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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8301 - 8320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8301 | 2025-10-07 |
Interpretable single-cell factor decomposition using sciRED
2024-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.01.605536
PMID:39149356
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研究论文 | 开发了一种名为sciRED的可解释单细胞因子分解方法，用于改进单细胞RNA测序数据的分析 | 通过去除已知混杂效应、使用旋转提高因子可解释性、将因子映射到已知协变量、识别可能捕获隐藏生物现象的未解释因子 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的因子分析解释性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子分解模型 | 基因表达数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8302 | 2025-10-07 |
Lamination-based organoid spatially resolved transcriptomics technique for primary lung and liver organoid characterization
2024-Nov-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2408939121
PMID:39514315
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研究论文 | 本研究开发了一种基于层压的类器官空间转录组技术，用于表征原代肺和肝脏类器官 | 开发了新型层压式类器官空间转录组技术，解决了传统切片方法不适用于原代组织来源类器官的技术难题 | 技术尚未在其他类型类器官中验证，且依赖于自制层压设备 | 开发适用于原代组织来源类器官的空间转录组表征方法 | 原代小鼠肺和肝脏来源的类器官 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，液滴工程方法，免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据，图像数据 | 小鼠肺和肝脏类器官 | NA | 空间转录组学 | 自制层压设备 | 基于重量压缩的自制层压装置，液滴工程方法制备类器官 |
| 8303 | 2025-10-07 |
Interpretable single-cell factor decomposition using sciRED
2024-Aug-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4819117/v1
PMID:39149508
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研究论文 | 开发了一种名为sciRED的可解释单细胞因子分解方法，用于改进scRNA-seq数据的因子分析 | 通过消除已知混杂效应、使用旋转提高因子可解释性、将因子映射到已知协变量、识别可能捕获隐藏生物现象的非解释因子 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的因子分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子分解模型 | 基因表达数据 | 多个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8304 | 2025-10-07 |
Endogenous FGFs drive ERK-dependent cell fate patterning in 2D human gastruloids
2024-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.08.602611
PMID:39026750
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研究论文 | 本研究揭示了FGF依赖性ERK信号在2D人类胃泌样体中驱动细胞命运模式化的新机制 | 发现了FGF4和FGF17通过基底定位的FGFR1信号诱导原始条纹样细胞的新机制，与人类和猴胚胎相似但与小鼠不同 | 研究基于体外2D胃泌样体模型，与真实胚胎环境存在差异 | 探究FGF在人类胃泌样体模型中的功能和作用机制 | 2D人类胃泌样体模型 | 发育生物学 | NA | scRNA-seq, 原位杂交 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8305 | 2025-10-07 |
Transcriptional control of the Cryptosporidium life cycle
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07466-1
PMID:38811723
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示隐孢子虫完整生命周期的基因表达程序 | 推翻现有模型，仅识别出三种细胞内阶段；发现Myb-M转录因子是雄性命运的最早决定因素 | 研究主要基于体外培养和感染动物模型，人类直接应用需进一步验证 | 解析隐孢子虫生命周期分子机制以推动疫苗和治疗开发 | 微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum) | 单细胞生物学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 体外培养和感染动物样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8306 | 2025-10-07 |
Spatial co-transcriptomics reveals discrete stages of the arbuscular mycorrhizal symbiosis
2024-04, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01666-3
PMID:38589485
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研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组技术揭示了植物与丛枝菌根真菌共生关系的细胞和空间动态过程 | 首次在细胞和空间分辨率水平整合分析植物和真菌转录组，揭示了皮层细胞在不同定殖阶段的动态转录组特征 | 研究仅限于两种模式生物，且技术方法可能无法完全捕获所有细胞类型的转录信息 | 探索植物与丛枝菌根真菌共生关系的分子机制 | 蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)和根内球囊霉(Rhizophagus irregularis) | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8307 | 2025-10-07 |
SPACEL: deep learning-based characterization of spatial transcriptome architectures
2023-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43220-3
PMID:37990022
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研究论文 | 介绍基于深度学习的空间转录组架构表征工具SPACEL，用于分析多个空间转录组切片数据 | 开发了首个集成细胞类型反卷积、空间域识别和3D对齐的深度学习工具包 | 未明确说明在特定组织类型或技术平台上的性能限制 | 解决多个空间转录组切片的联合分析和3D组织架构重建的挑战 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 多层感知机, 图卷积网络, 对抗学习 | mRNA表达数据, 空间坐标数据 | 模拟和真实空间转录组数据集，涉及多种组织和ST技术 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8308 | 2025-10-07 |
Brain-to-gut trafficking of alpha-synuclein by CD11c+ cells in a mouse model of Parkinson's disease
2023-11-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43224-z
PMID:37981650
|
研究论文 | 本研究揭示了帕金森病小鼠模型中α-突触核蛋白通过CD11c+细胞从大脑向回肠运输的机制 | 首次证明CD11c+细胞在大脑与肠道间运输α-突触核蛋白的机制，并发现回肠CD11c+细胞具有小胶质细胞样特征 | 研究仅使用雄性小鼠模型，未涉及雌性动物；研究结果需在人类中进一步验证 | 探究帕金森病中α-突触核蛋白聚集体的传播机制 | 帕金森病小鼠模型中的CD11c+细胞和α-突触核蛋白 | 神经科学 | 帕金森病 | 免疫组织化学，单细胞RNA测序，光转换蛋白示踪 | NA | 基因表达数据，蛋白质定位数据 | 雄性小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8309 | 2025-10-06 |
Simultaneous selection of nanobodies for accessible epitopes on immune cells in the tumor microenvironment
2023-11-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43038-z
PMID:37978291
|
研究论文 | 开发了一种名为INSPIRE-seq的方法，用于在肿瘤微环境中筛选免疫细胞结合纳米抗体 | 首次提出利用纳米抗体库和二代测序技术并行富集能够穿透肿瘤微环境的免疫细胞结合纳米抗体 | NA | 开发筛选靶向肿瘤微环境中免疫细胞表位的纳米抗体技术 | 肿瘤微环境中的免疫细胞，包括树突状细胞等亚型 | 合成生物学 | 肿瘤 | 二代测序，单细胞RNA测序，免疫荧光，结构建模与对接 | NA | 测序数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8310 | 2025-05-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Immune Landscape of Granulomatous Mastitis
2025-May-08, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02310-8
PMID:40338490
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示肉芽肿性乳腺炎的免疫图谱 | 首次使用单细胞RNA测序技术对肉芽肿性乳腺炎病变组织与正常乳腺组织进行比较分析，揭示了免疫细胞的浸润情况、免疫紊乱现象以及多种信号通路的异常激活 | 研究样本量未明确说明，可能影响结果的普遍性 | 探究肉芽肿性乳腺炎的免疫学特征和潜在发病机制 | 肉芽肿性乳腺炎病变组织和正常乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8311 | 2025-05-09 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals the Regulatory Functions of Copines Family Genes in Testicular Cancer Progression
2025-May-06, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
|
研究论文 | 本研究基于单细胞数据探讨了Copines家族基因在睾丸癌不同细胞亚群中的表达模式及调控功能 | 首次在单细胞水平上研究Copines家族基因在睾丸癌中的调控作用 | NA | 探究Copines家族基因在睾丸癌中的调控机制 | 睾丸癌细胞亚群 | 数字病理学 | 睾丸癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8312 | 2025-05-09 |
Integrated multiomics and Mendelian randomization identify CHIT1 as a novel sepsis biomarker and therapeutic target
2025-May-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99619-z
PMID:40325173
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和孟德尔随机化方法，发现CHIT1作为脓毒症的新型生物标志物和治疗靶点 | 首次将CHIT1鉴定为脓毒症的新生物标志物和潜在药物靶点，揭示了其在加剧中性粒细胞过度炎症和免疫抑制中的作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床验证 | 寻找能预测脓毒症患者预后的新关键生物标志物并探索其分子机制 | 脓毒症患者 | 生物信息学 | 脓毒症 | 批量转录组测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)分析 | 单变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE65682等)和eQTLGen Consortium及IEU OpenGWAS项目数据 | NA | NA | NA | NA |
| 8313 | 2025-05-09 |
Modulation of senescent Lepr+ skeletal stem cells via suppression of leptin-induced STAT3‒FGF7 axis activation alleviates abnormal subchondral bone remodeling and osteoarthritis progression
2025-May-05, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04342-1
PMID:40325465
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体内外实验，揭示了瘦素受体阳性骨骼干细胞（Lepr+ SSCs）在骨关节炎（OA）进展中的衰老机制及其通过STAT3-FGF7轴加剧软骨下骨异常重塑的作用 | 首次揭示了Lepr+ SSCs通过瘦素-Lepr信号通路激活STAT3-FGF7轴促进OA进展的新机制，为OA治疗提供了新的靶点 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类OA患者中进行验证 | 探究骨骼干细胞衰老在骨关节炎进展中的作用及其分子机制 | 小鼠创伤后骨关节炎（PTOA）模型中的Lepr+骨骼干细胞 | 骨生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、microCT、病理分析 | 小鼠PTOA模型 | 基因表达数据、影像数据、组织病理数据 | 未明确说明具体样本数量（小鼠模型） | NA | NA | NA | NA |
| 8314 | 2025-05-09 |
BRAF mutation cancer, colorectal cancer, tumor associated lymph node structure and immune microenvironment study: MAPK protein kinase molecular action and SIRPG-CD47 protein signaling pathway
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142191
PMID:40101830
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研究论文 | 本研究探讨了BRAF基因突变对结直肠癌免疫微环境重塑的影响，特别是对肿瘤相关淋巴结构成熟和功能的影响 | 通过单细胞RNA测序、伪时间轨迹分析和空间转录组分析，揭示了BRAF突变对T细胞亚群和B细胞亚群的影响，以及其在肿瘤免疫微环境重塑中的作用 | 研究样本量未明确说明，可能影响结果的普遍性 | 系统评估BRAF基因突变对结直肠癌免疫微环境重塑的影响 | 结直肠癌患者的临床样本 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、伪时间轨迹分析、空间转录组分析、免疫组织化学、多重荧光染色技术 | NA | RNA测序数据、免疫组织化学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8315 | 2025-05-09 |
scDREAMER for atlas-level integration of single-cell datasets using deep generative model paired with adversarial classifier
2023-11-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43590-8
PMID:38012145
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研究论文 | 介绍了一种名为scDREAMER的数据集成框架，用于整合异质性单细胞测序数据集 | 结合深度生成模型和对抗训练，支持无监督和有监督的数据集成，能够处理批次效应、细胞类型分布不均等问题 | 未提及具体的技术限制或应用范围的局限性 | 开发一个高效的框架来整合跨组织、时间和条件的单细胞测序数据集 | 单细胞测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 深度生成模型与对抗分类器 | 单细胞测序数据 | 六个真实基准数据集和一个包含100万细胞的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 8316 | 2025-05-09 |
Detection of isoforms and genomic alterations by high-throughput full-length single-cell RNA sequencing in ovarian cancer
2023-11-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43387-9
PMID:38012143
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研究论文 | 通过高通量全长单细胞RNA测序在卵巢癌中检测异构体和基因组改变 | 使用长读长单细胞RNA测序技术，提高了PacBio测序深度至每个细胞12,000读长，捕获了152,000个异构体，其中52,000个是先前未报道的 | 研究样本仅来自三名卵巢癌患者，样本量较小 | 理解癌症的复杂背景，提供单细胞分辨率的基因型-表型信息 | 卵巢癌患者的临床样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 长读长单细胞RNA测序（scRNA-seq），PacBio测序 | NA | RNA测序数据 | 三名卵巢癌患者的临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8317 | 2025-05-09 |
Robust mapping of spatiotemporal trajectories and cell-cell interactions in healthy and diseased tissues
2023-11-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43120-6
PMID:38007580
|
研究论文 | 开发了三种计算统计算法，整合空间转录组学的多种数据类型，以增强对健康与疾病组织中细胞过程的理解 | 提出了基于空间图的方法PSTS、空间约束的两级置换测试SCTP以及基于神经网络的插补方法stSME，用于建模细胞间相互作用和纠正技术噪声 | NA | 增强对健康与疾病组织中细胞过程的理解 | 细胞过程、细胞间相互作用 | 空间转录组学 | 癌症、脑损伤 | 空间转录组学 | 神经网络、基于图的方法 | 基因表达数据、物理距离数据、组织形态数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8318 | 2025-05-09 |
The extrafollicular B cell response is a hallmark of childhood idiopathic nephrotic syndrome
2023-11-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43504-8
PMID:37996443
|
research paper | 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，揭示了儿童特发性肾病综合征（INS）中B细胞的异常反应特征 | 首次在儿童INS中发现了以非滤泡性B细胞反应为主的免疫扰动，并识别了特定的B细胞亚群扩增 | 样本量较小（13名INS患儿和24名健康对照），且仅分析了血液样本 | 探究儿童特发性肾病综合征的免疫发病机制 | 儿童特发性肾病综合征患者和健康对照的B细胞 | 免疫学 | 肾病综合征 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 13名INS患儿和24名健康对照的血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8319 | 2025-05-09 |
Mouse models of pediatric high-grade gliomas with MYCN amplification reveal intratumoral heterogeneity and lineage signatures
2023-11-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43564-w
PMID:38001143
|
research paper | 该研究通过构建基因工程小鼠模型，模拟人类MYCN扩增的儿童高级别胶质瘤，揭示了肿瘤的分子特征和潜在治疗选项 | 首次构建了模拟人类HGG-MYCN的小鼠模型，并通过单细胞RNA测序揭示了肿瘤内异质性和谱系特征 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 探索MYCN扩增的儿童高级别胶质瘤的肿瘤发生机制和分子特征，寻找潜在治疗选项 | 基因工程小鼠模型和人类肿瘤细胞 | 肿瘤生物学 | 儿童高级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序，高通量药物筛选 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据，药物反应数据 | 未明确说明小鼠数量，但使用了小鼠和人类肿瘤细胞进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 8320 | 2025-05-09 |
Vector-borne Trypanosoma brucei parasites develop in artificial human skin and persist as skin tissue forms
2023-11-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43437-2
PMID:37996412
|
研究论文 | 该研究通过人工人类皮肤模型和采采蝇自然感染，详细描述了布氏锥虫在皮肤中的发育过程及其进入可逆静止状态的特性 | 首次使用先进的人工人类皮肤模型和单细胞RNA测序技术，揭示了布氏锥虫在皮肤中的发育时序及其可逆静止状态 | 研究依赖于人工皮肤模型，可能无法完全模拟自然感染环境 | 探究布氏锥虫在人类皮肤中的发育过程及其持久感染机制 | 布氏锥虫及其在人工人类皮肤中的发育 | 寄生虫学 | 锥虫病 | 单细胞RNA测序 | 人工人类皮肤模型 | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |