单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 8321 - 8340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8321 | 2024-09-25 |
Myocardial Milieu Favors Local Differentiation of Regulatory T Cells
2023-03-03, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.122.322183
PMID:36744467
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研究论文 | 研究心肌微环境如何影响局部调节性T细胞的分化 | 首次揭示了心肌微环境通过促进抗原特异性Treg细胞的分化来塑造局部免疫反应 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中验证 | 探讨心肌微环境对T辅助细胞分化的影响 | 心肌微环境中的抗原特异性CD4+ T细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 小鼠心肌梗死模型 |
| 8322 | 2024-09-25 |
Pairing of single-cell RNA analysis and T cell antigen receptor profiling indicates breakdown of T cell tolerance checkpoints in atherosclerosis
2023-Mar, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-023-00218-w
PMID:37621765
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序与T细胞抗原受体测序相结合的方法，研究了动脉粥样硬化斑块、动脉三级淋巴器官和淋巴结中的T细胞耐受检查点 | 首次揭示了动脉粥样硬化斑块中T细胞耐受检查点的破坏模式，并发现人类冠状动脉和颈动脉斑块中存在类似的CD8 T细胞耐受功能障碍 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，可能无法完全代表人类动脉粥样硬化的复杂性 | 探讨动脉粥样硬化中T细胞耐受检查点的功能障碍 | 动脉粥样硬化斑块、动脉三级淋巴器官、淋巴结和血液中的T细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、T细胞抗原受体测序 | NA | RNA | 小鼠和人类样本 |
| 8323 | 2024-09-25 |
Radiation-induced circulating myeloid-derived suppressor cells induce systemic lymphopenia after chemoradiotherapy in patients with glioblastoma
2023-01-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abn6758
PMID:36696484
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研究论文 | 研究了胶质母细胞瘤患者在接受放化疗后出现的淋巴细胞减少症的生物学机制，并探讨了药物抑制MDSC对缓解这一现象的潜力 | 首次揭示了放疗诱导的循环髓源抑制细胞（MDSC）与系统性淋巴细胞减少之间的因果关系，并验证了药物抑制MDSC在临床前模型中的有效性 | 研究仅限于临床前模型和少量患者样本，需要进一步的临床试验验证 | 探讨胶质母细胞瘤患者在接受放化疗后淋巴细胞减少的生物学机制，并寻找潜在的治疗方法 | 胶质母细胞瘤患者的外周血样本和临床前小鼠模型 | 免疫学 | 脑癌 | RNA测序、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、免疫监测数据 | 20名胶质母细胞瘤患者的外周血样本和临床前小鼠模型 |
| 8324 | 2024-09-25 |
Multi-omics analysis identifies IgG2b class-switching with ALCAM-CD6 co-stimulation in joint-draining lymph nodes during advanced inflammatory-erosive arthritis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1237498
PMID:37691918
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研究论文 | 本文利用多组学空间和单细胞转录组学技术，研究了在严重类风湿性关节炎（RA）患者中，关节引流淋巴结中淋巴引流功能障碍的分子机制 | 首次整合单细胞和空间转录组学数据，揭示了ALCAM-CD6共刺激在促进IgG2b类别转换中的作用 | 需要进一步研究免疫球蛋白克隆性和潜在的自身免疫后果，以及抗CD6疗法的有效性 | 探讨严重类风湿性关节炎中淋巴引流功能障碍的分子机制 | 关节引流淋巴结中的淋巴内皮细胞、巨噬细胞、B细胞和T细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 野生型小鼠10只，TNF-Tg小鼠18只（早期6只，晚期12只） |
| 8325 | 2024-09-25 |
scDemultiplex: An iterative beta-binomial model-based method for accurate demultiplexing with hashtag oligos
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.08.013
PMID:37664174
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研究论文 | 提出了一种基于beta-二项分布模型的迭代方法scDemultiplex，用于准确的多重样本解复用 | scDemultiplex采用beta-二项分布模型和迭代策略，相比现有七种方法在高质量和低质量数据中均表现出色，并能与其他方法结合以提升性能 | 未提及 | 开发一种准确的多重样本解复用方法，以提高单细胞测序数据的分析质量 | 单细胞测序中的多重样本解复用问题 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | beta-二项分布模型 | 单细胞测序数据 | 未提及 |
| 8326 | 2024-09-25 |
The Comparative Pathology Workbench: Interactive visual analytics for biomedical data
2023, Journal of pathology informatics
DOI:10.1016/j.jpi.2023.100328
PMID:37693862
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研究论文 | 设计了一个名为比较病理工作台（CPW）的交互式系统，用于生物医学数据的视觉分析 | 开发了一个基于网络浏览器的视觉分析平台，提供共享访问和交互式图像数据展示，支持多用户协作和讨论 | NA | 开发一个支持病理学家比较不同样本、病例和物种间正常和病变组织图像的交互式系统 | 病理图像和相关分析数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 图像 | NA |
| 8327 | 2024-09-25 |
A prebiotic diet modulates microglial states and motor deficits in α-synuclein overexpressing mice
2022-11-08, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81453
PMID:36346385
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研究论文 | 研究了富含纤维的饮食对α-突触核蛋白过度表达小鼠的微胶质细胞功能和运动障碍的影响 | 揭示了饮食与运动症状在微胶质细胞依赖性交互作用中的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨富含纤维的饮食对帕金森病样症状和病理的影响 | α-突触核蛋白过度表达的小鼠 | NA | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | α-突触核蛋白过度表达的小鼠和野生型小鼠 |
| 8328 | 2024-09-25 |
Epithelial cell plasticity drives endoderm formation during gastrulation
2021-07, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00694-x
PMID:34168324
|
研究论文 | 本文研究了在原肠胚形成过程中，上皮细胞可塑性驱动内胚层形成的过程 | 本文首次揭示了内胚层的形成独立于经典的EMT过程，而是通过上皮细胞可塑性机制实现的，并发现Foxa2作为上皮门控因子抑制EMT | NA | 揭示原肠胚形成过程中内胚层形成的分子机制 | 胚胎干细胞和鼠胚胎 | NA | NA | 高分辨率单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 8329 | 2024-09-25 |
The Dynamic Counterbalance of RAC1-YAP/OB-Cadherin Coordinates Tissue Spreading with Stem Cell Fate Patterning
2021-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202004000
PMID:34026448
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研究论文 | 研究了RAC1-YAP与OB-cadherin之间的动态平衡在协调组织扩散与干细胞命运模式中的作用 | 揭示了RAC1-YAP与OB-cadherin之间的动态平衡在协调组织扩散与干细胞命运模式中的关键作用，并通过单细胞测序和体内伤口愈合实验验证了这一机制 | NA | 探讨分子信号如何在多细胞组织的扩散动态和细胞命运承诺中起作用 | 胚胎发育和再生医学中的组织扩散 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞迁移轨迹分析 | NA |
| 8330 | 2024-09-24 |
At the interface of tumor-associated macrophages and fibroblasts: immune-suppressive networks and emerging exploitable targets
2024-Sep-23, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-1690
PMID:39311702
|
综述 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和癌症相关成纤维细胞（CAFs）之间的相互作用及其在肿瘤微环境中的免疫抑制网络 | 利用单细胞RNA测序（sc-RNA seq）和空间转录组学技术，深入理解TAMs和CAFs之间的信号动态和空间分布 | NA | 研究TAMs和CAFs在实体肿瘤微环境中的相互作用，寻找新的治疗靶点 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（sc-RNA seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 8331 | 2024-09-24 |
Single-cell RNA Sequencing Demonstrates the Heterogeneity of Different Molecular Subtypes in Gastric Cancer
2024-Sep-23, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-024-10922-2
PMID:39311993
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了胃癌不同分子亚型的异质性 | 揭示了不同TCGA分子亚型胃癌在单细胞水平的异质性，并识别了与预后相关的亚型特异性lncRNA | NA | 深入理解胃癌的异质性并预测患者预后 | 胃癌的不同分子亚型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 119,878个细胞 |
| 8332 | 2024-09-24 |
RGS19: A novel prognostic biomarker for tumor immunity in clear cell renal cell carcinoma revealed through comprehensive bulk and single-cell sequencing analysis
2024-Sep-21, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.09.057
PMID:39307631
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8333 | 2024-09-24 |
Gene regulatory mechanisms of T cell exhaustion in diffuse large B cell lymphoma based on single-cell transcriptome data
2024-Sep-19, Leukemia research
IF:2.1Q3
DOI:10.1016/j.leukres.2024.107588
PMID:39307100
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研究论文 | 研究基于单细胞转录组数据分析弥漫性大B细胞淋巴瘤中T细胞耗竭的基因调控机制 | 首次全面分析了弥漫性大B细胞淋巴瘤中T细胞耗竭的基因表达特征，并发现了ID3基因在T细胞耗竭中的关键作用 | 研究依赖于公开的单细胞转录组数据，可能存在数据质量和样本多样性的限制 | 深入理解弥漫性大B细胞淋巴瘤中T细胞耗竭的分子病理机制，寻找新的治疗靶点 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤中的T细胞耗竭及其相关基因表达特征 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 使用公开的单细胞转录组数据 |
| 8334 | 2024-09-23 |
Constructing a disulfidptosis-related prognostic signature of hepatocellular carcinoma based on single-cell sequencing and weighted co-expression network analysis
2024-Oct, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01968-z
PMID:38760515
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序和加权共表达网络分析构建了与硫氧还蛋白相关的肝细胞癌预后标志物 | 首次构建了基于硫氧还蛋白相关基因的肝细胞癌预后模型，并探讨了高硫氧还蛋白组和低硫氧还蛋白组在肝细胞癌中的差异 | 研究仅基于TCGA和GSE14520数据集，样本量有限，需要进一步验证 | 探讨硫氧还蛋白相关基因在肝细胞癌中的临床预后特征 | 肝细胞癌患者及其预后 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序、加权共表达网络分析 | COX回归、Lasso回归 | 基因表达数据 | TCGA和GSE14520数据集中的肝细胞癌患者 |
| 8335 | 2024-09-23 |
Metabolic Heterogeneity and Potential Immunotherapeutic Responses Revealed by Single-Cell Transcriptomics of Breast Cancer
2024-Oct, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01952-7
PMID:38578322
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了乳腺癌的代谢异质性和潜在的免疫治疗反应 | 首次全面阐明了乳腺癌在单细胞水平的转录组异质性，并揭示了癌症相关成纤维细胞在治疗抵抗中的作用 | 研究样本仅来自14名患者，可能影响结果的普适性 | 揭示乳腺癌的异质性及其与化疗抵抗和免疫治疗反应的关系 | 乳腺癌患者的肿瘤样本及其单细胞转录组 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 14名乳腺癌患者的样本 |
| 8336 | 2024-09-23 |
Spatiotemporal single-cell RNA sequencing reveals the role of steroid hormone pathway during chicken primordial follicle formation
2024-Oct, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2024.104090
PMID:39096826
|
研究论文 | 研究通过时空单细胞RNA测序揭示了鸡原始卵泡形成过程中类固醇激素通路的作用 | 首次通过单细胞mRNA测序和空间转录组分析探索了鸡原始卵泡形成过程中的卵巢微环境和调控通路 | 研究仅限于鸡的卵巢组织，未涉及其他物种 | 揭示鸡原始卵泡形成过程中的分子调控机制 | 鸡的卵巢组织和原始卵泡形成过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | mRNA | 收集了2天、5.5天和10.5天孵化的鸡的左侧卵巢组织 |
| 8337 | 2024-08-07 |
B-cell repertoire and functions in idiopathic nephrotic syndrome: what to learn from single-cell RNA sequencing?
2024-Oct, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.05.032
PMID:38977075
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8338 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Interaction between CCL19+ Inflammatory Keratinocytes and CCR7+ Dendritic Cells and B Cells in Pemphigus
2024-Oct, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.03.016
PMID:38537931
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8339 | 2024-09-23 |
Single-cell RNA sequencing identifies interferon-inducible monocytes/macrophages as a cellular target for mitigating the progression of abdominal aortic aneurysm and rupture risk
2024-Sep-21, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae117
PMID:38836630
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序识别出干扰素诱导的单核细胞/巨噬细胞作为减轻腹主动脉瘤进展和破裂风险的细胞靶点 | 首次识别出干扰素诱导的单核细胞/巨噬细胞（IFNICs）在腹主动脉瘤发展中的作用，并发现其通过cGAS-STING和JAK-STAT通路促进I型干扰素的分泌 | 研究主要基于AngII诱导的ApoE-/-小鼠模型，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨腹主动脉瘤发展过程中细胞类型和信号通路的变化，为开发治疗手段提供依据 | 腹主动脉瘤及其破裂风险 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | AngII诱导的ApoE-/-小鼠的腹主动脉样本 |
| 8340 | 2024-09-23 |
Immune profiling-based targeting of pathogenic T cells with ustekinumab in ANCA-associated glomerulonephritis
2024-Sep-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52525-w
PMID:39300109
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研究论文 | 本文通过空间和单细胞转录组分析，研究了ANCA相关性肾小球肾炎中致病性T细胞的特征，并探索了ustekinumab作为潜在治疗药物的效果 | 首次通过单细胞转录组分析识别出ANCA相关性肾小球肾炎中的致病性T细胞，并验证了ustekinumab作为治疗药物的潜力 | 研究样本量较小，仅涉及34名患者，且治疗效果需在更大规模的临床试验中进一步验证 | 探索ANCA相关性肾小球肾炎中致病性T细胞的特征，并寻找有效的治疗药物 | ANCA相关性肾小球肾炎患者及其肾脏样本 | NA | 肾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 34名ANCA相关性肾小球肾炎患者 |