和离体模型,缺乏在体动物模型的验证 | 探究EPAC1在调节血管炎症和损伤中的作用及其治疗潜力 | 小鼠主动脉、人冠状动脉、血管内皮细胞、平滑肌细胞和巨噬细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,三细胞共培养系统 | NA | 基因表达数据,功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
840 | 2025-10-05 |
Stage-specific regulation by autophagy-related transcription factors drives hematopoietic stem cell formation
2025-Oct, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2025.2551671
PMID:40878056
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录因子分析揭示了自噬相关转录因子在造血干细胞发育过程中的阶段性调控机制 | 首次结合单细胞RNA测序和metaTF方法系统解析了造血干细胞发育过程中自噬相关转录因子的阶段性调控网络 | 研究仅限于小鼠模型,人类造血干细胞发育的调控机制可能有所不同 | 探索自噬相关转录因子在造血干细胞发育过程中的调控机制 | 小鼠造血干细胞发育过程中的六个连续阶段 | 单细胞测序分析 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 转录因子分析 | metaTF | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎期E10.5主动脉-性腺-中肾区、E12.5/E14.5胎肝和成年骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |