单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32005 篇文献，本页显示第 8321 - 8340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8321 | 2025-10-06 |
HOXA1 Contributes to Bronchial Epithelial Cell Cycle Progression by Regulating p21/CDKN1A
2025-Mar-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052332
PMID:40076953
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研究论文 | 本研究探讨HOXA1基因通过调控p21/CDKN1A在支气管上皮细胞周期进程中的作用 | 首次揭示HOXA1在气道上皮细胞增殖和迁移中的功能，并阐明其通过p21/CDKN1A调控细胞周期的机制 | 研究仅使用细胞系模型，未在体内验证；样本来源单一 | 研究HOXA1基因在气道上皮细胞增殖和迁移中的作用机制 | 支气管上皮细胞系 | 细胞生物学 | 慢性阻塞性肺病 | CRISPR/CAS9基因编辑，单细胞RNA测序，流式细胞术，划痕实验 | 基因敲除细胞模型 | 基因表达数据，细胞图像，流式细胞数据 | HOXA1敲除和野生型支气管上皮细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8322 | 2025-10-06 |
TrAGEDy-trajectory alignment of gene expression dynamics
2025-Mar-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf073
PMID:40065693
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研究论文 | 提出一种名为TrAGEDy的新方法，用于对齐单细胞转录组测序中的独立轨迹，避免误差较大的整合步骤 | 能够处理不对称生物过程的轨迹对齐，在模拟和真实数据中均优于现有工具 | NA | 开发单细胞转录组数据中独立轨迹对齐的新方法 | T细胞和布氏锥虫血流形式的基因表达动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | 轨迹对齐算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8323 | 2025-10-06 |
AJGM: joint learning of heterogeneous gene networks with adaptive graphical model
2025-Mar-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf096
PMID:40073230
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研究论文 | 提出一种自适应联合图模型AJGM，用于从具有未知异质性的单细胞或批量数据中估计多个基因网络 | 引入整体网络捕捉所有样本共享的关系，通过自适应权重连接亚型网络与整体网络，更有效地关注跨网络共享的基因关系 | 未明确说明模型对非高斯分布数据的适应性限制 | 从异质性基因表达数据中同时进行亚型分类和基因网络推断 | 基因网络和基因功能关系 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 自适应联合图模型AJGM | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 8324 | 2025-10-06 |
NAD+ Promotes Superovulation of Huaxi Cattle Through Regulation of Cumulus Cell Proliferation and Oocyte Maturation
2025-Mar-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052276
PMID:40076893
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研究论文 | 本研究探讨了NAD+对华西牛超数排卵的促进作用及其机制 | 首次揭示了NAD+通过调控卵丘细胞活性和卵母细胞成熟来提高超数排卵效率的新机制 | 研究仅针对华西牛品种，未在其他牛种中验证 | 提高牛类超数排卵效率和胚胎质量 | 华西牛及其卵丘细胞和卵母细胞 | 生殖生物学 | NA | 血清代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据、单细胞转录组数据 | 华西牛群体 | NA | 单细胞RNA测序、代谢组学 | NA | NA |
| 8325 | 2025-10-06 |
Integrated Single-Cell Transcriptome and eQTL Analyses Reveal the Role of PZP in Aging and Chronic Kidney Disease
2025-Mar, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.70015
PMID:40058366
|
研究论文 | 通过单细胞转录组和eQTL整合分析揭示PZP蛋白在衰老和慢性肾病中的作用机制 | 首次发现CD8+中央记忆T细胞在衰老和慢性肾病中的关键作用，并鉴定PZP作为连接两者的重要遗传因子 | 样本来源仅限于外周血，未涉及肾脏组织样本；样本量相对有限 | 探索衰老与慢性肾病相互作用的遗传和免疫机制 | 年轻对照者、老年个体和慢性肾病患者的免疫细胞 | 单细胞组学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序, eQTL分析, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 临床指标数据 | 年轻对照、老年个体和慢性肾病患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8326 | 2025-10-06 |
Cell type-dependent directional transcription at enhancers
2025-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf007
PMID:40060372
|
研究论文 | 本研究通过分析转录组数据发现增强子在单个细胞类型中倾向于单向转录，而非传统认为的平衡双向转录 | 挑战了增强子平衡双向转录的传统观点，首次系统证明增强子在单个细胞类型中主要呈现单向转录特征 | 研究主要基于现有数据库分析，需要更多实验验证增强子转录方向与功能的关系 | 探究增强子转录方向特征及其在细胞类型特异性中的变化 | 增强子及其转录特征 | 基因组学 | NA | CAGE（帽分析基因表达），单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据，报告基因检测数据 | FANTOM5和其他深度CAGE转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序，深度转录组测序 | NA | NA |
| 8327 | 2025-10-06 |
HBx/DTL Positive Feedback Loop Promotes HBV-Related Hepatocellular Carcinoma Progression
2025-Mar, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70284
PMID:40062428
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研究论文 | 本研究揭示了HBx/DTL正反馈环路在HBV相关肝细胞癌进展中的关键作用机制 | 首次发现HBx与DTL之间的正反馈调控机制，并阐明DTL通过稳定HBx蛋白和调节肿瘤免疫微环境促进肝癌发展 | 研究主要基于实验模型，需要进一步临床验证DTL作为生物标志物的价值 | 探究HBV相关肝细胞癌的发病机制，特别是HBx蛋白与DTL的相互作用 | HBV阳性肝细胞癌样本、肝癌细胞系、裸鼠模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,蛋白质印迹分析,染色质免疫沉淀-qPCR,Cut&Tag | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,细胞周期数据 | HBV阳性HCC样本和实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8328 | 2025-10-06 |
Analyze the Diversity and Function of Immune Cells in the Tumor Microenvironment From the Perspective of Single-Cell RNA Sequencing
2025-Mar, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70622
PMID:40062730
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综述 | 从单细胞RNA测序角度分析肿瘤微环境中免疫细胞的多样性和功能 | 通过单细胞RNA测序技术揭示免疫细胞功能异质性及其在肿瘤抗体反应中的作用，构建免疫细胞互作网络 | 存在若干技术挑战，需要进一步改进才能完全整合到临床应用 | 总结肿瘤微环境中免疫细胞的多样性、对患者预后和治疗反应的影响 | 肿瘤微环境中的免疫细胞 | 单细胞分析 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8329 | 2025-10-06 |
A functional single-cell metabolic survey identifies Elovl1 as a target to enhance CD8+ T cell fitness in solid tumours
2025-Mar, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-025-01233-w
PMID:40065102
|
研究论文 | 通过单细胞代谢筛选鉴定Elovl1作为增强CD8+ T细胞在实体瘤中适应性的靶点 | 首次通过CRISPR/Cas9代谢筛选结合单细胞RNA测序系统鉴定Elovl1作为改善T细胞代谢适应性的关键靶点 | 研究主要聚焦于胰腺癌和黑色素瘤模型，在其他肿瘤类型中的适用性需进一步验证 | 探索通过代谢重编程增强CD8+ T细胞在实体瘤微环境中适应性的策略 | CD8+ T细胞及其在胰腺癌和黑色素瘤模型中的代谢调控机制 | 单细胞生物学 | 胰腺癌, 黑色素瘤 | CRISPR/Cas9筛选, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8330 | 2025-10-06 |
Integrated Analysis of WES and scRNA-Seq Data Reveals the Genetic Basis of Immune Dysregulation in Unexplained Recurrent Pregnancy Loss
2025-Mar, Journal of clinical laboratory analysis
IF:2.6Q2
DOI:10.1002/jcla.70011
PMID:40066928
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研究论文 | 通过整合全外显子组测序和单细胞RNA测序数据，揭示不明原因复发性流产中免疫失调的遗传基础 | 首次将WES与scRNA-seq数据整合分析，系统揭示MUC基因、脂代谢基因和结构基因变异通过破坏黏膜屏障和脂质稳态导致uRPL的分子机制 | 样本量较小（仅13例中国患者），需要更大规模研究验证 | 阐明不明原因复发性流产的遗传基础和免疫失调机制 | 13例中国不明原因复发性流产患者的绒毛膜样本和蜕膜免疫细胞 | 基因组学与转录组学 | 复发性流产 | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组测序数据, 单细胞转录组数据 | 13例uRPL患者 | NA | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8331 | 2025-10-06 |
Spatial and single-cell transcriptomic analysis reveals fibroblasts dependent immune environment in colorectal cancer
2025 Mar-Apr, BioFactors (Oxford, England)
DOI:10.1002/biof.70012
PMID:40068177
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了结直肠癌中成纤维细胞异质性对免疫微环境和预后的影响 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统分析结直肠癌成纤维细胞异质性，并鉴定出四个与预后相关的成纤维细胞相关基因 | 研究样本量有限，需要更大规模的队列验证研究结果 | 解析结直肠癌中成纤维细胞异质性及其对免疫微环境和预后的影响 | 结直肠癌患者组织样本和细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | Cox回归, 共识聚类, 机器学习算法 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8332 | 2025-10-06 |
Enhancing single-cell classification accuracy using image conversion and deep learning
2025-Mar, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-213
PMID:40068952
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研究论文 | 提出一种创新的单细胞分类方法scIC，通过将单细胞转录组测序数据转换为图像形式并结合深度学习技术进行细胞分类 | 首次将单细胞转录组测序数据转换为图像形式，并应用卷积神经网络和残差网络进行细胞分类 | 仅测试了四种细胞类型的数据集，需要更多样化的数据集验证方法通用性 | 提高单细胞转录组测序数据的分类准确性和可靠性 | 小鼠皮肤基底细胞、小鼠淋巴细胞、人类神经元细胞和小鼠脊髓细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | CNN, ResNet | 图像 | 四种细胞类型的单细胞转录组测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8333 | 2025-10-06 |
Alterations in PD-L1 succinylation shape anti-tumor immune responses in melanoma
2025-Mar, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02077-6
PMID:40069506
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研究论文 | 本研究揭示了PD-L1琥珀酰化通过调控抗肿瘤免疫反应影响黑色素瘤免疫治疗疗效的机制 | 首次发现PD-L1在赖氨酸129位点的琥珀酰化修饰导致其降解，并鉴定CPT1A作为PD-L1的琥珀酰转移酶 | 研究主要聚焦于黑色素瘤，其他肿瘤类型中的适用性需要进一步验证 | 探究线粒体代谢在肿瘤免疫中的作用及PD-L1琥珀酰化对抗肿瘤免疫反应的影响 | 黑色素瘤患者样本和肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、bulk转录组学、蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学,bulk RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 8334 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics in glomerular diseases
2025-Mar-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae556
PMID:40071426
|
综述 | 本文综述空间转录组学技术在肾小球疾病研究中的应用，重点讨论其技术特点、机遇与局限性 | 首次系统评述空间转录组学在肾小球疾病特别是寡免疫性局灶坏死性新月体肾小球肾炎和巨细胞动脉炎中的研究应用 | 方法存在前分析变异和探针相关的人工假象等技术限制 | 探讨空间转录组学技术在自身免疫和炎症性疾病研究中的应用价值 | 肾小球疾病，特别是寡免疫性局灶坏死性新月体肾小球肾炎和巨细胞动脉炎 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学，数字空间分析 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8335 | 2025-10-06 |
Identification and Validation of Four Serum Biomarkers With Optimal Diagnostic and Prognostic Potential for Gastric Cancer Based on Machine Learning Algorithms
2025-Mar, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70659
PMID:40084401
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法识别并验证了四种具有最佳胃癌诊断和预后潜力的血清生物标志物 | 整合多组学数据分析并结合机器学习算法首次系统识别出四种胃癌血清生物标志物组合 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步大规模临床验证 | 开发胃癌诊断和预后的生物标志物 | 胃癌患者 | 机器学习 | 胃癌 | scRNA-seq, RT-PCR, ELISA | LASSO, 随机森林 | 基因表达数据, 血清样本 | TCGA和GEO数据库中的胃癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8336 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptome and single-cell RNA sequencing reveal the molecular basis of cotton fiber initiation development
2025-Mar, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70064
PMID:40084712
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研究论文 | 本研究通过空间转录组和单细胞RNA测序揭示了棉花纤维起始发育的分子基础 | 首次构建棉花胚珠空间转录组图谱并整合单细胞RNA测序数据，发现SVB和SVBL基因在纤维起始中的功能冗余 | 仅分析了-1 DPA、0 DPA和1 DPA三个时间点，未覆盖更完整的纤维发育过程 | 解析棉花纤维起始发育的分子机制 | 棉花胚珠和纤维细胞 | 植物发育生物学 | NA | 空间转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 三个发育时间点的棉花胚珠样本(-1 DPA, 0 DPA, 1 DPA) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8337 | 2025-10-06 |
InfoScan: A New Transcript Identification Tool Based on scRNA-Seq and Its Application in Glioblastoma
2025-Feb-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052208
PMID:40076844
|
研究论文 | 开发了一种基于单细胞RNA测序的转录本识别工具InfoScan，并应用于胶质母细胞瘤研究 | 开发了新型生物信息学工具InfoScan，能够识别未注释转录本和罕见细胞群体，并在胶质母细胞瘤中发现具有癌症干细胞特征的'肿瘤干细胞样'亚群 | NA | 开发单细胞RNA测序数据分析工具并探索胶质母细胞瘤的转录组特征 | 胶质母细胞瘤组织和其中的细胞亚群 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8338 | 2025-10-06 |
stAI: a deep learning-based model for missing gene imputation and cell-type annotation of spatial transcriptomics
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf158
PMID:40057378
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研究论文 | 提出一种基于深度学习的模型stAI，用于空间转录组数据的缺失基因插补和细胞类型注释 | 首次提出同时解决空间转录组数据中缺失基因插补和细胞类型注释的深度学习模型，采用联合嵌入和双编码器-解码器模块 | NA | 解决单细胞空间转录组技术中全转录组水平表征和细胞类型全面注释的挑战 | 单细胞空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 深度学习，编码器-解码器 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8339 | 2025-10-06 |
Single-Cell Sequencing: Genomic and Transcriptomic Approaches in Cancer Cell Biology
2025-Feb-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052074
PMID:40076700
|
综述 | 本文综述单细胞测序技术在癌症生物学研究中的基因组和转录组学方法及其影响 | 整合单细胞测序与多组学数据提供癌症细胞状态和调控机制的多维视角，结合人工智能和机器学习解析海量数据 | NA | 探讨单细胞测序技术对癌症生物学研究的推动作用 | 癌症细胞生物学 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序，空间转录组学，原位测序 | 机器学习，人工智能 | 基因组数据，转录组数据，表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 8340 | 2025-10-06 |
Comprehensive SHAP Values and Single-Cell Sequencing Technology Reveal Key Cell Clusters in Bovine Skeletal Muscle
2025-Feb-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052054
PMID:40076676
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研究论文 | 通过SHAP值和单细胞测序技术揭示牛骨骼肌中关键细胞群及其基因调控机制 | 首次结合SHAP值分析和单细胞测序构建476个关键基因的交互网络，成功绘制骨骼肌单细胞图谱并识别肌纤维细胞的核心地位 | 研究仅聚焦牛和猪的跨物种比较，未涵盖更多物种；样本规模未明确说明 | 解析牛骨骼肌中不同细胞群的重要性排序及其在肌肉发育中的调控机制 | 牛骨骼肌组织中的细胞群体（特别是肌纤维细胞和中性粒细胞） | 单细胞生物学 | NA | 单细胞测序，SHAP值分析，蛋白质语言模型 | 机器学习模型（具体类型未明确），蛋白质语言模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |