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当前共找到 38991 篇文献,本页显示第 821 - 840 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
821 2026-04-24
Imputing causality and clonal dynamics from single-cell transcriptomics in paroxysmal nocturnal hemoglobinuria
2026-Apr-22, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析阵发性睡眠性血红蛋白尿症患者的骨髓细胞,揭示PIGA突变干细胞的克隆动态和因果关系 首次从单细胞转录组层面解析PNH患者中正常造血干细胞与PNH型造血干细胞在骨髓衰竭背景下的差异表达模式,以及免疫负向选择对正常造血干细胞的影响 样本量较小,仅纳入PNH细胞比例较大(>50%)和较小(10-50%)的两组患者,可能无法完全反映疾病异质性 探究阵发性睡眠性血红蛋白尿症中PIGA突变干细胞的克隆扩增机制及骨髓衰竭的病理生理学 阵发性睡眠性血红蛋白尿症患者的骨髓细胞 数字病理学 阵发性睡眠性血红蛋白尿症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 阵发性睡眠性血红蛋白尿症患者,根据PNH细胞比例分为大(>50%)和小(10-50%)两组 NA 单细胞RNA-seq NA NA
822 2026-04-24
Reference-free discovery with barcoded single-cell sequencing
2026-Apr-22, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 提出sc-SPLASH方法,用于条形码单细胞RNA测序和空间转录组的无参考发现,能高效揭示转录组变异 首次实现基于统计的无参考发现方法sc-SPLASH,独立BKC子模块优化条形码数据预处理,速度比UMI-tools快约50倍,并能在海绵和海鞘等无参考物种中检测分泌重复蛋白 本文未明确提及方法在复杂样本或高噪声数据中的性能限制,以及可能对低表达转录本的敏感性 开发无需参考基因组的单细胞RNA测序和空间转录组变异发现方法 海绵(Spongilla)和海鞘(Ciona)的免疫样细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 未提供具体样本数量 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
823 2026-04-24
Dysfunction of the neurovascular unit as a temporal driver in Alzheimer's pathogenesis
2026-Apr-22, Translational neurodegeneration IF:10.8Q1
综述 系统回顾了阿尔茨海默病进展中神经血管单元功能障碍的作用,以及空间转录组学和类器官技术在NVU研究中的应用 强调神经血管单元功能障碍可能是阿尔茨海默病发病的早期驱动因素,并整合三维NVU类器官、单细胞分辨率空间转录组学和人工智能技术构建功能结构模型的新视角 未明确提及本综述的局限性,但可能受限于现有研究数据的完整性和技术进步的速度 系统梳理神经血管单元功能障碍在阿尔茨海默病进展中的时序作用及相关技术应用 神经血管单元功能障碍事件,包括内皮细胞紧密连接损伤、周细胞退化、星形胶质细胞和小胶质细胞激活、神经元凋亡,以及Aβ沉积与NVU功能障碍的协同作用 数字病理学 阿尔茨海默病 空间转录组学, 类器官技术, 人工智能, 机器学习, 深度学习 NA 文本 NA NA 空间转录组学 NA 单细胞分辨率空间转录组学
824 2026-04-24
Single-cell and spatial transcriptomics in Phragmites australis reveal the association of B chromosomes with plant invasiveness
2026-Apr-22, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和比较基因组学,构建了芦苇的单细胞图谱,发现B染色体与植物入侵性相关 首次在非模式入侵植物中构建细胞类型分辨的分子图谱,并揭示B染色体基因在入侵种群中拷贝数扩增且差异表达 未提供明确的局限性信息 阐明入侵植物芦苇的分子和基因组机制,特别是B染色体在入侵过程中的作用 芦苇(Phragmites australis)的入侵种群(北美)和本地种群(欧洲) machine learning NA 单细胞RNA测序、空间转录组学、比较基因组学 NA 基因表达数据 欧洲本地种群和北美入侵种群的普通花园栽培样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
825 2026-04-24
Single-cell analysis highlights the role of CD4+ IFN-I-related T cells in Behcet's uveitis during Interferonα-2a therapy
2026-Apr-22, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞分析揭示CD4+ IFN-I相关T细胞在贝赫切特病葡萄膜炎患者接受干扰素α-2a治疗中的作用 首次从单细胞水平阐明IFNα-2a通过恢复CD4+ IFN-I相关T细胞频率并调控LLT1-CD161相互作用抑制NK细胞炎症表型的治疗机制 未说明具体局限性 探究IFNα-2a治疗通过免疫细胞调节对活动性贝赫切特病葡萄膜炎的疗效机制 活动性贝赫切特病葡萄膜炎患者、治疗后患者、健康对照的外周血单核细胞及CD4+ T细胞 机器学习和数字病理学 贝赫切特病 单细胞RNA测序、批量mRNA测序 NA 基因表达数据 包括12例活动性BD患者、治疗后BD患者及健康对照的外周血样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
826 2026-04-24
Machine learning predictions surpass individual mRNAs as a proxy of single-cell protein expression
2026-Apr-22, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 比较九种机器学习方法从单细胞RNA测序数据推断蛋白质表达的能力,发现机器学习预测优于单独使用mRNA作为蛋白质表达代理 系统评估多种机器学习方法在单细胞层面预测蛋白质表达的性能,揭示全转录组模式的预测能力优于直接mRNA推断 模型泛化能力有限,要求训练数据与测试数据的细胞类型组成高度相似,当前应用范围受限 评估机器学习方法替代mRNA作为单细胞蛋白质表达代理的可行性 单细胞RNA测序数据及其对应的表面蛋白质表达数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 机器学习方法(9种) 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 多数据集及组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
827 2026-04-24
CAR-M2 immunotherapy resolves renal fibrosis via revascularization and apoptosis of profibrotic Cxcr2+ endothelial cells
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
research paper 该研究提出了一种靶向FAP并分泌IL-4的嵌合抗原受体修饰的M2型巨噬细胞(CAR-M2),通过可注射水凝胶递送至肾包膜下,可减轻肾纤维化并促进血管新生,机制涉及降解基质、激活视黄醇X受体α及诱导纤维化相关内皮细胞凋亡 首次利用CAR-M2免疫疗法靶向纤维化微环境、重塑血管并特异性清除促纤维化的Cxcr2+内皮细胞 不清楚 开发针对肾纤维化的免疫治疗新策略并验证其机制 肾纤维化小鼠模型及肾脏基质和内皮细胞 NA 肾病 单细胞RNA测序, CAR免疫疗法 NA 基因表达数据 动物模型样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Genomics单细胞RNA测序平台
828 2026-04-24
Multi-omics reveal vitamin D regulation of immune-gut microbiome interactions and tolerogenic pathways in inflammatory bowel disease
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
研究论文 通过多组学方法揭示维生素D对炎症性肠病患者免疫-肠道微生物组相互作用及耐受性通路的影响 首次在IBD患者中整合免疫球蛋白测序(IgA-seq、IgG-seq)、单细胞RNA测序和免疫组库测序,系统揭示维生素D通过调节Ig/IgG结合肠道菌群、BAFF信号及α4β7+调节性T/B细胞促进免疫耐受的机制 样本量有限且未设置安慰剂对照组;仅评估12周维生素D干预,长期效果未知;免疫-微生物组相互作用机制仍需功能验证 探究维生素D如何通过调节宿主免疫-肠道微生物组相互作用改善IBD患者的免疫耐受 炎症性肠病(IBD)患者 免疫学、肠道微生物组学、数字病理学 炎症性肠病 NA NA 测序数据(IgA-seq、IgG-seq、scRNA-seq、免疫组库测序) IBD患者(具体数量未在摘要中明确) Illumina 免疫球蛋白测序、单细胞RNA测序、免疫组库测序 Illumina NovaSeq IgA-seq、IgG-seq基于16S rRNA扩增子测序;scRNA-seq采用10x Genomics平台(推测)
