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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8281 | 2025-05-10 |
Targeting VSIG4+ tissue-resident macrophages enhances T cell cytotoxicity and immunotherapy efficacy in cancer
2025-Apr-29, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.011
PMID:40339578
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研究论文 | 本研究探讨了VSIG4+组织驻留巨噬细胞在癌症中的作用及其对T细胞细胞毒性和免疫治疗效果的增强作用 | 发现VSIG4过表达的TRM衍生TAM亚群在多种癌症中存在,并揭示了VSIG4通过直接或间接方式促进免疫抑制效应的机制,同时鉴定出MEF2C作为维持VSIG4表达的关键转录因子 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索TRM衍生的TAM亚群在癌症中的作用及其对免疫治疗的影响 | VSIG4+组织驻留巨噬细胞及其衍生的TAM亚群 | 肿瘤免疫学 | 睾丸癌、肝细胞癌、肺癌、胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、谱系追踪 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
8282 | 2025-05-10 |
Single-Cell RNA Sequencing Outperforms Single-Nucleus RNA Sequencing in Analyzing Pancreatic Cell Diversity and Gene Expression in Goats
2025-Apr-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083916
PMID:40332786
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研究论文 | 本研究比较了单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq)在分析山羊胰腺细胞多样性和基因表达方面的效果 | 首次在山羊胰腺研究中比较了scRNA-seq和snRNA-seq的效果,发现scRNA-seq在检测细胞类型多样性和关键基因表达谱方面更优 | 研究仅使用了3只10日龄健康雌性山羊的胰腺组织,样本量较小 | 比较scRNA-seq和snRNA-seq在山羊胰腺研究中的效果 | 山羊胰腺组织 | 基因组学 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 3只10日龄健康雌性山羊的胰腺组织 | NA | NA | NA | NA |
8283 | 2025-05-10 |
Personalized Stem Cell-Based Regeneration in Spinal Cord Injury Care
2025-Apr-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083874
PMID:40332538
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综述 | 本文探讨了干细胞工程和再生医学在脊髓损伤治疗中的新进展,特别是通过神经干细胞/祖细胞、诱导多能干细胞和间充质干细胞的移植 | 结合患者特异性变异、生物工程创新和转录组学引导的精准医学,定义了脊髓损伤治疗的新前沿 | 患者特异性因素如细胞衰老、遗传和表观遗传变异、损伤微环境和合并症影响干细胞疗法的疗效 | 探索干细胞疗法在脊髓损伤治疗中的临床应用 | 脊髓损伤患者 | 再生医学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组学、CRISPR介导的低免疫原性工程、生物材料递送平台 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
8284 | 2025-05-10 |
Identifying Aberrant 1CM-Related Pathways by Multi-Omics Analysis and Validating Tumor Inhibitory Effect of One-Carbon Donor Betaine in Gastric Cancer
2025-Apr-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083841
PMID:40332533
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研究论文 | 通过多组学分析识别胃癌中异常的1CM相关通路,并验证一碳供体甜菜碱对胃癌的抑制作用 | 首次通过多组学联合分析揭示胃癌中1CM相关通路的异常激活,并发现甜菜碱作为一碳供体对胃癌细胞的抑制作用 | 样本量有限,特别是转录组测序仅使用了6对组织样本,需要更大规模的验证 | 阐明胃癌中代谢重编程的分子机制,特别是1CM相关通路的作用 | 胃癌患者和健康个体的血浆样本、胃癌组织 | 代谢组学 | 胃癌 | 代谢组学分析、转录组测序、单细胞测序、Random Forest分析 | NA | 代谢组数据、转录组数据、单细胞数据 | 334例血浆样本(胃癌患者和健康个体)、6对组织样本 | NA | NA | NA | NA |
8285 | 2025-05-10 |
The Complementary Role of Morphology in Understanding Microglial Functional Heterogeneity
2025-Apr-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083811
PMID:40332469
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综述 | 本文探讨了小胶质细胞在稳态、发育阶段和疾病状态下的异质性,重点整合了转录组数据和形态学分析 | 通过整合转录组数据和形态学分析,深入理解小胶质细胞的异质性及其在不同条件下的功能 | 未提及具体实验样本量或数据来源的详细描述 | 揭示小胶质细胞的异质性及其在发育和疾病中的功能 | 小胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据、形态学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
8286 | 2025-05-10 |
IRF5 Mediates Artery Inflammation in Salt-Sensitive Hypertension by Regulating STAT1 and STAT2 Phosphorylation to Increase ESM1 Transcription: Insights from Bioinformatics and Mechanistic Analysis
