单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 33678 篇文献，本页显示第 821 - 840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2025-11-27 |
Modelling the effects of human SUR1 R1420H variation on insulin secretory function using isogenic iPSC-derived pancreatic islets
2025-Nov-25, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06605-1
PMID:41291239
|
研究论文 | 利用等基因iPSC衍生的胰腺胰岛模型研究人类SUR1 R1420H变异对胰岛素分泌功能的影响 | 首次建立等基因iPSC衍生的胰腺胰岛平台，系统研究SUR1 R1420H变异在不同发育阶段对胰岛素分泌的时序性影响 | 研究仅基于两个亲本印第安美洲iPSC系，样本量有限 | 探究SUR1 R1420H变异是否导致KATP通道功能丧失及其对胰岛素分泌的发育阶段特异性影响 | 等基因iPSC衍生的胰腺胰岛（SC-islets） | 干细胞生物学 | 2型糖尿病 | CRISPR-Cas9基因编辑，单细胞RNA测序 | iPSC衍生胰腺胰岛模型 | 基因表达数据，胰岛素分泌数据 | 两个亲本iPSC系（IS1和IS2）衍生的三种基因型（1420RR，1420RH，1420HH）SC-islets | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 822 | 2025-11-27 |
Mapping cellular interactions and communication landscapes in cervical cancer via single-cell transcriptomics
2025-Nov-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04040-7
PMID:41291352
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研究论文 | 通过单细胞转录组学方法系统解析宫颈癌肿瘤微环境中的细胞多样性及细胞间通讯网络 | 首次在宫颈癌中系统绘制细胞间通讯图谱并识别MIF通路在癌症相关成纤维细胞中的关键作用 | 样本量相对有限（20例患者），且主要基于公共数据库的再分析 | 阐明宫颈癌肿瘤微环境中的细胞多样性、细胞间信号网络及分子机制 | 宫颈癌组织及癌旁正常组织 | 单细胞转录组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, ELISA | UMAP, t-SNE, 时序轨迹建模 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白表达数据 | 20例患者的配对肿瘤和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 823 | 2025-11-27 |
Identification of osteoarthritis-related genes and potential drugs based on single cell RNA-seq data
2025-Nov-25, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01379-z
PMID:41291434
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据识别骨关节炎相关基因并筛选潜在治疗药物 | 结合单细胞RNA测序与批量RNA测序数据，通过多算法整合分析鉴定OA关键基因，并利用斑马鱼模型验证药物作用机制 | 研究样本来源未明确说明，药物预测需进一步临床验证 | 发现骨关节炎治疗新靶点和潜在药物 | 骨关节炎相关基因和药物靶点 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化 | 随机森林, 高维加权基因共表达网络分析, 蛋白质相互作用网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 824 | 2025-11-27 |
Non-invasive assessment of activated renal macrophages by imaging of colony-stimulating factor 1 receptor in mouse model with ischemic acute kidney injury
2025-Nov-25, Journal of inflammation (London, England)
DOI:10.1186/s12950-025-00482-6
PMID:41291764
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研究论文 | 本研究通过CSF1R-PET成像技术无创评估小鼠缺血性急性肾损伤模型中活化的肾脏巨噬细胞 | 首次证明11C-CPPC-PET可作为临床可用工具无创检测活化的肾脏巨噬细胞，主要针对M2表型 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 开发无创评估肾脏炎症的方法 | 小鼠缺血性急性肾损伤模型和肾脏/肾周脓肿模型 | 医学影像 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序，PET成像，体外放射自显影，免疫组织化学分析 | NA | 基因表达数据，影像数据，组织学数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序，PET成像 | NA | NA |
| 825 | 2025-11-27 |
Cigarette smoke-mediated YTHDC2 suppression drives macrophage senescence and a tumor-promoting microenvironment in lung cancer
2025-Nov-25, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.70068
PMID:41292214
|
研究论文 | 本研究揭示了香烟烟雾通过抑制YTHDC2表达诱导巨噬细胞衰老，从而促进肺癌肿瘤微环境形成的机制 | 首次发现YTHDC2在香烟烟雾诱导的巨噬细胞衰老和肿瘤促进微环境形成中的关键调控作用 | NA | 探究香烟烟雾对m6A阅读器YTHDC2的影响及其在肺癌免疫微环境重塑中的作用 | 肺癌组织、巨噬细胞、香烟烟雾暴露的肺癌模型 | 单细胞测序分析 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 吸烟者与非吸烟者的肺癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 826 | 2025-11-27 |
CD8+ T cell depletion promotes human Tph/Tfh cell proliferation and Sjögren syndrome-like symptoms in PBMC-based humanized mice
2025-Nov-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191700
PMID:41277554
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研究论文 | 本研究开发了一种通过CD8+ T细胞耗竭促进人Tph/Tfh和B细胞增殖的方法，并建立了干燥综合征样症状的人源化小鼠模型 | 首次发现CD8+ T细胞耗竭可促进人Tph/Tfh细胞在体增殖，并建立了可模拟干燥综合征症状的PBMC人源化小鼠模型 | 研究基于人源化小鼠模型，与真实人体环境存在差异 | 研究人Tph/Tfh细胞分化机制及干燥综合征发病机理 | 人外周血单个核细胞、人源化小鼠模型、Tph/Tfh细胞、B细胞、CD8+ T细胞 | 免疫学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 多色流式细胞术 | 人源化小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 人PBMC移植的免疫缺陷小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
| 827 | 2025-11-27 |
Protocol to analyze changes in hippocampal neural stem cell quiescence from single-cell RNA sequencing data
2025-Nov-24, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104226
PMID:41289073
|
方法论文 | 介绍从单细胞RNA测序数据中分析小鼠海马神经干细胞静息状态变化的计算流程 | 开发了区分静息神经干细胞与星形胶质细胞、增殖神经干细胞与祖细胞的专用计算流程 | NA | 分析扰动对海马神经干细胞静息深度的影响 | 小鼠海马神经干细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 828 | 2025-11-27 |
MIF/CD74/CD44 pathway communicates between macrophages and colorectal Cancer cells and predicts survival of patients
2025-Nov-24, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115872
PMID:41289939
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现MIF/CD74/CD44信号轴是结直肠癌细胞与巨噬细胞间通讯的关键通路，并验证其作为预后生物标志物的潜力 | 首次系统性地通过单细胞RNA测序鉴定出MIF/CD74/CD44作为结直肠癌中巨噬细胞与癌细胞通讯的主要信号通路，并建立了相关的预后特征 | 研究主要基于体外共培养系统，需要进一步的体内实验验证 | 探索结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞与癌细胞之间的分子通讯机制 | 结直肠癌患者样本和体外培养的巨噬细胞与结直肠癌细胞 | 单细胞分析 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，体外共培养 | NA | 单细胞RNA测序数据，转录组数据 | 多个独立结直肠癌队列的患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 829 | 2025-11-27 |
Space-associated stem cell hallmarks of aging and resilience in astronauts
2025-Nov-24, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.11.001
PMID:41289992
|
研究论文 | 本研究通过对宇航员太空飞行前后造血干细胞的多组学分析，揭示了太空环境对造血干细胞衰老和恢复能力的影响 | 首次在宇航员中开展造血干细胞功能组织的多组学衰老和恢复能力分析，揭示了太空飞行与造血干细胞生存、自我更新、ADAR1表达、端粒维持等关键过程的关联 | 样本量较小（仅9名宇航员），研究仅限于短期国际空间站任务 | 探究太空环境对造血干细胞和免疫系统的衰老影响及恢复机制 | 宇航员的造血干细胞和免疫细胞亚群 | 空间生物学 | 衰老相关疾病 | 全基因组测序,全转录组测序,单细胞RNA测序,细胞因子阵列,流式细胞术 | NA | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据,蛋白质组数据 | 9名宇航员（太空飞行前、中、后多个时间点） | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序,全转录组测序 | NA | NA |
| 830 | 2025-11-27 |
Reversing lysosomal dysfunction restores youthful state in aged hematopoietic stem cells
2025-Nov-24, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.10.012
PMID:41289991
|
研究论文 | 本研究通过抑制过度活跃的溶酶体功能，成功恢复了老年造血干细胞的年轻状态 | 首次揭示溶酶体功能障碍是造血干细胞衰老的关键驱动因素，并证明通过v-ATPase抑制剂干预可逆转衰老表型 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未进行人体临床试验 | 探索溶酶体在造血干细胞衰老中的作用机制及逆转策略 | 老年造血干细胞 | 干细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞转录组测序，功能分析 | NA | 基因表达数据，功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 831 | 2025-11-27 |
Dicer is essential for proper maturation, composition, and function in the postnatal retina
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113794
PMID:41244583
|
研究论文 | 本研究探讨了Dicer/miRNAs在出生后视网膜发育中的关键作用 | 首次揭示了Dicer在出生后视网膜祖细胞/前体细胞中对视网膜成熟和功能的必要性 | 研究主要基于小鼠模型，结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 评估Dicer缺失对出生后视网膜发育和功能的影响 | 小鼠视网膜祖细胞/前体细胞和成年视网膜 | 发育生物学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序,光学相干断层扫描,视网膜电图,组织学分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 转录组数据,图像数据,电生理数据 | 一周龄和成年小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 832 | 2025-11-27 |
Fibrinogen triggers perivascular fibroblast activation in a mouse model of cortical ischemic stroke
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113834
PMID:41280671
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研究论文 | 本研究揭示了纤维蛋白原是皮质缺血性中风小鼠模型中血管周围成纤维细胞活化的关键触发因子 | 首次证明血液来源的纤维蛋白原通过β1整合素信号通路诱导血管周围成纤维细胞活化，并揭示其通过髓系细胞间接促进纤维化瘢痕形成的机制 | 研究仅限于小鼠光血栓形成模型，人类疾病中的适用性需要进一步验证 | 探究缺血性中风后纤维化瘢痕形成的分子机制 | 小鼠皮质缺血性中风模型中的血管周围成纤维细胞 | 神经科学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序，遗传学方法，药理学干预 | NA | 基因表达数据，细胞行为观察数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 833 | 2025-11-27 |
Multi-cellular phenotypic dynamics during the progression of an immunocompetent breast cancer model
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113808
PMID:41280683
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析免疫活性乳腺癌模型中肿瘤微环境的多细胞表型动态变化 | 首次在小鼠乳腺癌同种移植模型中系统描绘肿瘤微环境的多细胞表型时间动态模式 | 使用小鼠模型而非人类样本，可能无法完全反映人类乳腺癌的复杂性 | 揭示乳腺癌肿瘤微环境中细胞组成和表型的时间动态变化规律 | 小鼠乳腺癌同种移植模型中的肿瘤微环境细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同时间点的小鼠乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 834 | 2025-11-27 |
CONCERT predicts niche-aware perturbation responses in spatial transcriptomics
2025-Nov-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.08.686890
PMID:41292874
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研究论文 | 提出CONCERT模型预测空间转录组学中受微环境影响的扰动响应 | 开发了首个考虑细胞微环境的生成模型，通过高斯过程变分自编码器学习空间核函数，能够预测组织内扰动效应的传播 | NA | 预测空间转录组学中遗传或化学编辑对基因表达的影响 | 空间转录组数据，包括肺组织、结肠炎模型和缺血性脑卒中模型 | 空间转录组学 | 肺癌, 结肠炎, 缺血性脑卒中 | 空间转录组学 | 高斯过程变分自编码器 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 835 | 2025-11-27 |
Colorectal cancer relies on an immunosuppressive cellular topography and genomic adaptations for establishing brain metastases
2025-Nov-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.14.688538
PMID:41292744