829 2026-04-24
Non-neuronal sites of latency for alphaherpesviruses
2026-Apr-21, Journal of virology IF:4.0Q2
综述 该论文综述了α-疱疹病毒在非神经元细胞中潜伏感染的研究进展 提出非神经元细胞如扁桃体和淋巴组织中的免疫细胞亚群也可能作为疱疹病毒的潜伏库,并强调了结合单细胞转录组学、空间分析和生理相关模型研究非神经元潜伏的重要性 区分人类α-疱疹病毒中的真实潜伏与顿挫或持续感染仍具挑战 理解非神经元储存在α-疱疹病毒发病机制中的作用,以推进对潜伏、再激活和病毒传播的认识 α-疱疹病毒亚科成员(包括牛疱疹病毒1型、单纯疱疹病毒1型等) 分子生物学 感染性疾病 NA NA NA NA NA 单细胞转录组学,空间转录组学 NA NA
830 2026-04-24
Heterogeneity of bacterial host-pathogen interactions across biological scales
2026-Apr-21, mSystems IF:5.0Q1
综述 本文综述了单细胞技术如何揭示宿主-病原体相互作用的动态和异质性,探讨了从单细胞到组织和整个生物体的多尺度感染结果 整合了显微成像、单细胞转录组学、蛋白质组学及新兴的双RNA-seq和空间方法,强调多尺度异质性在决定感染结局中的关键作用 未明确讨论跨尺度模型整合的计算挑战及临床转化中的实际限制 理解宿主-病原体相互作用的异质性及其对感染结局的影响 细菌病原体与宿主细胞之间的相互作用 机器学习 感染性疾病 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学, 双RNA-seq, 空间转录组学 计算与数学建模 转录组数据, 蛋白质组数据, 空间数据 不适用 不适用 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 不适用 不适用
831 2026-04-24
Single-cell spatial transcriptomics reveals tumor microenvironment heterogeneity in primary and lymph node-metastatic small cell lung cancer
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
研究论文 利用单细胞空间转录组学技术绘制了小细胞肺癌原发灶和淋巴结转移灶的肿瘤微环境空间图谱,揭示了免疫排斥特征和血管-免疫串扰机制 首次对75例SCLC患者的105个原发和转移淋巴结标本进行单细胞空间转录组学分析,构建了超过60万个细胞的高分辨率空间图谱,发现了三个富集于淋巴结转移的恶性亚群及一个独立预测生存的泛免疫热点 未明确提及局限性 探究小细胞肺癌淋巴结转移过程中肿瘤微环境的空间异质性 75例小细胞肺癌患者的原发肿瘤和淋巴结转移标本 单细胞空间转录组学 小细胞肺癌 CosMx空间分子成像 NA 空间转录组数据 来自75例患者的105个标本(超过60万个细胞) NanoString 空间转录组学 CosMx空间分子成像仪 CosMx Spatial Molecular Imager进行单细胞空间转录组学分析
832 2026-04-24
mRNA lipid-nanoparticle-mediated mitochondrial apoptosis augments adoptive T cell immunotherapy
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究开发了一种基于mRNA脂质纳米颗粒的策略,通过编码BH3结构域触发线粒体凋亡,增强过继性T细胞免疫疗法对实体瘤的疗效 首次提出利用mRNA脂质纳米颗粒编码BH3结构域来调控癌细胞线粒体凋亡启动,从而与ACT协同增效,并揭示了单细胞转录组水平上的T细胞重编程机制 未提及具体限制,可能包括体内递送效率、长期安全性及临床转化可行性等问题 开发一种基于mRNA的策略,通过调控癌细胞线粒体凋亡启动来增强过继性T细胞免疫疗法的抗肿瘤效果 实体肿瘤细胞及过继性T细胞 机器学习 癌症 mRNA脂质纳米颗粒技术、单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
833 2026-04-24
Robust transcriptomic hallmarks targeting intratumor heterogeneity in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
研究论文 整合多区域、单区域和单细胞RNA测序数据,系统表征肝内胆管癌的基因表达异质性,并建立低肿瘤内异质性/高肿瘤间变异性的分类系统,定义五个亚组及其治疗脆弱性 识别出低肿瘤内异质性/高肿瘤间变异性的基因集,并开发了不受肿瘤内异质性影响的分类系统,发现GPRC5A和VTCN1作为免疫组化生物标志物,以及HSP90抑制与抗PD1联合治疗炎症性肝内胆管癌的新策略 未明确提及研究限制 克服肿瘤内异质性对基于转录组的肝内胆管癌分层的干扰,建立稳健的分子分类系统并识别治疗靶点 肝内胆管癌的多区域、单区域和单细胞RNA测序数据 机器学习 肝内胆管癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组化 NA 转录组数据 多区域、单区域和单细胞RNA测序队列 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
834 2026-04-24
Patient-derived kidney organoids recapitulate ADPKD and facilitate the identification of Rho pathway inhibitors as candidate therapeutics
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
研究论文 利用患者来源的肾类器官模拟常染色体显性多囊肾病并鉴定Rho通路抑制剂作为候选治疗药物 建立了直接来源于ADPKD患者手术标本的可扩增、多谱系成人肾类器官(MAROs)平台,能够忠实再现囊肿形成特征,并通过单细胞转录组学揭示基因型特异性改变,利用高通量药物筛选鉴定出Rho GTP酶抑制剂作为有效囊肿消退药物 未明确提及局限,但可能包括类器官模型与体内真实微环境的差异以及需要进一步验证药物在体内的效果 建立患者来源的ADPKD肾类器官模型,以重现疾病病理学并筛选潜在治疗药物 ADPKD患者和健康供体的手术标本衍生的肾类器官 数字病理学 多囊肾病 单细胞转录组学, 高通量药物筛选 类器官, 微流控灌注 转录组数据, 图像 来自ADPKD患者和健康供体的手术标本 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'试剂盒用于单细胞转录组测序
835 2026-04-24
Spatial multi-omics unveils the monoclonal origin, neuroendocrine plasticity, and microenvironment niches in combined small-cell lung cancer
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
研究论文 该研究利用空间多组学技术揭示了联合型小细胞肺癌的克隆起源、神经内分泌可塑性和微环境特征 首次通过空间全外显子测序、空间转录组学和单核RNA测序多组学联合分析,揭示了联合型小细胞肺癌不同组织成分的单克隆起源,发现了腺癌向小细胞肺癌转分化及小细胞肺癌亚型共存等谱系可塑性,并开发了基于突变的cSCLC检测方法 样本量有限(19例初治肿瘤),且为回顾性研究 阐明联合型小细胞肺癌的进化、异质性及肿瘤微环境特征 19例初治联合型小细胞肺癌肿瘤样本 数字病理学 肺癌 NGS, RNA-seq, 单核RNA测序 NA 图像, 文本 19例初治联合型小细胞肺癌肿瘤样本 NA 空间转录组学, 单核RNA测序 NA NA
836 2026-04-24
Hypoxia inducible factor network reflects kidney disease progression in diabetes and sodium-glucose co-transporters inhibition
2026-Apr-21, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示糖尿病肾病患者中缺氧诱导因子网络反映疾病进展及SGLT2抑制剂治疗反应 首次通过单细胞转录组数据构建启动子锚定的HIF调控网络,并使用多组学数据验证,实现对糖尿病肾病的进展和治疗反应的量化评估 该研究未明确提及具体局限性,但可能包括样本来源有限(主要为年轻2型糖尿病患者)以及网络在更广泛人群中的验证仍需进一步研究 探讨缺氧诱导因子网络如何反映糖尿病肾病的进展以及SGLT2抑制剂的治疗效果 患有2型糖尿病的年轻人(临床DKD证据极少)、晚期DKD患者(来自KPMP项目)以及缺氧人肾类器官模型 计算生物学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序、多组学分析、空间转录组学 调控网络模型 单细胞转录组数据、表观基因组数据(多组学)、空间转录组数据 未在摘要中明确样本量,但提及年轻T2D患者、KPMP项目参与者以及肾类器官模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
837 2026-04-24
Gut-microbiota-derived 3-indoleacrylic acid alleviates neonatal necrotizing enterocolitis by inhibiting epithelial necroptosis
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
研究论文 揭示肠道微生物来源的3-吲哚丙烯酸通过抑制上皮细胞坏死性凋亡缓解新生儿坏死性小肠结肠炎的作用机制 首次发现3-吲哚丙烯酸作为微生物代谢产物可通过AhR-SOCS5轴抑制STAT1驱动的坏死性凋亡,为NEC提供靶向治疗策略 未明确IA在临床治疗中的最佳剂量及长期安全性,且基于动物模型的结果需进一步在临床试验中验证 探索肠道菌群代谢物3-吲哚丙烯酸对新生儿坏死性小肠结肠炎的保护作用及其分子机制 新生儿坏死性小肠结肠炎患者及小鼠模型 机器学习 新生儿疾病 代谢组学分析,单细胞RNA测序 NA 测序数据 NEC患儿代谢组学样本及小鼠模型肠道组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序分析肠道上皮细胞STAT1信号通路
838 2026-04-24
Single-cell analysis highlights the significance of malignant cell IFN/MHC-II for immunotherapy response in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
研究论文 通过单细胞RNA测序分析头颈部鳞状细胞癌患者在接受新辅助帕博利珠单抗治疗前后的恶性细胞干扰素/主要组织相容性复合体II类表达程序,揭示其作为免疫治疗反应生物标志物的潜力 首次在单细胞水平上鉴定出恶性细胞中的IFN/MHC-II表达程序与帕博利珠单抗治疗反应相关,并通过小鼠模型和独立队列验证其预测价值 样本量有限(仅16例患者),且主要基于转录组数据,蛋白水平验证仅通过多重免疫荧光进行 阐明恶性细胞在头颈部鳞状细胞癌免疫治疗中的关键作用并识别新型反应生物标志物 16例头颈部鳞状细胞癌患者的新辅助帕博利珠单抗治疗前后的肿瘤样本 单细胞基因组学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 16例头颈部鳞状细胞癌患者 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
839 2026-04-24
DECTIN-2 regulates macrophage M1 polarization via the SYK/ROS/JNK axis to influence the progress of apical periodontitis
2026-Apr-21, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了DECTIN-2通过SYK/ROS/JNK信号轴调控巨噬细胞M1极化,进而影响根尖周炎的进展 首次发现DECTIN-2在根尖周炎中调控巨噬细胞M1极化的机制,为其治疗提供了新靶点 未提及明显局限性 探究DECTIN-2在巨噬细胞极化和根尖周炎中的作用及机制 人根尖周炎病变组织、巨噬细胞、Dectin-2基因敲除小鼠 机器学习(单细胞测序分析) 根尖周炎 单细胞测序、转录组测序 NA 单细胞转录组数据 人根尖周炎病变组织(样本量未明确)、体外细胞实验、小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
840 2026-04-24
A skeletal muscle atlas shows neuromuscular junction adaptations to growth and atrophy
2026-Apr-21, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本研究提供了小鼠后肢骨骼肌在静息状态和实验诱导的萎缩或肥大条件下的单细胞核和单细胞转录组图谱,并结合空间分析,揭示了神经肌肉接头在生长和萎缩过程中的适应性变化 首次构建了覆盖萎缩和肥大状态的骨骼肌单核/单细胞转录组图谱,并发现神经肌肉接头中突触肌核和终末施万细胞在萎缩和肥大状态下的特异性重塑 主要基于小鼠模型,人类样本验证仅在去神经和运动条件下进行,且样本量有限 阐明骨骼肌在萎缩和肥大过程中的分子机制和细胞适应 小鼠后肢骨骼肌细胞、神经肌肉接头结构、人类肌肉样本 数字病理学 肌肉相关疾病 单细胞核RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、高分辨率3D成像 NA 转录组数据、图像数据 小鼠后肢骨骼肌样本,包含静息、萎缩和肥大条件;人类肌肉样本来自去神经和运动条件 10x Genomics 单细胞核RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3'测序用于单细胞核和单细胞RNA-seq;10x Visium用于空间转录组学
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