2025-Apr-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083722
PMID:40332339
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研究论文 | 本研究揭示了IRF5通过调节STAT1和STAT2的磷酸化促进ESM1转录,从而在盐敏感性高血压中调节动脉炎症的分子机制 | 首次发现IRF5通过调控STAT1和STAT2磷酸化促进ESM1转录的机制,并验证了其在盐敏感性高血压中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证较少 | 探究盐敏感性高血压中动脉炎症的分子机制 | 盐敏感性高血压小鼠模型和人/小鼠主动脉内皮细胞 | 生物信息学与分子机制研究 | 心血管疾病 | scRNA-seq, RNA测序, ChIP-qPCR, 荧光素酶报告基因检测 | DOCA-盐诱导高血压小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 未明确说明具体样本数量,包括小鼠模型和人/小鼠主动脉内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
8287 | 2025-05-10 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of the Potential Mechanisms of Follicular Development in Stra8-Deficient Mice
2025-Apr-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083734
PMID:40332359
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析探讨Stra8缺陷小鼠卵泡发育的潜在机制 | 使用单细胞RNA测序技术构建了野生型和Stra8缺陷小鼠卵巢细胞的全面转录图谱,揭示了Stra8在生殖细胞分化和卵泡形成中的复杂作用 | 研究仅限于胚胎期E14.5和E16.5阶段的小鼠卵巢细胞,未涉及其他发育阶段或其他物种 | 探讨Stra8缺陷对小鼠卵泡发育的影响及其分子机制 | 野生型和Stra8缺陷小鼠的卵巢细胞 | 生殖生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 14,755个单细胞,来自野生型和Stra8缺陷小鼠的卵巢 | NA | NA | NA | NA |
8288 | 2025-05-10 |
Novel Link Between Myeloid-Specific Adenosine Deaminase 2 and CXCL10-CXCR3 Axis in Infectious ARDS
2025-Apr-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083678
PMID:40332245
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research paper | 研究发现骨髓特异性腺苷脱氨酶2(ADA2)与CXCL10-CXCR3轴在感染性ARDS中的新联系 | 揭示了ADA2与CXCL10及其受体CXCR3之间的新联系,以及在COVID-19相关ARDS中的关键作用 | 研究基于已发表的转录组数据,未进行实验验证 | 探究ARDS的病理生理特征及其与COVID-19的关联 | COVID-19引起的ARDS患者肺部单核细胞 | 生物医学 | ARDS, COVID-19 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 已发表数据集中的COVID-19相关ARDS肺部样本 | NA | NA | NA | NA |
8289 | 2025-05-10 |
Integrating Machine Learning and Bulk and Single-Cell RNA Sequencing to Decipher Diverse Cell Death Patterns for Predicting the Prognosis of Neoadjuvant Chemotherapy in Breast Cancer
2025-Apr-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083682
PMID:40332226
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研究论文 | 整合机器学习和批量及单细胞RNA测序技术,解析乳腺癌新辅助化疗预后中的多种细胞死亡模式 | 首次整合机器学习和批量及单细胞RNA测序技术,构建基于程序性细胞死亡相关基因的预后风险模型,用于预测乳腺癌新辅助化疗的临床结果 | 研究依赖于回顾性数据,需要前瞻性研究进一步验证模型的预测能力 | 探索程序性细胞死亡模式与乳腺癌新辅助化疗预后之间的关系,并构建预测模型 | 921名接受新辅助化疗的乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫组化(IHC) | 机器学习算法组合 | RNA测序数据, 临床数据 | 921名乳腺癌患者来自7个多中心队列 | NA | NA | NA | NA |
8290 | 2025-05-10 |
Current Research Trends in Glioblastoma: Focus on Receptor Tyrosine Kinases
2025-Apr-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083503
PMID:40332008
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review | 本文综述了当前胶质母细胞瘤(GBM)研究中受体酪氨酸激酶(RTK)的研究趋势及其在多组学方法中的应用 | 整合多组学技术(包括基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学)来全面理解RTK在GBM中的作用,揭示了新的治疗靶点和生物标志物 | RTK信号通路的复杂性需要更广泛的整合视角,目前的研究仍面临挑战 | 通过多组学方法提高GBM患者的诊断准确性和治疗效果 | 胶质母细胞瘤(GBM)及其受体酪氨酸激酶(RTK)信号通路 | digital pathology | glioblastoma | multi-omics (genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics), single-cell transcriptomics | NA | molecular data (genomic, transcriptomic, proteomic, metabolomic) | NA | NA | NA | NA | NA |
8291 | 2025-05-10 |
Stress-Induced Cholesterol Metabolic Dysregulation and Differentiation Trajectory Shift in Oligodendrocytes Synergistically Drive Demyelination
2025-Apr-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083517
PMID:40332029
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、谱系追踪和功能干预,揭示了应激诱导的少突胶质细胞胆固醇代谢紊乱和分化轨迹改变共同驱动脱髓鞘的新机制 | 从少突胶质细胞的动态角度揭示了'代谢失衡、分化阻滞和免疫激活'三者协同驱动应激性脱髓鞘的新机制 | 研究仅在小鼠模型中开展,尚未在人类样本中验证 | 探究应激诱导脱髓鞘的动态调控网络 | 少突胶质细胞(OLG) | 神经科学 | 抑郁症 | 单细胞转录组学、谱系追踪 | 约束应激小鼠模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
8292 | 2025-05-10 |
Single-Cell RNA Sequencing of Baseline Immune Profiles After Third Vaccination Associated with Subsequent SARS-CoV-2 Infection in Naïve Individuals
2025-Apr-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083494
PMID:40331973
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析疫苗接种后基线免疫特征与后续SARS-CoV-2感染的关系 | 揭示了疫苗接种后长期保护与突破性感染个体基线免疫亚群的分子特征差异 | 样本来自先前纵向研究,可能受限于原始研究设计 | 识别与增强SARS-CoV-2保护相关的分子特征 | 接种ChAdOx1/ChAdOx1/BNT162b2疫苗后未感染和突破性感染个体 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 酶联免疫斑点试验(ELISPOT) | NA | 基因表达数据 | 来自先前纵向研究的受试者样本(数量未明确说明) | NA | NA | NA | NA |
8293 | 2025-05-10 |
Single-Cell Transcriptome Identifies a Proinflammatory B-Cell Subset in Hepatitis B Virus Associated Acute-on-Chronic Liver Failure
2025-Mar, Journal of viral hepatitis
IF:2.5Q3
DOI:10.1111/jvh.70012
PMID:39976290
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,揭示了乙型肝炎病毒相关慢加急性肝衰竭(ACLF)患者外周血中B细胞的免疫异常特征 | 首次在ACLF患者中鉴定出一群促炎性B细胞亚群,并发现幼稚B细胞的比例显著增加及其功能异常 | 样本量相对有限,且未深入探究B细胞功能异常的分子机制 | 探究ACLF患者中B细胞的免疫特征及其在疾病发生发展中的作用 | ACLF患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 乙型肝炎病毒相关慢加急性肝衰竭 | scRNA-seq, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 临床ACLF患者和健康对照者的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
8294 | 2025-05-10 |
Single-cell RNA-seq and pathological phenotype reveal the functional atlas and precise roles of Sox30 in testicular cell development and differentiation
2025-Feb-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07442-1
PMID:39971903
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和病理表型分析,揭示了Sox30在睾丸细胞发育和分化中的功能图谱和精确作用 | 首次详细描述了Sox30在睾丸细胞中的具体功能,特别是在初级精母细胞分化中的作用,并揭示了Sox30缺失对细胞间通讯和转录因子网络的影响 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证 | 阐明Sox30在睾丸细胞发育和分化中的精确作用机制 | 小鼠睾丸细胞 | 单细胞测序 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量,但涉及野生型和Sox30缺失型小鼠的睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
8295 | 2025-05-10 |
Unravelling genotype-phenotype correlations in Stargardt disease using patient-derived retinal organoids
2025-Feb-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07420-7
PMID:39971915
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研究论文 | 利用患者来源的视网膜类器官研究Stargardt病的基因型-表型相关性 | 首次使用患者来源的iPSCs生成视网膜类器官,成功模拟了STGD1的病理特征并揭示了基因型与表型之间的相关性 | 研究仅涉及两名单等位基因未解决的STGD1患者和一名双等位基因受影响对照,样本量较小 | 探究STGD1的细胞和分子特征及其基因型-表型相关性 | STGD1患者和对照的iPSCs来源的视网膜类器官 | 遗传性视网膜疾病研究 | Stargardt病 | iPSC技术、视网膜类器官培养、scRNA-Seq、全基因组测序、长读长RNA测序 | 视网膜类器官模型 | 基因测序数据、单细胞RNA测序数据、RNA-seq数据 | 两名单等位基因未解决的STGD1患者和一名双等位基因受影响对照 | NA | NA | NA | NA |
8296 | 2025-05-10 |
Polycystic ovary syndrome and epithelial-mesenchymal transition: Mendelian randomization and single-cell analysis insights
2025-Feb-19, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01617-2
PMID:39972362
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研究论文 | 本研究通过转录组学和单细胞RNA测序结合孟德尔随机化分析,探索了与多囊卵巢综合征(PCOS)中上皮-间质转化(EMT)相关的关键基因及其分子调控机制 | 首次从转录组学和单细胞RNA测序角度结合孟德尔随机化分析,鉴定出与PCOS风险降低相关的三个EMT相关基因(NUCB2、PGF、CRIM1),并发现成纤维细胞是PCOS病理中的关键细胞群 | 研究仅基于公共数据库数据,缺乏实验验证 | 探索PCOS中EMT相关关键基因及其分子调控机制 | 多囊卵巢综合征(PCOS)患者样本 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)分析 | NA | 转录组数据 | 公共数据库中的PCOS样本数据 | NA | NA | NA | NA |
8297 | 2025-05-10 |
Precise gene expression deconvolution in spatial transcriptomics with STged
2025-Feb-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf087
PMID:39970279
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研究论文 | 提出了一种名为STged的新型计算框架,用于从空间转录组学数据中精确解卷积细胞类型特异性基因表达谱 | STged通过整合基于图的空间相关性和参考基因特征,超越了传统的细胞类型解卷积方法,能够重建混合点中的细胞类型特异性基因表达谱 | NA | 解决空间转录组学中细胞类型特异性基因表达模式被掩盖的问题 | 人类胰腺导管腺癌、人类鳞状细胞癌数据集以及小鼠肾脏组织 | 数字病理学 | 胰腺癌、鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 非负最小二乘回归框架 | 基因表达数据 | 人类和小鼠组织样本 | NA | NA | NA | NA |
8298 | 2025-05-10 |
Single-cell sequencing elucidates the mechanism of NUSAP1 in glioma and its diagnostic and prognostic significance
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1512867
PMID:39975552
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研究论文 | 通过单细胞测序技术探索NUSAP1在神经胶质瘤中的作用机制及其诊断和预后意义 | 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据结合基础实验,揭示了NUSAP1作为神经胶质瘤终末亚群的关键标记物及其与不良预后的关联 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的RNA-seq和微阵列数据,可能需要更多独立样本验证 | 探索神经胶质瘤的个性化精准治疗策略 | 神经胶质瘤细胞亚群 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RNA-seq, 微阵列 | NA | RNA-seq数据, 微阵列数据, scRNA-seq数据 | 来自TCGA和GEO数据库的神经胶质瘤患者样本 | NA | NA | NA | NA |
8299 | 2025-05-10 |
Advancing personalized, predictive, and preventive medicine in bladder cancer: a multi-omics and machine learning approach for novel prognostic modeling, immune profiling, and therapeutic target discovery
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1572034
PMID:40330458
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别并分析了膀胱癌中与免疫原性细胞死亡相关的多组学特征,构建了一个预后标志物ICDRS,并探讨了其临床和生物学意义 | 利用多组学数据和机器学习算法构建了膀胱癌的预后标志物ICDRS,揭示了其与免疫细胞浸润、肿瘤微环境及药物敏感性的关联 | 研究依赖于公开数据集,样本量有限,且未进行实验验证 | 推进膀胱癌的个性化、预测性和预防性医学研究 | 膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序(bulk RNA-seq), WGCNA, ssGSEA | Lasso, Ridge, CoxBoost | RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据9个样本,批量RNA测序数据TCGA-BLCA 403个样本,GSE13507 160个样本 | NA | NA | NA | NA |
8300 | 2025-05-10 |
METTL1-driven nucleotide metabolism reprograms the immune microenvironment in hepatocellular carcinoma: a multi-omics approach for prognostic biomarker discovery
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1582203
PMID:40330476
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research paper | 本研究揭示了METTL1通过驱动核苷酸代谢重编程在肝细胞癌(HCC)中调节肿瘤免疫微环境的新机制,并开发了一个基于多组学方法的预后生物标志物模型 | 首次揭示了METTL1驱动的核苷酸代谢重编程在HCC免疫微环境重塑中的关键作用,并构建了整合METTL1表达和免疫检查点特征的预后预测模型 | 研究主要基于计算分析和体外实验,需要更多体内实验和临床样本验证 | 探索HCC中代谢和免疫失调的分子机制,并开发预后预测模型 | 肝细胞癌(HCC)患者样本和细胞模型 | digital pathology | liver cancer | 多组学分析(包括单细胞RNA测序)、NMF聚类、WGCNA、机器学习算法 | 预后预测模型(基于多种机器学习算法) | 基因组数据、转录组数据、临床数据 | 来自TCGA、GEO和ICGC数据库的HCC患者样本 | NA | NA | NA | NA |