单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27967 篇文献，本页显示第 8321 - 8340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8321 | 2024-10-04 |
mosna reveals different types of cellular interactions predictive of response to immunotherapies and survival in cancer
2024-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532947
PMID:36993595
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研究论文 | 开发了一个名为mosna的Python包，用于分析空间组学数据并整合临床或生物学数据，以揭示细胞相互作用模式或组织架构 | mosna包整合了多种算法和条件，如临床数据，使得空间组学数据的分析更加便捷和全面 | NA | 开发一种工具，使空间组学数据的分析更加便捷，并能整合临床数据以揭示细胞相互作用和组织架构 | 空间组学数据和临床数据 | 生物信息学 | 癌症 | 空间组学 | 机器学习模型 | 蛋白质组学数据 | 两个空间解析的蛋白质组学数据集 |
| 8322 | 2024-10-04 |
DrugReSC: targeting disease-critical cell subpopulations with single-cell transcriptomic data for drug repurposing in cancer
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae490
PMID:39350337
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研究论文 | 本文提出了一种利用单细胞转录组数据进行药物再利用的新方法DrugReSC | DrugReSC利用单细胞RNA测序数据，针对疾病病理关键的细胞亚群进行药物再利用，构建了药物与细胞的转录关系矩阵，并使用基于排列的方法评估药物对细胞表型变化的贡献 | NA | 开发一种利用单细胞转录组数据进行药物再利用的新方法，以推进癌症精准医学 | 癌症中的关键细胞亚群 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个癌症案例 |
| 8323 | 2024-10-04 |
scPanel: a tool for automatic identification of sparse gene panels for generalizable patient classification using scRNA-seq datasets
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae482
PMID:39350339
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研究论文 | 介绍了一种名为scPanel的计算框架，用于从scRNA-seq数据中自动识别稀疏基因面板，以实现患者分类 | scPanel通过数据驱动的方式自动确定最小数量的信息性生物标志物基因，并在多个疾病数据集上展示了高分类准确性 | NA | 开发一种计算工具，用于从scRNA-seq数据中识别稀疏基因面板，以实现患者分类并降低测序成本 | scRNA-seq数据中的稀疏基因面板 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及硬皮病、结直肠癌和COVID-19的数据集 |
| 8324 | 2024-10-04 |
Decoding the genetic landscape of autism: A comprehensive review
2024-Sep-09, World journal of clinical pediatrics
DOI:10.5409/wjcp.v13.i3.98468
PMID:39350903
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综述 | 本文综述了自闭症谱系障碍（ASD）的遗传和表观遗传机制，探讨了基因突变和基因-环境相互作用对ASD的影响 | 本文整合了基因变异、表观遗传机制（如DNA甲基化和组蛋白修饰）以及新兴技术（如CRISPR-Cas9和单细胞RNA测序）的研究成果，提供了对ASD遗传景观的全面理解 | 尽管识别了许多与ASD相关的风险基因和突变，但仍有许多病例无法通过已知因素解释，表明存在未发现的遗传成分 | 探索ASD的遗传结构，阐明基因突变的机制，并研究基因-环境相互作用 | 自闭症谱系障碍（ASD）的遗传和表观遗传机制 | NA | 自闭症 | CRISPR-Cas9、单细胞RNA测序、DNA甲基化、组蛋白修饰 | NA | 基因组数据 | NA |
| 8325 | 2024-10-04 |
Single-cell transcriptomic analysis of radiation-induced lung injury in rat
2024-Sep-06, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2024.10357
PMID:38552230
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了放射线诱导的肺损伤在大鼠中的细胞机制 | 揭示了放射线暴露后肺组织中细胞间通讯增加以及不同细胞类型的亚群特征 | 仅限于大鼠模型，且样本量较小 | 探究放射线诱导肺损伤的细胞机制 | 大鼠肺组织中的单细胞 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠肺组织样本 |
| 8326 | 2024-10-04 |
Inactivated cGAS-STING Signaling Facilitates Endocrine Resistance by Forming a Positive Feedback Loop with AKT Kinase in ER+HER2- Breast Cancer
2024-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403592
PMID:39023171
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研究论文 | 本文研究了cGAS-STING信号通路在ER+HER2-乳腺癌内分泌抵抗中的作用及其与AKT激酶的正反馈机制 | 首次揭示了cGAS-STING信号通路在ER+HER2-乳腺癌内分泌抵抗中的作用，并发现其与AKT1激酶形成正反馈循环 | 研究主要基于RNA测序数据和空间转录组学分析，缺乏直接的细胞和动物实验验证 | 探讨ER+HER2-乳腺癌内分泌抵抗的分子机制及潜在治疗策略 | ER+HER2-乳腺癌细胞及其内分泌抵抗机制 | NA | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | ER+HER2-乳腺癌患者样本 |
| 8327 | 2024-10-04 |
Single-Cell RNA Sequencing Deconstructs the Distribution of Immune Cells Within Abdominal Aortic Aneurysms in Mice
2024-09, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321129
PMID:39051127
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠腹主动脉瘤中CD45+细胞的分布和相互作用 | 首次在单细胞水平上解析了腹主动脉瘤中免疫细胞的分布和相互作用，并发现了AAA组织中特有的常规树突状细胞类型1 | 研究仅限于小鼠模型，尚未完全验证在人类AAA中的适用性 | 探讨腹主动脉瘤发展过程中免疫细胞的作用及其相互作用 | 小鼠腹主动脉瘤组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个时间点的小鼠腹主动脉瘤组织样本 |
| 8328 | 2024-10-04 |
IL-33 Facilitates Fibro-Adipogenic Progenitors to Establish the Pro-Regenerative Niche after Muscle Injury
2024-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405299
PMID:39037903
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研究论文 | 研究探讨了肌肉损伤后IL-33通过激活纤维脂肪祖细胞（FAPs）促进肌肉再生的机制 | 首次揭示了IL-33/IL1RL1信号通路在肌肉再生中的作用，为肌肉相关疾病和损伤的治疗提供了新的策略 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中验证 | 探讨肌肉损伤后促进肌肉再生的机制 | 肌肉干细胞（MuSCs）、纤维脂肪祖细胞（FAPs）和巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 14种不同的肌肉细胞 |
| 8329 | 2024-10-04 |
Cross-modal integration of bulk RNA-seq and single-cell RNA sequencing data to reveal T-cell exhaustion in colorectal cancer
2024-Sep, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70101
PMID:39344205
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研究论文 | 本文提出了一种名为DeepTEX的多组学深度学习方法，通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA测序数据，研究结直肠癌中T细胞耗竭的异质性 | 本文创新性地提出了DeepTEX方法，通过跨模态数据整合和知识蒸馏模型，预测T细胞耗竭的异质性，并识别关键功能通路和基因 | NA | 研究结直肠癌中T细胞耗竭的异质性，并探索相关的治疗靶点 | 结直肠癌中的T细胞耗竭 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq | 深度学习模型 | RNA-seq数据 | NA |
| 8330 | 2024-10-04 |
Single-cell multiomic analysis identifies macrophage subpopulations in promoting cardiac repair
2024-Aug-27, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175297
PMID:39190625
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研究论文 | 研究通过单细胞多组学分析，揭示了在心脏修复过程中巨噬细胞亚群的作用及其命运调控机制 | 首次通过时空单细胞表观基因组分析，揭示了再生和非再生心脏中特定巨噬细胞亚群的功能及其命运调控机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨心脏修复过程中巨噬细胞亚群的功能及其命运调控机制 | 再生和非再生心脏中的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 再生（P1）和非再生（P10）小鼠心脏样本 |
| 8331 | 2024-10-04 |
High-resolution Inference of Multiplexed Anti-HIV Gene Editing using Single-Cell Targeted DNA Sequencing
2024-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.24.576921
PMID:38328062
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研究论文 | 本文介绍了一种用于评估抗HIV基因治疗策略的高分辨率单细胞靶向DNA测序平台 | 开发了一种单细胞DNA测序平台，能够同时分析HIV基因组和50个宿主依赖因子基因，以评估多重基因编辑的效果 | 研究结果显示，在单个细胞中观察到多个位点的抗病毒基因编辑的情况很少 | 评估抗HIV基因治疗策略的疗效和治疗潜力 | HIV基因组和宿主依赖因子基因 | 基因编辑 | HIV感染 | 单细胞靶向DNA测序 | CRISPR-Cas9 | DNA序列 | 涉及小胶质细胞和原代单核细胞衍生的巨噬细胞 |
| 8332 | 2024-10-04 |
Pediatric glioma immune profiling identifies TIM3 as a therapeutic target in BRAF fusion pilocytic astrocytoma
2024-Aug-13, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI177413
PMID:39137048
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研究论文 | 本文研究了儿童胶质瘤的免疫特征，并确定了TIM3作为BRAF融合型毛细胞星形细胞瘤的治疗靶点 | 首次在BRAF融合型毛细胞星形细胞瘤中发现了激活的微胶质细胞群MG-Act，并证明了TIM3在肿瘤微环境中的表达上调，以及抗TIM3治疗在MAPK驱动的低级别胶质瘤中的疗效 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未进行临床试验 | 探讨儿童胶质瘤的免疫特征，并寻找新的治疗靶点 | 儿童胶质瘤，特别是BRAF融合型毛细胞星形细胞瘤 | 数字病理学 | 脑瘤 | 全转录组测序、单细胞测序、顺序多重免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及人类和小鼠的胶质瘤样本 |
| 8333 | 2024-10-04 |
Molecular Changes Implicate Angiogenesis and Arterial Remodeling in Systemic Sclerosis-Associated and Idiopathic Pulmonary Hypertension
2024-08, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320005
PMID:38841857
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研究论文 | 研究分析了系统性硬化症相关和特发性肺动脉高压患者的肺组织中单细胞RNA测序数据，揭示了血管重塑和血管生成的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了系统性硬化症相关和特发性肺动脉高压患者的肺血管内皮细胞和周围间充质细胞的转录组变化，揭示了新的血管生成和重塑机制 | 研究样本量较小，且仅限于特定类型的肺动脉高压患者，可能影响结果的普适性 | 探究系统性硬化症相关和特发性肺动脉高压中血管重塑和血管生成的分子机制 | 系统性硬化症相关和特发性肺动脉高压患者的肺组织中的血管内皮细胞和周围间充质细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 系统性硬化症相关肺动脉高压患者16例，特发性肺动脉高压患者3例，健康对照15例 |
| 8334 | 2024-10-04 |
Circadian control of tumor immunosuppression affects efficacy of immune checkpoint blockade
2024-Jul, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01859-0
PMID:38806707
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研究论文 | 研究昼夜节律对肿瘤免疫抑制的影响及其对免疫检查点阻断疗法效果的影响 | 首次揭示了昼夜节律对免疫抑制细胞丰度的调控作用，并展示了时间依赖的免疫检查点阻断疗法效果 | NA | 探讨昼夜节律对肿瘤免疫抑制的影响及其对免疫检查点阻断疗法效果的影响 | 结直肠癌模型中的免疫抑制细胞和细胞毒性CD8 T细胞 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8335 | 2024-10-04 |
Antitumor efficacy and potential mechanism of FAP-targeted radioligand therapy combined with immune checkpoint blockade
2024-Jun-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01853-w
PMID:38825657
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研究论文 | 研究了FAP靶向放射配体疗法与免疫检查点阻断联合使用的抗肿瘤效果及其潜在机制 | 首次展示了Lu-LNC1004与抗PD-L1免疫疗法联合使用在MC38/NIH3T3-FAP肿瘤小鼠模型中的完全肿瘤消除效果，并通过单细胞RNA测序和TCR测序揭示了联合疗法对肿瘤微环境的重新编程 | 初步临床研究样本量较小，需要进一步的大规模临床试验验证 | 探讨FAP靶向放射配体疗法与免疫检查点阻断联合使用的抗肿瘤效果及其机制 | MC38/NIH3T3-FAP和CT26/NIH3T3-FAP肿瘤异种移植小鼠模型及难治性癌症患者 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), TCR测序 | NA | 单细胞RNA, T细胞受体 | MC38/NIH3T3-FAP和CT26/NIH3T3-FAP肿瘤异种移植小鼠模型，以及难治性癌症患者 |
| 8336 | 2024-10-04 |
Large-scale neurophysiology and single-cell profiling in human neuroscience
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07405-0
PMID:38898291
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研究论文 | 本文探讨了大规模单单位人类神经生理学、单细胞RNA测序、空间转录组学和长期体外组织培养等技术在人类神经科学中的应用 | 介绍了Neuropixels和近期脑细胞图谱工作的发展，并讨论了这些技术的融合如何进一步研究人类大脑网络级活动的细胞基础 | NA | 旨在为人类神经科学领域提供一个统一的框架，以理解人类大脑的功能细胞结构 | 人类大脑的细胞基础和网络级活动 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、Neuropixels | NA | 单细胞RNA数据、空间转录组数据 | NA |
| 8337 | 2024-10-04 |
Integrated analyses reveal the diagnostic and predictive values of COL5A2 and association with immune environment in Crohn's disease
2024-06, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00276-5
PMID:38789829
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研究论文 | 研究通过综合分析揭示了COL5A2在克罗恩病中的诊断和预测价值及其与免疫环境的关联 | 首次揭示了COL5A2在克罗恩病中的诊断和预测价值，并探讨了其与免疫环境的关联 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 探讨克罗恩病中免疫细胞异常及其与COL5A2的关联，以寻找潜在的诊断和预测标志物 | 克罗恩病患者的单细胞和批量RNA测序数据，以及COL5A2的表达和功能 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq），免疫组化（IHC） | NA | RNA | 克罗恩病患者和对照组的RNA测序数据，具体样本数量未明确提及 |
| 8338 | 2024-10-04 |
Identification of Colorectal Cancer Cell Stemness from Single-Cell RNA Sequencing
2024-04-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-23-0468
PMID:38156967
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别结直肠癌中的癌症干细胞 | 提出了一个单细胞干细胞特征（SCS_sig），能够稳健地识别表达所有标记基因的结直肠癌干细胞 | SCS_sig评分在不同肿瘤间差异较大，反映了结直肠癌转录组的异质性 | 研究结直肠癌中的癌症干细胞及其与复发的关系 | 结直肠癌中的癌症干细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个原发性结肠肿瘤、9个肝转移肿瘤和11个正常对照样本 |
| 8339 | 2024-10-04 |
APP-CD74 axis mediates endothelial cell-macrophage communication to promote kidney injury and fibrosis
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1437113
PMID:39351084
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研究论文 | 研究揭示了APP-CD74轴在肾损伤和纤维化过程中介导内皮细胞与巨噬细胞之间的通信机制 | 首次揭示了APP-CD74轴在肾损伤修复过程中内皮细胞与巨噬细胞之间的重要通信作用 | 研究主要基于体外细胞共培养和小鼠模型，需要进一步的临床验证 | 探讨肾损伤修复过程中内皮细胞与巨噬细胞之间的复杂动态和多样性 | 肾损伤和纤维化过程中的内皮细胞与巨噬细胞 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、Western blot分析、流式细胞术、免疫组化、免疫荧光染色 | NA | RNA | 使用了单侧输尿管梗阻（UUO）模型和肾缺血再灌注损伤（IRI）模型的数据，以及体外细胞共培养系统 |
| 8340 | 2024-10-04 |
Integrated analyses reveal IDO1 as a prognostic biomarker coexpressed with PD-1 on tumor-associated macrophages in esophageal squamous cell carcinoma
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1466779
PMID:39351094
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研究论文 | 研究探讨了IDO1在食管鳞状细胞癌（ESCC）肿瘤微环境中的表达模式及其对患者预后和治疗反应的影响 | 首次揭示了IDO1与PD-1在肿瘤相关巨噬细胞中的共表达，并探讨了其对化疗药物敏感性和免疫检查点阻断抵抗性的影响 | 研究样本量较小，且仅基于TCGA数据库和临床中心的数据，可能存在数据偏倚 | 研究IDO1在食管鳞状细胞癌中的表达及其对患者预后和治疗反应的影响 | 食管鳞状细胞癌患者及其肿瘤微环境中的IDO1表达 | 数字病理学 | 食管癌 | RNA测序、数字免疫组化、多重免疫荧光 | NA | RNA序列数据、图像 | 95名食管鳞状细胞癌患者 |