单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 8301 - 8320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8301 | 2024-09-25 |
Revelation of comprehensive cell profiling of primary and metastatic tumour ecosystems in oral squamous cell carcinoma by single-cell transcriptomic analysis
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.97404
PMID:39310253
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示口腔鳞状细胞癌原发和转移肿瘤生态系统的综合细胞图谱 | 发现了两种新型细胞类型（CD1C-CD141-树突状细胞和CD1C+_B树突状细胞），并确定了IL1RN和C15orf48作为新的标记物 | NA | 理解口腔鳞状细胞癌在单细胞水平上的细胞起源和基因表达特征 | 口腔鳞状细胞癌的原发和转移肿瘤组织中的细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括来自口腔鳞状细胞癌患者的原发肿瘤、转移淋巴结、放射治疗后的第二原发肿瘤等多种组织样本 |
| 8302 | 2024-09-25 |
Comprehensive analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data reveals Schlafen-5 (SLFN5) as a novel prognosis and immunity
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.97975
PMID:39310264
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析，探讨了Schlafen家族基因在结直肠腺癌（COAD）中的诊断和预后潜力 | 首次揭示了SLFN5在COAD中的显著上调及其与不良预后和免疫反应的关系 | NA | 探索Schlafen家族基因在结直肠腺癌中的诊断和预后潜力 | Schlafen家族基因在结直肠腺癌中的表达及其与预后和免疫反应的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 结直肠癌患者和正常组织的样本 |
| 8303 | 2024-09-25 |
Investigation and Confirmation of PYCARD as a Potential Biomarker for the Management of Psoriasis Disease
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S468746
PMID:39310902
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研究论文 | 本文探讨了坏死性凋亡相关基因在银屑病中的分子机制，并筛选出PYCARD作为潜在的银屑病生物标志物 | 首次将PYCARD确定为银屑病的潜在生物标志物，并通过多种实验验证了其在银屑病发展中的重要作用 | NA | 探索银屑病中坏死性凋亡相关基因的分子机制，并筛选潜在的生物标志物 | 银屑病患者和银屑病样皮炎小鼠模型 | 生物信息学 | 银屑病 | 实时荧光定量PCR、Western blot、免疫组化、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及GSE13355和GSE14905数据集中的银屑病差异表达基因，以及临床样本和动物实验 |
| 8304 | 2024-09-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and intercellular communication of hepatic stellate cells and macrophages during liver fibrosis
2023-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.378
PMID:37724132
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了肝星状细胞和巨噬细胞在肝纤维化过程中的异质性和细胞间通讯 | 首次在单细胞水平上揭示了肝星状细胞和巨噬细胞在肝纤维化中的异质性和相互调节网络，并发现了一种促纤维化的Thbs1+巨噬细胞亚群 | 研究仅限于小鼠和人类样本，未涉及其他物种 | 揭示肝纤维化过程中肝星状细胞和巨噬细胞的异质性和细胞间通讯 | 肝星状细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自正常和纤维化小鼠肝脏的非实质细胞 |
| 8305 | 2024-09-25 |
Integrative analysis of single-cell RNA-seq and ATAC-seq reveals heterogeneity of induced pluripotent stem cell-derived hepatic organoids
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107675
PMID:37680467
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序分析，揭示了诱导多能干细胞衍生的肝类器官的异质性 | 本文首次在单细胞水平上整合了RNA测序和ATAC测序数据，揭示了肝类器官在不同分化状态下的转录组和表观基因组特征 | 本文主要集中在肝类器官的研究，未涉及其他类型的类器官或组织 | 深入了解类器官的转录组和表观基因组特征，并探讨其在肝脏发育中的调控网络 | 诱导多能干细胞衍生的肝类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据和表观基因组数据 | 两种状态的肝类器官（可扩展和更分化的） |
| 8306 | 2024-09-25 |
Determinants of Survival with Combined HER2 and PD-1 Blockade in Metastatic Esophagogastric Cancer
2023-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-3769
PMID:37406106
|
研究论文 | 报告了在转移性食管胃癌中使用pembrolizumab、trastuzumab和化疗（PTC）的II期研究的更新临床结果，并结合了独立Memorial Sloan Kettering（MSK）队列的结果 | 通过89Zr-trastuzumab PET、scRNA-seq和连续ctDNA与CT成像，识别了治疗前患者内基因组异质性对无进展生存期（PFS）的负面影响，并发现了与治疗耐药性相关的基因表达特征 | NA | 评估在转移性食管胃癌中使用pembrolizumab、trastuzumab和化疗（PTC）的临床效果，并识别预测治疗反应和耐药性的生物标志物 | 转移性食管胃癌患者 | 数字病理学 | 食管胃癌 | PET成像、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、循环肿瘤DNA（ctDNA）分析 | NA | 基因组数据、影像数据 | 226名接受trastuzumab治疗的MSK患者 |
| 8307 | 2024-09-25 |
scPlant: A versatile framework for single-cell transcriptomic data analysis in plants
2023-09-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100631
PMID:37254480
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为scPlant的多功能框架，用于植物单细胞转录组数据的分析 | scPlant框架提供了一个端到端的解决方案，涵盖了从基本数据处理到高级分析任务的功能，并集成了多种可视化工具 | NA | 开发一个多功能框架，用于植物单细胞转录组数据的分析 | 植物单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 8308 | 2024-09-25 |
Cell specialization and coordination in Arabidopsis leaves upon pathogenic attack revealed by scRNA-seq
2023-09-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100676
PMID:37644724
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序技术研究拟南芥叶片在病原体攻击下的细胞特化和协调反应 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了拟南芥叶片在病原体攻击下的细胞特化和协调反应，并识别了不同细胞类型的转录重编程和调控因子 | 研究仅限于拟南芥叶片和特定的病原体Pseudomonas syringae DC3000，可能不适用于其他植物或病原体 | 探讨植物在病原体攻击下的防御反应中不同细胞类型的特化和协调机制 | 拟南芥叶片在病原体Pseudomonas syringae DC3000攻击下的细胞反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 三组独立的生物学重复样本 |
| 8309 | 2024-09-25 |
TISSUE: uncertainty-calibrated prediction of single-cell spatial transcriptomics improves downstream analyses
2023-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.25.538326
PMID:37162839
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为TISSUE的通用框架，用于估计空间基因表达预测的不确定性，并提供不确定性感知的下游推理方法 | TISSUE框架能够提供校准良好的预测区间，并显著降低差异基因表达分析的假发现率，改善聚类和可视化效果，以及监督学习模型的性能 | NA | 解决单细胞空间转录组学中基因表达预测的不确定性问题，并提高下游分析的准确性 | 单细胞空间转录组学数据中的基因表达预测及其不确定性估计 | 数字病理学 | NA | 空间基因表达预测 | NA | 转录组数据 | 涉及11个基准数据集和一个MERFISH空间转录组数据集 |
| 8310 | 2024-09-25 |
The Deep Generative Decoder: MAP estimation of representations improves modelling of single-cell RNA data
2023-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad497
PMID:37572301
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为深度生成解码器（DGD）的新模型，通过最大后验估计直接计算模型参数和表示，用于单细胞RNA数据的建模 | DGD模型能够处理复杂的参数化潜在分布，而变分自编码器通常使用固定的正态分布，因为添加其他类型的复杂性较高 | NA | 改进单细胞RNA数据的低维表示学习 | 单细胞RNA数据 | 机器学习 | NA | 最大后验估计 | 深度生成解码器（DGD） | 单细胞RNA数据 | 多个单细胞数据集 |
| 8311 | 2024-09-25 |
Challenges of clinical translation from single-cell sequencing to measures in clinical biochemistry of haematology: Definition of immune cell identities
2023-09, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1401
PMID:37700496
|
研究论文 | 本文探讨了从单细胞测序到临床血液学生化检测的临床转化挑战，特别是免疫细胞身份的定义 | 提出了细胞身份标记基因面板（ciMGPs）的概念，并探讨了其在疾病系统性反应、疾病特异性生物标志物识别和细胞异质性定义中的潜力 | 定义细胞亚群和状态的精确身份存在困难，且临床意义的精确解释和影响评估具有挑战性 | 促进单细胞RNA测序（scRNA-seq）在临床血液学生化检测中的应用 | 外周免疫细胞及其在系统性和微环境止血中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 大规模人群，包括不同年龄、疾病和治疗方案的个体 |
| 8312 | 2024-09-25 |
Activin A-Mediated Polarization of Cancer-Associated Fibroblasts and Macrophages Confers Resistance to Checkpoint Immunotherapy in Skin Cancer
2023-09-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-0219
PMID:37327314
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研究论文 | 研究探讨了皮肤癌中免疫检查点抑制剂治疗抵抗的细胞和分子机制 | 首次揭示了Activin A介导的癌症相关成纤维细胞和巨噬细胞的极化在皮肤癌免疫治疗抵抗中的关键作用 | 研究仅限于基底细胞癌，未涵盖其他类型的皮肤癌 | 探究基底细胞癌对免疫检查点抑制剂治疗抵抗的细胞和分子机制 | 基底细胞癌中的癌症相关成纤维细胞和巨噬细胞 | NA | 皮肤癌 | 空间转录组学和单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括对免疫治疗敏感和抵抗的基底细胞癌患者 |
| 8313 | 2024-09-25 |
Inferring and perturbing cell fate regulomes in human brain organoids
2023-Sep, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05279-8
PMID:36198796
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研究论文 | 研究利用人类脑类器官和单细胞基因组技术，推断和扰动细胞命运调控网络 | 开发了Pando框架，整合多组学数据和转录因子结合位点预测，推断出描述类器官发育的全局基因调控网络 | NA | 研究人类脑发育中的基因调控网络，并评估转录因子对细胞命运和状态调控的影响 | 人类脑类器官中的单细胞转录组和可及染色质数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因组数据 | 覆盖神经上皮形成、模式化、脑区域化和神经发生的密集时间序列数据 |
| 8314 | 2024-09-25 |
Single-cell sequencing of individual retinal organoids reveals determinants of cell-fate heterogeneity
2023-08-28, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100548
PMID:37671011
|
研究论文 | 本文应用sci-Plex单细胞组合索引RNA测序方法分析视网膜类器官的细胞命运异质性 | 开发了一种测量类器官异质性的方法，并发现早期激活Wnt信号通路可增加视网膜细胞类型 | 当前技术在处理条件上的限制限制了其在筛选或类器官异质性研究中的应用 | 探索视网膜类器官的细胞命运异质性及其调控机制 | 视网膜类器官及其细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 410个视网膜类器官 |
| 8315 | 2024-09-25 |
Unraveling Vulnerabilities in Endocrine Therapy-Resistant HER2+/ER+ Breast Cancer
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.21.554116
PMID:37662291
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研究论文 | 本研究开发并表征了两种不同的内分泌治疗耐药（ETR）HER2+/ER+乳腺癌体外模型，以识别可能的治疗脆弱性 | 本研究首次开发了两种内分泌治疗耐药的HER2+/ER+乳腺癌体外模型，并识别了脂质代谢和铁死亡重塑作为此类ETR乳腺癌的脆弱性 | 本研究仅限于体外模型，尚未在临床环境中验证其发现 | 研究内分泌治疗耐药的HER2+/ER+乳腺癌的潜在治疗脆弱性 | 内分泌治疗耐药的HER2+/ER+乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 全基因组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 两种长期雌激素剥夺（LTED）细胞系：BT-474（BT474）和MDA-MB-361（MM361） |
| 8316 | 2024-09-25 |
An overview of human single-cell RNA sequencing studies in neurobiological disease
2023-08, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2023.106201
PMID:37321420
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在神经生物学疾病研究中的应用 | 揭示了神经生物学疾病中的新型细胞类型或亚型，提出了新的病理生理机制，发现了新的药物靶点和潜在的生物标志物 | 主要集中在皮质脑区和少数疾病类型，未来研究应扩展到非皮质脑区和更多疾病类型 | 综述单细胞RNA测序在神经生物学疾病研究中的应用，探讨其对疾病理解和治疗的影响 | 神经生物学疾病患者的脑组织和由外周细胞衍生的类器官 | 数字病理学 | 神经生物学疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8317 | 2024-09-25 |
The central role of neutrophil extracellular traps (NETs) and by-products in COVID-19 related pulmonary thrombosis
2023-08, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.949
PMID:37647446
|
研究论文 | 探讨中性粒细胞外陷阱（NETs）及其副产物在COVID-19相关肺血栓形成中的中心作用 | 揭示了SARS-CoV-2如何促进NETs形成，并探讨了NETs在肺血栓形成中的作用机制 | 尚未完全阐明SARS-CoV-2促进NETs的具体机制 | 研究NETs在COVID-19相关肺血栓形成中的作用及其机制，并探讨针对NETs的治疗潜力 | 中性粒细胞外陷阱（NETs）及其在COVID-19肺血栓形成中的作用 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8318 | 2024-09-25 |
High-Dimensional Single-Cell Multimodal Landscape of Human Carotid Atherosclerosis
2023-Jul-16, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.07.13.23292633
PMID:37502836
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研究论文 | 本文通过结合CITE-seq和scRNA-seq技术，详细描述了人类颈动脉粥样硬化的单细胞多模态景观 | 首次全面揭示了颈动脉粥样硬化病变中细胞的转录组和表型景观，并开发了首个用于分离病变中SMC衍生细胞的流式细胞术面板 | NA | 深入了解颈动脉粥样硬化病变中细胞的全面转录组和表型景观 | 颈动脉粥样硬化病变中的细胞类型及其与临床病理生理学的关联 | 数字病理学 | 心血管疾病 | CITE-seq, scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 21个病变样本，其中13个为有症状的 |
| 8319 | 2024-09-25 |
Heterogeneity of Islet-Infiltrating IL-21+ CD4 T Cells in a Mouse Model of Type 1 Diabetes
2023-04-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200712
PMID:36762954
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研究论文 | 研究了在小鼠1型糖尿病模型中胰岛内IL-21+ CD4 T细胞的异质性 | 生成了一个新的IL-21报告NOD小鼠品系，以进一步表征IL-21+ CD4 T细胞在1型糖尿病中的作用 | NA | 探讨胰岛内IL-21+ CD4 T细胞的表型和分化状态 | 胰岛内IL-21+ CD4 T细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8320 | 2024-09-25 |
Glioblastoma induces the recruitment and differentiation of hybrid neutrophils from skull bone marrow
2023-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.24.534105
PMID:36993266
|
研究论文 | 研究揭示了胶质母细胞瘤诱导颅骨骨髓中的混合中性粒细胞招募和分化的机制 | 首次发现胶质母细胞瘤能够诱导颅骨骨髓中的混合中性粒细胞分化，并抑制肿瘤生长 | 研究主要基于患者和鼠类的胶质母细胞瘤样本，需要进一步验证在其他肿瘤类型中的适用性 | 探讨肿瘤相关中性粒细胞在胶质母细胞瘤生物学中的作用 | 胶质母细胞瘤、肿瘤相关中性粒细胞、颅骨骨髓 | NA | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者和鼠类的胶质母细胞瘤样本 |