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析结直肠癌脑转移瘤，揭示了其免疫抑制性细胞拓扑结构和基因组适应性机制 | 首次系统描绘结直肠癌脑转移的空间细胞特征，发现成纤维细胞-巨噬细胞细胞邻域促进血管生成和免疫抑制，并鉴定关键配体-受体相互作用 | 样本数量有限(51例)，部分机制验证仍需进一步功能实验 | 探索结直肠癌脑转移的分子和细胞机制 | 结直肠癌脑转移瘤患者组织样本 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 51例结直肠癌脑转移瘤，部分包含匹配原发结肠肿瘤和放疗前后配对样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 836 | 2025-11-27 |
Innovative insights and future research directions in gastric cancer through single-cell RNA sequencing
2025-Nov-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i11.103808
PMID:41281499
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序分析胃癌，解读研究发现并提出未来研究方向 | 提出整合多组学方法、空间转录组学、人工智能临床应用和新型免疫治疗策略等创新研究方向 | NA | 改善胃癌治疗结果，推动个性化医疗和早期检测 | 胃癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 837 | 2025-11-27 |
Genetic Convergence Analysis of CRISPR Perturbations Deciphers Gene Functional Similarity
2025-Nov-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.13.688060
PMID:41292726
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研究论文 | 开发了一种名为XConTest的统计方法来量化CRISPR扰动之间的功能相似性 | 提出了首个交叉验证的统计检验方法来解决遗传趋同问题，相比现有启发式方法更具统计严谨性 | 方法依赖于单细胞RNA测序数据的质量，且假设扰动对细胞表达谱的影响是正交的 | 开发统计方法来评估CRISPR扰动之间的功能相似性 | CRISPR基因扰动 | 生物信息学 | 自闭症,免疫疾病 | CRISPR筛选,单细胞RNA测序 | 统计检验 | 单细胞基因表达数据 | 两个研究的数据集（具体样本数未提供） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 838 | 2025-11-27 |
S3R: Modeling spatially varying associations with Spatially Smooth Sparse Regression
2025-Nov-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.06.674629
PMID:40964272
|
研究论文 | 提出一种名为S3R的空间平滑稀疏回归框架，用于建模空间转录组数据中分子和细胞特征之间的空间变化关联 | 结合结构化稀疏性和最小生成树引导的平滑惩罚，能够在邻域内保持系数连贯性同时允许锐利边界 | NA | 开发能够处理空间转录组数据中噪声、共线性、细胞混合和高维预测因子的统计模型 | 空间转录组数据中的分子和细胞特征关联 | 空间转录组学 | 乳腺癌,胰腺导管腺癌,皮肤感染,神经退行性疾病 | 空间转录组学 | 稀疏回归 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, Xenium | Visium空间转录组平台, Xenium原位分析平台 |
| 839 | 2025-11-27 |
Antibody feedback establishes an affinity brake in the germinal center
2025-Nov-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.13.688298
PMID:41292746
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研究论文 | 通过mRNA-LNP技术研究B细胞对HIV-1 Env表位的识别机制及抗体反馈对生发中心反应的调控作用 | 首次揭示抗体反馈机制作为生发中心亲和力调节的“刹车”系统，阐明了高亲和力B细胞在GC中停留时间更短的现象 | 研究基于基因敲入小鼠模型，结果在人类系统中的适用性需要进一步验证 | 探究B细胞对mRNA疫苗编码抗原的识别机制及生发中心反应的调控原理 | 具有特定亲和力B细胞受体的基因敲入小鼠模型 | 免疫学 | HIV感染 | mRNA-LNP技术，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，免疫组化数据 | 基因敲入小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 840 | 2025-11-27 |
Brain-wide Genome Editing via STEP-RNPs for Treatment of Angelman Syndrome
2025-Nov-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.13.684643
PMID:41292800
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研究论文 | 开发了一种基于化学修饰的非病毒基因编辑方法STEP-RNPs，用于治疗Angelman综合征 | 首次实现基于非病毒、非纳米颗粒的化学修饰方法，在全脑范围内高效编辑神经元基因组 | 目前仅在动物模型和体外人类神经元中验证，尚未进行人体临床试验 | 开发治疗神经遗传疾病的脑部基因编辑技术 | 小鼠模型、人类神经元、AS患者来源的iPSCs分化的皮质脑类器官 | 基因编辑 | Angelman综合征 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类神经元样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |